New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | REL606 | 2774435 = | NA (NA) | 92 (1.050) | 55/74 | NT | NA | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 2822512 | NA (NA) | noncoding (443/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
GAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2774488‑2774435 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acaGTCTCCGGAAGACGGTTGTTGCGCACGTATTCGGTGAACGCACTATGGCG < REL606/2822512‑2822463 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:5064242/1‑51 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:101409/51‑1 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:10244931/1‑51 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:9853892/51‑1 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:967459/51‑1 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:9505800/51‑1 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:8955496/1‑51 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA < 1:8842434/51‑1 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:4286045/1‑51 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTA > 1:10769607/1‑51 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |