New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3483684 = | 62 (0.600) | 11 (0.140) | 5/36 | NT | 15.9% | coding (2000/2706 nt) | malT | transcriptional regulator MalT |
? | REL606 | = 3677027 | 70 (0.910) | coding (478/987 nt) | yiaO | predicted transporter |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CGGGTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTAAA > REL606/3483650‑3483718 | gatgtcaccaactcgcgcgcaccggttaaaacccc > 1:8136435‑M1/35‑35 (MQ=255) cGGGTTATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgc > 1:19762564/1‑35 (MQ=255) cGGGTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgc < 1:16521580/35‑1 (MQ=255) cGGGTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgc < 1:18188296/35‑1 (MQ=255) cGGGTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgc > 1:5756606/1‑35 (MQ=255) cGGGTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgc < 1:519204/35‑1 (MQ=255) cGGGGGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgc > 1:2993873/1‑35 (MQ=255) gggTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgcc < 1:538958/35‑1 (MQ=255) gggTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgcc < 1:1475709/35‑1 (MQ=255) gggTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgcc < 1:16531471/35‑1 (MQ=255) gggTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgcc < 1:17606088/35‑1 (MQ=255) atgtccccaactcgcgcgcaccggttaaaaccccc > 1:12579550‑M1/34‑35 (MQ=255) atgtcaccaactcgcgcgcaccggttaaaaccccc < 1:19071302‑M1/2‑1 (MQ=255) tgtccccaactcgcgcgcaccggttaaaacccccg > 1:11263638‑M1/33‑35 (MQ=255) tgtcaccaactcgcgcgcaccggttaaaacccccg > 1:14624145‑M1/33‑35 (MQ=255) ggTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgccg > 1:4955362/1‑35 (MQ=255) ggTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgccg > 1:333239/1‑35 (MQ=255) gtcaccaactcgcgcgcaccggttaaaacccccgc < 1:15511761‑M1/4‑1 (MQ=255) gtcaccaactcgcgcgcaccggttaaaacccccgc < 1:10306367‑M1/4‑1 (MQ=255) gtcaccaactcgcgcgcaccggttaaaacccccgc < 1:14050864‑M1/4‑1 (MQ=255) gTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgccgc > 1:16545462/1‑35 (MQ=255) tGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgccgcc > 1:19801096/1‑35 (MQ=255) tGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgccgcc > 1:1262820/1‑35 (MQ=255) tGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAgccgcc > 1:9095781/1‑35 (MQ=255) caccaactcgcgcgcaccggttaaaacccccgccg < 1:11596080‑M1/6‑1 (MQ=255) caccaactcgcgcgcaccggttaaaacccccgccg < 1:3545071‑M1/6‑1 (MQ=255) aattACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCcgccgc > 1:9327746/3‑35 (MQ=255) aTTTACTGTCAAATGACCGGTGATAAAGCcgccgc > 1:12435305/1‑35 (MQ=255) aTTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCcgccgc > 1:18416655/1‑35 (MQ=255) aTTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCcgccgc > 1:20169266/1‑35 (MQ=255) aTTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCcgccgc > 1:9681612/1‑35 (MQ=255) aTTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCcgccgc > 1:13660630/1‑35 (MQ=255) tttACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCt > 1:404941/1‑35 (MQ=255) tttACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCt > 1:8365814/1‑35 (MQ=255) tttACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCt > 1:13415998/1‑35 (MQ=255) ttACTGGCAAATGACCTGTGATAAAGCCGCCGCTg > 1:5119996/1‑35 (MQ=255) ttACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTg > 1:5485060/1‑35 (MQ=255) ttACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTg > 1:4146919/1‑35 (MQ=255) ttACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTg > 1:1907386/1‑35 (MQ=255) cTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCa > 1:1234000/1‑35 (MQ=255) tGGCAAATGCCCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCaa > 1:3822695/1‑35 (MQ=255) tGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCaa > 1:1123118/1‑35 (MQ=255) ggCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAAc > 1:11325698/1‑35 (MQ=255) ggCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAAc > 1:10595662/1‑35 (MQ=255) aaaTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTgg > 1:7153118/1‑35 (MQ=255) aaaTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTgg > 1:19544353/1‑35 (MQ=255) aaaTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTgg > 1:957045/1‑35 (MQ=255) aaaTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTgg > 1:18563374/1‑35 (MQ=255) aaTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGt > 1:19717303/1‑35 (MQ=255) aTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGtt > 1:10865363/1‑35 (MQ=255) aTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGtt > 1:18707620/1‑35 (MQ=255) aTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGtt > 1:13005100/1‑35 (MQ=255) aTGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAAATGGtt > 1:3908349/1‑35 (MQ=255) tGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGCTg > 1:11409108/1‑35 (MQ=255) gACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGc > 1:19649116/1‑35 (MQ=255) gACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGc > 1:10353973/1‑35 (MQ=255) gACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGc > 1:7891938/1‑35 (MQ=255) aCCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGGTggg > 1:2981607/1‑33 (MQ=38) ccGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTgggc > 1:1035654/1‑32 (MQ=255) ccGGTGATAAAGCCGCCGCCGCCAACTGGTTGCGt > 1:20105856/1‑35 (MQ=255) cGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGGGTc > 1:6029453/1‑35 (MQ=255) cGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTc > 1:15336979/1‑35 (MQ=255) cGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTc > 1:18095230/1‑35 (MQ=255) gTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCAt > 1:2235090/1‑35 (MQ=255) gTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCAt > 1:8653352/1‑35 (MQ=255) tgaaacccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATa > 1:20612035‑M1/9‑35 (MQ=255) taaaacccCAGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATa > 1:4886519‑M1/9‑35 (MQ=255) tGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGGTGCGTCATa > 1:8002570/1‑35 (MQ=255) gacacccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATAc > 1:9061215‑M1/8‑35 (MQ=255) aaaacccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATAc > 1:3680537‑M1/8‑35 (MQ=255) aaaacccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATAc > 1:12166284‑M1/8‑35 (MQ=255) tgacccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACg > 1:616238‑M1/7‑35 (MQ=255) aaacccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACg > 1:17509334‑M1/7‑35 (MQ=255) aTAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACg > 1:1618935/1‑35 (MQ=255) aTAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACg > 1:11708496/1‑35 (MQ=255) tataGCCGTCGCTGCCAACTGGTTGTGGCATACgg > 1:645423/4‑35 (MQ=19) tacccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACgg > 1:10875061‑M1/6‑35 (MQ=255) tAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACgg > 1:16224156/1‑35 (MQ=255) tAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACgg > 1:4337096/1‑35 (MQ=255) aaaccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACgg > 1:7639492‑M1/6‑35 (MQ=255) aaaccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACgg > 1:17829443‑M1/6‑35 (MQ=255) acccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGc > 1:6398681‑M1/5‑35 (MQ=255) aaaGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGc > 1:9526215/1‑35 (MQ=255) cccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCt > 1:15908689‑M1/4‑35 (MQ=255) cccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCt > 1:813578‑M1/4‑35 (MQ=255) cccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCt > 1:13753573‑M1/4‑35 (MQ=255) aaGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCt > 1:15652553/1‑35 (MQ=255) aaGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCt > 1:19154938/1‑35 (MQ=255) aaGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCt > 1:859570/1‑35 (MQ=255) ccCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTa > 1:7885428‑M1/3‑35 (MQ=255) aGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTa > 1:10173003/1‑35 (MQ=255) aGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTa > 1:6748071/1‑35 (MQ=255) aGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTa > 1:44991/1‑35 (MQ=255) gccgccGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTaa > 1:20443871/1‑35 (MQ=255) gccgccGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTaa > 1:4604612/1‑35 (MQ=255) cCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTaa > 1:19057205‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTaa > 1:20066823‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTaa > 1:9010467‑M1/2‑35 (MQ=255) CCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTaaa < 1:17612524‑M1/35‑1 (MQ=255) CCCCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTaaa > 1:7396767‑M1/1‑35 (MQ=255) | CGGGTGATTTACTGGCAAATGACCGGTGATAAAGCCGCCGCTGCCAACTGGTTGCGTCATACGGCTAAA > REL606/3483650‑3483718 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |