New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 365501 =115 (1.120)5 (0.060) 3/40 NT 6.1% coding (1217/1221 nt) sbmA predicted transporter
?REL606 = 3726074 57 (0.670)coding (49/1545 nt) yibO phosphoglyceromutase

Only 100 of 134 total aligned reads displayed.

AAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTT  >  REL606/3726040‑3726108
                                  |                                  
aaaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGatggctatg                                    <  1:10767905/35‑1 (MQ=255)
 aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg                                   <  1:15183140‑M2/35‑2 (MQ=255)
 aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg                                   >  1:6058868‑M2/1‑34 (MQ=255)
 aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg                                   >  1:14188222‑M2/1‑34 (MQ=255)
 aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg                                   >  1:18226268‑M2/1‑34 (MQ=255)
 aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg                                   <  1:18108296‑M2/35‑2 (MQ=255)
 aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg                                   >  1:10367937‑M2/1‑34 (MQ=255)
  aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc                                  >  1:13070369‑M2/1‑33 (MQ=255)
  aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc                                  <  1:17190513‑M2/35‑3 (MQ=255)
  aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc                                  <  1:12087621‑M2/35‑3 (MQ=255)
  aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc                                  >  1:8672027‑M2/1‑33 (MQ=255)
  aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc                                  <  1:10806026‑M2/35‑3 (MQ=255)
   aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGggt                                 <  1:2515620‑M2/35‑4 (MQ=255)
   aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct                                 <  1:11883301‑M2/35‑4 (MQ=255)
   aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct                                 >  1:12555162‑M2/1‑32 (MQ=255)
   aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct                                 <  1:18911531‑M2/35‑4 (MQ=255)
   aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct                                 >  1:18537103‑M2/1‑32 (MQ=255)
   aCATATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct                                 >  1:1893226‑M2/1‑32 (MQ=255)
    ccTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgcta                                >  1:8422214‑M2/1‑31 (MQ=255)
    ccTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgcta                                <  1:7437240‑M2/35‑5 (MQ=255)
    catatGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgcta                                >  1:8285652‑M2/3‑31 (MQ=255)
     cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat                               <  1:15887577/35‑1 (MQ=255)
     cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat                               <  1:17583559/35‑1 (MQ=255)
     cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat                               <  1:5138574/35‑1 (MQ=255)
     cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat                               <  1:9535986/35‑1 (MQ=255)
     cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat                               <  1:14789589/35‑1 (MQ=255)
      tATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaa                              <  1:13672568‑M2/35‑7 (MQ=255)
      tATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATc                              <  1:12312073/35‑1 (MQ=255)
       aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaa                             <  1:14808048‑M2/35‑8 (MQ=255)
       aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaa                             <  1:6843407‑M2/35‑8 (MQ=255)
       aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCg                             <  1:19376600/35‑1 (MQ=255)
       aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCg                             <  1:16481383/35‑1 (MQ=255)
        tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt                            <  1:20556737/35‑1 (MQ=255)
        tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt                            <  1:7277524/35‑1 (MQ=255)
        tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt                            <  1:20340669/35‑1 (MQ=255)
        tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt                            <  1:7389348/35‑1 (MQ=255)
         ggTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTg                           <  1:15919425/35‑1 (MQ=255)
         ggTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATAGTg                           <  1:5758563/35‑1 (MQ=255)
          gTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTga                          <  1:19275017/35‑1 (MQ=255)
          gTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTga                          <  1:5400518/35‑1 (MQ=255)
          gTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTga                          <  1:8811193/35‑1 (MQ=255)
           tACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaa                         <  1:9252627‑M2/35‑12 (MQ=255)
           tACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaa                         <  1:18378934‑M2/35‑12 (MQ=255)
           tACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaa                         <  1:17163093/35‑1 (MQ=255)
            aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaaggag                        <  1:8732291‑M2/35‑13 (MQ=255)
            aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaaggaa                        <  1:10012098‑M2/35‑13 (MQ=255)
            aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaaa                        <  1:15154209‑M2/35‑13 (MQ=255)
            aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaaa                        <  1:17076010‑M2/35‑13 (MQ=255)
            aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaag                        <  1:9647749/35‑1 (MQ=255)
            aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaag                        <  1:16369061/35‑1 (MQ=255)
             cTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaaga                       <  1:9576356/35‑1 (MQ=255)
             cTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaaga                       <  1:11803508/35‑1 (MQ=255)
             cTGGTGATCCTGGATGGCTATGgctaaaaaggaga                       <  1:5898566‑M2/35‑14 (MQ=255)
              tGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaaggagaa                      <  1:2803368‑M2/35‑15 (MQ=255)
              tGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaagaa                      <  1:17070920/35‑1 (MQ=255)
              tGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaagaa                      <  1:7578771/35‑1 (MQ=255)
              tGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaagaa                      <  1:11835636/35‑1 (MQ=255)
               ggTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAc                     <  1:5447620/35‑1 (MQ=255)
               ggTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAc                     <  1:13175817/35‑1 (MQ=255)
               ggTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAc                     <  1:10187821/35‑1 (MQ=255)
                gTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAca                    <  1:8322811/35‑1 (MQ=255)
                gTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAca                    <  1:3112164/35‑1 (MQ=255)
                gTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAca                    <  1:18124437/35‑1 (MQ=255)
                 tGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcag                   <  1:7326826/35‑1 (MQ=255)
                 tGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcag                   <  1:9431231/35‑1 (MQ=255)
                 tGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcag                   <  1:9677419/35‑1 (MQ=255)
                 tGATTCTGGATGGCTATGGCTAAAATgaagaaaaa                   >  1:9302022/1‑32 (MQ=19)
                 tGATTCTGGATGGCTATGGCTAAAATgaagaaaaa                   >  1:14743214/1‑32 (MQ=19)
                  gATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagc                  <  1:1435081/35‑1 (MQ=255)
                  gATTCGGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagc                  <  1:1773040/35‑1 (MQ=255)
                   aTTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagca                 <  1:19743597/35‑1 (MQ=255)
                   aTTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagca                 <  1:3772673/35‑1 (MQ=255)
                   aTTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagca                 <  1:4011474/35‑1 (MQ=255)
                   aTTCTGGATGGCTATAGCTATCGTGAAGAAcagca                 <  1:13122688/35‑1 (MQ=255)
                    ttCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagcag                <  1:9209641/35‑1 (MQ=255)
                    ttCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagcag                <  1:3086908/35‑1 (MQ=255)
                       tGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGAt             <  1:5108261/35‑1 (MQ=255)
                       tGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGAt             <  1:8333197/35‑1 (MQ=255)
                       tGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGAt             <  1:1359343/35‑1 (MQ=255)
                        ggATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATa            <  1:15273435/35‑1 (MQ=255)
                        ggATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATa            <  1:6405067/35‑1 (MQ=255)
                         gATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATaa           <  1:19403159/35‑1 (MQ=255)
                         gATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATaa           <  1:15697483/35‑1 (MQ=255)
                         gATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATaa           <  1:15418865/35‑1 (MQ=255)
                          atggctatggctATCGTGAAGAACAGCAGGATAAc          <  1:16036665/35‑1 (MQ=255)
                          atggctatggctATCGTGAAGAACAGCAGGATAAc          <  1:4752756/35‑1 (MQ=255)
                          atggctatggctATCGTGAAGAACAGCAGGATAAc          <  1:4647820/35‑1 (MQ=255)
                           tggctatggctaTCGTGAAGAACAGCAGGATAACg         <  1:2183423/35‑1 (MQ=255)
                            ggctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGc        <  1:18294294/35‑1 (MQ=255)
                            ggctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGc        <  1:1638738/35‑1 (MQ=255)
                            ggctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGc        <  1:8126130/35‑1 (MQ=255)
                             gctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGcc       <  1:6824108/35‑1 (MQ=255)
                               tatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAt     <  1:13566693/35‑1 (MQ=255)
                                atggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtt    <  1:6998817/35‑1 (MQ=255)
                                 tggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAttt   <  1:8387007/35‑1 (MQ=255)
                                 tggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAttt   <  1:14143384/35‑1 (MQ=255)
                                  ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtttt  <  1:11373723/35‑1 (MQ=255)
                                  ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtttt  <  1:15388365/35‑1 (MQ=255)
                                  ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtttt  >  1:4417291/1‑35 (MQ=255)
                                  ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAAAGCCAtttt  >  1:8745932/1‑35 (MQ=255)
                                  |                                  
AAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTT  >  REL606/3726040‑3726108

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.