Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | REL606 | 2,446,984 | A→C | 100% | intergenic (‑53/‑283) | mntH ← / → nupC | manganese transport protein MntH/nucleoside (except guanosine) transporter |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | REL606 | 2,446,984 | 0 | A→C | 100.0% | 488.8 | 136 | intergenic (‑53/‑283) | mntH/nupC | manganese transport protein MntH/nucleoside (except guanosine) transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (58/75): ref base (1/2): total (59/77) |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTTGTGGT > REL606/2446952‑2447017 | ccTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCAt < 1:15314698/35‑1 (MQ=255) ccTTTGCTATGTTTAATGCTATGCCAAACGAGCAt < 1:9572651/35‑1 (MQ=37) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg < 1:18307082/35‑1 (MQ=255) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg > 1:18925212/1‑35 (MQ=255) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg > 1:8205467/1‑35 (MQ=255) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg < 1:19822548/35‑1 (MQ=255) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg < 1:1302200/35‑1 (MQ=255) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg < 1:11537585/35‑1 (MQ=255) cTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg < 1:5397721/35‑1 (MQ=255) cTTTGCCATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATg > 1:16528105/1‑35 (MQ=38) tttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGa > 1:18876926/1‑35 (MQ=255) tttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGa < 1:4194565/35‑1 (MQ=255) tttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGa < 1:4913994/35‑1 (MQ=255) tttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGa < 1:6432368/35‑1 (MQ=255) ttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGAt > 1:14625101/1‑35 (MQ=255) ttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGAt < 1:8445091/35‑1 (MQ=255) ttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGAt < 1:13270667/35‑1 (MQ=255) ttGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGAt > 1:6976790/1‑35 (MQ=255) tGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGAtt < 1:19855976/35‑1 (MQ=255) tGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGAtt < 1:5240419/35‑1 (MQ=255) tGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGAtt < 1:10451765/35‑1 (MQ=255) tGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGAtt < 1:11844433/35‑1 (MQ=255) tGCTATGTTCCATGCTATGCCAAACGAGCATGAtt < 1:10765280/35‑1 (MQ=38) gCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTa < 1:3608859/35‑1 (MQ=255) gCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTa < 1:15934799/35‑1 (MQ=255) gCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTa < 1:18693807/35‑1 (MQ=255) gCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTa > 1:14429684/1‑35 (MQ=255) cTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTAt < 1:7355093/35‑1 (MQ=255) cTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTAt < 1:15143424/35‑1 (MQ=255) atATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTAt < 1:11291670/34‑1 (MQ=255) tATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATc < 1:11179155/35‑1 (MQ=255) tATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATc < 1:11568106/35‑1 (MQ=255) aTGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCa > 1:9222159/1‑35 (MQ=255) aTGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCa < 1:981112/35‑1 (MQ=255) aTGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCa < 1:11869945/35‑1 (MQ=255) tGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCaa < 1:11075273/35‑1 (MQ=255) tGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCaa > 1:11583752/1‑35 (MQ=255) tGTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTACCaa > 1:5552954/1‑35 (MQ=37) gTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCaaa > 1:19473263/1‑35 (MQ=255) gTTTCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCaaa < 1:19245432/35‑1 (MQ=255) tttCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAAt > 1:16888416/1‑35 (MQ=255) ttCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAAtt < 1:18162819/35‑1 (MQ=255) ttCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAAtt < 1:4717916/35‑1 (MQ=255) tCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTc > 1:15009785/1‑35 (MQ=255) tCATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTc > 1:13971576/1‑35 (MQ=255) cATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCa > 1:3210877/1‑35 (MQ=255) cATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCa < 1:11475334/35‑1 (MQ=255) cATGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCa < 1:15566151/35‑1 (MQ=255) aTGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAt < 1:18406203/35‑1 (MQ=255) aTGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAt > 1:9451082/1‑35 (MQ=255) aTGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAt < 1:11936365/35‑1 (MQ=255) tGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAtt > 1:6652442/1‑35 (MQ=255) tGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAtt > 1:11125664/1‑35 (MQ=255) tGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAtt < 1:6574960/35‑1 (MQ=255) tGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAtt > 1:18915028/1‑35 (MQ=255) tGCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAtt > 1:1565082/1‑35 (MQ=255) gCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAttt < 1:1747481/35‑1 (MQ=255) gCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAttt < 1:11619771/35‑1 (MQ=255) gCTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCAttt > 1:5138644/1‑35 (MQ=255) cTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTa > 1:18024061/1‑35 (MQ=255) cTATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTa > 1:16692412/1‑35 (MQ=255) tATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaa > 1:10585654/1‑35 (MQ=255) tATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaa > 1:10240219/1‑35 (MQ=255) tATGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaa < 1:15793280/35‑1 (MQ=255) aTGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaaa > 1:8684102/1‑35 (MQ=255) aTGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaaa < 1:8625158/35‑1 (MQ=255) aTGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaaa < 1:7886700/35‑1 (MQ=255) aTGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaaa < 1:14173425/35‑1 (MQ=255) aTGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTaaa > 1:5958979/1‑35 (MQ=255) tGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAAt < 1:5779779/35‑1 (MQ=255) tGCCAAACGAGCATGATTATCAAATTAATTTaaan < 1:11392804/35‑2 (MQ=37) gCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATg > 1:14866706/1‑35 (MQ=255) gCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATg > 1:20492750/1‑35 (MQ=255) gCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATg > 1:17480954/1‑35 (MQ=255) gCCAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATg > 1:6860955/1‑35 (MQ=255) gCCAAACGAGCATGATTATAAAATTCATTTAAATg < 1:7596777/35‑1 (MQ=37) ccAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATgg > 1:8337907/1‑35 (MQ=255) ccAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATgg < 1:18407232/35‑1 (MQ=255) ccAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATgg > 1:7685842/1‑35 (MQ=255) cAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATggg < 1:13854366/35‑1 (MQ=255) cAAACGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATggg > 1:10917082/1‑35 (MQ=255) aaaCTAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGt > 1:242000/1‑35 (MQ=37) aaaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGt > 1:3190332/1‑35 (MQ=255) aaaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGt < 1:13844212/35‑1 (MQ=255) aaaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGt > 1:15933519/1‑35 (MQ=255) aaaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGt > 1:12989344/1‑35 (MQ=255) aaaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGt > 1:17388761/1‑35 (MQ=255) aaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGtt < 1:5492760/35‑1 (MQ=255) aaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGtt > 1:19335607/1‑35 (MQ=255) aaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGtt > 1:7461504/1‑35 (MQ=255) aaCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGtt > 1:13020637/1‑35 (MQ=255) aCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtg > 1:9787977/1‑35 (MQ=255) aCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtg < 1:3860964/35‑1 (MQ=255) aCGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtg > 1:20407154/1‑35 (MQ=255) cGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtgt < 1:19287523/35‑1 (MQ=255) cGAGCATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtgt < 1:6229105/35‑1 (MQ=255) gagcATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtgtg > 1:1275953/1‑35 (MQ=255) gagcATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtgtg > 1:8771610/1‑35 (MQ=255) gagcATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtgtg < 1:13370466/35‑1 (MQ=255) gagcATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTtgtg < 1:6198476/35‑1 (MQ=255) | CCTTTGCTATGTTTCATGCTATGCCAAACGAGAATGATTATCAAATTCATTTAAATGGGTTGTGGT > REL606/2446952‑2447017 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |