Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 546,191 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (346‑354/384 nt) | ybcQ → | predicted antitermination protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 546191 = | 0 (0.000) | 77 (0.780) | 35/46 | NT | 100% | coding (346/384 nt) | ybcQ | predicted antitermination protein |
? | REL606 | 546932 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 546199 | 0 (0.000) | 125 (1.220) | 42/48 | NT | 100% | coding (354/384 nt) | ybcQ | predicted antitermination protein |
? | REL606 | = 547699 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
AGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/546166‑546199 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < REL606/547699‑547666 AGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGG > 1:9813676/1‑35 AGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGG < 1:16390059/35‑1 AGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGG < 1:10448072/35‑1 AGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGG > 1:2818694/1‑35 AGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGG > 1:4062864/1‑35 GGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGG > 1:19374848/1‑35 GGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGG > 1:13454755/1‑35 GGATGTTAATGGCATTAGATATCCTGTTAGAGGGT > 1:8961707/1‑35 GGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGg > 1:4163813/1‑34 GGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGT < 1:2659742/35‑1 GATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTG > 1:7253375/1‑35 GATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTG < 1:10861903/35‑1 GATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTG > 1:15195354/1‑35 TGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGAT > 1:20326258/1‑35 GTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATG > 1:9137402/1‑35 GTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATG > 1:11043340/1‑35 GTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATG > 1:17823488/1‑35 TTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGC < 1:14082116/35‑1 TAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCT > 1:7064787/1‑35 TAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCT > 1:16951131/1‑35 TAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCT < 1:20172556/35‑1 TAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCT > 1:15347100/1‑35 TAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCT > 1:3447166/1‑35 AATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTG > 1:9359063/1‑35 AATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTG > 1:3341420/1‑35 ATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGC < 1:14464090/35‑1 TGGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCC < 1:16594383/35‑1 GGCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCA > 1:14266819/1‑35 GCATTAGATATCCTGTTAGAGGGTGATGCTGCCAA > 1:15458656/1‑35 GCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAA > 1:11352824/1‑35 GCATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAA < 1:13290230/35‑1 CATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAAC > 1:613241/1‑35 ATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACT > 1:554627/1‑35 ATTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACT < 1:8205840/35‑1 TTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:3943545/35‑1 TTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:4592960/35‑1 TTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:490671/35‑1 TTAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:651350/35‑1 TAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:16184244/35‑1 TAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:4238658/35‑1 TAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:7801113/35‑1 TAGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGACAACTTA < 1:19109768/35‑1 AGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:10028640/1‑35 AGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:14027416/35‑1 AGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:261337/1‑35 AGATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:16717029/1‑35 GATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:9645306/1‑35 GATATCCGGTTAGAGGGTGATGCAGCCAACTTACT < 1:18265179/35‑1 GATATCCGGCTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:2318904/1‑35 ATATCCGGTTAGAGTGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:9477142/1‑35 ATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:10582198/35‑1 ATATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:14144492/1‑35 ATATCAGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:1005346/35‑1 TATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCCACTTACTGA < 1:10256773/35‑1 TATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:14620458/35‑1 TATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 1:18697252/1‑35 TATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 1:3063595/1‑35 TATCAGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:7463799/35‑1 cTCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:15544257/34‑1 ATCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:8277222/1‑35 TCCGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:12763864/35‑1 CGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:4509084/35‑1 CGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:19944545/1‑35 CGGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:12244170/1‑35 GGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:17629856/35‑1 GGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:13259159/1‑35 GGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:13118631/35‑1 GGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:20422181/35‑1 GGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:5697563/1‑35 GGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:19807052/35‑1 GGTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:7472802/1‑35 GTTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:15315057/1‑35 TTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:9048133/35‑1 TTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:6843431/1‑35 TTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:15950854/1‑35 TTAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:20546688/35‑1 TAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:18108447/35‑1 TAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:18918286/35‑1 TAGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:12840941/1‑35 AGAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:17609642/35‑1 GAGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:3199410/1‑35 AGGGTGATGCTTCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:2898119/1‑35 AGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 1:16118939/35‑1 AGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:17391928/1‑35 AGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 1:17990041/35‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATta > 1:5367741/1‑33 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:8673679/1‑35 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:18617886/1‑35 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:18280511/1‑35 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:11427945/1‑35 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:11732152/35‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:121226/35‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:5894306/35‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:1367880/1‑35 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:4591873/1‑35 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:18800271/35‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:14909816/1‑35 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:3498460/35‑1 GGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:19485800/1‑35 GGGTCATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:4526461/35‑1 AGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/546166‑546199 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < REL606/547699‑547666 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |