New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 699047 | 102 (0.990) | 3 (0.040) | 3/36 | NT | 4.6% | coding (1314/1320 nt) | potE | putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter |
? | REL606 | 1115826 = | 48 (0.620) | coding (428/834 nt) | csgG | outer membrane lipoprotein |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TTCAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATACCA > REL606/699013‑699081 | ttCAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCG < 1:1757624‑M1/35‑1 (MQ=255) ttCAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCG < 1:5819730‑M1/35‑1 (MQ=255) ttCAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCG > 1:1412544‑M1/1‑35 (MQ=255) tCAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCgt < 1:5423955/35‑1 (MQ=255) tCAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCgt < 1:14931105/35‑1 (MQ=255) cAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCgtg < 1:6695648/35‑1 (MQ=255) cAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCgtg < 1:5207133/35‑1 (MQ=255) aaTCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCgtgt < 1:11722022/35‑1 (MQ=255) aaTCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCgtgt < 1:7357751/35‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGtt > 1:2388813/1‑35 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGtt > 1:10402143/1‑35 (MQ=255) aTCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGtt > 1:9668448/1‑35 (MQ=255) cGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTa < 1:18382226/35‑1 (MQ=255) cGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTa < 1:16700060/35‑1 (MQ=255) cGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTa < 1:10703614/35‑1 (MQ=255) gCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAt < 1:10276307/35‑1 (MQ=255) gCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAt > 1:20134383/1‑35 (MQ=255) cccTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAtt < 1:931397/35‑1 (MQ=255) cccTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAtt < 1:7266907/35‑1 (MQ=255) cccTTTTTTACTTTGTTTTATTAACAGTGTTTAtt < 1:10903597/35‑1 (MQ=255) ccTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAttt < 1:1772348/35‑1 (MQ=255) ccTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAttt < 1:17662952/35‑1 (MQ=255) ccTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAttt < 1:18773651/35‑1 (MQ=255) cTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAtttt < 1:13635263/35‑1 (MQ=255) ttttttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTAttttt < 1:6185903/35‑1 (MQ=255) tttttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTc < 1:18326536/35‑1 (MQ=255) ttttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCa > 1:12903663/1‑35 (MQ=255) ttttACTCTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCa < 1:15334285/35‑1 (MQ=255) tttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAg > 1:15041659/1‑35 (MQ=255) tttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAg > 1:16806641/1‑35 (MQ=255) tttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAg < 1:20184391/35‑1 (MQ=255) ttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGt < 1:8119874/35‑1 (MQ=255) ttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGt > 1:7659690/1‑35 (MQ=255) ttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGt > 1:13965175/1‑35 (MQ=255) ttACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGt > 1:19597663/1‑35 (MQ=255) ttAATTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGt < 1:12355353/35‑1 (MQ=255) tACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGtt < 1:10839417/35‑1 (MQ=255) aCTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTc < 1:17259688/35‑1 (MQ=255) cTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCa < 1:947224/35‑1 (MQ=255) cTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCa > 1:18685095/1‑35 (MQ=255) cTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCa > 1:11944547/1‑35 (MQ=255) tttGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCaa < 1:1528197/35‑1 (MQ=255) tttGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCaa > 1:3581027/1‑35 (MQ=255) tttGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCaa < 1:12770638/35‑1 (MQ=255) ttGTTTTATTAACAGTGTTTATTTTTCAGTTCaaa < 1:16536752/35‑1 (MQ=255) tGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAg > 1:19067007/1‑35 (MQ=255) tGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAg > 1:7323190/1‑35 (MQ=255) tGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAg < 1:8457928/35‑1 (MQ=255) nntttANTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGc < 1:9011381/33‑1 (MQ=255) gTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGc > 1:5524207/1‑35 (MQ=255) gTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGc < 1:19674938/35‑1 (MQ=255) gTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGc > 1:4517118/1‑35 (MQ=255) gTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGc > 1:9807719/1‑35 (MQ=255) ttttATTACCCGataatcgaaccttcaaccatgat < 1:4410517‑M1/35‑24 (MQ=255) tttATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgt < 1:7287244/35‑1 (MQ=255) ttattaCCCGataatcgaaccttcaaccatgatat < 1:7347313‑M1/35‑26 (MQ=255) ttattaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtt > 1:14818283/1‑34 (MQ=255) ttattaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtg > 1:13032377/1‑35 (MQ=255) tattaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtgg > 1:4784770/1‑35 (MQ=255) tttacCCGataatcgaaccttcaaccatgatattt < 1:19436601‑M1/34‑28 (MQ=255) attaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggt > 1:14373727/1‑35 (MQ=255) attaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggt < 1:20393899/35‑1 (MQ=255) attaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggt < 1:3855094/35‑1 (MQ=255) ttaCCCGataatcgaaccttcaaccatgatatttg < 1:1609221‑M1/35‑29 (MQ=255) ttaACCTTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggtg > 1:5923006/1‑35 (MQ=255) ttaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggtg > 1:6922283/1‑35 (MQ=255) ttaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggtg > 1:16291694/1‑35 (MQ=255) ttaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggtg > 1:10020361/1‑35 (MQ=255) ttaACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCgtggtg > 1:2509112/1‑35 (MQ=255) aacccgataatcgaaccttcaaccatgatatttgc < 1:1334634‑M1/32‑30 (MQ=255) acccgataatcgaaccttcaaccatgatatttgcc < 1:10563753‑M1/33‑31 (MQ=255) aaCCGataatcgaaccttcaaccatgatatttgcc > 1:14558672‑M1/1‑5 (MQ=255) aaCCGataatcgaaccttcaaccatgatatttgcc > 1:8854644‑M1/1‑5 (MQ=255) aaCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGAt < 1:7456381/35‑1 (MQ=255) aaCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGAt < 1:5349906/35‑1 (MQ=255) aaCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGAt < 1:16637655/35‑1 (MQ=255) cccgataatcgaaccttcaaccatgatatttgccg < 1:19909414‑M1/34‑32 (MQ=255) aCCGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccg > 1:12459575‑M1/1‑4 (MQ=255) aCCGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccg > 1:8005977‑M1/1‑4 (MQ=255) aCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATa > 1:15947802/1‑35 (MQ=255) aCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATa > 1:16196757/1‑35 (MQ=255) aCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATa > 1:8728426/1‑35 (MQ=255) aCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATa > 1:4934548/1‑35 (MQ=255) aCCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATa > 1:4620258/1‑35 (MQ=255) ccGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgc < 1:9204716‑M1/35‑33 (MQ=255) ccGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgc > 1:7119290‑M1/1‑3 (MQ=255) ccGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgc < 1:18107064‑M1/35‑33 (MQ=255) ccGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATAc > 1:8066261/1‑35 (MQ=255) ccGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATAc < 1:19187579/35‑1 (MQ=255) ccGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATAc > 1:2928805/1‑35 (MQ=255) cGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgcc > 1:12578887‑M1/1‑2 (MQ=255) cGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgcc > 1:20313118‑M1/1‑2 (MQ=255) cGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgcc > 1:11327226‑M1/1‑2 (MQ=255) cGataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgcc < 1:20436379‑M1/35‑34 (MQ=255) cGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATAcc > 1:17466760/1‑35 (MQ=255) cGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATAcc > 1:11642246/1‑35 (MQ=255) cGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATAcc < 1:3352755/35‑1 (MQ=255) cGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATAcc > 1:11420645/1‑35 (MQ=255) gtgtTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATACCa < 1:15488457/35‑1 (MQ=255) gataatcgaaccttcaaccatgatatttgccgccg > 1:9539325‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTCAATCGCCCTTTTTTACTTTGTTTTATTAACCGTGTTTATTTTTCAGTTCAAAGCGTGGTGATACCA > REL606/699013‑699081 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |