New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1686611 | 82 (0.800) | 12 (0.120) | 3/48 | NT | 15.0% | coding (276/1059 nt) | rnfD | electron transport complex protein RnfD |
? | REL606 | = 4059472 | 54 (0.530) | coding (536/636 nt) | fdoI | formate dehydrogenase‑O, cytochrome b556 subunit |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
CAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGGTGT > REL606/1686577‑1686645 | cAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTc < 1:5201116/35‑1 (MQ=255) cAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTc < 1:16684449/35‑1 (MQ=255) cAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTc < 1:18814271/35‑1 (MQ=255) ggCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTcgc < 1:14685053/35‑1 (MQ=255) ggCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTcgc < 1:9382011/35‑1 (MQ=255) ggCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTcgc < 1:17307344/35‑1 (MQ=255) ttATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGcc < 1:10540466/35‑1 (MQ=255) tATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCa < 1:13709696/35‑1 (MQ=255) tATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCa < 1:880887/35‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCAtg < 1:11568737/35‑1 (MQ=255) ttGATGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCAtg < 1:17898388/35‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCAtgg < 1:1789357/35‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCAtgg < 1:7592663/35‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCAtggt < 1:1119186/35‑1 (MQ=255) tGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCAtggtgg < 1:508188/35‑1 (MQ=255) tGGCGGTAAGTATTCCCACCCTCGCGCCAtggtgg < 1:10049079/35‑1 (MQ=255) ggCGGTAAGTATTCCCCACCTCGCGCCATGGTGGa < 1:13570573/35‑1 (MQ=255) cGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATg < 1:19172829/35‑1 (MQ=255) cGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATg > 1:16334389/1‑35 (MQ=255) ggTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCCTGGTGGATgg < 1:15236054/35‑1 (MQ=255) ggTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATTGTGGATgg > 1:8675565/1‑35 (MQ=255) ggTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATgg < 1:18363748/35‑1 (MQ=255) ggTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATgg < 1:3728293/35‑1 (MQ=255) ggTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATgg > 1:15106389/1‑35 (MQ=255) gTAAGTATTCCCCCCCTCTCGCCATGGTGGATggc > 1:10916432/1‑34 (MQ=255) gTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATgtt > 1:18730474/1‑33 (MQ=255) gTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGt < 1:17139242/35‑1 (MQ=255) gTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGt < 1:5464661/35‑1 (MQ=255) gTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGt < 1:7340420/35‑1 (MQ=255) gTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGt > 1:903917/1‑35 (MQ=255) tAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTc < 1:197656/35‑1 (MQ=255) tAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTc < 1:12367594/35‑1 (MQ=255) tAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTc > 1:10397614/1‑35 (MQ=255) aaatATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCg > 1:13868210/4‑35 (MQ=255) aaGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCg > 1:19530861/1‑35 (MQ=255) aaGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCg < 1:5774744/35‑1 (MQ=255) aaGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCg > 1:16794523/1‑35 (MQ=255) gTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGTATGGTCGTg > 1:15075119/1‑35 (MQ=255) gTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTg > 1:7697489/1‑35 (MQ=255) gTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTg > 1:9596444/1‑35 (MQ=255) gTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTg < 1:10033852/35‑1 (MQ=255) tATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGc > 1:9173782/1‑35 (MQ=255) tATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGc < 1:11309674/35‑1 (MQ=255) tATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGc < 1:5627418/35‑1 (MQ=255) tATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGc < 1:2462104/35‑1 (MQ=255) tATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGc < 1:14245938/35‑1 (MQ=255) ttCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTg < 1:288210/35‑1 (MQ=255) tCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTgg < 1:12225461/35‑1 (MQ=255) tCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTgg < 1:18607210/35‑1 (MQ=255) cccccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTggg > 1:15857900/1‑35 (MQ=255) cccccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTggg < 1:12073286/35‑1 (MQ=255) cccccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTggg < 1:3848977/35‑1 (MQ=255) cccccccCCccgccatggtgctttggtccaggtag < 1:4826362‑M1/35‑27 (MQ=255) ccaccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTggg < 1:16392263/32‑1 (MQ=255) ccccccCCccgccatggtggaaggatgggttacca < 1:2123004‑M1/35‑28 (MQ=255) ccccccCCccgccatggtgctttggtccaggtagt < 1:9045322‑M1/35‑28 (MQ=255) ctcccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTa < 1:4443207/33‑1 (MQ=255) cccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTa > 1:4444191/1‑35 (MQ=255) cccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTa < 1:7541032/35‑1 (MQ=255) cccccCCccgccatggtggaaggatgggttaccag < 1:3206622‑M1/35‑29 (MQ=255) cccccCCccgccatggtgctttggtccaggtagtg < 1:1496522‑M1/35‑29 (MQ=255) cccccCCccgccatggtgctttggtccaggtagtg < 1:15547536‑M1/35‑29 (MQ=255) ccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTAc > 1:13182018/1‑35 (MQ=255) ccccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTAc < 1:8207662/35‑1 (MQ=255) ccccTAGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTAc < 1:6190090/35‑1 (MQ=255) ccccCCccgccatggtggaaggatgggttaccagc < 1:633570‑M1/35‑30 (MQ=255) ccccCCccgccatggtggaaggatgggttaccagc < 1:1263025‑M1/35‑30 (MQ=255) cccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACg < 1:2623309/35‑1 (MQ=255) cccCCccgccatggtggaaggatgggttaccagcg < 1:15537221‑M1/35‑31 (MQ=255) cccCCccgccatggtggaaggatgggttaccagcg < 1:11453688‑M1/35‑31 (MQ=255) cccCCccgccatggtgctttggtccaggtagtgcc < 1:938910‑M1/35‑31 (MQ=255) ctccccgccatggtggaaggatgggttaccagcgc < 1:20496468‑M1/32‑32 (MQ=255) ccccccgccatggtggaaggatgggttaccagcgc < 1:17377378‑M1/32‑32 (MQ=255) ccccccgccatggtgctttggtccaggtagtgcct < 1:2402925‑M1/32‑32 (MQ=255) ccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACgg < 1:7003426/35‑1 (MQ=255) ccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACgg < 1:5874918/35‑1 (MQ=255) ccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACgg < 1:5795048/35‑1 (MQ=255) ccTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACgg < 1:5578649/35‑1 (MQ=255) cccccgccatggtgctttggtccaggtagtgcctt < 1:14538198‑M1/33‑33 (MQ=255) cccccgccatggtgctttggtccaggtagtgcctt < 1:13650154‑M1/33‑33 (MQ=255) cccccgccatggtgctttggtccaggtagtgcctn < 1:19595348‑M1/33‑33 (MQ=255) cacccgccatggtggaaggatgggttaccagcgcc < 1:18879660‑M1/33‑33 (MQ=255) cTCccgccatggtggaaggatgggttaccagcgcc < 1:4174932‑M1/35‑33 (MQ=255) cTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgt > 1:15268109/1‑35 (MQ=255) cTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgt < 1:12775027/35‑1 (MQ=255) cTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgt < 1:11202047/35‑1 (MQ=255) cTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgt < 1:130133/35‑1 (MQ=255) cTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgt > 1:6980220/1‑35 (MQ=255) cTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgt < 1:5123955/35‑1 (MQ=255) cNCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgn < 1:17489301/35‑1 (MQ=255) tCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgtg < 1:8491595/35‑1 (MQ=255) tCGCGCCATGGTGCATGGTCGTGCTGGGTACGgtg > 1:5018063/1‑35 (MQ=255) ccccgccatggtgctttggtccaggtagtgccttc < 1:14864892‑M1/34‑34 (MQ=255) cgcgCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGgtgt > 1:13972016/1‑35 (MQ=255) cgcgCCATGGTGGATGGCCGTGCTGGCCACGgtgt > 1:19325344/1‑35 (MQ=25) cccgccatggtggaaggatgggttaccagcgcctg < 1:12438664‑M1/35‑35 (MQ=255) cccgccatggtggaaggatgggttaccagcgcctg < 1:5382235‑M1/35‑35 (MQ=255) cccgccatggtgctttggtccaggtagtgccttca < 1:8097112‑M1/35‑35 (MQ=255) cccgccatggtgctttggtccaggtagtgccttca < 1:3330351‑M1/35‑35 (MQ=255) cccgccatggtgctttggtccaggtagtgccttca < 1:1979231‑M1/35‑35 (MQ=255) | CAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCCCTCGCGCCATGGTGGATGGTCGTGCTGGGTACGGTGT > REL606/1686577‑1686645 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |