Predicted mutation | |||||||
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RA | REL606 | 1,733,343 | G→A | 100% | D127N (GAT→AAT) | pykF → | pyruvate kinase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | REL606 | 1,733,343 | 0 | G→A | 100.0% | 361.5 | 126 | D127N (GAT→AAT) | pykF | pyruvate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (46/80): ref base (0/0): total (46/80) |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
ACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCGCCAT > REL606/1733311‑1733374 | aCCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACAAt < 1:9775757/35‑1 (MQ=255) aCCTGTCTGTTGGCAACACCGTACT‑GTTGACAATg > 1:17196551/1‑35 (MQ=25) ccTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATg < 1:3089163/35‑1 (MQ=255) ccTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATg < 1:8844279/35‑1 (MQ=255) ccTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATg < 1:6629957/35‑1 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATgg > 1:20453542/1‑35 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATgg > 1:4989448/1‑35 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATgg > 1:7106904/1‑35 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATgg > 1:1526296/1‑35 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATgg > 1:10926266/1‑35 (MQ=255) ctgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATgg < 1:9289166/35‑1 (MQ=255) tgtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATGGt < 1:17837189/35‑1 (MQ=255) gtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATgggc > 1:13514140/1‑33 (MQ=37) gtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATGGTc > 1:8348649/1‑35 (MQ=255) gtctgtTGGCAACACCGTACTGGTTGACAATGGTc 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |