Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | ADP1‑WT | 2,726,455 | Δ1,268 bp | ACIAD2779–ACIAD2782 | ACIAD2779, ACIAD2780, ACIAD2781, ACIAD2782 |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | ADP1‑WT | 2726455 | 2727722 | 1268 | 30 [0] | [0] 30 | ACIAD2779–ACIAD2782 | ACIAD2779,ACIAD2780,ACIAD2781,ACIAD2782 |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | ADP1‑WT | = 2726454 | 0 (0.000) | 30 (0.860) | 28/250 | 0.3 | 100% | intergenic (‑741/+6) | ACIAD2778/ACIAD2779 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | ADP1‑WT | 2727723 = | 0 (0.000) | intergenic (‑186/+93) | ACIAD2782/ACIAD2783 | hypothetical protein/hypothetical protein |
TGCTATTTAAATTCTGGACTTGAGCAGCACTGCTGCGCAAGATAGCCTTTCCCTACATCTCCAAAGTTAACGTTACGTTATCTTTAGAGGGACCATGTGTCCATTATTTTGTCTAGGACCAGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCTTATTTATCACTTAATGATTAAACTATTTAGCAGTTAAAGATAAAAAAATTG > ADP1‑WT/2727602‑2727844 | tttgatgcgctacattaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCa > 1:140128‑M2/122‑126 (MQ=255) tgatgcgctacattaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAg < 2:353368‑M2/7‑1 (MQ=255) atgcgctacattaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTg < 2:208873‑M2/9‑1 (MQ=255) atgcgctacattaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTg > 1:72176‑M2/118‑126 (MQ=255) ctacattaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGtt > 2:480623‑M2/113‑126 (MQ=255) cattaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTAc < 1:355820‑M2/17‑1 (MQ=255) attaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACt < 1:192772‑M2/18‑1 (MQ=255) attaaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACt > 1:322528‑M2/109‑126 (MQ=255) aaaatcatcatcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGa < 1:400353‑M2/21‑1 (MQ=255) catcgatcattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACa > 2:495117‑M2/98‑126 (MQ=255) cattttactgtcatagttatcgcactattttatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATg > 1:48202‑M2/91‑126 (MQ=255) cattttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATg > 1:425396‑M2/91‑126 (MQ=255) ttttactgtcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAg > 2:19771‑M2/89‑126 (MQ=255) tcatagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTc < 2:142207‑M2/46‑1 (MQ=255) tagttatcgcactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCaat < 1:481312‑M2/49‑1 (MQ=255) cactatttgatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTaaa < 2:322080‑M2/58‑1 (MQ=255) gatcagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATAttagtt > 2:281448‑M2/61‑126 (MQ=255) gataagattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATAttagtt < 1:292675‑M2/66‑1 (MQ=255) gattacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCt < 1:231117‑M2/71‑1 (MQ=255) attacctcaccatttaatatctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCtt > 1:457658‑M2/55‑126 (MQ=255) ctgttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCTTATTTATCACTTAATGATTaa > 1:43040‑M2/35‑126 (MQ=255) gttgaggatgatactttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCTTATTTATCACTTAATGATTAAAc < 1:436686‑M2/94‑1 (MQ=255) 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tttcgactaactgagtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCTTATTTATCACTTAATGATTAAACTATTTAGCAGTTaa > 1:224286‑M2/19‑126 (MQ=255) gtagGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCTTATTTATCACTTAATGATTAAACTATTTAGCAGTTAAAGATAAAAAAATTg < 2:491706‑M2/122‑1 (MQ=255) | TGCTATTTAAATTCTGGACTTGAGCAGCACTGCTGCGCAAGATAGCCTTTCCCTACATCTCCAAAGTTAACGTTACGTTATCTTTAGAGGGACCATGTGTCCATTATTTTGTCTAGGACCAGTTCAAGTGGGGTTTACTGGATGCTTACAAAATATGAGCCTAACTCAATAATTTTAAATATTAGTTAGGCTTATTTATCACTTAATGATTAAACTATTTAGCAGTTAAAGATAAAAAAATTG > ADP1‑WT/2727602‑2727844 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |