New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 954088 = | 106 (1.030) | 4 (0.040) | 3/48 | NT | 4.2% | coding (3807/4029 nt) | ftsK | DNA‑binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning |
? | REL606 | 4604384 = | 76 (0.740) | coding (394/864 nt) | yjjW | predicted pyruvate formate lyase activating enzyme |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GCATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCGT > REL606/954054‑954122 | ggtgaagccacgacccagctgccgtttgtggtggg < 1:15138322‑M1/1‑1 (MQ=255) gCATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCg < 1:6946149/35‑1 (MQ=255) gtgaagccacgacccagctgccgtttgtggtgggg < 1:4970207‑M1/2‑1 (MQ=255) gtgaagccacgacccagctgccgtttgtggtgggg < 1:15525662‑M1/2‑1 (MQ=255) cATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCgt > 1:6295173/1‑34 (MQ=255) cATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCgg > 1:13332320/1‑35 (MQ=255) tgaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggg < 1:1526255‑M1/3‑1 (MQ=255) tgaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggg < 1:1340119‑M1/3‑1 (MQ=255) aTCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCggg > 1:10664887/1‑35 (MQ=255) aTCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCggg > 1:7521902/1‑35 (MQ=255) tccccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggt < 1:8894201/32‑1 (MQ=255) gaagccacgacccagctgccgtttgtggtgggggc < 1:2691830‑M1/4‑2 (MQ=255) gaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggct < 1:7672301‑M1/4‑3 (MQ=255) gaagccacgacccagctgccgtttgtggtggggct < 1:15957133‑M1/4‑3 (MQ=255) ccccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtg < 1:2058672/33‑1 (MQ=255) aCCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtgg < 1:15808773/35‑1 (MQ=255) ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt < 1:20231487/35‑1 (MQ=255) ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt < 1:15343532/35‑1 (MQ=255) ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt > 1:8151337/1‑35 (MQ=255) ccTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtggt < 1:15056219/35‑1 (MQ=255) cTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGggtgggt > 1:17614149/1‑33 (MQ=255) tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGttt < 1:7426347/35‑1 (MQ=255) tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGttt < 1:8413899/35‑1 (MQ=255) tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGgtt > 1:19202296/1‑35 (MQ=255) tCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGGGGgtt > 1:14214344/1‑35 (MQ=38) cacgacccagctgccgtttgtggtggGGGTGGttt < 1:3762258‑M1/9‑1 (MQ=255) cacgacccagctgccgtttgtggtggGGCTGGttt < 1:10157600‑M1/9‑1 (MQ=255) ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTc < 1:5253242/35‑1 (MQ=255) ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTc < 1:16450162/35‑1 (MQ=255) ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGGTTc > 1:1280967/1‑35 (MQ=255) ccGACAGCGAAAGCGAAGGTGGGGCGGGTGGGTTc > 1:380334/1‑35 (MQ=38) cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCg < 1:18643163/35‑1 (MQ=255) cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCg < 1:5126357/35‑1 (MQ=255) cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCg > 1:5519251/1‑35 (MQ=255) cGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGGGGTTTCg > 1:18343037/1‑35 (MQ=255) gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGTGTGGTTTCGa > 1:6774556/1‑35 (MQ=255) gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCgg > 1:8612461/1‑34 (MQ=255) gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGGTTCGa > 1:2515482/1‑35 (MQ=255) gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGGTTCGa > 1:14326603/1‑35 (MQ=255) gACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGGGGGTTTGa > 1:11976610/1‑35 (MQ=25) aCAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGAt > 1:20236184/1‑35 (MQ=255) aCAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGAt < 1:15303934/35‑1 (MQ=255) aCAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGAt < 1:18780199/35‑1 (MQ=255) cAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGCTg > 1:12168055/1‑35 (MQ=255) agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATgg < 1:18996012/35‑1 (MQ=255) agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATgg < 1:18503427/35‑1 (MQ=255) agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATgg < 1:10178087/35‑1 (MQ=255) agcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGGTTCGATgg > 1:13895989/1‑35 (MQ=255) gcgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGgc < 1:11914306/35‑1 (MQ=255) cgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGgcg > 1:18906403/1‑35 (MQ=255) cgaaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGgcg < 1:4095874/35‑1 (MQ=255) aaagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCt > 1:15229938/1‑35 (MQ=255) aagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTg < 1:9670104/35‑1 (MQ=255) aagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTg < 1:7770363/35‑1 (MQ=255) aagcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTg < 1:9432852/35‑1 (MQ=255) gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGGTgga > 1:19555923/1‑33 (MQ=37) gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaa < 1:19975185/35‑1 (MQ=255) gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaa < 1:10785187/35‑1 (MQ=255) gcgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaa < 1:17787720/35‑1 (MQ=255) cgaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaag < 1:18917173/35‑1 (MQ=255) gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga < 1:14820848/35‑1 (MQ=255) gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga < 1:11471058/35‑1 (MQ=255) gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga > 1:4806159/1‑35 (MQ=255) gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga < 1:4925941/35‑1 (MQ=255) gaaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaaga > 1:19499326/1‑35 (MQ=255) aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagga > 1:3012674/1‑33 (MQ=255) aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa > 1:6467571/1‑35 (MQ=255) aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa > 1:18002603/1‑35 (MQ=255) aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa < 1:13595099/35‑1 (MQ=255) aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa > 1:13979636/1‑35 (MQ=255) aaGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTgaagaa < 1:15872628/35‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAAc < 1:4997949/35‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAAc > 1:4606877/1‑35 (MQ=255) aGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAAc > 1:2400101/1‑35 (MQ=255) ggtggtGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACt > 1:17235554/1‑35 (MQ=255) gtggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTg > 1:14683391/1‑35 (MQ=255) gtggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTg < 1:5745804/35‑1 (MQ=255) gtggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTg < 1:15438031/35‑1 (MQ=255) tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg < 1:5258476/35‑1 (MQ=255) tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg < 1:1050070/35‑1 (MQ=255) tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg < 1:3236784/35‑1 (MQ=255) tggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg < 1:11407481/35‑1 (MQ=255) tggtcCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTgg > 1:8096158/1‑35 (MQ=255) ggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGa < 1:855543/35‑1 (MQ=255) ggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGa > 1:10706701/1‑35 (MQ=255) ggtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGa > 1:13337329/1‑35 (MQ=255) gtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAt > 1:9597912/1‑35 (MQ=255) gtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAt > 1:9223016/1‑35 (MQ=255) gtgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAt < 1:18427563/35‑1 (MQ=255) tgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATc < 1:605128/35‑1 (MQ=255) tgCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATc < 1:5345646/35‑1 (MQ=255) gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGAtac < 1:1931291/35‑3 (MQ=255) gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATcc > 1:19401242/1‑35 (MQ=255) gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATcc < 1:16913311/35‑1 (MQ=255) gCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATcc < 1:11292076/35‑1 (MQ=255) cGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCg > 1:10185272/1‑35 (MQ=255) gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAGCTGGATCCgt < 1:12638508/35‑1 (MQ=255) gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCgt > 1:9105898/1‑35 (MQ=255) gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCgt > 1:11723076/1‑35 (MQ=255) gggTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCgt > 1:9924552/1‑35 (MQ=255) | GCATCACCTCCGACAGCGAAAGCGAAGGTGGTGCGGGTGGTTTCGATGGCGCTGAAGAACTGGATCCGT > REL606/954054‑954122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |