New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2318764 = | 63 (0.610) | 11 (0.140) | 4/36 | NT | 13.6% | coding (1344/1653 nt) | arnT | 4‑amino‑4‑deoxy‑L‑arabinose transferase |
? | REL606 | 4219145 = | 92 (1.190) | intergenic (+483/‑112) | yjbH/yjbA | predicted porin/phosphate‑starvation‑inducible protein PsiE |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAA > REL606/4219111‑4219179 | gCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCGGGCttt < 1:912147/35‑1 (MQ=255) acaccgacgctatcagtaagaatatagcggctttg > 1:12354676‑M2/34‑35 (MQ=255) acaccgacgctatcagtaagaatatagcggctttg > 1:6011958‑M2/34‑35 (MQ=255) ttATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtgg > 1:10794713/1‑35 (MQ=255) ttATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtgg < 1:3201090/35‑1 (MQ=255) ttATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtgg < 1:15931212/35‑1 (MQ=255) ttATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtgg < 1:12690207/35‑1 (MQ=255) tATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggt > 1:975689/1‑35 (MQ=255) tATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggt < 1:13450341/35‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggt < 1:18118629/35‑1 (MQ=255) aTCCTGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg > 1:2911051/1‑35 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg > 1:2606814/1‑35 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg > 1:317249/1‑35 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg < 1:11947301/35‑1 (MQ=255) tCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtgg < 1:15374563/35‑1 (MQ=255) tCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtgg < 1:5331384/35‑1 (MQ=255) cgacgctatcagtaagaatatagcgggtttggtgg > 1:19546542‑M2/30‑35 (MQ=255) gacgctatcagtaagaatatagcggcttTGGTGGa > 1:7292516‑M2/29‑35 (MQ=255) gacgctatcagtaagaatatagcggcttTGGTGGa > 1:4154382‑M2/29‑35 (MQ=255) gacgctatcagtaagaatatagcggcttTGCTGGa > 1:11087364‑M2/29‑35 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa > 1:19348715/1‑35 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa > 1:18510349/1‑35 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa < 1:10286654/35‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa < 1:11615493/35‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa > 1:796111/1‑35 (MQ=255) cGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAg < 1:6763991/35‑1 (MQ=255) cGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAg > 1:87548/1‑35 (MQ=255) acgctatcagtaagaatatagcggcttTGGTTGAg > 1:15591315‑M2/28‑35 (MQ=255) ggCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg > 1:6656900/1‑35 (MQ=255) ggCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 1:9082233/35‑1 (MQ=255) ggCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 1:14118195/35‑1 (MQ=255) ggCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 1:13982124/35‑1 (MQ=255) cgctatcagtaagaatatagcggcttTGGTGGAgg > 1:4439199‑M2/27‑35 (MQ=255) gCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgc > 1:134121/1‑35 (MQ=255) gCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgc < 1:5115751/35‑1 (MQ=255) gCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgc < 1:518212/35‑1 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcg < 1:14262944/35‑1 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcg < 1:286937/35‑1 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcg > 1:14457547/1‑35 (MQ=255) tatcagtaagaatatagcggcttTGGTggaggggt > 1:12463862‑M2/24‑32 (MQ=255) cTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcgc > 1:8231532/1‑35 (MQ=255) tACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcgcg > 1:6750882/1‑35 (MQ=255) aCGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcgcgc < 1:2070306/35‑1 (MQ=255) cGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt > 1:10276726/1‑35 (MQ=255) cGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt > 1:19075075/1‑35 (MQ=255) cGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt < 1:7546962/35‑1 (MQ=255) cGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt > 1:20549001/1‑35 (MQ=255) cGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt > 1:4587951/1‑35 (MQ=255) cGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt < 1:18194338/35‑1 (MQ=255) gggTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTc > 1:5992530/1‑35 (MQ=255) gggTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTc > 1:16404260/1‑35 (MQ=255) gtaggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCa < 1:4357727/35‑1 (MQ=255) gtaggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCa > 1:3916655/1‑35 (MQ=255) taggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaa > 1:11731482/1‑35 (MQ=255) taggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaa < 1:6544752/35‑1 (MQ=255) taggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaa < 1:14457214/35‑1 (MQ=255) taggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaa > 1:16452761/1‑35 (MQ=255) taggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCAaa < 1:4884910/35‑1 (MQ=255) aggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCTCGCTCCaaa > 1:5023144/1‑35 (MQ=255) aggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaaa < 1:6450418/35‑1 (MQ=255) aggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaaa < 1:12722096/35‑1 (MQ=255) aggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaaa < 1:19988876/35‑1 (MQ=255) aggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaaa > 1:1497099/1‑35 (MQ=255) aggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaaa < 1:2126946/35‑1 (MQ=255) ggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 1:5453858/1‑35 (MQ=255) ggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 1:19627524/1‑35 (MQ=255) ggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt < 1:3839279/35‑1 (MQ=255) ggtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 1:792102/1‑35 (MQ=255) gtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATc > 1:12260008/1‑35 (MQ=255) gtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATc < 1:759837/35‑1 (MQ=255) gtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATc > 1:2179805/1‑35 (MQ=255) gtaTATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATc < 1:11020903/35‑1 (MQ=255) tataTCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATcc > 1:4227372/1‑35 (MQ=255) atatCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCa < 1:16092682/35‑1 (MQ=255) tatCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCaa < 1:11604862/35‑2 (MQ=255) atCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg > 1:6502948/1‑35 (MQ=255) atCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg < 1:6377297/35‑1 (MQ=255) atCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg > 1:2657342/1‑35 (MQ=255) atCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg < 1:4552967/35‑1 (MQ=255) tCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGt < 1:16384120/35‑1 (MQ=255) tCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGt < 1:349838/35‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCCAATCCAGGtt > 1:8627244/1‑35 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 1:11233501/35‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 1:5903039/35‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 1:6090/35‑1 (MQ=255) cggcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTg < 1:13522904‑M2/29‑1 (MQ=255) ggcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGa < 1:9350687‑M2/30‑1 (MQ=255) ggcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGa < 1:8894876‑M2/30‑1 (MQ=255) ggcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGa < 1:20158730‑M2/30‑1 (MQ=255) ggcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGa > 1:13189775‑M2/6‑35 (MQ=255) gcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGttgca > 1:17395955‑M2/5‑33 (MQ=255) gcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGaa > 1:19189763‑M2/5‑35 (MQ=255) gcttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGaa > 1:951614‑M2/5‑35 (MQ=255) cttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAAc < 1:10494037‑M2/32‑1 (MQ=255) ttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACa < 1:12931075‑M2/33‑1 (MQ=255) ttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACa < 1:7367159‑M2/33‑1 (MQ=255) ttTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACa > 1:18797539‑M2/3‑35 (MQ=255) tTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaa < 1:20340048‑M2/34‑1 (MQ=255) tTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaa < 1:12039900‑M2/34‑1 (MQ=255) tggtggAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaa < 1:14536624/35‑1 (MQ=255) | GCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAA > REL606/4219111‑4219179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |