New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 = 168661182 (0.800)5 (0.050) 3/48 NT 10.1% coding (276/1059 nt) rnfD electron transport complex protein RnfD
?REL606 1736972 = 7 (0.070)coding (819/1221 nt) sufS selenocysteine lyase

CCCCCCCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  >  REL606/1686603‑1686611
‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA  >  REL606/1736972‑1737005
                                           
CCCCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAG          <  1:4826362/35‑1
 CCCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGT         <  1:9045322/35‑1
  CCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTG        <  1:6139808/35‑1
  CCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTG        <  1:1496522/35‑1
  CCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTG        <  1:15547536/35‑1
    CCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCC      <  1:938910/35‑1
     cccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCT     <  1:2402925/32‑1
      ccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTT    <  1:14538198/33‑1
      ccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTT    <  1:13650154/33‑1
      ccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTN    <  1:19595348/33‑1
      acCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTT    <  1:18640817/33‑1
       cCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTC   <  1:17422636/34‑1
       cCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTC   <  1:14864892/34‑1
       cCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTC   <  1:4947015/34‑1
        CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA  <  1:1979231/35‑1
        CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA  <  1:3330351/35‑1
        CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA  <  1:5097249/35‑1
        CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA  <  1:8097112/35‑1
        CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA  <  1:13657590/35‑1
                                           
CCCCCCCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  >  REL606/1686603‑1686611
‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA  >  REL606/1736972‑1737005

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.