Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 3,517,306 | IS186 (+) +8 bp :: Δ2 | 56.2% | coding (187‑194/1743 nt) | ggt ← | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 590715 = | NA (NA) | 34 (0.380) | 22/42 | NT | 41.2% | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | = 3517313 | 30 (0.540) | coding (187/1743 nt) | ggt | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor | |||||
* | ? | REL606 | = 2774194 | NA (NA) | 52 (0.530) | 28/46 | NT | 47.8% | noncoding (1341/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | 3517306 = | 37 (0.580) | coding (194/1743 nt) | ggt | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor |
TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2774162‑2774194 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCCA > REL606/3517306‑3517339 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTACGAT > 1:6289400/1‑35 AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATAT < 1:16090389/35‑1 AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATAT < 1:14762480/35‑1 AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATAT > 1:575193/1‑35 GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATC < 1:9425574/35‑1 GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATC < 1:9367588/35‑1 GATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATC < 1:2474991/35‑1 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCC > 1:15395951/1‑35 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCC < 1:4982007/35‑1 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCC < 1:10854387/35‑1 TGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCA > 1:6746172/1‑35 GGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCAC < 1:17385280/35‑1 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACC < 1:158722/35‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCC < 1:7207245/35‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCC < 1:8598031/35‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCC < 1:2174469/35‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCA < 1:8719247/35‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCA < 1:1598886/35‑1 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCAC > 1:18066939/1‑35 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCAC > 1:10738134/1‑35 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCAC < 1:15650415/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCT < 1:5330067/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCT > 1:4255355/1‑35 CCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCT > 1:3840624/1‑35 CCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCT < 1:14950497/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCT < 1:19681203/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCT < 1:18879694/35‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTG < 1:3173956/35‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTG < 1:2684643/35‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTG > 1:19577918/1‑35 CTTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTG < 1:15986211/35‑1 TTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGA < 1:11782442/35‑1 TTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGA < 1:18390828/35‑1 TTAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGA < 1:17034885/35‑1 TAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAG > 1:7871890/1‑35 TAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAG > 1:12997294/1‑35 TAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAG < 1:19012521/35‑1 TAAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACATGAG < 1:20602169/35‑1 AAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGT > 1:6025790/1‑35 AAGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGT > 1:5885461/1‑35 AGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTG > 1:9234131/1‑35 AGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTG < 1:12035730/35‑1 AGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTG < 1:12458464/35‑1 AGTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTG < 1:4093189/35‑1 GTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGG < 1:2305173/35‑1 GTTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGG < 1:7218555/35‑1 TTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGC > 1:127236/1‑35 TTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGC < 1:15535501/35‑1 TTAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGC < 1:17122041/35‑1 TAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCA > 1:4700682/1‑35 TAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCA > 1:5400960/1‑35 TAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCA < 1:14176471/35‑1 TAGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCA < 1:18521238/35‑1 AGCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAG < 1:20563284/35‑1 AGCGCTTATGATATCAACCCCCACCTGAGTGGCAG < 1:1710257/35‑1 GCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGg > 1:576251/1‑34 GCGCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGT < 1:7550827/35‑1 GCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGG < 1:2754140/35‑1 GCTTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGGGG > 1:3692868/1‑35 CTTATGATATCCACCCACACCTGAGTGGCAGTGGC < 1:10935883/35‑1 TTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCG < 1:18621781/35‑1 TTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCG < 1:10774332/35‑1 TTATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCG < 1:4275925/35‑1 TATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGT < 1:9343053/35‑1 ATGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTC < 1:8741824/35‑1 TGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCC < 1:17908144/35‑1 TGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCC < 1:16846064/35‑1 TGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCC < 1:20073057/35‑1 GATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCCA < 1:6569525/35‑1 GATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCCA < 1:10788600/35‑1 GATATCCACCCCCACATGAGTGGCAGTGGCGTCCA < 1:4348617/35‑1 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2774162‑2774194 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCCA > REL606/3517306‑3517339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |