| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,522,900 | IS150 (–) +3 bp | 100% | coding (255‑257/2019 nt) | hyfB → | NADH dehydrogenase subunit N |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2522900 = | 0 (0.000) | 85 (0.900) | 49/80 | NT | 100% | coding (255/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
| ? | REL606 | 3651091 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2522902 | 0 (0.000) | 120 (1.260) | 60/80 | NT | 100% | coding (257/2019 nt) | hyfB | NADH dehydrogenase subunit N |
| ? | REL606 | = 3894996 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTA > REL606/2522850‑2522950 | tattaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCt > 1:6062769‑M1/49‑51 (MQ=255) aTTTTCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:5349120/1‑51 (MQ=255) aTTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:2932253/1‑51 (MQ=255) tttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTt > 1:336755‑M1/1‑50 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg > 1:3074578‑M1/48‑51 (MQ=255) attaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTg < 1:766039‑M1/4‑1 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTgg < 1:993798‑M1/5‑1 (MQ=255) ttaggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTgg < 1:1505538‑M1/5‑1 (MQ=255) ttGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtg > 1:2068679‑M1/1‑49 (MQ=255) taggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGt < 1:3313060‑M1/6‑1 (MQ=255) aggggctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGtt < 1:3271450‑M1/7‑1 (MQ=255) cGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtact < 1:3996496‑M1/51‑7 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:3505367‑M1/1‑44 (MQ=255) gATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactg > 1:683829‑M1/1‑44 (MQ=255) aTTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactga < 1:9287533‑M1/51‑9 (MQ=255) ctattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTAtctc > 1:5463526‑M1/40‑51 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:1680484‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:9575094‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:8305853‑M1/1‑41 (MQ=255) ttAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacc > 1:3156584‑M1/1‑41 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc < 1:4717113‑M1/13‑1 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc < 1:8009908‑M1/13‑1 (MQ=255) tattccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTcc < 1:2729399‑M1/13‑1 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg > 1:8947019‑M1/36‑51 (MQ=255) tccatttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTg > 1:4825944‑M1/36‑51 (MQ=255) aCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgacccca > 1:5390249‑M1/1‑38 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa > 1:3918730‑M1/1‑37 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa > 1:4056966‑M1/1‑37 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa < 1:1482165‑M1/51‑15 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa < 1:10726093‑M1/51‑15 (MQ=255) cccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaa > 1:1649916‑M1/1‑37 (MQ=255) ccTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaa > 1:758297‑M1/1‑36 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaa < 1:10386342‑M1/51‑17 (MQ=255) cTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaa < 1:2556088‑M1/51‑17 (MQ=255) tttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:1150019‑M1/20‑1 (MQ=255) tGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaa > 1:10354685‑M1/1‑34 (MQ=255) tGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtaccgaccccaaaaa > 1:2877124‑M1/1‑34 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt > 1:4468116‑M1/31‑51 (MQ=255) ttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggt < 1:2692149‑M1/21‑1 (MQ=255) tcatcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 1:4235897‑M1/30‑51 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:1900481‑M1/1‑32 (MQ=255) cGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagt > 1:2582043‑M1/1‑32 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtgg < 1:10557356‑M1/23‑1 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 1:8802893‑M1/29‑50 (MQ=255) atcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt > 1:9818223‑M1/28‑51 (MQ=255) aaTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttg > 1:8913472‑M1/1‑30 (MQ=255) aaTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttg > 1:6166157‑M1/1‑30 (MQ=255) tcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg > 1:10005328‑M1/27‑51 (MQ=255) tcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg < 1:623250‑M1/25‑1 (MQ=255) aTGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgg > 1:9708507‑M1/1‑29 (MQ=255) tGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttgga < 1:5118098‑M1/51‑24 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg < 1:6103058‑M1/26‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg < 1:4601782‑M1/26‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg > 1:2336642‑M1/26‑51 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTggtggtggt < 1:5042192‑M1/27‑1 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:8494976‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:1867255‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggac < 1:434636‑M1/51‑25 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt < 1:1424153‑M1/28‑1 (MQ=255) gATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggaca < 1:1595592‑M1/51‑26 (MQ=255) gATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggaca > 1:2253588‑M1/1‑26 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGttt < 1:6559928‑M1/29‑1 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGttt < 1:8656849‑M1/29‑1 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt > 1:3052690‑M1/1‑24 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:5577925‑M1/51‑28 (MQ=255) tAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:8137952‑M1/51‑28 (MQ=255) aGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagtt > 1:690504‑M1/1‑23 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt > 1:8663103‑M1/20‑51 (MQ=255) acaaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt > 1:9255651‑M1/20‑51 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc > 1:8502836‑M1/19‑51 (MQ=255) tctcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaac < 1:9372432‑M1/51‑33 (MQ=255) aaatgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctc < 1:3725206‑M1/35‑1 (MQ=255) aatgggtgcggtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctct < 1:6763930‑M1/36‑1 (MQ=255) tcGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacac < 1:5805926‑M1/51‑35 (MQ=255) atgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctctc > 1:8189287‑M1/15‑51 (MQ=255) tgggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct > 1:4186425‑M1/14‑51 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacg < 1:3015353‑M1/51‑36 (MQ=255) cGGCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa > 1:6652331‑M1/1‑16 (MQ=255) gggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTa < 1:3885813‑M1/39‑1 (MQ=255) ggCATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaagttggacagttaaacacgag < 1:4396002‑M1/51‑37 (MQ=255) ggtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt > 1:4037655‑M1/12‑51 (MQ=255) gtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAtt > 1:10672293‑M1/11‑51 (MQ=255) gtgcagtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAtt < 1:9686631‑M1/41‑1 (MQ=255) cATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgagg > 1:785079‑M1/1‑13 (MQ=255) cATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgagg < 1:2437276‑M1/51‑39 (MQ=255) cATTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagtta > 1:9741240‑M1/1‑13 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc > 1:7277536‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTTATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggc < 1:9083019‑M1/51‑40 (MQ=255) tttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggca > 1:588078‑M1/1‑11 (MQ=255) ttATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcat < 1:7407758‑M1/51‑42 (MQ=255) tATGGTGCTtgtactgaccccaaaaagttggacagttaaacacgaggcata > 1:4925815‑M1/1‑9 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt < 1:1571462‑M1/45‑1 (MQ=255) agtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAtt > 1:3490199‑M1/7‑51 (MQ=255) gtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTg < 1:9204838‑M1/46‑1 (MQ=255) gtacaGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTg < 1:6491484‑M1/46‑1 (MQ=255) caGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACt > 1:6426168‑M1/3‑51 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt > 1:1230805‑M1/2‑51 (MQ=255) aGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt < 1:1284904‑M1/50‑1 (MQ=255) gCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTta < 1:8845078/51‑1 (MQ=255) gCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTta > 1:3976146/1‑51 (MQ=255) | GAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTA > REL606/2522850‑2522950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |