New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1979076 | 88 (0.860) | 10 (0.110) | 4/44 | NT | 14.7% | coding (595/636 nt) | yedZ | hypothetical protein |
? | REL606 | = 2901067 | 35 (0.370) | coding (153/579 nt) | ygfJ | hypothetical protein |
TGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGA > REL606/2901033‑2901101 | tGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGc < 1:4387774/35‑1 (MQ=255) tGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGc < 1:4907023/35‑1 (MQ=255) tGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGc > 1:2307997/1‑35 (MQ=255) tGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGc > 1:2826443/1‑35 (MQ=255) gCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCt > 1:13941183‑M2/1‑34 (MQ=255) gCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCt > 1:8967712‑M2/1‑34 (MQ=255) cATTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCta > 1:12255432‑M2/1‑33 (MQ=255) cATTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCta > 1:14975822‑M2/1‑33 (MQ=255) cAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCta < 1:10852697‑M2/35‑3 (MQ=255) cAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCta < 1:15248742‑M2/35‑3 (MQ=255) atttttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 1:11666647/33‑1 (MQ=255) aGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCTGCTAt > 1:3244613/1‑35 (MQ=255) aGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 1:16030967/35‑1 (MQ=255) aGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 1:20577451/35‑1 (MQ=255) aGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAt < 1:13427622/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaa < 1:14861041‑M2/35‑5 (MQ=255) gTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaa < 1:5579813‑M2/35‑5 (MQ=255) gTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATc < 1:7027191/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATc < 1:20271366/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTAGCAGAATTATTTTAGTCACCGGCTATc < 1:8129797/35‑1 (MQ=255) ttttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaag < 1:11713726‑M2/35‑6 (MQ=255) ttttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaa < 1:19725020‑M2/35‑6 (MQ=255) ttttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCg < 1:3011799/35‑1 (MQ=255) tttTTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGt < 1:1710778/35‑1 (MQ=255) tttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaa < 1:1111063‑M2/35‑7 (MQ=255) tttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaa < 1:1665787‑M2/35‑7 (MQ=255) tttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGt < 1:19421579/35‑1 (MQ=255) tttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGt < 1:701223/35‑1 (MQ=255) ttttAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTg < 1:2321485/32‑1 (MQ=255) ttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaatg < 1:4828729‑M2/35‑8 (MQ=255) ttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaagg < 1:12824940‑M2/35‑8 (MQ=255) ttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaag < 1:4818637‑M2/35‑8 (MQ=255) ttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTg < 1:8732321/35‑1 (MQ=255) ttGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTg < 1:13243991/35‑1 (MQ=255) tGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaagg < 1:4385582‑M2/35‑9 (MQ=255) tGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTgg < 1:9287761/35‑1 (MQ=255) gTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaaggg < 1:8996305‑M2/35‑10 (MQ=255) gTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaaggg < 1:2459916‑M2/35‑10 (MQ=255) tAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaaggga < 1:6615575‑M2/35‑11 (MQ=255) tAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTa < 1:16270993/35‑1 (MQ=255) tAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTa < 1:20596136/35‑1 (MQ=255) tAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTa < 1:10608418/35‑1 (MQ=255) aGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaagggaa < 1:3980888‑M2/35‑12 (MQ=255) aGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaagggaa < 1:6396260‑M2/35‑12 (MQ=255) aGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaagagaa < 1:4204236‑M2/35‑12 (MQ=255) gCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaatggaaa < 1:16202595‑M2/35‑13 (MQ=255) gCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaagggaat < 1:248279‑M2/35‑13 (MQ=255) gCCGAATTATTTTAGTCACCGGCtaaaaagggaaa < 1:8341456‑M2/35‑13 (MQ=255) gCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTAAAGTGGTAAt > 1:14672557/1‑35 (MQ=37) ccGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATg < 1:19989199/35‑1 (MQ=255) cGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGa < 1:2386115/35‑1 (MQ=255) cGAATTATTTTAGTCACCGGATATCGTGGTAATGa < 1:5728053/35‑1 (MQ=255) gAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGaa < 1:14621561/35‑1 (MQ=255) gAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGaa < 1:14625084/35‑1 (MQ=255) aaTTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAAc < 1:2685523/35‑1 (MQ=255) attattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACt < 1:4646898/35‑1 (MQ=255) attattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACt < 1:1014496/35‑1 (MQ=255) attattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACt < 1:2231349/35‑1 (MQ=255) attattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACt < 1:17964100/35‑1 (MQ=255) attattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACt < 1:18943576/35‑1 (MQ=255) ttattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTg < 1:7569052/35‑1 (MQ=255) ttattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTg < 1:1796405/35‑1 (MQ=255) ttattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTg < 1:498166/35‑1 (MQ=255) tattTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGc < 1:12125326/35‑1 (MQ=255) attTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCn < 1:6507783/35‑1 (MQ=255) attTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCa < 1:17515719/35‑1 (MQ=255) tttAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACg < 1:13486115/35‑1 (MQ=255) tttAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACg < 1:16610774/35‑1 (MQ=255) ttAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGa < 1:14282262/35‑1 (MQ=255) aGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAAc < 1:447566/35‑1 (MQ=255) aGTCACCGGCTATAGTGGTAATGAACTGCACGAAc < 1:17848988/35‑1 (MQ=255) gTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACg < 1:6758474/35‑1 (MQ=255) gTCACCGGCTATCATGGTAATGAACTGCACGAACg < 1:2733418/35‑1 (MQ=255) tCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGt < 1:17672693/35‑1 (MQ=255) cACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGtt < 1:15764713/35‑1 (MQ=255) cACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGtt < 1:15813961/35‑1 (MQ=255) cACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGtt < 1:5231004/35‑1 (MQ=255) aCCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTa < 1:9958005/35‑1 (MQ=255) aCCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTa < 1:5813318/35‑1 (MQ=255) ccGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTAt < 1:8512989/35‑1 (MQ=255) ccGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTAt < 1:15069228/35‑1 (MQ=255) ccGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTAt < 1:7967334/35‑1 (MQ=255) cGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATg < 1:2568809/35‑1 (MQ=255) aggCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATg < 1:12481942/34‑1 (MQ=255) ggCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGc < 1:4037725/35‑1 (MQ=255) ggCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGc < 1:18897091/35‑1 (MQ=255) ggCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGc < 1:11805539/35‑1 (MQ=255) gccTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGc < 1:11887846/33‑1 (MQ=255) gCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCg > 1:4241112/1‑35 (MQ=255) gCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCg > 1:4308650/1‑35 (MQ=255) gCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCg > 1:5778668/1‑35 (MQ=255) gCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCg > 1:10011077/1‑35 (MQ=255) cTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGa < 1:2316592/35‑1 (MQ=255) cTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGa < 1:4813191/35‑1 (MQ=255) cTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGa > 1:11042610/1‑35 (MQ=255) | TGCAGTTTTGTAGCCGAATTATTTTAGTCACCGGCTATCGTGGTAATGAACTGCACGAACGTTATGCGA > REL606/2901033‑2901101 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |