Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 546,191 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (346‑354/384 nt) | ybcQ → | predicted antitermination protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 546191 = | 0 (0.000) | 77 (0.780) | 35/46 | NT | 100% | coding (346/384 nt) | ybcQ | predicted antitermination protein |
? | REL606 | 546932 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 546199 | 0 (0.000) | 125 (1.220) | 42/48 | NT | 100% | coding (354/384 nt) | ybcQ | predicted antitermination protein |
? | REL606 | = 547699 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
TAGAGTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/546224‑546191 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > REL606/546932‑546966 TAGAGTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGG > 1:5297217/1‑35 GAGTTATTAACAAAGATATCCATCTCTAACCGGGT < 1:7397293/35‑1 AGTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTA > 1:8758261/1‑35 GTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAA < 1:8819139/35‑1 GTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAA > 1:14730210/1‑35 GTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAA < 1:18338568/35‑1 GTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAA < 1:20360327/35‑1 TTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAAT > 1:17687054/1‑35 ATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTACTGA > 1:12414211/1‑35 TTAACAACGATATCCATCTCTAACCTGGTAATGAC > 1:9147695/1‑35 TAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACT < 1:1475431/35‑1 TAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACT > 1:8920435/1‑35 TAACAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACT < 1:1200272/35‑1 CAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCA > 1:8424670/1‑35 CAACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCA > 1:19756346/1‑35 AACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAA > 1:16145761/1‑35 AACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAA > 1:4776112/1‑35 ACGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAAC > 1:657186/1‑35 CGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACT > 1:4494967/1‑35 CGATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACT > 1:13876916/1‑35 GATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTT < 1:19277568/35‑1 GATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTT > 1:11203898/1‑35 ATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTA < 1:12598689/35‑1 ATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTA > 1:5645197/1‑35 ATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTA > 1:16994319/1‑35 ATATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTA > 1:9500860/1‑35 ATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:9886753/35‑1 ATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:13187458/35‑1 ATCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:11606596/35‑1 TCCATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:16824568/1‑35 ATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:19796677/1‑35 ATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:2340821/1‑35 ATCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:13733046/1‑35 TCTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:12095817/35‑1 CTCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGN < 1:15070322/35‑1 TCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 1:19906259/1‑35 TCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:14416589/35‑1 TCTAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:17121499/35‑1 TAACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 1:10906815/35‑1 ACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:14201348/1‑35 CCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:8296474/35‑1 CCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 1:2170684/1‑35 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:5878417/1‑35 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:6956652/1‑35 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:7697594/35‑1 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:7888428/1‑35 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:11792484/35‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:558725/35‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:7066246/1‑35 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:4393588/1‑35 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:288870/1‑35 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:12971504/1‑35 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:20064657/1‑35 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:10862833/35‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:1017939/35‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:10056404/35‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:15230426/35‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:1943077/35‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:17191975/1‑35 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:1584871/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:16953103/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:16906229/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:16521049/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:728876/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:11444829/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:16417486/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:7822368/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:16272553/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:8087989/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:15916631/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:11006076/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:8538908/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:10942147/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:15703891/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:10740180/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:9403256/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:15479894/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:9633344/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:9765879/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:19580747/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:19541826/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:20204969/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:20596405/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:18853789/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:18742806/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:3273336/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:355609/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:3787942/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:4214318/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:18693883/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:12165912/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:5068640/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:18517852/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:18041623/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:17565758/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:5737716/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 1:6018892/1‑35 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:6342821/35‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGN < 1:12253216/35‑1 GGTAATGACTCAAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:13598921/35‑1 TAGAGTTATTAACAACGATATCCATCTCTAACCGg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/546224‑546191 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > REL606/546932‑546966 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |