| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 115 | = 9626 | 77 (1.130) | 26 (0.490) | 19/168 | 2.1 | 44.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 60 | 17 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
ATGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCATCGTGCACCGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 115/9549‑9626‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCG > 60/17‑114 cTGATAAGACGCGGGAGCGGCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTT < 1:1327989/100‑1 GATAAGACGCGTGAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCG < 1:1004912/101‑1 GATAAGACGCGTGAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCG < 2:1507265/101‑1 GATAAGACGCGTGAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCG > 1:1084685/1‑101 ATAAGACGCGTGAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGG > 1:583025/1‑101 TAAGACGCGTGAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGT > 2:1292062/1‑101 gccgcgtgAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGA < 2:126997/93‑1 tgAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTT < 1:90345/99‑1 gAGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTT < 2:984122/100‑1 AGCGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTT < 2:457932/101‑1 CGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCG < 1:351987/101‑1 CGTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCG < 2:1054540/101‑1 GTCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGG > 2:1248033/1‑101 TCGCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGC < 2:981286/101‑1 GCATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCA < 2:489248/101‑1 ATCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGT > 2:1583494/1‑101 ATCAGACATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCCTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGT < 2:64503/101‑1 TCAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTC < 2:489440/101‑1 CAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCG < 1:1445444/101‑1 CAGGCATCGTTCACC‑ATTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCG < 1:1268758/101‑1 AACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGg > 2:1498705/1‑100 AACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGA > 2:1481039/1‑101 AACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGA > 2:949566/1‑101 ACGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGAT < 2:253189/101‑1 CGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATG < 1:823594/101‑1 CGCCTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATG < 2:1388732/101‑1 CTTATCCGGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGG > 2:1125826/1‑101 GGCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGC > 2:711252/1‑101 GCCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCT < 1:1481219/101‑1 CCTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTC > 1:458641/1‑101 CTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGGCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCC > 2:1063210/1‑101 CTACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCC < 1:1218530/101‑1 TACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCG < 1:1292068/101‑1 TACGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCG < 1:1035744/101‑1 ATGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCATCGTGCACCGATTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 115/9549‑9626‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccttatccggcctacGGTTGAGCACTCAGCTTACTTCTTCGGTTGATCCTTTTTCGGCCAGTCGTCGTCATCGTCCCACTTATCGTTGAAATCACGATGCGGGGGAAGCTCCG > 60/17‑114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |