New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 481061 = | 70 (0.680) | 12 (0.160) | 4/34 | NT | 13.9% | coding (2487/2505 nt) | copA | copper transporter |
? | REL606 | = 606452 | 99 (1.360) | coding (767/957 nt) | fepB | iron‑enterobactin transporter subunit |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ATCCGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTAA > REL606/481027‑481095 | aTCCGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑c > 1:3478071/1‑35 (MQ=255) aTCCGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑c > 1:20027084/1‑35 (MQ=255) tCCGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑cc > 1:17497557/1‑35 (MQ=255) tCCGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑cc > 1:20199982/1‑35 (MQ=255) ccggcgaacaggaatagcgattcaccgtttaaccc > 1:11452678‑M1/35‑35 (MQ=255) cggcgaacaggaatagcgattcaccgtttaacccc < 1:17684331‑M1/2‑1 (MQ=255) ccGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCg < 1:14943606/35‑1 (MQ=255) ccGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCg < 1:17842259/35‑1 (MQ=255) ggcgaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCg > 1:6537336‑M1/33‑35 (MQ=255) ggcgaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCg < 1:2928250‑M1/3‑1 (MQ=255) cGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgc < 1:20447338/35‑1 (MQ=255) cGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgc > 1:12107191/1‑35 (MQ=255) gcgaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgc < 1:13886599‑M1/4‑1 (MQ=255) cgaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgca > 1:10652768‑M1/31‑35 (MQ=255) cgaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgca > 1:10042606‑M1/31‑35 (MQ=255) cAATTATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcag > 1:9658363/1‑35 (MQ=255) cAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcag < 1:1931748/35‑1 (MQ=255) cAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcag < 1:7261301/35‑1 (MQ=255) cAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcag > 1:10001786/1‑35 (MQ=255) gaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgcag < 1:19144167‑M1/6‑1 (MQ=255) gaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgcag < 1:8313476‑M1/6‑1 (MQ=255) gaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgcag < 1:16922913‑M1/6‑1 (MQ=255) gaacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgcag < 1:7392044‑M1/6‑1 (MQ=255) aaTGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcagc > 1:19475628/1‑35 (MQ=255) aaTGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcagc > 1:17719307/1‑35 (MQ=255) aaTGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcagc > 1:17079863/1‑35 (MQ=255) atgatgTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCgcagca > 1:5793292/1‑35 (MQ=255) aacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgcagc > 1:15057274‑M1/29‑35 (MQ=255) aacaggaatagcgattcaccgtttaaccCCgcagc > 1:10548571‑M1/29‑35 (MQ=255) atgTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAAcc > 1:19703118/1‑35 (MQ=255) atgTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAAcc > 1:4721644/1‑35 (MQ=255) tgTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCg > 1:11096279/1‑35 (MQ=255) gTACTTATTCCTTCTGTTTAAA‑CCGCAGCAACCgg > 1:11817243/1‑35 (MQ=255) tACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGt > 1:15356995/1‑35 (MQ=255) aCTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGtt > 1:4230541/1‑35 (MQ=255) ttATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCCGCAACCGGTTgg > 1:5387492/1‑35 (MQ=255) ttATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTgg > 1:16053588/1‑35 (MQ=255) ttATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTgg > 1:1353748/1‑35 (MQ=255) ttATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTgg > 1:16532163/1‑35 (MQ=255) ttttCCCTCCGTTTAAACCCGCAGCAACCGGTTgg < 1:14913235/33‑1 (MQ=12) atcccTTCGGTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCg < 1:3854649/32‑1 (MQ=25) ttCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGt > 1:12184737/1‑35 (MQ=255) atCCCTCGGGTTAAACCCGCAGCAACCGGTTGGCg < 1:20109721/34‑1 (MQ=16) cccTTCGGTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGtt < 1:17501001/34‑1 (MQ=25) ccTTCGTTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTa < 1:11804426/35‑1 (MQ=25) ccTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTa > 1:9482319/1‑35 (MQ=255) ccTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTa > 1:3298635/1‑35 (MQ=255) ccTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTa > 1:8546861/1‑35 (MQ=255) ccTTCGGTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTa < 1:8310696/35‑1 (MQ=37) cTTCGTTTTAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTAc < 1:19049739/35‑1 (MQ=37) cTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTAc > 1:19028781/1‑35 (MQ=255) ttCGTTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACt < 1:2514808/35‑1 (MQ=25) ttCGTTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACt < 1:8759009/35‑1 (MQ=25) ttCGTTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGAGTTACt < 1:12538733/35‑1 (MQ=16) tgggTTAAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTc < 1:13526840/33‑1 (MQ=25) tggTTTAAACCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTc < 1:5977784/34‑1 (MQ=25) cGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCTGTTGGCGTTACTCa > 1:8905082/1‑35 (MQ=255) cgtttaaccCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCa > 1:3637635‑M1/10‑35 (MQ=255) ggttaaccCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCAc > 1:18066211‑M1/9‑35 (MQ=255) gTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACt > 1:451999/1‑35 (MQ=255) gTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACt > 1:157457/1‑35 (MQ=255) gTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACt > 1:6782283/1‑35 (MQ=255) tttaaccCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACt > 1:14190448‑M1/8‑35 (MQ=255) tttaaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACt > 1:644462‑M1/8‑35 (MQ=255) ttaaaccCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACt > 1:16887233‑M1/8‑35 (MQ=255) gttaaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACt > 1:8164462‑M1/8‑35 (MQ=255) ttaaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTa > 1:12414961‑M1/7‑35 (MQ=255) ttAAC‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc < 1:2978695/35‑1 (MQ=255) ttAAACCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTAACTa < 1:18159504/35‑1 (MQ=25) ttAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc > 1:5631637/1‑35 (MQ=255) ttAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc > 1:17614029/1‑35 (MQ=255) ttAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc > 1:7579820/1‑35 (MQ=255) taaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc > 1:4258879‑M1/6‑35 (MQ=255) taaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc > 1:3958296‑M1/6‑35 (MQ=255) taaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc > 1:1644092‑M1/6‑35 (MQ=255) taaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTAc > 1:10288716‑M1/6‑35 (MQ=255) tAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACg > 1:10528896/1‑35 (MQ=255) tAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACg > 1:4861499/1‑35 (MQ=255) tAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACg > 1:2008597/1‑35 (MQ=255) aacaCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACg > 1:8718491‑M1/5‑35 (MQ=255) aaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACg > 1:8507465‑M1/5‑35 (MQ=255) aaacCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACg > 1:5323323‑M1/5‑35 (MQ=255) aaa‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACgg > 1:13388734/1‑35 (MQ=255) aaa‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACgg > 1:14524422/1‑35 (MQ=255) aaa‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACgg > 1:10844187/1‑35 (MQ=255) aa‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGt > 1:18609355/1‑35 (MQ=255) aa‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGt > 1:6205924/1‑35 (MQ=255) ccCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGt > 1:2802724‑M1/3‑35 (MQ=255) agccGCACCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGt < 1:13173216/33‑1 (MQ=37) a‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACTGTa > 1:3075363/1‑35 (MQ=255) a‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTa > 1:15796626/1‑35 (MQ=255) cCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTa > 1:1696148‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTa > 1:12790336‑M1/2‑35 (MQ=255) CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACtacggcaa < 1:2782672‑M1/35‑4 (MQ=255) CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTaa < 1:12181580‑M1/35‑1 (MQ=255) CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTaa < 1:4843577‑M1/35‑1 (MQ=255) CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTaa < 1:6038541‑M1/35‑1 (MQ=255) CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTaa > 1:14141762‑M1/1‑35 (MQ=255) CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTaa > 1:9334569‑M1/1‑35 (MQ=255) CCGCACCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTaa > 1:323954‑M1/1‑35 (MQ=255) | ATCCGCAATGATGTACTTATTCCTTCGGTTTAAA‑CCGCAGCAACCGGTTGGCGTTACTCACTACGGTAA > REL606/481027‑481095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |