Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 1,619,834 | IS150 (–) +3 bp | 100% | intergenic (‑71/+139) | hokD ← / ← ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 89 (0.990) | 56/76 | NT | 98.8% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | 1619834 = | 1 (0.010) | intergenic (‑71/+141) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
* | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 70 (0.760) | 46/78 | NT | 98.5% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 1619836 | 1 (0.010) | intergenic (‑73/+139) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCT > REL606/1619786‑1619886 | tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt > 1:4023052‑M2/49‑51 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:10163270‑M2/3‑1 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:2130003‑M2/3‑1 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:10706924‑M2/3‑1 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:10596463‑M2/3‑1 (MQ=255) ggCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGAt > 1:4576483/1‑51 (MQ=255) gCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATt > 1:10024365‑M2/1‑50 (MQ=255) gCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATt < 1:2623591‑M2/51‑2 (MQ=255) cACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtg < 1:19320‑M2/51‑3 (MQ=255) taggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTaa < 1:2828136‑M2/6‑1 (MQ=255) aCGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgt < 1:527311‑M2/51‑4 (MQ=255) aggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAAt < 1:1687859‑M2/7‑1 (MQ=255) gTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac < 1:2207637‑M2/51‑6 (MQ=255) gTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 1:979922‑M2/1‑46 (MQ=255) gTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac < 1:8028777‑M2/51‑6 (MQ=255) gTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac < 1:10896352‑M2/51‑6 (MQ=255) tAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtact < 1:6413200‑M2/51‑7 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGt < 1:6703232‑M2/9‑1 (MQ=255) ggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGtt < 1:5034805‑M2/10‑1 (MQ=255) aaGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactg > 1:1812429‑M2/1‑44 (MQ=255) agagGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactga < 1:643350‑M2/51‑9 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTaa > 1:2588975‑M2/40‑51 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAg > 1:6107717‑M2/39‑51 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAg < 1:7017918‑M2/13‑1 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAg > 1:504034‑M2/39‑51 (MQ=255) agGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgacc < 1:4880487‑M2/51‑11 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:6550882‑M2/38‑51 (MQ=255) catttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCt > 1:6128211‑M2/34‑51 (MQ=255) anCCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaa < 1:1402841‑M2/51‑16 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCtt < 1:9137847‑M2/19‑1 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCtt > 1:10241826‑M2/33‑51 (MQ=255) aCCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaa > 1:202334‑M2/1‑35 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGtctcg < 1:841355‑M2/20‑3 (MQ=255) cTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaag < 1:1599320‑M2/51‑19 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCa > 1:8612608‑M2/30‑51 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCa < 1:5356306‑M2/22‑1 (MQ=255) tACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagt < 1:8758747‑M2/51‑20 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAg < 1:10463386‑M2/23‑1 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagtt < 1:7892375‑M2/51‑21 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagtt > 1:960686‑M2/1‑31 (MQ=255) aTGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttgg > 1:9357545‑M2/1‑29 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAc < 1:1524180‑M2/26‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAc < 1:6832334‑M2/26‑1 (MQ=255) gtgtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:3258502‑M2/1‑27 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcg > 1:7733783‑M2/25‑51 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcg > 1:8383584‑M2/25‑51 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcg < 1:9699856‑M2/27‑1 (MQ=255) tgtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggaca < 1:10436986‑M2/51‑26 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgc < 1:275603‑M2/28‑1 (MQ=255) gtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacag < 1:7636239‑M2/51‑27 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:1727298‑M2/23‑51 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:4324500‑M2/23‑51 (MQ=255) tCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagt > 1:9791095‑M2/1‑24 (MQ=255) tCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:3429085‑M2/51‑28 (MQ=255) cTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:8508565‑M2/51‑29 (MQ=255) cTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt > 1:9412065‑M2/1‑23 (MQ=255) cTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:10385069‑M2/51‑29 (MQ=255) cTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:10881485‑M2/51‑29 (MQ=255) cTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt > 1:2016978‑M2/1‑23 (MQ=255) tAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtta < 1:4792050‑M2/51‑30 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTaa < 1:814547‑M2/32‑1 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTaa > 1:10539729‑M2/20‑51 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAAt > 1:7856038‑M2/19‑51 (MQ=255) aGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa > 1:3714927‑M2/1‑21 (MQ=255) gCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaa > 1:10200927‑M2/1‑20 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGTGTAATg < 1:7804905‑M2/34‑1 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATg > 1:6730843‑M2/18‑51 (MQ=255) cATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 1:6236292‑M2/51‑33 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGtt > 1:5517093‑M2/16‑51 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:10094537‑M2/51‑34 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:3559760‑M2/51‑34 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca > 1:2877490‑M2/1‑18 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:3852813‑M2/51‑34 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:7255354‑M2/51‑34 (MQ=255) tGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac > 1:2344375‑M2/1‑17 (MQ=255) tGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:9485170‑M2/51‑35 (MQ=255) tGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:294116‑M2/51‑35 (MQ=255) tGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:2072990‑M2/51‑35 (MQ=255) gAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa < 1:4816583‑M2/46‑31 (MQ=255) aaTTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag > 1:8726339‑M2/1‑14 (MQ=255) gtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTg < 1:7367943‑M2/41‑1 (MQ=255) ttGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc < 1:893958‑M2/51‑40 (MQ=255) tgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTgg > 1:4255298‑M2/10‑51 (MQ=255) tGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca < 1:4391285‑M2/51‑41 (MQ=255) tGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca > 1:595021‑M2/1‑11 (MQ=255) tGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca < 1:1167224‑M2/51‑41 (MQ=255) gcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTggg < 1:5560495‑M2/43‑1 (MQ=255) ggCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat < 1:8219910‑M2/51‑42 (MQ=255) ccTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatat > 1:3110213‑M2/1‑8 (MQ=255) cTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatata > 1:4368642‑M2/1‑7 (MQ=255) tCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatag < 1:23054‑M2/51‑46 (MQ=255) acaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCttt < 1:3207371‑M2/48‑1 (MQ=255) caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCtttt > 1:7560295‑M2/3‑51 (MQ=255) caGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCttnt < 1:1836241‑M2/49‑1 (MQ=255) aGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggt < 1:10816789‑M2/51‑48 (MQ=255) aGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggt < 1:9007486‑M2/51‑48 (MQ=255) aGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTc < 1:331475‑M2/50‑1 (MQ=255) aGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTc > 1:4718452‑M2/2‑51 (MQ=255) gATTAATGTTAAGCGTCTTGCCGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtct < 1:5807342/51‑1 (MQ=255) ttAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTctct < 1:1640588/51‑1 (MQ=255) | GGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCTCT > REL606/1619786‑1619886 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |