Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,522,900 | IS150 (–) +3 bp | 100% | coding (255‑257/2019 nt) | hyfB → | NADH dehydrogenase subunit N |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2522900 = | 0 (0.000) | 85 (0.900) | 49/80 | NT | 100% | coding (255/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2522902 | 0 (0.000) | 120 (1.260) | 60/80 | NT | 100% | coding (257/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
ATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATA > REL606/2522852‑2522952 | tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCt > 1:6062769‑M1/49‑51 (MQ=255) tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCt < 1:9254446‑M1/3‑1 (MQ=255) aTTTTCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:5349120/1‑51 (MQ=255) aTTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:2932253/1‑51 (MQ=255) tttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTt > 1:336755‑M1/1‑50 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg < 1:4463337‑M1/4‑1 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg < 1:2256418‑M1/4‑1 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg > 1:3074578‑M1/48‑51 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg > 1:6669029‑M1/48‑51 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTgg < 1:993798‑M1/5‑1 (MQ=255) ttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtg > 1:2068679‑M1/1‑49 (MQ=255) tGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgt > 1:4353507‑M1/1‑48 (MQ=255) gCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgta < 1:2744307‑M1/51‑5 (MQ=255) aggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGtt < 1:3271450‑M1/7‑1 (MQ=255) ggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTa < 1:1672291‑M1/8‑1 (MQ=255) ccGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtac > 1:3322566‑M1/1‑46 (MQ=255) gggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTAt > 1:7383156‑M1/43‑51 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:2007470‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:1840938‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg < 1:1577401‑M1/51‑8 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:6791921‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:3505367‑M1/1‑44 (MQ=255) aTTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactga < 1:9287533‑M1/51‑9 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTAtctc > 1:5463526‑M1/40‑51 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:8884857‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:3156584‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:9575094‑M1/1‑41 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc < 1:1446890‑M1/13‑1 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt > 1:830634‑M1/38‑51 (MQ=255) attccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCt > 1:4936637‑M1/38‑51 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg > 1:4047266‑M1/36‑51 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg > 1:8947019‑M1/36‑51 (MQ=255) aCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacccca > 1:5390249‑M1/1‑38 (MQ=255) aCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacccca < 1:10763569‑M1/51‑14 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa < 1:1599044‑M1/51‑15 (MQ=255) ccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaa > 1:758297‑M1/1‑36 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaa < 1:4685557‑M1/51‑17 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaa < 1:2556088‑M1/51‑17 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaa < 1:10386342‑M1/51‑17 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtg < 1:6996901‑M1/19‑1 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:1150019‑M1/20‑1 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt < 1:7697642‑M1/21‑1 (MQ=255) gCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaag < 1:6516389‑M1/51‑19 (MQ=255) atcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt > 1:9818223‑M1/28‑51 (MQ=255) aaTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttg > 1:6166157‑M1/1‑30 (MQ=255) tcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg > 1:10005328‑M1/27‑51 (MQ=255) aTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgg < 1:2613708‑M1/51‑23 (MQ=255) aTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgg > 1:9708507‑M1/1‑29 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgga > 1:3498038‑M1/1‑28 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgga > 1:5042635‑M1/1‑28 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg > 1:2336642‑M1/26‑51 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:8494976‑M1/1‑27 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 1:2702995‑M1/24‑51 (MQ=255) gATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggaca > 1:5883552‑M1/1‑26 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt > 1:3052690‑M1/1‑24 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTg > 1:5129848‑M1/22‑51 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTg < 1:10356742‑M1/30‑1 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 1:480639‑M1/31‑1 (MQ=255) aGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagtt < 1:4254707‑M1/51‑29 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt > 1:8663103‑M1/20‑51 (MQ=255) aaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtct > 1:152387‑M1/18‑51 (MQ=255) tctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 1:1247033‑M1/51‑33 (MQ=255) tctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 1:9372432‑M1/51‑33 (MQ=255) ctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca < 1:8546566‑M1/51‑34 (MQ=255) ctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaaca > 1:6854587‑M1/1‑18 (MQ=255) tcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:5805926‑M1/51‑35 (MQ=255) tgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct > 1:7984731‑M1/14‑51 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:3015353‑M1/51‑36 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:6113356‑M1/51‑36 (MQ=255) gggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTa < 1:3885813‑M1/39‑1 (MQ=255) ggCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacga < 1:4199362‑M1/51‑37 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt > 1:876310‑M1/12‑51 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt < 1:3933312‑M1/40‑1 (MQ=255) gCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag < 1:2475291‑M1/51‑38 (MQ=255) gCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgag > 1:4856030‑M1/1‑14 (MQ=255) gtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAtt < 1:9686631‑M1/41‑1 (MQ=255) gtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAtt > 1:10672293‑M1/11‑51 (MQ=255) cATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgagg > 1:10573680‑M1/1‑13 (MQ=255) cATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagtta > 1:9741240‑M1/1‑13 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc < 1:8143300‑M1/51‑40 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 1:6317446‑M1/1‑12 (MQ=255) ttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat > 1:6627214‑M1/1‑10 (MQ=255) ttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat > 1:1381775‑M1/1‑10 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt < 1:401169‑M1/45‑1 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt > 1:9013932‑M1/7‑51 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt > 1:2899054‑M1/7‑51 (MQ=255) gtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTg < 1:9204838‑M1/46‑1 (MQ=255) gtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCACTCTATTCATTg < 1:4064113‑M1/46‑1 (MQ=255) acaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGAc > 1:8117410‑M1/4‑51 (MQ=255) acaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGAc > 1:5601810‑M1/4‑51 (MQ=255) acaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGAc > 1:4557536‑M1/4‑51 (MQ=255) caGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACt > 1:6426168‑M1/3‑51 (MQ=255) tGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcatatag > 1:1887997‑M1/1‑4 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt < 1:1490995‑M1/50‑1 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt > 1:3737583‑M1/2‑51 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |