Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 3,517,306 | IS186 (+) +8 bp :: Δ2 | 56.2% | coding (187‑194/1743 nt) | ggt ← | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 590715 = | NA (NA) | 34 (0.380) | 22/42 | NT | 41.2% | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | = 3517313 | 30 (0.540) | coding (187/1743 nt) | ggt | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor | |||||
* | ? | REL606 | = 2774194 | NA (NA) | 52 (0.530) | 28/46 | NT | 47.8% | noncoding (1341/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | 3517306 = | 37 (0.580) | coding (194/1743 nt) | ggt | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor |
CAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGAT > REL606/2774163‑2774228 | cAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt > 1:16470082/1‑35 (MQ=32) cAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt < 1:9386706/35‑1 (MQ=32) cAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt > 1:18406189/1‑35 (MQ=32) cAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt > 1:4600839/1‑35 (MQ=32) cAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGt > 1:16829330/1‑35 (MQ=32) aGATTGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtt > 1:6490961/1‑35 (MQ=255) aGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtt > 1:12314877/1‑35 (MQ=35) gATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGttt < 1:16436408/35‑1 (MQ=38) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtttt < 1:1017349/35‑1 (MQ=40) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtttt > 1:20488448/1‑35 (MQ=40) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtttt < 1:13978217/35‑1 (MQ=40) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtgtt < 1:7502002/35‑1 (MQ=12) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtggg > 1:17089597/1‑32 (MQ=12) aTGGTTAAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtgtt < 1:35979/35‑1 (MQ=11) tGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtgttc < 1:3240334/35‑2 (MQ=255) tGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTa > 1:2886536/1‑35 (MQ=255) ggTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGtgttcc < 1:4846750/35‑3 (MQ=11) ggTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAc < 1:7971309/35‑1 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAcc < 1:3536702/35‑1 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAcc < 1:16972255/35‑1 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAcc > 1:16639545/1‑35 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCcc < 1:12861195/35‑1 (MQ=11) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCcc < 1:20320149/35‑1 (MQ=11) gTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCcc < 1:7028446/35‑1 (MQ=11) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccc > 1:16105336/1‑35 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccc > 1:7805508/1‑35 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCccc < 1:15710645/35‑1 (MQ=11) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAcccc > 1:6888934/1‑35 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCcccg < 1:13963482/35‑2 (MQ=11) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccccc > 1:12162812/1‑35 (MQ=255) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTAccccc < 1:13380973/35‑1 (MQ=255) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCcccgc < 1:20024165/35‑3 (MQ=11) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCcccgc < 1:10052527/35‑3 (MQ=11) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTAcccgc < 1:12396245/35‑3 (MQ=14) cAACCATTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCcccgc < 1:2257910/35‑3 (MQ=11) aaaccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcg < 1:1100662/32‑1 (MQ=2) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcg < 1:1438108/35‑1 (MQ=11) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcg < 1:2337915/35‑1 (MQ=11) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgc > 1:12749777/1‑35 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgc < 1:10658744/35‑1 (MQ=14) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgc < 1:60125/35‑1 (MQ=14) cccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCcgcg > 1:20419630/1‑35 (MQ=255) cccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgcc < 1:7608468/35‑2 (MQ=11) cccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgcc < 1:18763093/35‑2 (MQ=11) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgcca < 1:9001303/35‑3 (MQ=11) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgcca < 1:11652910/35‑3 (MQ=11) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgcca < 1:20308504/35‑3 (MQ=11) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtg > 1:17939437/1‑35 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtg < 1:14529965/35‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGTGTTCCCCGcgccag < 1:2297075/35‑4 (MQ=2) ttAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtgg < 1:9874239/35‑1 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtgg > 1:17032801/1‑35 (MQ=255) tAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggt > 1:6207291/1‑35 (MQ=255) tAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggt < 1:19884809/35‑1 (MQ=255) tAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggt < 1:4203146/35‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg > 1:17387888/1‑35 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg > 1:19066809/1‑35 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg > 1:5113766/1‑35 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg < 1:7478989/35‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg > 1:17972732/1‑35 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCgtggtg > 1:1811725/1‑35 (MQ=255) aGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGtggtgg > 1:825535/1‑35 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCt > 1:19004417/1‑35 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCt < 1:17208336/35‑1 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCt > 1:340251/1‑35 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTa < 1:13670749/35‑1 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTa < 1:11033955/35‑1 (MQ=255) aGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGTCTAc > 1:19002572/1‑35 (MQ=255) aGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAc > 1:7933115/1‑35 (MQ=255) aGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAc < 1:10456304/35‑1 (MQ=255) gcgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAct < 1:7655965/35‑1 (MQ=255) gcgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAct < 1:18283952/35‑1 (MQ=255) gcgcTTATGGGTTTTACCCCAGCGTGGTGGCTAct < 1:13638590/35‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActt < 1:17875302/35‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActt < 1:4238613/35‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActt < 1:18560806/35‑1 (MQ=255) gcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtc < 1:7323809/35‑1 (MQ=255) gcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtc > 1:7257743/1‑35 (MQ=255) gcTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtc > 1:1957211/1‑35 (MQ=255) cTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct < 1:11919418/35‑1 (MQ=255) cTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct < 1:6355039/35‑1 (MQ=255) cTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct < 1:6388660/35‑1 (MQ=255) cTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct > 1:6568839/1‑35 (MQ=255) cTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtct < 1:14791888/35‑1 (MQ=255) ttATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtctt > 1:15484388/1‑35 (MQ=255) ttATGGGTTTTACCCACGCGTGGTGGCTActtctt < 1:4222577/35‑1 (MQ=255) tATGGTCTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACttcttc < 1:5832919/35‑1 (MQ=37) aTGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTActtttttg > 1:13985906/1‑33 (MQ=38) aTGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCg > 1:2850491/1‑35 (MQ=255) aTGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCg < 1:2140334/35‑1 (MQ=255) aTGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCg < 1:16092251/35‑1 (MQ=255) aTGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTAATTTTTCg > 1:19904254/1‑35 (MQ=37) tGGTTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGa < 1:10633031/35‑1 (MQ=255) tGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTTTTCGa > 1:16353416/1‑35 (MQ=255) tGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGa < 1:16102832/35‑1 (MQ=255) tGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGa < 1:3632521/35‑1 (MQ=255) tGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGa < 1:1191672/35‑1 (MQ=255) gggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGAt > 1:3053150/1‑35 (MQ=255) gggTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGAt < 1:1769111/35‑1 (MQ=255) | CAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTTACCCCCGCGTGGTGGCTACTTCTTCGAT > REL606/2774163‑2774228 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |