Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
JC JC REL606 3,517,306 IS186 (+) +8 bp :: Δ2 56.2% coding (187‑194/1743 nt) ggt ← gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 590715 =NA (NA)34 (0.380) 22/42 NT 41.2% noncoding (1/1343 nt) IS186 repeat region
?REL606 = 3517313 30 (0.540)coding (187/1743 nt) ggt gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor
* ? REL606 = 2774194NA (NA)52 (0.530) 28/46 NT 47.8% noncoding (1341/1343 nt) IS186 repeat region
?REL606 3517306 = 37 (0.580)coding (194/1743 nt) ggt gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  REL606/590748‑590715
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG  <  REL606/3517313‑3517280
                                                                    
gcAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:18369907/3‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:8700527/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:1805733/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:18274391/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:7573233/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:18454627/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:11894568/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:16083454/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:20411102/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:6283330/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:15721208/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   <  1:3072927/35‑1
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:12636948/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   <  1:14463875/35‑1
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   >  1:1307534/1‑35
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGATTATGGGG                                   <  1:4533329/35‑1
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCCCTTATGGGG                                   >  1:3793453/1‑35
GTAATACCACAAACCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG                                   <  1:17773658/35‑1
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:82570/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:17412133/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  <  1:18115747/35‑1
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:16691976/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  <  1:6797719/35‑1
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:12033125/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:12128879/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:12330806/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:12539629/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:3177414/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:14664863/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  <  1:344730/35‑1
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  >  1:6204484/1‑35
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  <  1:1432429/35‑1
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  <  1:5351044/35‑1
 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT                                  <  1:13900480/35‑1
  AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTG                                 <  1:7667328/35‑1
   ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGG                                <  1:2817891/35‑1
   ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGG                                <  1:997184/35‑1
    TACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGA                               >  1:6953146/1‑35
    TACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGA                               <  1:5067338/35‑1
     ACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGAT                              >  1:1929876/1‑35
     ACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGAT                              <  1:10642343/35‑1
      CCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATA                             >  1:18920703/1‑35
        ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATC                           >  1:13479754/1‑35
         CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCC                          <  1:2973370/35‑1
          AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT                         >  1:20601331/1‑35
          AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT                         <  1:7113858/35‑1
          AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT                         >  1:16201984/1‑35
          AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT                         <  1:15805813/35‑1
           ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGTGTGGATATCCTC                        >  1:4357556/1‑35
            CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTaa                       <  1:18729316/35‑3
            CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCA                       <  1:3060388/35‑1
            CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCA                       <  1:17019764/35‑1
             CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAA                      <  1:14508016/35‑1
             CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAA                      >  1:3933592/1‑35
              CTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAG                     <  1:19629749/35‑1
              CTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAG                     <  1:6280463/35‑1
               TTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGG                    >  1:15575749/1‑35
               TTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGG                    >  1:501666/1‑35
               TTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGG                    >  1:12164065/1‑35
                TAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGA                   <  1:1019598/35‑1
                 AAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAG                  >  1:4709469/1‑35
                 AAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAG                  >  1:13961865/1‑35
                 AAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAG                  >  1:10404178/1‑35
                    TTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGC               >  1:9663542/1‑35
                     TAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCG              >  1:17569871/1‑35
                     TAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCG              >  1:17045165/1‑35
                      AGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGG             <  1:18074974/35‑1
                      AGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGG             <  1:12713030/35‑1
                       GCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGG            <  1:11711293/35‑1
                        CGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGA           <  1:3514298/35‑1
                         GCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAA          >  1:6922249/1‑35
                         GCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAA          >  1:12637207/1‑35
                         GCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAA          <  1:19654505/35‑1
                          CTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAAT         <  1:11341830/35‑1
                          CTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAAT         <  1:9568272/35‑1
                           TTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATG        <  1:1994146/35‑1
                            TATGGGTTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC       >  1:13961622/1‑35
                            TATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC       <  1:4673412/35‑1
                            TATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC       <  1:5854005/35‑1
                            TATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC       >  1:2863110/1‑35
                             ATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCC      >  1:830201/1‑35
                             ATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCC      >  1:6919031/1‑35
                              TGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCa     <  1:7353114/35‑2
                              TGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCG     >  1:16231546/1‑35
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    >  1:1642104/1‑35
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    <  1:18107108/35‑1
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    >  1:9112408/1‑35
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    >  1:18853787/1‑35
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    <  1:5255628/35‑1
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    >  1:5252657/1‑35
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    >  1:5201790/1‑35
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    <  1:1575225/35‑1
                               GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT    <  1:2935386/35‑1
                                GGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTT   <  1:104475/35‑1
                                GGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTT   >  1:2106486/1‑35
                                 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG  <  1:7022537/35‑1
                                 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG  <  1:10623334/35‑1
                                 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG  >  1:20502643/1‑35
                                 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG  <  1:4463450/35‑1
                                 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG  <  1:14856814/35‑1
                                                                    
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  REL606/590748‑590715
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG  <  REL606/3517313‑3517280

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.