| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 1,619,834 | IS150 (–) +3 bp | 100% | intergenic (‑71/+139) | hokD ← / ← ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 89 (0.990) | 56/76 | NT | 98.8% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | 1619834 = | 1 (0.010) | intergenic (‑71/+141) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
| * | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 70 (0.760) | 46/78 | NT | 98.5% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | REL606 | = 1619836 | 1 (0.010) | intergenic (‑73/+139) | hokD/ECB_01533 | small toxic polypeptide/conserved hypothetical protein | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
TCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCT > REL606/1619784‑1619884 | tCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAg < 1:10695366/51‑1 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt > 1:8964159‑M2/49‑51 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:10163270‑M2/3‑1 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt > 1:5036659‑M2/49‑51 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:338451‑M2/3‑1 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:10596463‑M2/3‑1 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAt < 1:759715‑M2/3‑1 (MQ=255) gCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATt > 1:10024365‑M2/1‑50 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGAtt < 1:7075695‑M2/4‑1 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTa > 1:1899332‑M2/47‑51 (MQ=255) aCGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgt < 1:527311‑M2/51‑4 (MQ=255) aCGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgt < 1:4497626‑M2/51‑4 (MQ=255) aCGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgt < 1:160966‑M2/51‑4 (MQ=255) cGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtg < 1:8666454‑M2/51‑5 (MQ=255) ggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAAt > 1:7705748‑M2/44‑50 (MQ=255) gTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtac > 1:979922‑M2/1‑46 (MQ=255) tAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtact < 1:6413200‑M2/51‑7 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGt < 1:6703232‑M2/9‑1 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGt < 1:2541686‑M2/9‑1 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGt > 1:2325707‑M2/43‑51 (MQ=255) ggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGtt > 1:7817119‑M2/42‑51 (MQ=255) aaGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactg < 1:4726845‑M2/51‑8 (MQ=255) aaGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactg < 1:2021877‑M2/51‑8 (MQ=255) agagGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactga < 1:643350‑M2/51‑9 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTaa < 1:4803740‑M2/12‑1 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAg < 1:10868385‑M2/13‑1 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAg > 1:6107717‑M2/39‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc < 1:7334750‑M2/14‑1 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:2600955‑M2/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc < 1:1088839‑M2/14‑1 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:3632523‑M2/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:9306785‑M2/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGc > 1:6550882‑M2/38‑51 (MQ=255) ttccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCg < 1:4648882‑M2/15‑1 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGt < 1:2122696‑M2/16‑1 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGt < 1:348767‑M2/16‑1 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGt > 1:4291940‑M2/36‑51 (MQ=255) cTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgacccca < 1:4357701‑M2/51‑14 (MQ=255) catttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCt < 1:8850534‑M2/18‑1 (MQ=255) catttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCt > 1:6128211‑M2/34‑51 (MQ=255) aaCCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaa < 1:3816440‑M2/51‑16 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCtt > 1:10241826‑M2/33‑51 (MQ=255) aCCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaa > 1:7382381‑M2/1‑35 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTg < 1:3284285‑M2/20‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTg < 1:841352‑M2/20‑1 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGc < 1:8740108‑M2/21‑1 (MQ=255) cTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaag < 1:10743543‑M2/51‑19 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCa < 1:5356306‑M2/22‑1 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCa > 1:2036526‑M2/30‑51 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAg < 1:10463386‑M2/23‑1 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAg > 1:9007688‑M2/29‑51 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagtt > 1:960686‑M2/1‑31 (MQ=255) aCATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagtt > 1:4376533‑M2/1‑31 (MQ=255) cATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttg < 1:4072633‑M2/51‑22 (MQ=255) aTGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttgg < 1:2764976‑M2/51‑23 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAc < 1:6832334‑M2/26‑1 (MQ=255) gtgtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggac < 1:1812606‑M2/51‑25 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcg < 1:9699856‑M2/27‑1 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcg > 1:8518462‑M2/25‑51 (MQ=255) tgtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggaca < 1:10436986‑M2/51‑26 (MQ=255) gtCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacag > 1:1546594‑M2/1‑25 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:2870235‑M2/23‑51 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGAcgcg > 1:2668670‑M2/23‑51 (MQ=255) tCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagt > 1:9791095‑M2/1‑24 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGt > 1:1715683‑M2/22‑51 (MQ=255) cTAGCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:10385069‑M2/51‑29 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTaa < 1:140435‑M2/32‑1 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTaa > 1:10539729‑M2/20‑51 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAAt > 1:7753887‑M2/19‑51 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAAt > 1:8330897‑M2/19‑51 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAAt > 1:1947064‑M2/19‑51 (MQ=255) gCATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaa > 1:10200927‑M2/1‑20 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATg > 1:6730843‑M2/18‑51 (MQ=255) cATGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 1:6236292‑M2/51‑33 (MQ=255) aaatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGt > 1:3859638‑M2/17‑51 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGtt > 1:2160512‑M2/16‑51 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGtt > 1:5517093‑M2/16‑51 (MQ=255) aTGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:10094537‑M2/51‑34 (MQ=255) tGAAATTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:9485170‑M2/51‑35 (MQ=255) atgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTa > 1:110710‑M2/15‑51 (MQ=255) atgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTa > 1:795468‑M2/15‑51 (MQ=255) tgggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTaa < 1:8494856‑M2/38‑1 (MQ=255) gggtgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCATAATGTTAAc < 1:4839231‑M2/39‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag > 1:9376828‑M2/1‑14 (MQ=255) gtgcagtacaGACTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTg > 1:4883731‑M2/11‑51 (MQ=255) ttGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc < 1:8077288‑M2/51‑40 (MQ=255) tgcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTgg < 1:3041899‑M2/42‑1 (MQ=255) tGGCCTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca > 1:595021‑M2/1‑11 (MQ=255) gcagtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTggg < 1:5560495‑M2/43‑1 (MQ=255) agtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGc > 1:8197894‑M2/7‑51 (MQ=255) gtacaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCt < 1:3188326‑M2/46‑1 (MQ=255) cTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatata > 1:7867955‑M2/1‑7 (MQ=255) cTCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatata > 1:507150‑M2/1‑7 (MQ=255) tCAGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatag > 1:1373116‑M2/1‑6 (MQ=255) acaGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCttt > 1:1781609‑M2/4‑51 (MQ=255) aGATtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggt > 1:2240948‑M2/1‑4 (MQ=255) aGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTc > 1:2924773‑M2/2‑51 (MQ=255) gATTAATGTTAAGCGTCTTGCCGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtct < 1:5807342/51‑1 (MQ=255) gATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtct > 1:3209920/1‑51 (MQ=255) gATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTtct > 1:6910528/1‑51 (MQ=255) | TCGGCACGTAAGAGGCTAACCTACATGTGTCTAGCATGAAATTGGCCTCAGATTAATGTTAAGCGTCTTGCAGGACGCGTAATGTTAACTGGGGCTTTTCT > REL606/1619784‑1619884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |