Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA REL606 3,536,881 A→G E148G (GAA→GGA)  yhhN → conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*REL6063,536,8810AG100.0% 206.8 / NA 55E148G (GAA→GGA) yhhNconserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (24/31);  total (24/31)

CTGCACGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGAACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGTTTGTTG  >  REL606/3536834‑3536928
                                               |                                               
cTGCACGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACt                                              <  1:6779627/51‑1 (MQ=255)
  gCACGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACtg                                             >  1:6046136/1‑50 (MQ=255)
   cACGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACtgtg                                           <  1:3350436/51‑1 (MQ=255)
    aCGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTgg                                          <  1:2547403/51‑1 (MQ=255)
    aCGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTgg                                          >  1:5120080/1‑51 (MQ=255)
     cGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGGGGACTGTGGt                                         >  1:3493535/1‑51 (MQ=38)
      gTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGtt                                        >  1:5573176/1‑51 (MQ=255)
      gTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGtt                                        <  1:5927009/51‑1 (MQ=255)
       tttATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGtt                                        >  1:5455953/1‑50 (MQ=255)
               cATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTtccgtcc                               <  1:6737473/51‑1 (MQ=255)
                aTGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTtccgtccg                              <  1:1534040/51‑1 (MQ=255)
                aTGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTtccgtccg                              <  1:4850894/51‑1 (MQ=255)
                 tGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGa                             <  1:2554592/51‑1 (MQ=255)
                 tGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGGGGACTGTGGTTCTtccgtc                                >  1:1664971/1‑48 (MQ=38)
                  gACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGGGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGAc                            >  1:2469371/1‑51 (MQ=39)
                   aCGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGAcc                           <  1:3911173/51‑1 (MQ=255)
                   aCGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGAcc                           >  1:4107748/1‑51 (MQ=255)
                   aCGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGGGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGAcc                           >  1:433433/1‑51 (MQ=39)
                    cGCTGGTGATGGTGTGGCTGGTAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCg                          <  1:4995978/51‑1 (MQ=255)
                    cGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCg                          <  1:4317625/51‑1 (MQ=255)
                    cGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCg                          <  1:5525495/51‑1 (MQ=255)
                     gCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGAcc                           >  1:6136695/1‑49 (MQ=255)
                     gCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGc                         >  1:27970/1‑51 (MQ=255)
                      cTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGGGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCt                        >  1:2033392/1‑51 (MQ=255)
                       tGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTc                       <  1:6646905/51‑1 (MQ=255)
                       tGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGGGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTc                       >  1:2522764/1‑51 (MQ=255)
                        ggTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTcc                      <  1:3326545/51‑1 (MQ=255)
                         gTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCg                     <  1:4219904/51‑1 (MQ=255)
                         gTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCg                     <  1:3874430/51‑1 (MQ=255)
                         gTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCg                     <  1:4288864/51‑1 (MQ=255)
                          tGATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCgg                    >  1:4855530/1‑51 (MQ=255)
                           gATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGgc                   <  1:4987533/51‑1 (MQ=255)
                           gATGGTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGgc                   >  1:2619396/1‑51 (MQ=255)
                              ggTGTGGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGct                >  1:4315314/1‑51 (MQ=255)
                                tgtgGCTGGCAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGctct              >  1:5170754/1‑51 (MQ=255)
                                  tggctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGctctct            <  1:4283965/51‑1 (MQ=255)
                                  tggctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGctctct            <  1:6906188/51‑1 (MQ=255)
                                  tggctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGctctct            <  1:3936296/51‑1 (MQ=255)
                                  tggctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGctctct            <  1:1481390/51‑1 (MQ=255)
                                  tggctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGctctct            <  1:5139330/51‑1 (MQ=255)
                                   ggctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTg           >  1:43765/1‑51 (MQ=255)
                                    gctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGc          <  1:4188854/51‑1 (MQ=255)
                                    gctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGc          <  1:2772953/51‑1 (MQ=255)
                                    gctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGc          <  1:3259410/51‑1 (MQ=255)
                                     ctggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCg         >  1:520268/1‑51 (MQ=255)
                                      tggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGt        >  1:2215370/1‑51 (MQ=255)
                                      tggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGt        >  1:304171/1‑51 (MQ=255)
                                       ggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGtt       <  1:103393/51‑1 (MQ=255)
                                       ggcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGtt       <  1:103394/51‑1 (MQ=255)
                                        gcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGttt      <  1:965767/51‑1 (MQ=255)
                                        gcAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGttt      >  1:2351217/1‑51 (MQ=255)
                                         cAGGTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGTttg     >  1:3489160/1‑51 (MQ=255)
                                            gTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGTttgttg  <  1:5185389/51‑1 (MQ=255)
                                            gTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGTttgttg  <  1:2219421/51‑1 (MQ=255)
                                            gTGGACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGTttgttg  >  1:43964/1‑51 (MQ=255)
                                               |                                               
CTGCACGTTTATCGGCATGACGCTGGTGATGGTGTGGCTGGCAGGTGAACTGTGGTTCTTCCGTCCGACCGCTCCGGCGCTCTCTGCGTTTGTTG  >  REL606/3536834‑3536928

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: