New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 422591 = | 80 (0.780) | 9 (0.110) | 4/38 | NT | 16.0% | intergenic (‑278/+184) | cyoA/ampG | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II/muropeptide transporter |
? | REL606 | 3002837 = | 31 (0.380) | coding (307/2517 nt) | yeeR | predicted membrane protein |
CACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCA > REL606/3002803‑3002871 | cacCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCg > 1:4201987/1‑35 (MQ=255) cacCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCg > 1:5018335/1‑35 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGc > 1:18505764/1‑35 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGc > 1:9259079/1‑35 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGc > 1:6687820/1‑35 (MQ=255) acCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGc > 1:14545395/1‑35 (MQ=255) ccTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGct > 1:12071622/1‑35 (MQ=255) cTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGctc > 1:3224546/1‑35 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTTACCACCGctct > 1:17911060/1‑35 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGctct > 1:6070501/1‑35 (MQ=255) tttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGctct > 1:1448310/1‑35 (MQ=255) ttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCtctc > 1:3787411/1‑35 (MQ=255) ttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCtctc > 1:3580723/1‑35 (MQ=255) ttGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCtctc > 1:2728948/1‑35 (MQ=255) gACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGc > 1:13580682/1‑35 (MQ=255) aCTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGcc > 1:13512486/1‑35 (MQ=255) aCTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGcc > 1:16491835/1‑35 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCg > 1:1798339/1‑35 (MQ=255) ctctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCg > 1:16030644/1‑35 (MQ=255) tctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCgg > 1:6317053/1‑35 (MQ=255) tctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCgg > 1:6574069/1‑35 (MQ=255) tctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCgg > 1:19000465/1‑35 (MQ=255) ctttgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggt > 1:415549/4‑35 (MQ=255) ctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggt > 1:9808996/1‑35 (MQ=255) ctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggt > 1:19888820/1‑35 (MQ=255) ctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggt > 1:2605742/1‑35 (MQ=255) ctGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggt > 1:4201871/1‑35 (MQ=255) tgtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggtg > 1:20345800/1‑35 (MQ=255) tgtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggtg > 1:9748693/1‑35 (MQ=255) tgtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggtg > 1:5021189/1‑35 (MQ=255) tgtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggag > 1:14870142/1‑33 (MQ=255) gtgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggtgg > 1:16039769/1‑35 (MQ=255) tgAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggtggg > 1:6371474/1‑34 (MQ=255) gAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCggtgggc > 1:9318406/1‑33 (MQ=255) aaaTTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGct > 1:48534/1‑35 (MQ=255) aaaTTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGct > 1:12964731/1‑35 (MQ=255) ttttttcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTctgc < 1:5885077‑M2/19‑1 (MQ=255) aTTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGctgc > 1:17750183/1‑35 (MQ=255) tttttcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTctgct < 1:3051421‑M2/20‑1 (MQ=255) tttATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTCGCctgct > 1:1156669/1‑35 (MQ=37) ttttcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTctgctg < 1:17314847‑M2/21‑1 (MQ=255) ttttcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTctgctg < 1:12077096‑M2/21‑1 (MQ=255) ttttcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTctgctg < 1:15597821‑M2/21‑1 (MQ=255) ttttcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTctgctg < 1:3741699‑M2/21‑1 (MQ=255) tttcccccccaccGCTCTCGCAGGTGGTCTgctgg < 1:523962‑M2/22‑1 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGCTgctgg > 1:11830592/1‑35 (MQ=255) tATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGCTgctgg > 1:5664515/1‑35 (MQ=255) ttcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTgctggc < 1:18601162‑M2/23‑1 (MQ=255) aTTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGCTgctggc > 1:20027801/1‑35 (MQ=255) ttCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTgctggct > 1:17986618/1‑35 (MQ=255) tcccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTgctggct < 1:5202221‑M2/24‑1 (MQ=255) gccccccaccGCGCTCGCCGGTGGTCTgctggctg < 1:11250385‑M2/25‑1 (MQ=255) ccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGt < 1:17526147‑M2/26‑1 (MQ=255) ccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGt < 1:6998721‑M2/26‑1 (MQ=255) ccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGt < 1:4815654‑M2/26‑1 (MQ=255) ccccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGt < 1:5729844‑M2/26‑1 (MQ=255) cTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGGTgctggctgg > 1:3107253/1‑34 (MQ=25) cTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGGCTgctggctgg > 1:17219370/1‑34 (MQ=255) tGACCACCGCTCTCGCCGGTTGTCTgctggctggg > 1:12025568/1‑33 (MQ=38) cccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGtt < 1:2942602‑M2/27‑1 (MQ=255) gACCACCGCTCTCGCCGGTGGGCTgctggctgggg > 1:7426192/1‑32 (MQ=37) ccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTc < 1:3698596‑M2/28‑1 (MQ=255) ccccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTc < 1:4948007‑M2/28‑1 (MQ=255) cccccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTccc < 1:9458990‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTccc < 1:17413320‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTccc < 1:885531‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTccc < 1:15688254‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTccc < 1:16657015‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTccc < 1:6219819‑M2/30‑1 (MQ=255) ccaccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTccc < 1:12237246‑M2/30‑1 (MQ=255) caccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTcccc < 1:15661618‑M2/31‑1 (MQ=255) accGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCt < 1:19902738‑M2/32‑1 (MQ=255) accGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCt < 1:13937304‑M2/32‑1 (MQ=255) accGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCt < 1:14025910‑M2/32‑1 (MQ=255) accGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCt < 1:2340‑M2/32‑1 (MQ=255) accGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCt < 1:17521371‑M2/32‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTg < 1:493070‑M2/33‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTg < 1:11648480‑M2/33‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTg < 1:13344278‑M2/33‑1 (MQ=255) gCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCa < 1:2171927/35‑1 (MQ=255) gCTCTCGCCGGTGGTCTGATGGCTGTTCCCCTGCa < 1:16143485/35‑1 (MQ=255) | CACCTTTGACTCTGTGAAATTTATTCTGACCACCGCTCTCGCCGGTGGTCTGCTGGCTGTTCCCCTGCA > REL606/3002803‑3002871 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |