Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 1,448,695 | IS1 (+) +9 bp | coding (224‑232/1758 nt) | ynbC → | predicted hydrolase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1448695 = | 0 (0.000) | 43 (0.670) | 40/200 | 0.7 | 100% | coding (224/1758 nt) | ynbC | predicted hydrolase |
? | REL606 | = 1460927 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 1448703 | 0 (0.000) | 50 (0.780) | 37/198 | 0.9 | 100% | coding (232/1758 nt) | ynbC | predicted hydrolase |
? | REL606 | 1460160 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
CATTCTGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1448604‑1448703 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > REL606/1460160‑1460259 CATTCTGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCG < 2:1426603/101‑1 TTCTGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGT < 2:1078616/101‑1 TGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGAT > 1:1381709/1‑101 TCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCC < 2:217101/101‑1 TCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCC < 1:88304/101‑1 CTACAACATCTCGTTGATGAACTTGCGATGCCAGATACTGATTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTGCGGGGCGGCGGTGATGCTGCCA > 2:154678/1‑101 TACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAA > 1:95477/1‑101 CAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACT < 2:959215/101‑1 ACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:1193915/101‑1 CATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTAC > 2:1497409/1‑101 GTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 2:327958/1‑101 TGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:924077/101‑1 GATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:1200120/101‑1 ACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 2:733845/101‑1 TGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 2:596121/1‑101 GGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 2:1381703/101‑1 GATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 2:1291205/1‑101 ATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:318629/101‑1 GCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:147225/101‑1 GCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:770180/1‑101 GATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:629724/1‑101 ACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:1682526/1‑101 TGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGCGTTTTTGAGGGGC > 2:570053/1‑101 ATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 1:1407625/1‑101 GCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCACGGTGATGCTGCCATCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 2:1425557/101‑1 CCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 2:1377056/1‑101 GATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:711675/1‑101 GATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 2:1604036/101‑1 TGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:722630/101‑1 gCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:1102556/100‑1 CGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC < 2:1251015/101‑1 AGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 2:318237/1‑101 ATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTTTTAGCTGTC > 2:1538348/1‑101 ATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC > 1:1056744/1‑101 TGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC > 1:879869/1‑101 GGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:629729/101‑1 AAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:894010/1‑101 AGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT > 1:799180/1‑101 CCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:890635/101‑1 CGCGTTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 2:328614/101‑1 GCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 2:494823/101‑1 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 2:601997/101‑1 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 1:1609203/101‑1 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 1:944703/101‑1 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 1:1378338/1‑101 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 2:734290/101‑1 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 2:597965/1‑101 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 1:746641/101‑1 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 1:946934/1‑101 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 2:956322/101‑1 CGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 2:1464817/101‑1 CATTCTGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1448604‑1448703 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > REL606/1460160‑1460259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |