Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL606986,0540T→G33.3% 10.431597lpxKtetraacyldisaccharide 4'‑kinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (10/0):  ref base (5/15):  total (16/15)

TTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCT  >  REL606/986019‑986089
                                   |                                   
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ttAGAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgt                                     <  2:767682/36‑1 (MQ=255)
ttAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgt                                     <  2:1895555/36‑1 (MQ=255)
ttAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgt                                     <  1:1747650/36‑1 (MQ=255)
  aaaGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGgtgt                                   <  2:749269/36‑1 (MQ=255)
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        ggTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGGcccccc                             >  1:209149/1‑33 (MQ=37)
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           tGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAg                          <  1:3216860/36‑1 (MQ=255)
           tGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGGGTGCCTCGccg                          >  1:1934126/1‑34 (MQ=37)
           tGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGGGTCCCTCgggg                          >  2:3246888/1‑33 (MQ=37)
           tGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGGGTCCCTCGccc                          >  2:13226/1‑34 (MQ=38)
            gATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGc                         <  1:1381925/36‑1 (MQ=255)
             aTGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCg                        <  2:1014928/36‑1 (MQ=255)
               gCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGt                      <  1:2103095/36‑1 (MQ=255)
               gCGGTAATCGTCAACGGCGGGGGCCCCCGCCGccgg                      >  1:2272792/1‑33 (MQ=16)
                cGGTAATCGTCAACGGCGGCGGTCCCCACAGCgggg                     >  1:550368/1‑34 (MQ=9)
                 ggTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGa                    <  1:449225/36‑1 (MQ=255)
                   tAATCGTCAACGGCGGGGTCCCTCGCCGCGGTGgaa                  >  1:3616752/1‑36 (MQ=37)
                    aaTCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAAt                 <  1:596101/36‑1 (MQ=255)
                        gTCAACGGCGGGGTCCCTCGCAGCGGGGAAATcccc             >  2:2908746/1‑36 (MQ=37)
                          cAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCAt           <  2:2154817/36‑1 (MQ=255)
                          cAACGGCGGGGTCCCTCCCCGCGGGGGAATcccccc           >  2:39980/1‑34 (MQ=255)
                           aaCGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATg          <  1:2005365/36‑1 (MQ=255)
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                            aCGGCGGTGTCCCTCGCCGCGGTGGAATTCCCCTGc         >  2:2630109/1‑36 (MQ=19)
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                                cggTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATct     <  1:1545959/36‑1 (MQ=255)
                                cggTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATct     >  1:3671390/1‑36 (MQ=255)
                                 ggTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATctg    <  2:657387/36‑1 (MQ=255)
                                  gtgtCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATctgc   >  2:1986271/1‑36 (MQ=255)
                                   tgtCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATctgct  >  2:632205/1‑36 (MQ=255)
                                   tgtCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATctgct  >  1:1817024/1‑36 (MQ=255)
                                   |                                   
TTAAAGTCGGTTGATGCGGTAATCGTCAACGGCGGTGTCCCTCGCAGCGGTGAAATCCCCATGCATCTGCT  >  REL606/986019‑986089

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 5 ≤  ATCG  < 11 ≤  ATCG  < 25 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG