New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1691508 = | 100 (0.970) | 7 (0.100) | 3/34 | NT | 8.7% | intergenic (+43/‑63) | ydgR/gst | putative tripeptide transporter permease/glutathionine S‑transferase |
? | REL606 | = 1806767 | 76 (1.040) | coding (233/1479 nt) | astD | succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
CTTACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCAAAGC > REL606/1806733‑1806800 | cTTACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAAtt > 1:4653728/1‑35 (MQ=255) cTTACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAAtt < 1:13616194/35‑1 (MQ=255) cTTACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAAtt < 1:16068563/35‑1 (MQ=255) cTTACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAAtt < 1:2503058/35‑1 (MQ=255) ttACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTc > 1:4508582‑M2/1‑34 (MQ=255) ttACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTc > 1:15967554‑M2/1‑34 (MQ=255) ttACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTc < 1:15320219‑M2/35‑2 (MQ=255) ttACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTc > 1:12812304‑M2/1‑34 (MQ=255) ttACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTc < 1:16917910‑M2/35‑2 (MQ=255) tACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGGTAAtttg > 1:19898489/1‑33 (MQ=38) aCCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcgg < 1:9540083‑M2/35‑4 (MQ=255) cccGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggc > 1:3806001‑M2/1‑31 (MQ=255) cccGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGGTAATTcggc < 1:10167719‑M2/35‑5 (MQ=255) ccGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggct > 1:15141085‑M2/1‑30 (MQ=255) ccGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggct > 1:855929‑M2/1‑30 (MQ=255) cGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctt < 1:6838462‑M2/35‑7 (MQ=255) cGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctt < 1:2924524‑M2/35‑7 (MQ=255) cGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctt > 1:13019330‑M2/1‑29 (MQ=255) cGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctt > 1:15238557‑M2/1‑29 (MQ=255) cGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctt < 1:19339706‑M2/35‑7 (MQ=255) cGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctt < 1:10048728‑M2/35‑7 (MQ=255) cGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGGTAATTCGGGtt > 1:10065201/1‑35 (MQ=38) gTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggcttt < 1:9691574‑M2/35‑8 (MQ=255) gTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggcttt < 1:6155334‑M2/35‑8 (MQ=255) gTTTCTCTGGCAATAATCGCGGGTAATTcggcttt < 1:15061296‑M2/35‑8 (MQ=255) tttCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctttt < 1:7826416‑M2/35‑9 (MQ=255) tttCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTa < 1:3880683/35‑1 (MQ=255) tttCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTa < 1:13191664/35‑1 (MQ=255) ttCTCTGGCAATAATCGCTGTTAATTcggcttttt < 1:4040357‑M2/35‑10 (MQ=255) ttCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggcttttt < 1:6579571‑M2/35‑10 (MQ=255) ttCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggcttttt < 1:20147565‑M2/35‑10 (MQ=255) ttCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTAt < 1:14761009/35‑1 (MQ=255) ttCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTAt < 1:14105932/35‑1 (MQ=255) tctcTGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctttttt < 1:10465239‑M2/35‑11 (MQ=255) tctcTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTAtt < 1:4356026/35‑1 (MQ=255) tctcTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTAtt < 1:20231554/35‑1 (MQ=255) tctcTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTAtt < 1:8899583/35‑1 (MQ=255) ctctGGCAATAATCGCGGTTAATTcggcttttttt < 1:2182189‑M2/35‑12 (MQ=255) tctGGCAATAATCGCGGTTAATTcggctttttttt < 1:14616768‑M2/35‑13 (MQ=255) tctGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGc < 1:16529590/35‑1 (MQ=255) ctGGCAATAATCGCGGTTAATTcggcttttttttc < 1:2201791‑M2/35‑14 (MQ=255) tGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCtt < 1:4062223/35‑1 (MQ=255) tGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCtt < 1:12325875/35‑1 (MQ=255) ggCAATAATCGCGGTTAATTcggcttttttttttt < 1:8636261‑M2/35‑16 (MQ=255) ggCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCttt < 1:17903418/35‑1 (MQ=255) gCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTTTTTCTTTc > 1:19735949/1‑35 (MQ=37) gCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTc < 1:12677501/35‑1 (MQ=255) cAATAATCGCGGTTAATTcggcttttttttttttc < 1:16108775‑M2/35‑18 (MQ=255) cAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTTTTTGTTTcc > 1:18194072/1‑35 (MQ=25) cAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTcc < 1:12519957/35‑1 (MQ=255) cAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTcc < 1:12355791/35‑1 (MQ=255) aataatCGCGGTTAATTcggcttttttttttttca < 1:8309273‑M2/35‑19 (MQ=255) aataatCGCGGTTAATTcggcttttttttttttca < 1:17298197‑M2/35‑19 (MQ=255) aataatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCa < 1:9903986/35‑1 (MQ=255) aataatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCa < 1:12787618/35‑1 (MQ=255) ataatCGCGGTTAATTCGGCTTTTTTTTTTTCCAg > 1:7762860/1‑35 (MQ=21) ataatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAg < 1:18837658/35‑1 (MQ=255) ataatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAg < 1:17779661/35‑1 (MQ=255) ataatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCAAg < 1:10223797/35‑1 (MQ=255) taatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGc < 1:11776167/35‑1 (MQ=255) aatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCa < 1:7243300/35‑1 (MQ=255) aatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCa < 1:18727351/35‑1 (MQ=255) aatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCa < 1:14567845/35‑1 (MQ=255) aatCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCAAGCa < 1:6200590/35‑1 (MQ=255) atCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCaa < 1:16668793/35‑1 (MQ=255) atCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCaa < 1:9648600/35‑1 (MQ=255) tCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAAt < 1:16173786/35‑1 (MQ=255) tCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAAt < 1:14429936/35‑1 (MQ=255) tCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAAt < 1:19432162/35‑1 (MQ=255) cgcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATc < 1:3764010/35‑1 (MQ=255) cgcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATc < 1:12948736/35‑1 (MQ=255) cgcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATc < 1:129994/35‑1 (MQ=255) cgcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATc < 1:9377494/35‑1 (MQ=255) cgcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATc > 1:7389192/1‑35 (MQ=255) gcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATcc < 1:8193086/35‑1 (MQ=255) gcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATcc < 1:8993256/35‑1 (MQ=255) gcgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATcc < 1:19588534/35‑1 (MQ=255) gcgGTTAATTAGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATcc < 1:15094145/35‑1 (MQ=255) cgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCg < 1:5137626/35‑1 (MQ=255) cgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCg < 1:14790417/35‑1 (MQ=255) cgGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCg < 1:11951924/35‑1 (MQ=255) ggTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATTCgg > 1:14249857/1‑35 (MQ=255) ggTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGAAATCCgg < 1:13106359/35‑1 (MQ=255) ggTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGAAATCCgg > 1:2570885/1‑35 (MQ=255) gTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGc < 1:6431866/35‑1 (MQ=255) gTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGc < 1:16173316/35‑1 (MQ=255) gTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGc < 1:11058927/35‑1 (MQ=255) ttAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCa < 1:13240349/35‑1 (MQ=255) ttAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCa > 1:9795304/1‑35 (MQ=255) ttAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCa > 1:18419834/1‑35 (MQ=255) tAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCaa > 1:8729865/1‑35 (MQ=255) tAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCaa < 1:387102/35‑1 (MQ=255) aaTTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCaaa < 1:17430306/35‑1 (MQ=255) aaTTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCaaa < 1:9334961/35‑1 (MQ=255) aaTTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCaaa > 1:10254966/1‑35 (MQ=255) aaTTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCaaa < 1:14246251/35‑1 (MQ=255) aTTCTGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCAAAg > 1:8850738/1‑35 (MQ=255) aTTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCAAAg > 1:9668962/1‑35 (MQ=255) aTTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCAAAg > 1:4188171/1‑35 (MQ=255) ttCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCAAAGc < 1:18948999/35‑1 (MQ=255) | CTTACCCGTTTCTCTGGCAATAATCGCGGTTAATTCGGCTTTATTGCTTTCCAGCAATCCGGCAAAGC > REL606/1806733‑1806800 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |