New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 294204 = | 76 (0.740) | 6 (0.070) | 3/38 | NT | 10.8% | intergenic (+474/‑53) | ykgD/ykgE | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted oxidoreductase |
? | REL606 | = 2574914 | 39 (0.480) | intergenic (+756/+62) | sseA/sseB | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase/rhodanase‑like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate |
ATAATAACCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGCC > REL606/2574881‑2574948 | ataataACCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTg < 1:16887462‑M2/35‑2 (MQ=255) ataataACCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTg > 1:8075755‑M2/1‑34 (MQ=255) ataataACCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTg > 1:9205534‑M2/1‑34 (MQ=255) ataataACCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTg > 1:20457041‑M2/1‑34 (MQ=255) taataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTgg < 1:5248395‑M2/35‑3 (MQ=255) taataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTgg < 1:14193213‑M2/35‑3 (MQ=255) atctaaccgGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTgg > 1:10838360‑M2/4‑33 (MQ=255) aataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACttgt > 1:18892306/1‑35 (MQ=255) aataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggt < 1:4752067‑M2/35‑4 (MQ=255) aataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggt < 1:14252286‑M2/35‑4 (MQ=255) ataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtg < 1:19160850‑M2/35‑5 (MQ=255) ataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtg > 1:3449838‑M2/1‑31 (MQ=255) ataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtg < 1:8847384‑M2/35‑5 (MQ=255) ataaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtg > 1:9203392‑M2/1‑31 (MQ=255) taaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtgg > 1:10772502‑M2/1‑30 (MQ=255) aaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtggt < 1:5962818/35‑1 (MQ=255) aaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtggt < 1:5888106/35‑1 (MQ=255) aaCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtggg < 1:15218677‑M2/35‑7 (MQ=255) aCCGGGGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGtt < 1:7006298/35‑1 (MQ=255) aCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtgggg < 1:12226152‑M2/35‑8 (MQ=255) aCCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGtt < 1:1085865/35‑1 (MQ=255) aCCGGAGTATCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGtt < 1:11772424/35‑1 (MQ=255) ccGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtggggg < 1:652926‑M2/35‑9 (MQ=255) ccGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTa < 1:19878649/35‑1 (MQ=255) cGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtgggggg < 1:9264673‑M2/35‑10 (MQ=255) ggAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtggggggg < 1:11719300‑M2/35‑11 (MQ=255) ggAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtgggggga < 1:16044502‑M2/35‑11 (MQ=255) ggAGTCTCTCCGGAGACAATTTACTGGTGGTTaac < 1:20339306/35‑1 (MQ=255) gAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtgggggggg < 1:13285518‑M2/35‑12 (MQ=255) gAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtgggggaga < 1:9563628‑M2/35‑12 (MQ=255) gAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTaaca < 1:7706109/35‑1 (MQ=255) gAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTaaca < 1:6938457/35‑1 (MQ=255) gAGTCTATCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTaaca < 1:589064/35‑1 (MQ=255) nGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtggggggaga < 1:10611803‑M2/35‑13 (MQ=255) aGTCTCTCCGGCGACAATTTACTggtgggggggaa < 1:11868187‑M2/35‑13 (MQ=255) aGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTaacaa < 1:8395279/35‑1 (MQ=255) gTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTaacaac < 1:15832047/35‑1 (MQ=255) gTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTaacaac < 1:11660846/35‑1 (MQ=255) gTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTaacaac < 1:13213176/35‑1 (MQ=255) tctctcCGGCTACAATTTACTggtgggggggaaac < 1:2817470‑M2/35‑15 (MQ=255) tctctcCGGCGACAATTTACTggtgggggggaaac < 1:4171774‑M2/35‑15 (MQ=255) tctctcCGGCGACAATTTACTggtggggggcaaaa < 1:9226844‑M2/35‑15 (MQ=255) tctctcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAAcc < 1:6918343/35‑1 (MQ=255) tctctcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAAcc < 1:18841804/35‑1 (MQ=255) ctctcCGGCGACAATTTACTggtgggggggaaaca < 1:2815950‑M2/35‑16 (MQ=255) ctctcCGGCGACAATTTACTggtgggggagaaacc < 1:16335979‑M2/35‑16 (MQ=255) ctctcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCt < 1:7966367/35‑1 (MQ=255) ctctcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCt < 1:18523205/35‑1 (MQ=255) ctctcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCt < 1:7698008/35‑1 (MQ=255) tctcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCtt < 1:3636150/35‑1 (MQ=255) tctcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCtt < 1:4930015/35‑1 (MQ=255) tcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCa < 1:20215234/35‑1 (MQ=255) tcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCa < 1:19179586/35‑1 (MQ=255) tcCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCa < 1:10644450/35‑1 (MQ=255) ccGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCag < 1:5621908/35‑1 (MQ=255) cGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCaga < 1:1110159/35‑1 (MQ=255) cGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCaga < 1:4699435/35‑1 (MQ=255) cGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCaga < 1:16935371/35‑1 (MQ=255) ggCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCagag < 1:1030323/35‑1 (MQ=255) gCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGagc < 1:6645710/35‑1 (MQ=255) cGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGagca < 1:2596413/35‑1 (MQ=255) cGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGagca < 1:14887066/35‑1 (MQ=255) gNCAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGagcan < 1:15622328/35‑1 (MQ=255) gACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGagcag < 1:14498479/35‑1 (MQ=255) gACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGagcag < 1:15487104/35‑1 (MQ=255) aCAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGagcagc < 1:5847838/35‑1 (MQ=255) cAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAgcagca < 1:6264347/35‑1 (MQ=255) cAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAgcagca < 1:9156647/35‑1 (MQ=255) cAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTAAGAgcagca < 1:15696950/35‑1 (MQ=255) aaTTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCaa < 1:17842839/35‑1 (MQ=255) aaTTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCaa < 1:11023332/35‑1 (MQ=255) aaTTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCaa < 1:10570888/35‑1 (MQ=255) aTTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAg < 1:7916359/35‑1 (MQ=255) aTTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAg < 1:1976177/35‑1 (MQ=255) aTTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAg < 1:9811072/35‑1 (MQ=255) tttACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGt < 1:6422197/35‑1 (MQ=255) ttACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTa < 1:8898270/35‑1 (MQ=255) cTGGTGTTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGc < 1:18137186/35‑1 (MQ=255) cTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGc > 1:838772/1‑35 (MQ=255) cTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGc > 1:20560270/1‑35 (MQ=255) cTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGc > 1:4516512/1‑35 (MQ=255) tggtggTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGcc > 1:18293664/1‑35 (MQ=255) tggtggTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGcc < 1:1091053/35‑1 (MQ=255) | ATAATAACCGGAGTCTCTCCGGCGACAATTTACTGGTGGTTAACAACCTTCAGAGCAGCAAGTAAGCC > REL606/2574881‑2574948 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |