Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (+) +6 bp | 66.5% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 30 (0.470) | 59 (0.660) | 32/42 | NT | 58.4% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 32 (0.500) | 64 (0.710) | 34/42 | NT | 58.8% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
CTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATG > REL606/2448464‑2448532 | ggttcaacccttaagttagctcttatgggATAAtt < 1:1328599‑M1/6‑1 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggATAAtt < 1:1350345‑M1/6‑1 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAtt < 1:3938081/35‑1 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAtt > 1:7714225/1‑35 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAtt > 1:8948967/1‑35 (MQ=255) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAtt < 1:19032853/35‑1 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatgggATAATTcc > 1:15301037‑M1/28‑35 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggATAATTcccc > 1:19825005‑M1/26‑35 (MQ=255) aaGCCCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccc < 1:19702743/35‑1 (MQ=255) aaGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccc < 1:2828101/35‑1 (MQ=255) aaGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcccc < 1:17004888/35‑1 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg > 1:18362053‑M1/25‑35 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCg > 1:17130580‑M1/25‑35 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCg > 1:19880050/1‑35 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCg < 1:3727615/35‑1 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCg < 1:14381800/35‑1 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCgg > 1:18139901‑M1/24‑35 (MQ=255) cccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGt < 1:11425113‑M1/13‑1 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGtt < 1:12909675‑M1/14‑1 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttt > 1:1623639‑M1/21‑35 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttt < 1:2267930‑M1/15‑1 (MQ=255) catacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGttt < 1:5135638/35‑1 (MQ=255) catacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGttt > 1:12429540/1‑35 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGtttt > 1:9217002‑M1/20‑35 (MQ=255) atacataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcg < 1:9595250‑M1/35‑11 (MQ=255) atacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGtttt < 1:7419672/35‑1 (MQ=255) atacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGtttt > 1:19431837/1‑35 (MQ=255) tacataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgc < 1:17704988‑M1/35‑12 (MQ=255) tacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGttttt > 1:13410668/1‑35 (MQ=255) taagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttt < 1:15814655‑M1/17‑1 (MQ=255) taagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttt > 1:17223589‑M1/19‑35 (MQ=255) acataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgct < 1:14786978‑M1/35‑13 (MQ=255) acataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGtttttt < 1:4535044/35‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgggATAATTCCCCGGtttttt > 1:20345336‑M1/18‑35 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATGATTcccataagcgcta > 1:139947‑M1/1‑22 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATGATTcccataagcgcta < 1:19409856‑M1/35‑14 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATAATTcccataagcgcta > 1:18646502‑M1/1‑22 (MQ=255) agttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttttt < 1:234345‑M1/19‑1 (MQ=255) agttagcgcttatgggATAATTCCCCGGttttttt < 1:204309‑M1/19‑1 (MQ=255) gttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTa < 1:8657160‑M1/20‑1 (MQ=255) ttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTAc < 1:7855353‑M1/21‑1 (MQ=255) ttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTAc < 1:2587811‑M1/21‑1 (MQ=255) ttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTAc > 1:6366113‑M1/15‑35 (MQ=255) ttagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTAc < 1:17432747‑M1/21‑1 (MQ=255) tagcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACg < 1:3648455‑M1/22‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaact > 1:3109192‑M1/1‑19 (MQ=255) aaaaaaGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACg > 1:6068266/1‑35 (MQ=255) aaaaaaGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACg < 1:2743146/35‑1 (MQ=255) agcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc > 1:13550861‑M1/13‑35 (MQ=255) agcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc > 1:11810127‑M1/13‑35 (MQ=255) agcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc < 1:15743302‑M1/23‑1 (MQ=255) aaaaaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaactt < 1:6507339‑M1/35‑18 (MQ=255) gcgcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGcc > 1:18932778‑M1/12‑35 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCt < 1:15137944/35‑1 (MQ=255) gcttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTg > 1:3428254‑M1/10‑35 (MQ=255) aaGCCGGGGATAATTcccataagcgctaacttaag > 1:9139407‑M1/1‑15 (MQ=255) aaGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTg < 1:11594496/35‑1 (MQ=255) cttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGt > 1:17902106‑M1/9‑35 (MQ=255) cttatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGt > 1:9395986‑M1/9‑35 (MQ=255) gCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGtt > 1:15402996/1‑35 (MQ=255) gCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGtt > 1:16367244/1‑35 (MQ=255) tatgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTa < 1:1101830‑M1/29‑1 (MQ=255) cGGTGATAATTcccataagcgctaacttaagggtt > 1:8531378‑M1/1‑11 (MQ=255) cGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggtt > 1:2061989‑M1/1‑11 (MQ=255) cGGGGATAATTcccataagcgctaacttaagggtt < 1:20117976‑M1/35‑25 (MQ=255) cGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTaa > 1:16906840/1‑35 (MQ=255) atgggATAATTCCCCTGTTTTTTTACGCCTGTTaa > 1:6222865‑M1/6‑35 (MQ=255) tgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt < 1:18444975‑M1/31‑1 (MQ=255) tgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt < 1:14295695‑M1/31‑1 (MQ=255) tgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt > 1:19316554‑M1/5‑35 (MQ=255) tgggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt > 1:6573409‑M1/5‑35 (MQ=255) ggggATAATTcccataagcgctaacttaagggttg < 1:7014372‑M1/35‑26 (MQ=255) gggATAATTcccataagcgctaacttaagggttgt > 1:11732822‑M1/1‑9 (MQ=255) ggATAATTcccataagcgctaacttaagggttgtg > 1:7481101‑M1/1‑8 (MQ=255) ggATAATTcccataagcgctaacttaagggttgtg < 1:12675952‑M1/35‑28 (MQ=255) ggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa < 1:4144605‑M1/33‑1 (MQ=255) ggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa > 1:2869436‑M1/3‑35 (MQ=255) ggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCa < 1:15685924‑M1/33‑1 (MQ=255) gATAATTcccataagcgctaacttaagggttgtgg < 1:7316999‑M1/35‑29 (MQ=255) gATAATTcccataagcgctaacttaagggttgtgg < 1:16547122‑M1/35‑29 (MQ=255) gATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAg < 1:8166078‑M1/34‑1 (MQ=255) gATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAg < 1:10145800‑M1/34‑1 (MQ=255) aTAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGc > 1:13777010/1‑35 (MQ=255) aTAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGc > 1:4695640/1‑35 (MQ=255) aTAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGc > 1:19175267/1‑35 (MQ=255) tAATTcccataagcgctaacttaagggttgtggta < 1:9365536‑M1/35‑31 (MQ=255) tAATTcccataagcgctaacttaagggttgtggta < 1:379599‑M1/35‑31 (MQ=255) tAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCt < 1:12229113/35‑1 (MQ=255) aaTTcccataagcgctaacttaagggttgtggtat < 1:9811270‑M1/35‑32 (MQ=255) aaTTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTa < 1:14549923/35‑1 (MQ=255) aaTTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTa > 1:7067413/1‑35 (MQ=255) aaTTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTa < 1:5575053/35‑1 (MQ=255) tcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:17343877‑M1/35‑35 (MQ=255) tcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac > 1:13196095‑M1/1‑1 (MQ=255) tcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:5235844‑M1/35‑35 (MQ=255) tcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:10619169‑M1/35‑35 (MQ=255) tcccataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:5414698‑M1/35‑35 (MQ=255) tccaataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:2935583‑M1/35‑35 (MQ=255) tccaataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:3872060‑M1/35‑35 (MQ=255) tCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATg < 1:4942343/35‑1 (MQ=255) | CTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATG > REL606/2448464‑2448532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |