Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL60692,3590G→T25.0% 14.040intergenic (+523/‑79)fruR/yabBDNA‑binding transcriptional dual regulator/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (10/0):  ref base (7/23):  total (17/23)

GGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTAAACTCCTTTCAG  >  REL606/92324‑92394
                                   |                                   
gggTTTTTTTCCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTg                                     <  1:1910015/36‑1 (MQ=255)
 ggTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGa                                    <  1:3601742/36‑1 (MQ=255)
  gTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGAc                                   <  2:893272/36‑1 (MQ=255)
   ttttttTCCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACa                                  <  1:957896/36‑1 (MQ=255)
     ttttACCTCGGTATGTCTTGTGACTGGCTTGACAAg                                <  2:2458842/36‑1 (MQ=255)
       ttAGCTCGGTATGCGTTGTGGGTGGCTTGACAAGCt                              <  1:3620468/36‑1 (MQ=19)
        tgccTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCtt                             <  1:2553121/34‑1 (MQ=255)
        tACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTTACCAACtt                             >  2:1461056/1‑36 (MQ=25)
        tACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCtt                             <  1:1648268/36‑1 (MQ=255)
         aCCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCttt                            <  2:1852862/36‑1 (MQ=255)
          ccTTGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCtttt                           <  2:1682940/36‑1 (MQ=255)
          ccTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTTACAAGCtttt                           >  1:200644/1‑36 (MQ=255)
          ccTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTTACAAACtttt                           >  2:2792239/1‑36 (MQ=37)
          ccTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCtttt                           <  2:1260289/36‑1 (MQ=255)
           cTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTTTCAAGCttttt                          >  1:3035023/1‑35 (MQ=37)
           cTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTTTCAAACTTTtc                          >  1:2462889/1‑36 (MQ=25)
            tCGGTATGCATTTTGACTGGCTTGACAAGCTTTtcc                         <  1:1248212/36‑1 (MQ=38)
             cGGTATGCCTTGTGACTGGCTTTTCAAGCTTTttct                        >  1:1925518/1‑36 (MQ=25)
             cGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTtcct                        <  1:2211226/36‑1 (MQ=255)
               gaaTGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTtcctcc                      <  1:439170/34‑1 (MQ=255)
               gTATGCCTTGTGACTGGCTTTTTAAGATTTtcttct                      >  1:1816476/1‑35 (MQ=16)
                 aTGCCTTGTGACTGGCTTTTCAAGCTTTTCctccgc                    >  2:1933674/1‑36 (MQ=37)
                  tGCCTTGTGACTGGCTTTACAAACCTTTCcccccct                   >  1:246974/1‑36 (MQ=12)
                  tGCCTTGTGACTGGCTTGTCAAGCTTTTCctccgct                   >  1:3571730/1‑36 (MQ=255)
                  tGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCctccgct                   <  2:386533/36‑1 (MQ=255)
                  tGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCctcccct                   >  2:3720822/1‑36 (MQ=255)
                    ccTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCctccgctcc                 <  2:1836713/36‑1 (MQ=255)
                     cTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCctccgctccg                <  1:2652269/36‑1 (MQ=255)
                     cTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCctccgctccg                <  2:2495915/36‑1 (MQ=255)
                     cTTGTGACTGGCTTGACAAACTTTTCctcccctccg                >  1:1092781/1‑36 (MQ=37)
                      ttGTGACTGGCTTTACAAGCTTTTCctccgctccgc               >  1:601276/1‑35 (MQ=255)
                      ttGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGt               <  1:2143722/36‑1 (MQ=255)
                       tgtgACTGGCTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTa              <  2:623197/36‑1 (MQ=255)
                       tgtgACTGGCTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTa              <  2:913819/36‑1 (MQ=255)
                           aCTGGCTTGTCAAGCTTTTTTTCCCCTCCGTTAACt          >  2:3492044/1‑36 (MQ=12)
                             tGGCTTGACAAGCTTTTTCTCCGCTCCGTAAACTcc        >  1:1124074/1‑36 (MQ=255)
                              ggCTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTAAACTCCt       <  1:400684/36‑1 (MQ=255)
                              ggCTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTAAACTCCt       <  1:1120924/36‑1 (MQ=255)
                                cTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTAAACTCCttt     <  1:1574291/36‑1 (MQ=255)
                                 ttGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTAAACTCCTTTc    >  2:1920762/1‑36 (MQ=255)
                                  tGACAAGCTTTTCCTTCGCTCCGTAAACTCCTTTCa   >  1:3512749/1‑36 (MQ=255)
                                   gACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTAAACTCCTTTCAg  <  2:1521847/36‑1 (MQ=255)
                                   |                                   
GGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAAGCTTTTCCTCCGCTCCGTAAACTCCTTTCAG  >  REL606/92324‑92394

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 5 ≤  ATCG  < 13 ≤  ATCG  < 27 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG