Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL6063,268,9910T→G28.2% 18.43948ispBoctaprenyl diphosphate synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (11/0):  ref base (7/21):  total (18/21)

AAAATCAATGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTCCGA  >  REL606/3268956‑3269026
                                   |                                   
aaaaTCAATGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGgt                                     <  2:1011460/36‑1 (MQ=255)
 aaaACAATGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGgtg                                    <  1:3728262/36‑1 (MQ=255)
    tCAATGAGTTAACCTCGCAAGATATGGCGGGTGTTa                                 <  2:2063083/36‑1 (MQ=255)
     cAATGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTaa                                <  1:843930/36‑1 (MQ=255)
     cAATGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTaa                                <  1:1625903/36‑1 (MQ=255)
       aTGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGGGGTaaag                              >  1:2285490/1‑34 (MQ=37)
       aTGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGGGGTAAtt                              >  2:2405738/1‑35 (MQ=37)
        tGAGTTAACCGCGCGAGATATGGCGGGTGTTAATGc                             <  1:165663/36‑1 (MQ=255)
        tGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGc                             <  1:2098474/36‑1 (MQ=255)
         gAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGGGGTAATGCg                            >  1:1914887/1‑36 (MQ=37)
         gAGTCAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCg                            <  2:3198583/36‑1 (MQ=255)
          aGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCgg                           <  1:2162987/36‑1 (MQ=255)
          aGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGGGTTTATGTgg                           >  1:2264718/1‑36 (MQ=25)
           gTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGc                          <  2:211564/36‑1 (MQ=255)
           gTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGc                          <  2:1266688/36‑1 (MQ=255)
           gTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGc                          <  1:2513943/36‑1 (MQ=255)
              aaCCGCGCAAGATATGGCGGGGGTTAATTCAGCAAt                       >  2:199224/1‑36 (MQ=25)
              aaCCGCGCAAGATATGGCGGGGGTTAATGCGGGAAt                       >  1:2234045/1‑36 (MQ=37)
              aaCCGCGCAAGATATGGCGGGGGGTAATGCGGCaaa                       >  2:2077752/1‑35 (MQ=37)
               aCCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATc                      <  1:3045697/36‑1 (MQ=255)
               aCCGCGCAAGATATGGCGGGGGGTTATTCGGGAAtg                      >  1:2466926/1‑35 (MQ=12)
                ccGCGCAAGATATGGCGGGGGTTAATGCAGCAAttc                     >  2:828651/1‑34 (MQ=37)
                ccGCGCAAGATATGGCGGGGGGTAATTCGGCGAttc                     >  1:1654032/1‑34 (MQ=16)
                 cgcgCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCt                    <  1:1804451/36‑1 (MQ=255)
                   cgcAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTg                  <  1:3131820/36‑1 (MQ=255)
                   cgcAAGATATGGCGGGGGGTAATTGGGGCATCCttc                  >  2:685875/1‑35 (MQ=9)
                      aaGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGagc               <  1:416495/36‑1 (MQ=255)
                      aaGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGagc               <  2:2016799/36‑1 (MQ=255)
                      aaGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGagc               <  1:1180428/36‑1 (MQ=255)
                      aaGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGagc               <  2:2499968/36‑1 (MQ=255)
                       aGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGagca              <  1:3485566/36‑1 (MQ=255)
                         atatGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTTagcagc            >  2:2397477/1‑36 (MQ=255)
                         atatGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGagcagc            <  1:358241/36‑1 (MQ=255)
                            tGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTa         >  1:1435732/1‑36 (MQ=255)
                             ggCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTaa        >  2:1978619/1‑36 (MQ=255)
                              gCGGGTGTTAATGCGGCACTCCTTGAGCAGCTTAAt       >  2:3327570/1‑36 (MQ=255)
                              gCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAAt       >  2:2271363/1‑36 (MQ=255)
                                gggTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTc     <  2:2466728/36‑1 (MQ=255)
                                gggTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTc     <  2:222428/36‑1 (MQ=255)
                                gggTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTc     >  1:1100877/1‑36 (MQ=255)
                                 ggTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTcc    >  2:3468810/1‑36 (MQ=255)
                                  gtgtTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTCCg   <  2:2893607/36‑1 (MQ=255)
                                  gtgtTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTCCg   >  2:2915002/1‑36 (MQ=255)
                                  gtgtTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTCCg   >  2:1210032/1‑36 (MQ=255)
                                   tgtTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTCCGa  >  2:1574967/1‑36 (MQ=255)
                                   tgtTAATGCGGCAATCCTTCAGCAGCCTAATCccca  >  1:1447672/1‑34 (MQ=21)
                                   |                                   
AAAATCAATGAGTTAACCGCGCAAGATATGGCGGGTGTTAATGCGGCAATCCTTGAGCAGCTTAATTCCGA  >  REL606/3268956‑3269026

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 5 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 29 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG