New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 223959 =46 (0.450)15 (0.180) 4/38 NT 24.3% coding (503/654 nt) metI DL‑methionine transporter subunit
?REL606 1306336 = 57 (0.700)intergenic (‑97/+274) cls/kch cardiolipin synthetase/voltage‑gated potassium channel

TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  REL606/223997‑223959
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcggGGGCGGGGGTAT  >  REL606/1306336‑1306347
                                                   
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TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAG                  >  1:14056326/1‑35
TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAG                  <  1:12465270/35‑1
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 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT                 >  1:15977354/1‑35
 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT                 >  1:18369384/1‑35
 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT                 <  1:8934784/35‑1
 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT                 <  1:19105680/35‑1
  CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTTGTGCAGTC                >  1:8795178/1‑35
  CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC                >  1:15169374/1‑35
  CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC                <  1:8613168/35‑1
  CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC                <  1:11698830/35‑1
  CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC                <  1:2132150/35‑1
  CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC                <  1:10895649/35‑1
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   CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG               <  1:10783638/35‑1
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    aTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG              <  1:5472358/34‑1
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    CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG              <  1:18931252/35‑1
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    CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG              <  1:3844474/35‑1
    CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG              <  1:11522473/35‑1
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    CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG              >  1:5357839/1‑35
    CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG              <  1:13936920/35‑1
     TGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGG             >  1:16298736/1‑35
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      GGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGG            >  1:2218998/1‑35
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      GGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGG            >  1:9702329/1‑35
         CGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCNNGGGNN         >  1:11723217/1‑35
         CGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGgg         >  1:5854485/1‑33
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         CGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCG         >  1:9465737/1‑35
          GGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGG        >  1:4920713/1‑35
           GTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGG       >  1:9991549/1‑35
           GTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGG       >  1:3217012/1‑35
           GTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGG       >  1:10945539/1‑35
            TTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGG      >  1:4448451/1‑35
            TTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGG      >  1:1155530/1‑35
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             TATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCCGGGG     >  1:735588/1‑35
              ATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGg    >  1:12733665/1‑34
              ATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGg    >  1:8983872/1‑34
              ATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGCCGGGGGg    >  1:18827041/1‑34
               TTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGgg   >  1:15670530/1‑33
                TCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGggg  >  1:18992892/1‑32
                                                   
TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  REL606/223997‑223959
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcggGGGCGGGGGTAT  >  REL606/1306336‑1306347

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.