New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 187382 = | 110 (1.070) | 13 (0.150) | 3/40 | NT | 14.9% | coding (530/813 nt) | yaeI | predicted phosphatase |
? | REL606 | 3669194 = | 57 (0.670) | coding (1242/2031 nt) | malS | periplasmic alpha‑amylase precursor |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TTTTGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATGG > REL606/3669160‑3669228 | ttttGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCt > 1:2606978/1‑35 (MQ=255) tttGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCtt > 1:10130533/1‑35 (MQ=255) ttGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTc > 1:7520140/1‑35 (MQ=255) tGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCt > 1:7663281/1‑35 (MQ=255) gCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTg > 1:15249640/1‑35 (MQ=255) gCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTg > 1:5178841/1‑35 (MQ=255) ccGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTgg > 1:17370724/1‑35 (MQ=255) ccGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTgg > 1:16800222/1‑35 (MQ=255) cGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGt > 1:529767/1‑35 (MQ=255) cGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGt > 1:3110977/1‑35 (MQ=255) cGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGt > 1:19023826/1‑35 (MQ=255) ggATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTc > 1:7487383/1‑35 (MQ=255) ggATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTc > 1:2623769/1‑35 (MQ=255) ggATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTc > 1:7988285/1‑35 (MQ=255) ggATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTc > 1:19076571/1‑35 (MQ=255) ggATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTc > 1:17866020/1‑35 (MQ=255) gATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCt > 1:3783634/1‑35 (MQ=255) gATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCt > 1:19900424/1‑35 (MQ=255) gATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCt > 1:9558343/1‑35 (MQ=255) gATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCt > 1:12423978/1‑35 (MQ=255) tatCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGc > 1:9172561/1‑35 (MQ=255) tatCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGc > 1:2719263/1‑35 (MQ=255) atCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGcc > 1:8627899/1‑35 (MQ=255) atCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGcc > 1:12337576/1‑35 (MQ=255) atCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGcc > 1:16514685/1‑35 (MQ=255) tCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCg > 1:4095211/1‑35 (MQ=255) cAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCgg > 1:552031/1‑35 (MQ=255) cAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCgg > 1:4927356/1‑35 (MQ=255) aaaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtg > 1:10322163/1‑35 (MQ=255) aaaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtg > 1:5125464/1‑35 (MQ=255) aaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtgt > 1:9074574/1‑35 (MQ=255) aaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtgt > 1:12405933/1‑35 (MQ=255) aaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtgt > 1:8015917/1‑35 (MQ=255) aaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtgt > 1:14293111/1‑35 (MQ=255) aaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtgt > 1:18390533/1‑35 (MQ=255) aaCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGgtgt > 1:5888865/1‑35 (MQ=255) cccaaaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGtt < 1:19612017‑M2/18‑1 (MQ=255) cccaaaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGtt < 1:4046951‑M2/18‑1 (MQ=255) cccaaaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGtt < 1:5142193‑M2/18‑1 (MQ=255) aCCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGtt > 1:15788023/1‑35 (MQ=255) ccGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTc > 1:3149411/1‑35 (MQ=255) ccGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTc > 1:17425654/1‑35 (MQ=255) ccGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTc > 1:14866584/1‑35 (MQ=255) caaaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCt < 1:294200‑M2/20‑1 (MQ=255) caaaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCt < 1:16125137‑M2/20‑1 (MQ=255) cGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCt > 1:11078903/1‑35 (MQ=255) cGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCt > 1:6151431/1‑35 (MQ=255) cGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCt > 1:18531428/1‑35 (MQ=255) cGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCt > 1:15149857/1‑35 (MQ=255) gAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta > 1:10749924/1‑35 (MQ=255) gAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta > 1:17992597/1‑35 (MQ=255) gAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta > 1:9551810/1‑35 (MQ=255) gAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta > 1:2583954/1‑35 (MQ=255) aaaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta < 1:16852821‑M2/21‑1 (MQ=255) aaaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta < 1:13339535‑M2/21‑1 (MQ=255) aaacaacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta < 1:13435265‑M2/21‑1 (MQ=255) aaaacacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCta < 1:16264115‑M2/21‑1 (MQ=255) aaccccctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCtat < 1:18360853‑M2/22‑1 (MQ=255) aaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCtat < 1:16290038‑M2/22‑1 (MQ=255) aaccacctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCtat < 1:5416776‑M2/22‑1 (MQ=255) aaTCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCtat > 1:13008550/1‑35 (MQ=255) aTCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCtata > 1:2397335/1‑35 (MQ=255) tCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaa > 1:18787585/1‑35 (MQ=255) accaCTCCCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaa < 1:3298427/32‑1 (MQ=37) cccctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaa < 1:14821356‑M2/25‑1 (MQ=255) cAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaa > 1:9503972/1‑35 (MQ=255) cAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaa > 1:1089107/1‑35 (MQ=255) accccccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaaa < 1:11961795‑M2/26‑1 (MQ=255) aaCTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaaa > 1:13363440/1‑35 (MQ=255) aaCTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaaa > 1:5989517/1‑35 (MQ=255) cctcccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaaaa < 1:15528311‑M2/27‑1 (MQ=255) aCTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaaaa > 1:14990735/1‑35 (MQ=255) aCTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATaaaaa > 1:6924544/1‑35 (MQ=255) cccccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAAc < 1:848831‑M2/28‑1 (MQ=255) cTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAAc > 1:18258249/1‑35 (MQ=255) cTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAAc > 1:5791729/1‑35 (MQ=255) ccccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACa < 1:5869020‑M2/29‑1 (MQ=255) ccccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACa < 1:20355427‑M2/29‑1 (MQ=255) ccccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACa < 1:3339635‑M2/29‑1 (MQ=255) aCCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaa > 1:12003621/1‑35 (MQ=255) aCCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaa > 1:18298937/1‑35 (MQ=255) aCCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaa > 1:4658218/1‑35 (MQ=255) ccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTGTATAAAAACaaa > 1:5217732‑M2/5‑35 (MQ=255) ccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaa > 1:20128452‑M2/5‑35 (MQ=255) ccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaa < 1:14505979‑M2/31‑1 (MQ=255) ccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaa < 1:18250113‑M2/31‑1 (MQ=255) ccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaa > 1:3863970‑M2/5‑35 (MQ=255) ccgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaa < 1:2737740‑M2/31‑1 (MQ=255) cgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaaa > 1:19512655‑M2/4‑35 (MQ=255) cgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaaa > 1:2318062‑M2/4‑35 (MQ=255) cgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaaa > 1:16766596‑M2/4‑35 (MQ=255) cgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaaa < 1:15223935‑M2/32‑1 (MQ=255) cgcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACaaaa > 1:16106640‑M2/4‑35 (MQ=255) gcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAAt < 1:15778419‑M2/33‑1 (MQ=255) gcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAAt < 1:8784817‑M2/33‑1 (MQ=255) gcTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAAt < 1:1617130‑M2/33‑1 (MQ=255) cTTCTGGTCTGCCTGTGTTCTATAAAAACAAAATg > 1:9430612‑M2/2‑35 (MQ=255) cTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATg > 1:13392840‑M2/2‑35 (MQ=255) cTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATg < 1:12769935‑M2/34‑1 (MQ=255) ttCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATgg > 1:9320689/1‑35 (MQ=255) | TTTTGCCGGATATCAAAACCGAATCAACTACCGCTTCTGGTCTGCCGGTGTTCTATAAAAACAAAATGG > REL606/3669160‑3669228 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |