Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL606964,8050A→G25.0% 13.061M162V (ATT→GTT) ycaMpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (15/0):  ref base (13/32):  total (29/32)

TGAAATCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTATGTGGCG  >  REL606/964770‑964840
                                   |                                   
tGAAATCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGa                                     <  1:6523589/36‑1 (MQ=255)
 gAAATCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGAt                                    <  1:4525556/36‑1 (MQ=255)
 gAAATCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGAt                                    <  1:3733495/36‑1 (MQ=255)
  aaaTCGCAGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGAtt                                   <  1:7004286/36‑1 (MQ=255)
    aTCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGGTGGGTTTgt                                 >  1:7410136/1‑35 (MQ=21)
    aTCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGAtttc                                 >  1:4740530/1‑34 (MQ=255)
    aTCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGc                                 <  1:1258269/36‑1 (MQ=255)
     tCGCTGGAAAGCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCt                                <  1:290232/36‑1 (MQ=25)
     tCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGttatt                                >  1:604957/1‑33 (MQ=25)
      cGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTgttt                               >  1:1053490/1‑33 (MQ=25)
       gCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTTCttt                              >  1:7468165/1‑34 (MQ=21)
       gCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTGCttt                              >  1:5462121/1‑34 (MQ=25)
       gCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGAGTGCttt                              >  1:3690634/1‑34 (MQ=25)
        cTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTTGTAtg                             >  1:2238449/1‑36 (MQ=21)
        cTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTTCTAtg                             >  1:4172479/1‑36 (MQ=25)
          gAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTTCTAtttt                           >  1:1454435/1‑36 (MQ=21)
          gAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTGCTAtgtt                           >  1:3387981/1‑36 (MQ=255)
          gAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgtt                           <  1:3182301/36‑1 (MQ=255)
           aaatTCGTTGGTTCTGTGGGAGGGATTGCTAtgttt                          <  1:2894868/36‑1 (MQ=255)
           aaaaTCGTCGGTTCTGTGGCTGGGGTTTTTTtgttt                          >  1:5970154/1‑36 (MQ=12)
           aaaaTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTGCTTttttt                          >  1:2702527/1‑36 (MQ=21)
            agaTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgtttg                         <  1:2439375/34‑1 (MQ=255)
            aaaTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGCTTCTAtgtttt                         >  1:3669376/1‑35 (MQ=21)
            aaaCCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgtttg                         <  1:3631667/36‑1 (MQ=255)
             aaTCGTCGGTTCTGTGGCCGGGGTTGCTTtttttgt                        >  1:2297416/1‑36 (MQ=18)
             aaTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTTCTTttttttt                        >  1:6438184/1‑34 (MQ=17)
             aaTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGGTTGCTAtgttttt                        >  1:5890480/1‑34 (MQ=25)
             aaTCGGCGGTTCGGGGGCAGGGATTGCTAtgtttgt                        <  1:3066341/36‑1 (MQ=255)
              aTCGTTGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgtttgtt                       <  1:5594858/36‑1 (MQ=255)
              aTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgtttgtt                       <  1:1418652/36‑1 (MQ=255)
              aTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgtttgtt                       <  1:3185971/36‑1 (MQ=255)
              aTCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgtttgtt                       <  1:3380639/36‑1 (MQ=255)
              aTCGGCGGTTCTGTGGCATGGATTGCTAtgtttgtt                       <  1:1428986/36‑1 (MQ=25)
               tcgtcgGTTCTGTGGCAGGGATTGCTAtgttttttt                      >  1:5870325/1‑35 (MQ=255)
               tcgtcgGTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTa                      <  1:2479177/36‑1 (MQ=255)
                cgtcgGTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTAt                     <  1:5656494/36‑1 (MQ=255)
                cgtcgGTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTAt                     <  1:6822545/36‑1 (MQ=255)
                cgtcgGTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTAt                     <  1:3502802/36‑1 (MQ=255)
                 gtcgGTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATg                    <  1:2954495/36‑1 (MQ=255)
                    ggTTCTGTGGCAGGGATGGCTATGTTTGTTATGTCg                 <  1:7189007/36‑1 (MQ=255)
                     gTTCTGTGGCGAGGATTGCTATGTTGTTTATTTCGc                <  1:144873/36‑1 (MQ=12)
                     gTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGc                <  1:147076/36‑1 (MQ=255)
                     gTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGc                <  1:3370905/36‑1 (MQ=255)
                      ttCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATATCGCt               >  1:5513497/1‑36 (MQ=255)
                      ttCTGTGGCAGGGATTGCTAAGTTTGTTATTTCGCt               >  1:6696263/1‑36 (MQ=25)
                          gtgGCAGGGGTTGCTATGTTTGTTATTTCGCTCCTg           >  1:5741668/1‑36 (MQ=25)
                          gtgGCAGGGATTGCTTTGTTTTTTATGTCGCTCCtt           >  1:5378334/1‑35 (MQ=25)
                          gtgGCAGGGATTGCTATGTTTTTTTTTTTGCTCCtt           >  1:1545877/1‑35 (MQ=18)
                          gtgGCAGGGATTGCTATGTTTTTTATGTCGCTCCtt           >  1:5005151/1‑35 (MQ=37)
                          gtgGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCtt           >  1:3628290/1‑35 (MQ=255)
                          gtgGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTg           >  1:5387619/1‑36 (MQ=255)
                           tgGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGCCGCTCCttt          >  1:537320/1‑34 (MQ=25)
                           tagCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGt          <  1:6816737/34‑1 (MQ=255)
                            ggCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTa         <  1:243024/36‑1 (MQ=255)
                             gCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTAt        <  1:6694016/36‑1 (MQ=255)
                             gCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTAt        <  1:2079329/36‑1 (MQ=255)
                              cAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTAtg       >  1:4101834/1‑36 (MQ=255)
                               aGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTAtgt      <  1:1882612/36‑1 (MQ=255)
                               aGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTAtgt      >  1:3445778/1‑36 (MQ=255)
                               aGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTAtgt      <  1:3575101/36‑1 (MQ=255)
                                  gATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTATGTGGc   <  1:6640639/36‑1 (MQ=255)
                                  gATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTATGTGGc   <  1:6926148/36‑1 (MQ=255)
                                   aTTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTATGTGGCg  >  1:3192455/1‑36 (MQ=255)
                                   |                                   
TGAAATCGCTGAAAATCGTCGGTTCTGTGGCAGGGATTGCTATGTTTGTTATGTCGCTCCTGTATGTGGCG  >  REL606/964770‑964840

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 5 ≤  ATCG  < 13 ≤  ATCG  < 27 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG