New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 4551446 | NA (NA) | 9 (0.090) | 8/46 | NT | 7.0% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | REL606 | 4560889 = | 119 (1.210) | coding (135/1590 nt) | hsdM | DNA methylase M |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
ATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGCCCA > REL606/4551414‑4551480 | aTAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCAc > 1:3193064/1‑35 (MQ=32) aTAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCAc > 1:10054468/1‑35 (MQ=32) aTAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCAc > 1:12588619/1‑35 (MQ=32) aTAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCAc > 1:11871632/1‑35 (MQ=32) tAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACg > 1:6283901/1‑35 (MQ=35) tAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACg > 1:6075821/1‑35 (MQ=35) aaaCCCTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGc < 1:12435908/35‑1 (MQ=255) aaaCACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGc > 1:2442440/1‑35 (MQ=38) aaCACTATCAATAAGTTGGAGTCATTCCCACGGCt < 1:9154700/35‑1 (MQ=255) aaCACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCt > 1:12545246/1‑35 (MQ=40) acacTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCtt < 1:15422909/35‑1 (MQ=255) acacTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCtt > 1:2838125/1‑35 (MQ=255) cacTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCttt < 1:16309948/35‑1 (MQ=255) acTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCtttt < 1:14699682/35‑1 (MQ=255) acTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCtttt > 1:7592138/1‑35 (MQ=255) cTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTa > 1:11048750/1‑35 (MQ=255) cTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTa > 1:5250693/1‑35 (MQ=255) cTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTa > 1:7886718/1‑35 (MQ=255) tATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTaa > 1:19435663/1‑35 (MQ=255) tATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTaa > 1:388799/1‑35 (MQ=255) aTCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTaaa < 1:13003636/35‑1 (MQ=255) aTCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTaaa > 1:8457011/1‑35 (MQ=255) aTCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTaaa > 1:11519462/1‑35 (MQ=255) aTCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTaaa < 1:17254042/35‑1 (MQ=255) tCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAg > 1:1745501/1‑35 (MQ=255) tCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAg > 1:10639315/1‑35 (MQ=255) tCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAg < 1:6894738/35‑1 (MQ=255) cAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAgg > 1:10676700/1‑35 (MQ=255) aaTAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAggg > 1:1497283/1‑34 (MQ=255) aaTAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGc > 1:9325561/1‑35 (MQ=255) aaTAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGc < 1:11968486/35‑1 (MQ=255) aaTAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGc > 1:7604030/1‑35 (MQ=255) aTAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCt > 1:11496974/1‑35 (MQ=255) aTAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCt > 1:18790793/1‑35 (MQ=255) aTAAGTTGGAGTCATTAACACGGCTTTTAAAGGCt < 1:19706530/35‑1 (MQ=255) tAAGTTGGAGTCATTACCACGTCTTTTAAAGGCtt > 1:13873119/1‑35 (MQ=255) tAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCtt > 1:58292/1‑35 (MQ=255) aaGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTa > 1:20323136/1‑35 (MQ=255) aaGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTa < 1:5099959/35‑1 (MQ=255) aaGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTa > 1:6612441/1‑35 (MQ=255) aaGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTa > 1:3175497/1‑35 (MQ=255) aGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTaa > 1:7681102/1‑35 (MQ=255) aGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTaa > 1:14194047/1‑35 (MQ=255) aGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTaa > 1:19203374/1‑35 (MQ=255) aGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTaa > 1:8841943/1‑35 (MQ=255) aGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTaa < 1:8006971/35‑1 (MQ=255) aGTTGGAGTCATTACAACGGCTTTTAAAGGCTTaa < 1:9191287/35‑1 (MQ=255) gTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTTAATGCTTTAc > 1:16255394/1‑35 (MQ=21) gTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAc < 1:18496702/35‑1 (MQ=255) gTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAc > 1:12789100/1‑35 (MQ=255) gTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAc < 1:8710184/35‑1 (MQ=255) gTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAc < 1:15945992/35‑1 (MQ=255) gTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAc < 1:16457675/35‑1 (MQ=255) gTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAAGCTTAAc > 1:9075805/1‑35 (MQ=255) ttGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTTAcc > 1:10348616/1‑35 (MQ=255) ttGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAcc > 1:18032677/1‑35 (MQ=255) ttGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAcc < 1:3785734/35‑1 (MQ=255) ttGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAcc > 1:5744211/1‑35 (MQ=255) ttGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAcc < 1:18780650/35‑1 (MQ=255) tGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAccc > 1:18065475/1‑35 (MQ=255) tGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAccc > 1:7232584/1‑35 (MQ=255) tGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAccc > 1:17343131/1‑35 (MQ=255) tGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAccc > 1:17131195/1‑35 (MQ=255) tGGAGTCATTACCACGGATTTTAAAGGCTTAAccc < 1:10758756/35‑1 (MQ=255) gggAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAccc < 1:6259272/34‑1 (MQ=255) ggAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAcccc < 1:1326142/35‑1 (MQ=255) ggAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAAcccc < 1:13010832/35‑1 (MQ=255) gAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGGTTAACCCCt > 1:16929555/1‑35 (MQ=255) gAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCt > 1:18023590/1‑35 (MQ=255) gAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCt < 1:3360278/35‑1 (MQ=255) aGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCtt > 1:9550413/1‑35 (MQ=255) aGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCtt < 1:12200295/35‑1 (MQ=255) aGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCtt < 1:13102816/35‑1 (MQ=255) gTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTa > 1:12325495/1‑35 (MQ=255) gTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTa > 1:13566131/1‑35 (MQ=255) gTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTa > 1:17047697/1‑35 (MQ=255) tCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTAt < 1:8104127/35‑1 (MQ=255) cATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATc < 1:9673133/35‑1 (MQ=255) aTTACCACGGCTTTTAAAGGCTTCACCCCTTATCt < 1:4164953/35‑1 (MQ=255) aTTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt > 1:1978985/1‑35 (MQ=255) aTTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt > 1:17646833/1‑35 (MQ=255) aTTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt < 1:12054187/35‑1 (MQ=255) aTTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt < 1:8265451/35‑1 (MQ=255) aTTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCt < 1:14846159/35‑1 (MQ=255) ttgccACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg < 1:14175818/32‑1 (MQ=255) ttACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg < 1:11323063/35‑1 (MQ=255) ttACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg < 1:4394963/35‑1 (MQ=255) ttACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg > 1:10193148/1‑35 (MQ=255) ttACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg < 1:18981842/35‑1 (MQ=255) ttACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg < 1:10982390/35‑1 (MQ=255) ttACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg < 1:1245646/35‑1 (MQ=255) ttACCACCGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTg > 1:7026698/1‑35 (MQ=255) tACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGc > 1:20465808/1‑35 (MQ=255) aCCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGcc < 1:10042079/35‑1 (MQ=255) aCCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCAGcc < 1:15869256/35‑1 (MQ=255) aCCACGGCTTTTAAAAGCTTAACCCCTTATCTGcc > 1:11343562/1‑35 (MQ=255) ccACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGccc < 1:5085104/35‑1 (MQ=255) cACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGccca < 1:9217241/35‑1 (MQ=255) cACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGccca < 1:8392415/35‑1 (MQ=255) cACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGccca < 1:19948273/35‑1 (MQ=255) | ATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCACGGCTTTTAAAGGCTTAACCCCTTATCTGCCCA > REL606/4551414‑4551480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |