New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 2197349 | 85 (0.830) | 22 (0.240) | 7/42 | NT | 18.7% | coding (659/1992 nt) | cirA | ferric iron‑catecholate outer membrane transporter |
? | REL606 | 3882314 = | 133 (1.290) | coding (104/816 nt) | atpB | F0F1 ATP synthase subunit A |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TCCTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGTTT > REL606/2197315‑2197383 | tCCTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCggtgg < 1:20288570/35‑1 (MQ=255) ccTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCggtggt < 1:1045682/35‑1 (MQ=255) ccTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGg > 1:10766906‑M1/1‑34 (MQ=255) cTTCATTACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTc < 1:847763/35‑1 (MQ=255) cTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgg > 1:11245169‑M1/1‑33 (MQ=255) cTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTc < 1:15650310/35‑1 (MQ=255) cTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTc < 1:15424969/35‑1 (MQ=255) cTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTc < 1:13624055/35‑1 (MQ=255) ttCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGggg > 1:16395578‑M1/1‑32 (MQ=255) ttCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCg < 1:13584193/35‑1 (MQ=255) ttCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCg < 1:12382849/35‑1 (MQ=255) ttCAATAAGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCg < 1:51889/35‑1 (MQ=255) tCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggg > 1:118386‑M1/1‑31 (MQ=255) tCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggg > 1:2531198‑M1/1‑31 (MQ=255) tCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGt < 1:14895129/35‑1 (MQ=255) tCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGt < 1:11183728/35‑1 (MQ=255) tCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGt < 1:12865542/35‑1 (MQ=255) cAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGtt < 1:7062309/35‑1 (MQ=255) aaTACGCTGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggg > 1:17530743‑M1/1‑29 (MQ=255) tACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGggggtggg > 1:6029570‑M1/1‑27 (MQ=255) tACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggg > 1:8014799‑M1/1‑27 (MQ=255) tACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAg < 1:3024860/35‑1 (MQ=255) aCGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGggggggggg > 1:5705668‑M1/1‑26 (MQ=255) aCGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgcggggggg > 1:15505449‑M1/1‑26 (MQ=255) aCGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGt < 1:4455138/35‑1 (MQ=255) aCGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGt < 1:208248/35‑1 (MQ=255) aCGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGt < 1:17317073/35‑1 (MQ=255) cgcgGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGggggggggtg > 1:1680822‑M1/1‑25 (MQ=255) cgcgGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggt > 1:15205155‑M1/1‑25 (MQ=255) cgcgGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggt > 1:16468133‑M1/1‑25 (MQ=255) cgcgGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggg > 1:15295098‑M1/1‑25 (MQ=255) cgcgGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggg > 1:19308993‑M1/1‑25 (MQ=255) cgcgGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGtt < 1:7667583/35‑1 (MQ=255) gcggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggtgggtt > 1:1966828‑M1/1‑24 (MQ=255) gcggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggtt > 1:18890271‑M1/1‑24 (MQ=255) cggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggttt > 1:6302387‑M1/1‑23 (MQ=255) cggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGtttt < 1:15165453/35‑1 (MQ=255) ggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggtttt > 1:18246582‑M1/1‑22 (MQ=255) ggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTg < 1:5113130/35‑1 (MQ=255) ggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTg < 1:2191626/35‑1 (MQ=255) ggcgTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTg < 1:6726547/35‑1 (MQ=255) gcgTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGc < 1:6281260/35‑1 (MQ=255) gagTTTCTACGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGc < 1:8163340/33‑1 (MQ=38) ctgTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGc < 1:4757715/33‑1 (MQ=255) cgTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggtttttt > 1:8144090‑M1/1‑20 (MQ=255) cgTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCg < 1:2357988/35‑1 (MQ=255) gTTTCTCCGGTATCGGTGGgggggggggttttgtg > 1:3213615‑M1/1‑19 (MQ=255) tttCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCggg < 1:13167099/35‑1 (MQ=255) tttCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCggg < 1:12400753/35‑1 (MQ=255) ttCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGt < 1:2747822/35‑1 (MQ=255) ttCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGt < 1:5256233/35‑1 (MQ=255) ttCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGt < 1:9515212/35‑1 (MQ=255) ttCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGt < 1:15389561/35‑1 (MQ=255) ttCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGt < 1:10162442/35‑1 (MQ=255) ttCTCCGGTATAGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGt < 1:16762954/35‑1 (MQ=255) tctcCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTc < 1:6717317/35‑1 (MQ=255) tctcAGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTc < 1:1501226/35‑1 (MQ=255) ctcCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCa < 1:5011404/35‑1 (MQ=255) ctcCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCa < 1:9597515/35‑1 (MQ=255) ctcCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCa < 1:18496801/35‑1 (MQ=255) ctcCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCa < 1:16303589/35‑1 (MQ=255) ccGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATc < 1:7594762/35‑1 (MQ=255) ccGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATc < 1:9513037/35‑1 (MQ=255) ccGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATc < 1:4705924/35‑1 (MQ=255) ccGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATc < 1:1030869/35‑1 (MQ=255) ggTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCt < 1:11728633/35‑1 (MQ=255) gTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCtt < 1:402570/35‑1 (MQ=255) gTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCtt < 1:5546994/35‑1 (MQ=255) gTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCtt < 1:14596708/35‑1 (MQ=255) gTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCtt < 1:14343058/35‑1 (MQ=255) tATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCttt < 1:12702987/35‑1 (MQ=255) tATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCttt < 1:8031974/35‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCtttt < 1:16611750/35‑1 (MQ=255) tCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTc < 1:15073092/35‑1 (MQ=255) tCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTc < 1:2313343/35‑1 (MQ=255) tCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTc < 1:14279124/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCa < 1:8891234/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCa < 1:2998905/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTAGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCa < 1:5801765/35‑1 (MQ=255) ggtggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc < 1:195419/35‑1 (MQ=255) ggtggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc < 1:1108198/35‑1 (MQ=255) ggtggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc < 1:18953731/35‑1 (MQ=255) ggtggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc > 1:13322337/1‑35 (MQ=255) ggtggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc < 1:15948875/35‑1 (MQ=255) ggtggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc < 1:15478415/35‑1 (MQ=255) ggtggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc < 1:4881580/35‑1 (MQ=255) ggtggtCATTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCAc < 1:16081417/35‑1 (MQ=255) tggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGt < 1:3712867/35‑1 (MQ=255) tggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGt < 1:15549209/35‑1 (MQ=255) ggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGtt > 1:10781007/1‑35 (MQ=255) ggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGtt > 1:10837251/1‑35 (MQ=255) ggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGtt > 1:9911571/1‑35 (MQ=255) ggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGtt > 1:657308/1‑35 (MQ=255) ggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGtt < 1:6486682/35‑1 (MQ=255) ggtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGtt < 1:2628550/35‑1 (MQ=255) gtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGttt > 1:5355614/1‑35 (MQ=255) gtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGttt > 1:2519404/1‑35 (MQ=255) gtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGttt < 1:17124262/35‑1 (MQ=255) gtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGttt > 1:18757523/1‑35 (MQ=255) gtCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGttt < 1:19918746/35‑1 (MQ=255) | TCCTTCAATACGCGGCGTTTCTCCGGTATCGGTGGTCGTTGAGTTTTGCGGGTCATCCTTTTCACGTTT > REL606/2197315‑2197383 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |