New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 225795 = | 119 (1.160) | 11 (0.130) | 3/40 | NT | 13.7% | coding (123/573 nt) | gmhB | hypothetical protein |
? | REL606 | 2126049 = | 40 (0.470) | coding (187/1041 nt) | gatD | galactitol‑1‑phosphate dehydrogenase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
AATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGGTAGTAA > REL606/225761‑225829 | tattatccaataacgttaggccatgaatttagcgg < 1:7972838‑M1/1‑1 (MQ=255) tattatccaataacgttaggccatgaatttagcgg < 1:13137163‑M1/1‑1 (MQ=255) aaTTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAg < 1:537617/35‑1 (MQ=255) aaTTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAg < 1:17228644/35‑1 (MQ=255) attatccaataacgttaggccatgaatttagcgGc < 1:17589487‑M1/2‑1 (MQ=255) aTTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGc < 1:3253313/35‑1 (MQ=255) tttATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCt < 1:11690858/35‑1 (MQ=255) ttatccaataacgttaggccatgaatttagcgGCt < 1:1641078‑M1/3‑1 (MQ=255) ttATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTa < 1:9769870/35‑1 (MQ=255) tatccaataacgttaggccatgaatttagcgGCTa < 1:13497523‑M1/4‑1 (MQ=255) atccaataacgttaggccatgaatttagcgGGTaa < 1:8364050‑M1/5‑1 (MQ=255) atccaataacgttaggccatgaatttagcgGCTaa < 1:10118338‑M1/5‑1 (MQ=255) tccaataacgttaggccatgaatttagcgGCTaaa < 1:1335933‑M1/6‑1 (MQ=255) aTCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaa < 1:11489004/35‑1 (MQ=255) aTCGACAGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaa < 1:291323/35‑1 (MQ=255) tCGACTGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaa < 1:359018/35‑1 (MQ=255) tCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGTGAGCTaaaa > 1:3269260/1‑35 (MQ=255) tCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaa < 1:13209343/35‑1 (MQ=255) caataacgttaggccatgaatttagcgGCTaaaaa < 1:4017316‑M1/8‑1 (MQ=255) caataacgttaggccatgaatttagcgGCTaaaaa < 1:471850‑M1/8‑1 (MQ=255) caataacgttaggccatgaatttagcgGCTaaaaa < 1:10008518‑M1/8‑1 (MQ=255) cGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGGGGTaaaaa > 1:14259218/1‑35 (MQ=37) cGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaa > 1:6069676/1‑35 (MQ=255) cGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaa < 1:14634543/35‑1 (MQ=255) cGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaa < 1:2138675/35‑1 (MQ=255) gACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaa > 1:9535969/1‑35 (MQ=255) gACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaa > 1:9371669/1‑35 (MQ=255) gACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaa > 1:8953192/1‑35 (MQ=255) gACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaa > 1:5450185/1‑35 (MQ=255) gACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaa < 1:18875024/35‑1 (MQ=255) aCGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaa < 1:3391736/35‑1 (MQ=255) aCGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaa > 1:12492281/1‑35 (MQ=255) aCGGTGTTATTGACGCAATGCGCGAGCTaaaaaaa < 1:11048710/35‑1 (MQ=255) aCGGTGTTACTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaa > 1:15608329/1‑35 (MQ=255) taacgttaggccatgaatttagcggctaaaaatat < 1:15862848‑M1/11‑4 (MQ=255) cGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaaa > 1:10741932/1‑35 (MQ=255) cGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaaa < 1:3047153/35‑1 (MQ=255) cGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaaa > 1:2114259/1‑35 (MQ=255) cGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaaa > 1:19582470/1‑35 (MQ=255) cGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaaa > 1:18124384/1‑35 (MQ=255) ggTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAAt > 1:6309340/1‑35 (MQ=255) ggTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAAt > 1:13876562/1‑35 (MQ=255) gtgtTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATg > 1:774604/1‑35 (MQ=255) tgtTATTGACGCCATGCGCTAGCTAAAAAAAATgg > 1:5154484/1‑35 (MQ=255) tgtTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATgg < 1:16701791/35‑1 (MQ=255) tgtTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATgg < 1:12237673/35‑1 (MQ=255) cgttaggccatgaatttagcggctaaaaaaaaatg < 1:10886374‑M1/14‑4 (MQ=255) gttaggccatgaatttagcgGCTAAAAAaaataag < 1:2766737‑M1/15‑4 (MQ=255) gtcaTTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATggg > 1:7266986/4‑35 (MQ=255) gtTATTGACGCCATGCGCGATCTAAAAAAAATggg < 1:19906889/35‑1 (MQ=255) ttATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATgggg < 1:18506155/35‑1 (MQ=255) ttATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATgggg > 1:14366034/1‑35 (MQ=255) ttATTGACGCCATGCGCAAGCTAAAAAAAATgggg < 1:7521426/35‑1 (MQ=255) tATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGt < 1:6940044/35‑1 (MQ=255) tATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGt < 1:16900506/35‑1 (MQ=255) tATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGt > 1:5581668/1‑35 (MQ=255) aTTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGtt > 1:7859868/1‑35 (MQ=255) aTTGACGCCATGAGCGAGCTAAAAAAAATGGGGtt < 1:2628859/35‑1 (MQ=255) tGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTg < 1:10880659/35‑1 (MQ=255) tGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTg > 1:16035401/1‑35 (MQ=255) tGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTg < 1:14766690/35‑1 (MQ=255) tGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTg > 1:18791154/1‑35 (MQ=255) tGACGCCATGAGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTg < 1:8779819/35‑1 (MQ=255) gACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTgc < 1:14418758/35‑1 (MQ=255) gACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTgc < 1:5036769/35‑1 (MQ=255) gACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTgc < 1:4380092/35‑1 (MQ=255) gACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTgc < 1:15365808/35‑1 (MQ=255) aCGCCATGCGCGTGCTAAAAAAAATGGGGTTTgcg > 1:635573/1‑35 (MQ=255) aCGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTgcg < 1:6794824/35‑1 (MQ=255) aCGCCATG‑GCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTgcgc > 1:14975137/1‑35 (MQ=37) cGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTgcgc < 1:12898783/35‑1 (MQ=255) gCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGTTTTGCGCt > 1:17000818/1‑35 (MQ=255) gCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCt > 1:11076312/1‑35 (MQ=255) gCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCt > 1:5189537/1‑35 (MQ=255) ccATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtg < 1:3600081/35‑1 (MQ=255) ccATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtg < 1:20433017/35‑1 (MQ=255) cATGCGCTAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtgg > 1:11264359/1‑35 (MQ=255) cATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtgg > 1:15932284/1‑35 (MQ=255) cATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtgg < 1:6603406/35‑1 (MQ=255) cATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCagg > 1:7107314/1‑35 (MQ=255) aTGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtggt > 1:18288960/1‑35 (MQ=255) aTGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtggt > 1:7659573/1‑35 (MQ=255) aTGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtggt < 1:4574269/35‑1 (MQ=255) tGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtggtg < 1:18147402/35‑1 (MQ=255) tGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtggtg < 1:13727826/35‑1 (MQ=255) tGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCtggtg < 1:381520/35‑1 (MQ=255) ctcgAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTggtggt < 1:9481690/33‑1 (MQ=255) gcgAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGgta < 1:19301596/35‑1 (MQ=255) cgAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGgtag < 1:10473151/35‑1 (MQ=255) cgAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGgtag < 1:8677694/35‑1 (MQ=255) gAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGgtagt < 1:10571346/35‑1 (MQ=255) gAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGgtagt < 1:4926569/35‑1 (MQ=255) gAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGggagt > 1:18709925/1‑35 (MQ=255) gAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGggagg > 1:12312551/1‑34 (MQ=255) gAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGggagg > 1:9289236/1‑34 (MQ=255) aGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGgtagta < 1:10221554/35‑1 (MQ=255) aGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGggagga > 1:5092617/1‑33 (MQ=37) GCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGgtggtaggaa < 1:6685738‑M1/35‑4 (MQ=255) GCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGGTAGTaa > 1:15298598‑M1/1‑35 (MQ=255) GCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGGTAGTaa > 1:3690584‑M1/1‑35 (MQ=255) | AATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGGTTTGCGCTGGTGGTAGTAA > REL606/225761‑225829 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |