| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 4,462,655 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑85/‑100) | yjgM ← / → yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 4462655 = | 0 (0.000) | 97 (1.220) | 55/100 | 0.1 | 100% | intergenic (‑85/‑108) | yjgM/yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
| ? | REL606 | 4521571 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 4462663 | 0 (0.000) | 93 (1.190) | 44/98 | 0.6 | 100% | intergenic (‑93/‑100) | yjgM/yjgN | predicted acetyltransferase/conserved inner membrane protein |
| ? | REL606 | = 4506109 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4462614‑4462663‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < REL606/4506109‑4506059 CTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGA > 1:3622655/1‑51 CTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATG > 1:3533034/1‑51 CTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATG < 1:4844010/51‑1 CTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATG > 1:1627729/1‑51 TTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTG > 1:3646603/1‑51 TTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTG > 1:146041/1‑51 TCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGC < 1:2216201/51‑1 CTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCC > 1:5451171/1‑51 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA > 1:694542/1‑51 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA > 1:620591/1‑51 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA < 1:2792036/51‑1 TTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCA > 1:2231025/1‑51 TACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAA < 1:4248604/51‑1 TACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAA < 1:6501891/51‑1 ACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAAC > 1:5787385/1‑51 GTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTT < 1:5716979/51‑1 TGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:1386694/51‑1 GCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:2637558/1‑51 CGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:4000280/51‑1 GCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:726021/1‑51 GCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:6388127/51‑1 GCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:5386413/1‑51 AAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:3116066/1‑51 GCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:664233/1‑51 GCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:199813/51‑1 CATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:1700478/51‑1 CATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:5696081/1‑51 TCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:5241355/51‑1 TCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1265472/51‑1 CTTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:7234107/50‑1 TTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:3747448/1‑51 TTATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:5556292/51‑1 TATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:3827313/1‑50 ATAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:2476302/1‑51 TAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:1950316/1‑51 TAAAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:4720485/1‑51 AAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:3180302/51‑1 AAGCAATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:1086039/51‑1 AATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:1419649/51‑1 ATAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:2962273/51‑1 TAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:854295/1‑51 TAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:5047595/1‑51 TAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:6908875/1‑51 TAAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:7004349/1‑51 AAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:6124716/51‑1 AAAGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:3591169/1‑51 AGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:1133486/51‑1 AGTTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:6545021/51‑1 TTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:1235209/1‑51 TTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:5381457/1‑51 TTTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:4433843/51‑1 TTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:3743954/1‑51 TTTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:3617764/51‑1 TTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAag < 1:2342080/51‑3 TTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:4646971/51‑1 TTTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:5510347/51‑1 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:1208914/51‑1 TTGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:484525/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:1116574/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:7028704/51‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:2549010/51‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:6845070/51‑1 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:5879490/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:1531255/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:4460109/1‑51 TGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:4659441/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:2678161/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:3599577/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:2183334/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:2082534/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:5137693/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:1926029/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:1794324/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:5710907/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:1592411/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:5039070/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:5036998/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4078636/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:6148450/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:141143/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:6350103/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:6351902/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:1335959/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:1241792/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:3005931/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:6547284/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:6598556/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:3953562/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:4970534/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:3017997/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4932307/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:3439774/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4885185/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:7110948/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:7113098/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:3441539/51‑1 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:724698/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:2505208/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:792276/1‑51 GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:4204303/1‑51 ACCACTCTCTTCTTACGTGCGCAAGCATCTTATAAAGCAATAAAGTTTTTg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4462614‑4462663‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < REL606/4506109‑4506059 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |