New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 954088 =106 (1.030)4 (0.040) 3/48 NT 4.2% coding (3807/4029 nt) ftsK DNA‑binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning
?REL606 4604384 = 76 (0.740)coding (394/864 nt) yjjW predicted pyruvate formate lyase activating enzyme

Only 100 of 165 total aligned reads displayed.

GCATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCGT  >  REL606/954054‑954122
                                  |                                  
ggtgaagccacgacccagctgccgtttgtggtggg                                    <  1:15138322‑M1/1‑1 (MQ=255)
gCATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCg                                    <  1:6946149/35‑1 (MQ=255)
 gtgaagccacgacccagctgccgtttgtggtgggg                                   <  1:4970207‑M1/2‑1 (MQ=255)
 gtgaagccacgacccagctgccgtttgtggtgggg                                   <  1:15525662‑M1/2‑1 (MQ=255)
 cATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCgt                                   >  1:6295173/1‑34 (MQ=255)
 cATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCgg                                   >  1:13332320/1‑35 (MQ=255)
  tgaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggg                                  <  1:1526255‑M1/3‑1 (MQ=255)
  tgaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggg                                  <  1:1340119‑M1/3‑1 (MQ=255)
  aTCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCggg                                  >  1:10664887/1‑35 (MQ=255)
  aTCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCggg                                  >  1:7521902/1‑35 (MQ=255)
   tccccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggt                                 <  1:8894201/32‑1 (MQ=255)
   gaagccacgacccagctgccgtttgtggtgggggc                                 <  1:2691830‑M1/4‑2 (MQ=255)
   gaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggct                                 <  1:7672301‑M1/4‑3 (MQ=255)
   gaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggct                                 <  1:15957133‑M1/4‑3 (MQ=255)
    ccccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtg                                <  1:2058672/33‑1 (MQ=255)
     aCCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtgg                               <  1:15808773/35‑1 (MQ=255)
      ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt                              <  1:20231487/35‑1 (MQ=255)
      ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt                              <  1:15343532/35‑1 (MQ=255)
      ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt                              >  1:8151337/1‑35 (MQ=255)
      ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt                              <  1:15056219/35‑1 (MQ=255)
       cTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtgggt                             >  1:17614149/1‑33 (MQ=255)
        tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGttt                            <  1:7426347/35‑1 (MQ=255)
        tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGttt                            <  1:8413899/35‑1 (MQ=255)
        tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGgtt                            >  1:19202296/1‑35 (MQ=255)
        tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGGGGgtt                            >  1:14214344/1‑35 (MQ=38)
        cacgacccagctgccgtttgtggtggGGGTGGttt                            <  1:3762258‑M1/9‑1 (MQ=255)
        cacgacccagctgccgtttgtggtggGGCTGGttt                            <  1:10157600‑M1/9‑1 (MQ=255)
         ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTc                           <  1:5253242/35‑1 (MQ=255)
         ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTc                           <  1:16450162/35‑1 (MQ=255)
         ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGGTTc                           >  1:1280967/1‑35 (MQ=255)
         ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGGGCGGGTGGGTTc                           >  1:380334/1‑35 (MQ=38)
          cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCg                          <  1:18643163/35‑1 (MQ=255)
          cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCg                          <  1:5126357/35‑1 (MQ=255)
          cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCg                          >  1:5519251/1‑35 (MQ=255)
          cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGGGGTTTCg                          >  1:18343037/1‑35 (MQ=255)
           gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGTGTGGTTTCGa                         >  1:6774556/1‑35 (MQ=255)
           gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCgg                         >  1:8612461/1‑34 (MQ=255)
           gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGGTTCGa                         >  1:2515482/1‑35 (MQ=255)
           gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGGTTCGa                         >  1:14326603/1‑35 (MQ=255)
           gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGGGGGTTTGa                         >  1:11976610/1‑35 (MQ=25)
            aCAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGAt                        >  1:20236184/1‑35 (MQ=255)
            aCAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGAt                        <  1:15303934/35‑1 (MQ=255)
            aCAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGAt                        <  1:18780199/35‑1 (MQ=255)
             cAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGCTg                       >  1:12168055/1‑35 (MQ=255)
              agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATgg                      <  1:18996012/35‑1 (MQ=255)
              agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATgg                      <  1:18503427/35‑1 (MQ=255)
              agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATgg                      <  1:10178087/35‑1 (MQ=255)
              agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGGTTCGATgg                      >  1:13895989/1‑35 (MQ=255)
               gcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGgc                     <  1:11914306/35‑1 (MQ=255)
                cgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGgcg                    >  1:18906403/1‑35 (MQ=255)
                cgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGgcg                    <  1:4095874/35‑1 (MQ=255)
                  aaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCt                  >  1:15229938/1‑35 (MQ=255)
                   aagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTg                 <  1:9670104/35‑1 (MQ=255)
                   aagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTg                 <  1:7770363/35‑1 (MQ=255)
                   aagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTg                 <  1:9432852/35‑1 (MQ=255)
                     gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGGTgga               >  1:19555923/1‑33 (MQ=37)
                     gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaa               <  1:19975185/35‑1 (MQ=255)
                     gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaa               <  1:10785187/35‑1 (MQ=255)
                     gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaa               <  1:17787720/35‑1 (MQ=255)
                      cgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaag              <  1:18917173/35‑1 (MQ=255)
                       gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga             <  1:14820848/35‑1 (MQ=255)
                       gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga             <  1:11471058/35‑1 (MQ=255)
                       gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga             >  1:4806159/1‑35 (MQ=255)
                       gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga             <  1:4925941/35‑1 (MQ=255)
                       gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga             >  1:19499326/1‑35 (MQ=255)
                        aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagga            >  1:3012674/1‑33 (MQ=255)
                        aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa            >  1:6467571/1‑35 (MQ=255)
                        aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa            >  1:18002603/1‑35 (MQ=255)
                        aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa            <  1:13595099/35‑1 (MQ=255)
                        aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa            >  1:13979636/1‑35 (MQ=255)
                        aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa            <  1:15872628/35‑1 (MQ=255)
                         aGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAAc           <  1:4997949/35‑1 (MQ=255)
                         aGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAAc           >  1:4606877/1‑35 (MQ=255)
                         aGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAAc           >  1:2400101/1‑35 (MQ=255)
                          ggtggtGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACt          >  1:17235554/1‑35 (MQ=255)
                           gtggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTg         >  1:14683391/1‑35 (MQ=255)
                           gtggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTg         <  1:5745804/35‑1 (MQ=255)
                           gtggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTg         <  1:15438031/35‑1 (MQ=255)
                            tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg        <  1:5258476/35‑1 (MQ=255)
                            tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg        <  1:1050070/35‑1 (MQ=255)
                            tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg        <  1:3236784/35‑1 (MQ=255)
                            tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg        <  1:11407481/35‑1 (MQ=255)
                            tggtcCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg        >  1:8096158/1‑35 (MQ=255)
                             ggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGa       <  1:855543/35‑1 (MQ=255)
                             ggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGa       >  1:10706701/1‑35 (MQ=255)
                             ggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGa       >  1:13337329/1‑35 (MQ=255)
                              gtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAt      >  1:9597912/1‑35 (MQ=255)
                              gtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAt      >  1:9223016/1‑35 (MQ=255)
                              gtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAt      <  1:18427563/35‑1 (MQ=255)
                               tgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATc     <  1:605128/35‑1 (MQ=255)
                               tgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATc     <  1:5345646/35‑1 (MQ=255)
                                gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAtac    <  1:1931291/35‑3 (MQ=255)
                                gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATcc    >  1:19401242/1‑35 (MQ=255)
                                gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATcc    <  1:16913311/35‑1 (MQ=255)
                                gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATcc    <  1:11292076/35‑1 (MQ=255)
                                 cGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCg   >  1:10185272/1‑35 (MQ=255)
                                  gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAGCTGGATCCgt  <  1:12638508/35‑1 (MQ=255)
                                  gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCgt  >  1:9105898/1‑35 (MQ=255)
                                  gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCgt  >  1:11723076/1‑35 (MQ=255)
                                  gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCgt  >  1:9924552/1‑35 (MQ=255)
                                  |                                  
GCATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCGT  >  REL606/954054‑954122

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.