New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1924962 = | 56 (0.540) | 10 (0.100) | 4/48 | NT | 12.3% | intergenic (‑216/‑59) | ruvA/yebB | Holliday junction DNA helicase motor protein/hypothetical protein |
? | REL606 | = 2078183 | 86 (0.840) | coding (1712/3306 nt) | yegE | predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
ATCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGAGAAG > REL606/2078149‑2078217 | aTCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAt < 1:7809662/35‑1 (MQ=255) aTCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAt < 1:9604822/35‑1 (MQ=255) aTCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAt < 1:14842073/35‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATg < 1:10053594/35‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATg < 1:10523423/35‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATg < 1:8304455/35‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATg < 1:11766537/35‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATg < 1:4122188/35‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATg < 1:20372777/35‑1 (MQ=255) cGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGa < 1:19513968/35‑1 (MQ=255) gttGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGaa < 1:1883707/33‑1 (MQ=255) ggTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGaa < 1:6877595/35‑1 (MQ=255) ggTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGaa < 1:5430084/35‑1 (MQ=255) ggTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaa < 1:17291426‑M2/35‑4 (MQ=255) gTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGaaa < 1:17835361/35‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaa < 1:8758845‑M2/35‑5 (MQ=255) tGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGaaaa < 1:13822810/35‑1 (MQ=255) tGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGaaaa < 1:20128038/35‑1 (MQ=255) tGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGaaaa < 1:5715208/35‑1 (MQ=255) tGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaaa < 1:18675770‑M2/35‑6 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAAt < 1:10468948/35‑1 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAAt < 1:990231/35‑1 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaaaa < 1:18501860‑M2/35‑7 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaaaa < 1:9870383‑M2/35‑7 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaaaa < 1:14781394‑M2/35‑7 (MQ=255) gAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAGaaaaa > 1:13886617/1‑34 (MQ=255) aaGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGACGaaaaat > 1:10892096/1‑33 (MQ=37) aGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaaaata < 1:14398271‑M2/35‑9 (MQ=255) aGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAAaaaaaaa > 1:2278240/1‑32 (MQ=25) gCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTAc < 1:10147662/35‑1 (MQ=255) gCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTAc < 1:5095452/35‑1 (MQ=255) gCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTAc < 1:6097094/35‑1 (MQ=255) ccGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTAcc < 1:10047913/35‑1 (MQ=255) ccGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTAcc < 1:11278674/35‑1 (MQ=255) ccGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaaaataac < 1:4708753‑M2/35‑11 (MQ=255) cGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCt < 1:14686009/35‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAAAAAAATAACt > 1:15933490/1‑35 (MQ=16) cGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAAAAAAATAACt > 1:14477212/1‑35 (MQ=16) cGTGGTCTGTATTGATATGGCGAAAAAAAATAACt > 1:16972041/1‑35 (MQ=16) gTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCtt < 1:12784017/35‑1 (MQ=255) gTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCtt < 1:10997889/35‑1 (MQ=255) gTGGTCTGTATTGATATGGCGAAaaaaaataaatt < 1:19771840‑M2/35‑13 (MQ=255) gTGGTCTGTATTGATATGGCGAAAAAAAATACCtt > 1:5340812/1‑35 (MQ=25) tGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCttt < 1:7662349/35‑1 (MQ=255) tGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCttt < 1:14796192/35‑1 (MQ=255) tGGTCTGTATTGATATGGCGAAAAAAAATAACttt > 1:13484750/1‑35 (MQ=16) ggTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTa < 1:16300543/35‑1 (MQ=255) ggTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTa < 1:10372168/35‑1 (MQ=255) gTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTAt < 1:221246/35‑1 (MQ=255) gTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTAt < 1:6400742/35‑1 (MQ=255) gTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTAt < 1:4345852/35‑1 (MQ=255) gTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTAt < 1:975965/35‑1 (MQ=255) tCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATg < 1:1992520/35‑1 (MQ=255) cTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGa < 1:17348323/35‑1 (MQ=255) cTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGa < 1:7738689/35‑1 (MQ=255) tGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGaa < 1:6929751/35‑1 (MQ=255) gTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAAt < 1:17652088/35‑1 (MQ=255) gTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAAt < 1:17182987/35‑1 (MQ=255) gTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAAt < 1:15507537/35‑1 (MQ=255) gTATTGATATGGCGATGAAAATTACATTTATGAAt < 1:20509114/35‑1 (MQ=255) tATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATc < 1:10575275/35‑1 (MQ=255) tATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATc < 1:6431363/35‑1 (MQ=255) tATTGATATGGAGATGAAAATTACCTTTATGAATc < 1:3561828/35‑1 (MQ=255) aTTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATcc < 1:6755546/35‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCa < 1:17359119/35‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCa < 1:15942558/35‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCa < 1:2497583/35‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATACa < 1:16563906/35‑1 (MQ=255) gATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGt < 1:17438977/35‑1 (MQ=255) gATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGt < 1:4524828/35‑1 (MQ=255) gATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGt < 1:2702242/35‑1 (MQ=255) gATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGt < 1:19829135/35‑1 (MQ=255) atatGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTg < 1:11996754/35‑1 (MQ=255) atatGGCGATGAAAATTAACTTTATGAATCCAGTg > 1:15147272/1‑35 (MQ=255) atatGGAGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTg < 1:17892205/35‑1 (MQ=255) tatGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg < 1:6574385/35‑1 (MQ=255) tatGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg < 1:1920062/35‑1 (MQ=255) atGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGc < 1:1145009/35‑1 (MQ=255) atGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGc < 1:12659925/35‑1 (MQ=255) tGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCg < 1:19023630/35‑1 (MQ=255) ggCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCgg > 1:6869353/1‑35 (MQ=255) ggCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCgg > 1:6070510/1‑35 (MQ=255) gCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCggg > 1:17829659/1‑34 (MQ=255) gCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGga > 1:15727512/1‑35 (MQ=255) gCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGga < 1:17001066/35‑1 (MQ=255) gCGATGAAAATTAACTTTATGAATCCAGTGGCGga < 1:660106/35‑1 (MQ=255) cGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCgggg > 1:11210359/1‑33 (MQ=255) cGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCgggg > 1:16742089/1‑33 (MQ=255) cGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCggcg > 1:18201130/1‑33 (MQ=255) cGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGgag < 1:8207309/35‑1 (MQ=255) gATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCggggg > 1:7820756/1‑32 (MQ=255) gATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGggga > 1:8565066/1‑35 (MQ=255) gATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTCGCGgaga > 1:401997/1‑35 (MQ=255) aTGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGggaa > 1:12161980/1‑35 (MQ=255) aTGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGggaa > 1:16761996/1‑35 (MQ=255) aTGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGggaa > 1:13203901/1‑35 (MQ=255) aTGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGagaa < 1:18698673/35‑1 (MQ=255) tGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGggaag > 1:15075703/1‑35 (MQ=255) tGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGagaag < 1:3625793/35‑1 (MQ=255) tGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGagaag > 1:14721198/1‑35 (MQ=255) | ATCGGTGAAGCCGTGGTCTGTATTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGGCGGAGAAG > REL606/2078149‑2078217 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |