Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	REL606	3,155,168	G→A	G296S (GGC→AGC)	ebgR	DNA‑binding transcriptional repressor

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	REL606	3,155,168	0	G→A	100.0%	133.7	41	G296S (GGC→AGC)	ebgR	DNA‑binding transcriptional repressor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (16/24):  ref base (0/0):  total (17/24)

TGCGCATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGGGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGCCCGCGAT  >  REL606/3155136‑3155200                                 |                                 tgagcATCCATCCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCg                               <  1:555669/33‑1 (MQ=255) tGCGCATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCg                               >  1:5334315/1‑36 (MQ=255) tGCGCATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCg                               <  1:5415002/36‑1 (MQ=255)  gcgcATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGt                              <  1:4724296/36‑1 (MQ=255)  gcgcATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGt                              <  1:4920083/36‑1 (MQ=255)  gcgcATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGt                              >  1:5181428/1‑36 (MQ=255)   cgcATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGtt                             >  1:3310150/1‑36 (MQ=255)     cATCCATTCCGTGATGATGGGAAGTCAGTGTGTTaa                           >  1:6715393/1‑36 (MQ=21)     cATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTaa                           <  1:329052/36‑1 (MQ=255)      aTCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAAc                          <  1:6992962/36‑1 (MQ=255)       tgcATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAAcc                         <  1:2239197/34‑1 (MQ=37)       tCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAAcc                         <  1:3045423/36‑1 (MQ=255)       tCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAAcc                         <  1:1260370/36‑1 (MQ=255)       tCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAAcc                         >  1:6839045/1‑36 (MQ=255)          agtCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTgg                      <  1:2617028/34‑1 (MQ=37)          aTTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTgg                      <  1:4739248/36‑1 (MQ=255)          aTTCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTgg                      <  1:2136144/36‑1 (MQ=255)           ttCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGgt                     >  1:5825611/1‑36 (MQ=255)           ttCCGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGgt                     <  1:4127849/36‑1 (MQ=255)           taccGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGgt                     <  1:6593644/34‑1 (MQ=25)             ccGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGgtgt                   >  1:2335104/1‑36 (MQ=255)              cGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTa                  <  1:3156530/36‑1 (MQ=255)              cGAGATGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTa                  <  1:2015132/36‑1 (MQ=255)               gagaTGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTAt                 >  1:7467886/1‑36 (MQ=255)                agaTGATGGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATg                >  1:4016789/1‑36 (MQ=255)                  atgatgGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGaa              <  1:4616310/36‑1 (MQ=255)                  atgatgGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGaa              <  1:4221827/36‑1 (MQ=255)                  atgatgGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGaa              <  1:5392747/36‑1 (MQ=255)                  atgatgGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGaa              >  1:3078340/1‑36 (MQ=255)                   tgatgGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGaaa             <  1:3467659/36‑1 (MQ=255)                   tgatgGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGaaa             <  1:2342747/36‑1 (MQ=255)                     atgGGAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGaaaat           >  1:650901/1‑35 (MQ=37)                       gggAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGCACAAGc         >  1:1941697/1‑36 (MQ=21)                       gggAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGc         <  1:7017377/36‑1 (MQ=255)                       gggAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGc         >  1:591960/1‑36 (MQ=255)                       gggAAGTCAGAGCGCTAACCTGGTGTATGAAAAAga         >  1:1360894/1‑35 (MQ=25)                        ggAAGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGcc        <  1:1906079/36‑1 (MQ=255)                           aGTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGccccc     >  1:2743160/1‑34 (MQ=25)                            gTCAGAGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGCCcgcg    <  1:10211/36‑1 (MQ=255)                              cAGAGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGCCCGCGAt  >  1:1780789/1‑36 (MQ=255)                              cAGAGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGCCCGCGAt  >  1:7168005/1‑36 (MQ=255)                                 |                                 TGCGCATCCATTCCGAGATGATGGGAAGTCAGGGCGTTAACCTGGTGTATGAAAAAGCCCGCGAT  >  REL606/3155136‑3155200 Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 9 ≤  ATCG  < 19 ≤  ATCG  < 30 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG