Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 546,191 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (346‑354/384 nt) | ybcQ → | predicted antitermination protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 546191 = | 0 (0.000) | 77 (0.780) | 35/46 | NT | 100% | coding (346/384 nt) | ybcQ | predicted antitermination protein |
? | REL606 | 546932 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 546199 | 0 (0.000) | 125 (1.220) | 42/48 | NT | 100% | coding (354/384 nt) | ybcQ | predicted antitermination protein |
? | REL606 | = 547699 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
AAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATG > REL606/546165‑546233 | aGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGg < 1:10448072‑M1/35‑2 (MQ=255) aGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGg > 1:17381956‑M1/1‑34 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccCGGTTAGAGAt > 1:812012‑M1/25‑35 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccCGGTTAGAGAt > 1:2340821‑M1/25‑35 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccCGGTTAGAGAt > 1:12184504‑M1/25‑35 (MQ=255) gggATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGgg < 1:9842563‑M1/35‑3 (MQ=255) gggATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGgg > 1:19374848‑M1/1‑33 (MQ=255) gggATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGgg > 1:13454755‑M1/1‑33 (MQ=255) ggATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggg > 1:4163813‑M1/1‑32 (MQ=255) gATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtg > 1:15195354‑M1/1‑31 (MQ=255) gATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtg > 1:7253375‑M1/1‑31 (MQ=255) gATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtg < 1:3390104‑M1/35‑5 (MQ=255) caataagttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGa > 1:5692580‑M1/22‑35 (MQ=255) aTGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtga > 1:8210915‑M1/1‑30 (MQ=255) aTGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtga < 1:13840325‑M1/35‑6 (MQ=255) tGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtgat > 1:20326258‑M1/1‑29 (MQ=255) aataagttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGat > 1:16912535‑M1/21‑35 (MQ=255) ttAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtgatgc < 1:14082116‑M1/35‑9 (MQ=255) taagttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGatat > 1:9500860‑M1/19‑35 (MQ=255) taagttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGatat < 1:12598689‑M1/17‑1 (MQ=255) taagttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGatat > 1:1503437‑M1/19‑35 (MQ=255) taagttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGatat < 1:718105‑M1/17‑1 (MQ=255) agttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGATATCg > 1:4494967‑M1/17‑35 (MQ=255) agttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGATATCg > 1:16099180‑M1/17‑35 (MQ=255) agttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGATATCg < 1:17793904‑M1/19‑1 (MQ=255) aTGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtgatgctgc < 1:14464090‑M1/35‑12 (MQ=255) ttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGATATCgtt > 1:4776112‑M1/15‑35 (MQ=255) ttggagtcattaccCGGTTAGAGATGGATATCgtt > 1:16145761‑M1/15‑35 (MQ=255) tGGCATTAGATATCCGGTTAGAGggtgatgctgcc < 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1:10028640‑M1/1‑16 (MQ=255) aGATATCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttac < 1:14027416‑M1/35‑20 (MQ=255) gATATCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttact > 1:9645306‑M1/1‑15 (MQ=255) ttaccCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAAc < 1:8819139‑M1/30‑1 (MQ=255) atatCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactg > 1:12804802‑M1/1‑14 (MQ=255) atatCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactg < 1:9433332‑M1/35‑22 (MQ=255) tatCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactga > 1:3063595‑M1/1‑13 (MQ=255) tatCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactga > 1:18697252‑M1/1‑13 (MQ=255) tatCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactga < 1:14620458‑M1/35‑23 (MQ=255) taccCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAAct > 1:3717577‑M1/5‑35 (MQ=255) atCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactgat < 1:3201096‑M1/35‑24 (MQ=255) accCGGTTAGAGATGGATATCTTTGTTAATAActc < 1:7397293‑M1/32‑1 (MQ=255) tCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatt < 1:18517505‑M1/35‑25 (MQ=255) tCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatt < 1:211641‑M1/35‑25 (MQ=255) tCCGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatt < 1:10716841‑M1/35‑25 (MQ=255) cGGTTAGGGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaa < 1:17858787/35‑1 (MQ=255) cGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactgattta > 1:6854476‑M1/1‑9 (MQ=255) cGGTTAGAGggtgatgctgccaacttactgattta > 1:19944545‑M1/1‑9 (MQ=255) cGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaa < 1:12074632/35‑1 (MQ=255) ggTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:17629856‑M1/35‑28 (MQ=255) ggTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatttag > 1:13259159‑M1/1‑8 (MQ=255) ggTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatttag > 1:7472802‑M1/1‑8 (MQ=255) ggTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatttag > 1:20413730‑M1/1‑8 (MQ=255) ggTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:13118631‑M1/35‑28 (MQ=255) ggTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:19807052‑M1/35‑28 (MQ=255) ggTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaat > 1:10814710/1‑35 (MQ=255) gTTAGAGggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:14155196‑M1/1‑7 (MQ=255) ttAGAGggtgatgctgccaacttactgatttagtg < 1:20546688‑M1/35‑30 (MQ=255) ttAGAGggtgatgctgccaacttactgatttagtg > 1:15950854‑M1/1‑6 (MQ=255) ttAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaatta > 1:19094245/1‑35 (MQ=255) ttAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaatta < 1:16783089/35‑1 (MQ=255) ttAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaatta > 1:430844/1‑35 (MQ=255) tAGAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:16296963‑M1/1‑5 (MQ=255) tAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaattaa < 1:15704812/35‑1 (MQ=255) agagggtgatgctgccaacttactgatttagtgta > 1:14813104‑M1/1‑4 (MQ=255) agagggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:9086983‑M1/35‑32 (MQ=255) agagggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:2778906‑M1/35‑32 (MQ=255) agagATGGATATCGTTGTTAATAACTCtaattaat > 1:896855/1‑35 (MQ=255) gagggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 1:18114739‑M1/1‑3 (MQ=255) agggtgatgcttccaacttactgatttagtgtatg > 1:2898119‑M1/1‑2 (MQ=255) agggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg > 1:18061008‑M1/1‑2 (MQ=255) agaTGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAatat < 1:17457367/35‑1 (MQ=255) agaTGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAatat > 1:19575688/1‑35 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatta > 1:20056477‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:18280511‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:11427945‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:18933776‑M1/35‑35 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:9176348‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:8673679‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:7847245‑M1/35‑35 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:1367880‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:3498460‑M1/35‑35 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:10950583‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:6125371‑M1/1‑1 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:5894306‑M1/35‑35 (MQ=255) gggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:15344964‑M1/35‑35 (MQ=255) gggtcatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:4526461‑M1/35‑35 (MQ=255) | AAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATG > REL606/546165‑546233 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |