New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1213353 | 36 (0.350) | 4 (0.060) | 3/30 | NT | 9.5% | intergenic (‑85/+136) | ycgX/ycgE | hypothetical protein/predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
? | REL606 | = 4512602 | 54 (0.840) | coding (720/747 nt) | yjhP | predicted methyltransferase |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATCTG > REL606/1213319‑1213387 | gTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTG < 1:9450839‑M1/35‑1 (MQ=255) gTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTG > 1:18732431‑M1/1‑35 (MQ=255) gTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTG < 1:17006481‑M1/35‑1 (MQ=255) gTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTG > 1:4142191‑M1/1‑35 (MQ=255) gTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTG < 1:11696163‑M1/35‑1 (MQ=255) ttttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGg > 1:9040781‑M1/1‑34 (MQ=255) ttttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGg > 1:17512850‑M1/1‑34 (MQ=255) tttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCtgtg < 1:19656835/35‑1 (MQ=255) tttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCtgtg < 1:19827218/35‑1 (MQ=255) tttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCtgtg < 1:2929411/35‑1 (MQ=255) tttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCtgtg < 1:14838529/35‑1 (MQ=255) tttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgg > 1:18101977‑M1/1‑33 (MQ=255) tttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgg > 1:8317961‑M1/1‑33 (MQ=255) ttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGggg > 1:12367271‑M1/1‑32 (MQ=255) ttACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGa < 1:8212180/35‑1 (MQ=255) tACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgggg > 1:3003153‑M1/1‑31 (MQ=255) aCCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGggggg > 1:10282912‑M1/1‑30 (MQ=255) aCCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGggggg > 1:13666154‑M1/1‑30 (MQ=255) aCCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGata < 1:10103283/35‑1 (MQ=255) aCCACTTAAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGata < 1:5590768/35‑1 (MQ=255) ccACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgggggt > 1:16098677‑M1/1‑29 (MQ=255) ccACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgggggg > 1:4211252‑M1/1‑29 (MQ=255) cACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgggggtg > 1:1996850‑M1/1‑28 (MQ=255) aCTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgggggtgg > 1:10349426‑M1/1‑27 (MQ=255) aCTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGt < 1:12311347/35‑1 (MQ=255) cTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGgggggtgtt > 1:32446‑M1/1‑26 (MQ=255) cTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTa < 1:3813742/35‑1 (MQ=255) cTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTa < 1:16029583/35‑1 (MQ=255) ttCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTAc < 1:4546969/35‑1 (MQ=255) tCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACa < 1:2450727/35‑1 (MQ=255) tCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACa < 1:15020623/35‑1 (MQ=255) cAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACag < 1:15867335/35‑1 (MQ=255) cAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACag < 1:2150729/35‑1 (MQ=255) cAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACag < 1:16495093/35‑1 (MQ=255) cAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACag < 1:19683596/35‑1 (MQ=255) cAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACag < 1:8951114/35‑1 (MQ=255) aTCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACagag < 1:5870616/35‑1 (MQ=255) aTCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACagag < 1:13457509/35‑1 (MQ=255) aTCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACagag < 1:4839200/35‑1 (MQ=255) tCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAgt < 1:2283322/35‑1 (MQ=255) ggTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGtgtg < 1:13031413/35‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGAt < 1:19368095/35‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGAt < 1:1147911/35‑1 (MQ=255) tGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATag < 1:19308537/35‑1 (MQ=255) tGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATag < 1:1003191/35‑1 (MQ=255) gTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATaga < 1:15169932/35‑1 (MQ=255) gTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATaga < 1:16268283/35‑1 (MQ=255) tCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATagag < 1:9533794/35‑1 (MQ=255) ccTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAgg < 1:2163937/35‑1 (MQ=255) ntttGNNTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAggg < 1:14466753/34‑1 (MQ=255) cTTTGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggt > 1:17150137‑M1/1‑9 (MQ=255) cTTTGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggt < 1:1856579‑M1/35‑27 (MQ=255) cTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAggg < 1:16358173/35‑1 (MQ=255) tttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggta < 1:5199706‑M1/35‑28 (MQ=255) tttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggta > 1:16371884‑M1/1‑8 (MQ=255) tttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggta < 1:3006353‑M1/35‑28 (MQ=255) tttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggta > 1:2490115‑M1/1‑8 (MQ=255) tttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggta > 1:15825540‑M1/1‑8 (MQ=255) tttGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGa < 1:14092314/35‑1 (MQ=255) tttGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGa < 1:96794/35‑1 (MQ=255) ttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaa < 1:3146775‑M1/35‑29 (MQ=255) ttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaa > 1:20471189‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaa < 1:17492339‑M1/35‑29 (MQ=255) ttGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaa < 1:17531671‑M1/35‑29 (MQ=255) ttGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGaa < 1:20018746/35‑1 (MQ=255) tGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtgac < 1:11084962‑M1/35‑30 (MQ=255) tGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaac < 1:5131829‑M1/35‑30 (MQ=255) tGGCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaac < 1:4515790‑M1/35‑30 (MQ=255) ggCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaaca > 1:2235557‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaaca > 1:17552912‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAata < 1:16102430/35‑1 (MQ=255) ggCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAata < 1:10240056/35‑1 (MQ=255) ggCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAata < 1:10159200/35‑1 (MQ=255) gCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaa < 1:8188745‑M1/35‑32 (MQ=255) gCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaa < 1:741177‑M1/35‑32 (MQ=255) gCTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggcaacaa > 1:5145869‑M1/1‑4 (MQ=255) gCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAatat < 1:14152611/35‑1 (MQ=255) gCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAatat < 1:18933903/35‑1 (MQ=255) gCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAatat > 1:6367181/1‑35 (MQ=255) cttggggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaa < 1:17040178‑M1/33‑32 (MQ=255) cTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaac > 1:2667439‑M1/1‑3 (MQ=255) cTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaac < 1:10387968‑M1/35‑33 (MQ=255) cTGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaac > 1:5714748‑M1/1‑3 (MQ=255) cTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATc > 1:4065674/1‑35 (MQ=255) cTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATc > 1:14648706/1‑35 (MQ=255) cTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATc > 1:7078946/1‑35 (MQ=255) tgtgATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATCt < 1:15767629/35‑1 (MQ=255) tgtgATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATCt < 1:9615557/35‑1 (MQ=255) tGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaaca < 1:9915432‑M1/35‑34 (MQ=255) tGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaaca > 1:5432708‑M1/1‑2 (MQ=255) tGgggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaaca < 1:17947690‑M1/35‑34 (MQ=255) gtgATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATCTg > 1:10380092/1‑35 (MQ=255) gtgATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATCTg < 1:1213507/35‑1 (MQ=255) gtgATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATCTg > 1:3531500/1‑35 (MQ=255) ggggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaacag > 1:7700004‑M1/1‑1 (MQ=255) ggggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaacag < 1:11242715‑M1/35‑35 (MQ=255) ggggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaacag < 1:3451034‑M1/35‑35 (MQ=255) ggggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaacag > 1:15583823‑M1/1‑1 (MQ=255) ggggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaacag > 1:18204880‑M1/1‑1 (MQ=255) ggggcgtgttcgcactcatcgcccggtaacaacag > 1:17972211‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTTTTACCACTTCAATCTGGTCTGTCCTTTGGCTGTGATATGTACAGAGTGTGATAGAGGGAATATCTG > REL606/1213319‑1213387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |