Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 1,162,790 | IS150 (–) +3 bp | 41.7% | coding (601‑603/1071 nt) | plsX → | fatty acid/phospholipid synthesis protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 45 (0.480) | 28/44 | NT | 38.5% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | 1162790 = | 62 (0.760) | coding (601/1071 nt) | plsX | fatty acid/phospholipid synthesis protein | |||||
* | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 46 (0.450) | 24/48 | NT | 38.2% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 1162792 | 65 (0.720) | coding (603/1071 nt) | plsX | fatty acid/phospholipid synthesis protein |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
AGTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATAT > REL606/1162756‑1162824 | gTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGc > 1:6211443/1‑35 (MQ=255) gTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGc > 1:3275780/1‑35 (MQ=255) gTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGc > 1:1695424/1‑35 (MQ=255) gTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGc < 1:16905856/35‑1 (MQ=255) tAAAGGGTCTCGACAGTATTTGGGATGCCTCAGCg < 1:2581167/35‑1 (MQ=255) tAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCTGCg > 1:14187174/1‑35 (MQ=255) tAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCg > 1:18718199/1‑35 (MQ=255) atttcatcgtccaacaaaatgggtgcagtagaGCg < 1:5318983‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGt > 1:3338767‑M2/1‑34 (MQ=255) aaaGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGt < 1:19536715‑M2/35‑2 (MQ=255) aaaGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGt < 1:17858300‑M2/35‑2 (MQ=255) aaGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtg < 1:7881293‑M2/35‑3 (MQ=255) gggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGc < 1:9895465/35‑1 (MQ=255) gggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGGGc > 1:5929017/1‑35 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGc < 1:1360710‑M2/7‑1 (MQ=255) ggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtac > 1:3803051‑M2/1‑30 (MQ=255) ggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtac < 1:13885845‑M2/35‑6 (MQ=255) ggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCt < 1:11256948/35‑1 (MQ=255) atcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCt < 1:12065471‑M2/8‑1 (MQ=255) tcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCtt < 1:4764791‑M2/9‑1 (MQ=255) gTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtact > 1:10661108‑M2/1‑29 (MQ=255) tctcGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtactg > 1:12752988‑M2/1‑28 (MQ=255) tctcGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTa < 1:150128/35‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTa < 1:3692775‑M2/10‑1 (MQ=255) cgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTa < 1:716019‑M2/10‑1 (MQ=255) gtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTaa > 1:13223400‑M2/25‑35 (MQ=255) tccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTaaa > 1:18004246‑M2/24‑35 (MQ=255) tcGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTaaa < 1:4267505/35‑1 (MQ=255) tcGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTaaa < 1:9638526/35‑1 (MQ=255) ccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTaaaa > 1:19821404‑M2/23‑35 (MQ=255) cGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgacc < 1:5183611‑M2/35‑11 (MQ=255) cGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTaaaa < 1:9258249/35‑1 (MQ=255) gACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAAc > 1:10401932/1‑35 (MQ=255) gACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAAc < 1:16389790/35‑1 (MQ=255) gACAGTATTAGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccc > 1:634360‑M2/1‑24 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACa < 1:12486947‑M2/15‑1 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACa < 1:15827723‑M2/15‑1 (MQ=255) aCAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACa < 1:2874880/35‑1 (MQ=255) aCAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACa > 1:18581379/1‑35 (MQ=255) cAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACaa > 1:13069878/1‑35 (MQ=255) cAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACaa > 1:12900806/1‑35 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAAt < 1:10089693‑M2/17‑1 (MQ=255) gTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATc < 1:18255772/35‑1 (MQ=255) tATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATcc < 1:2031525/35‑1 (MQ=255) tATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATcc < 1:12229750/35‑1 (MQ=255) aaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATcc < 1:4208932‑M2/19‑1 (MQ=255) aaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATcc < 1:3555604‑M2/19‑1 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATccc < 1:14317549‑M2/20‑1 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATccc < 1:2281084‑M2/20‑1 (MQ=255) aTTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaa < 1:16063033‑M2/35‑18 (MQ=255) aTTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaa < 1:13746057‑M2/35‑18 (MQ=255) aTTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaa < 1:6302736‑M2/35‑18 (MQ=255) aTTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgacccaaaaaa > 1:10331495‑M2/1‑18 (MQ=255) tgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCtt > 1:15275970‑M2/14‑35 (MQ=255) tCGGGATGGCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCtt < 1:19972038/35‑1 (MQ=255) tCGCGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCtt > 1:11371158/1‑35 (MQ=255) gggtgcattacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc > 1:12273099‑M2/13‑35 (MQ=255) gggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc > 1:16431358‑M2/13‑35 (MQ=255) cGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagtt < 1:2083892‑M2/35‑21 (MQ=255) cGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagtt < 1:19645514‑M2/35‑21 (MQ=255) cGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc < 1:6783209/35‑1 (MQ=255) cGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc < 1:6062243/35‑1 (MQ=255) ggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCt < 1:2661994‑M2/24‑1 (MQ=255) gggATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttg < 1:15395553‑M2/35‑22 (MQ=255) gggATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCt < 1:11827347/35‑1 (MQ=255) gggATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCt < 1:8069041/35‑1 (MQ=255) gggATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCATTCt < 1:14125729/35‑1 (MQ=255) ggATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttgg > 1:11114101‑M2/1‑13 (MQ=255) ggATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttgg > 1:12408084‑M2/1‑13 (MQ=255) tgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTAt < 1:15206981‑M2/26‑1 (MQ=255) tgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTATAt < 1:7580744‑M2/26‑1 (MQ=255) gATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttgga > 1:15752045‑M2/1‑12 (MQ=255) gATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTAt < 1:18663522/35‑1 (MQ=255) gATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTAt < 1:18909184/35‑1 (MQ=255) gATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTAt < 1:6888776/35‑1 (MQ=255) gATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTAt < 1:683484/35‑1 (MQ=255) tGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCa < 1:10826549/35‑1 (MQ=255) cagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCa < 1:17535021‑M2/28‑1 (MQ=255) cagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCa < 1:2815221‑M2/28‑1 (MQ=255) agtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCaa < 1:873773‑M2/29‑1 (MQ=255) agtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCaa < 1:3480627‑M2/29‑1 (MQ=255) gtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAt > 1:18476720‑M2/6‑35 (MQ=255) gtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAt > 1:7330664‑M2/6‑35 (MQ=255) ccTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAt > 1:4457070/1‑35 (MQ=255) ccTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAt > 1:2731243/1‑35 (MQ=255) tacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAtt < 1:7407231‑M2/31‑1 (MQ=255) cTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAtt > 1:7187737/1‑35 (MQ=255) cTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAtt < 1:2054996/35‑1 (MQ=255) tCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacagtta > 1:19195676‑M2/1‑6 (MQ=255) tCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacagtta < 1:10732207‑M2/35‑30 (MQ=255) tCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATta < 1:781256/35‑1 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtat < 1:17260845‑M2/33‑1 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtat > 1:8186059‑M2/3‑35 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtat < 1:14214597‑M2/33‑1 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATACCTTCTATCAATtat < 1:5594884‑M2/33‑1 (MQ=255) aGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtata > 1:20246806‑M2/2‑35 (MQ=255) aGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtata > 1:11581118‑M2/2‑35 (MQ=255) aGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtata < 1:5199299‑M2/34‑1 (MQ=255) aGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtata < 1:11025964‑M2/34‑1 (MQ=255) gCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTatat > 1:2160692/1‑35 (MQ=255) | AGTAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATAT > REL606/1162756‑1162824 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |