New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2908068 = | 60 (0.580) | 9 (0.110) | 4/38 | NT | 14.3% | coding (999/2871 nt) | xdhD | fused predicted xanthine/hypoxanthine oxidase: molybdopterin‑binding subunit/Fe‑S binding subunit |
? | REL606 | 4123539 = | 60 (0.740) | coding (903/1080 nt) | frwC | predicted enzyme IIC component of PTS |
TTGATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2908106‑2908068 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctgGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGC > REL606/4123539‑4123572 TTGATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATG > 1:7868205/1‑35 TTGATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATG > 1:8513984/1‑35 TGATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGG > 1:11383955/1‑35 GATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGC < 1:11692403/35‑1 GATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGC > 1:12334500/1‑35 GATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGC > 1:12570762/1‑35 GATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGC > 1:3839264/1‑35 GATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGC < 1:8746658/35‑1 ATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCT < 1:3494428/35‑1 ATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCT > 1:2707754/1‑35 ATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCT > 1:3606244/1‑35 ATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCT < 1:6419519/35‑1 ATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCT > 1:16379276/1‑35 ATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCT > 1:15325778/1‑35 ATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCT < 1:13853856/35‑1 TGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTG < 1:1568331/35‑1 TGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTG > 1:13136438/1‑35 TGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTG > 1:12263865/1‑35 GATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGa > 1:12498851/1‑34 GATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGG > 1:15615705/1‑35 GATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGG > 1:13693438/1‑35 ATCATATTCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGG > 1:17598773/1‑35 ATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGat < 1:20152975/35‑3 TCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGG > 1:15038378/1‑35 TCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGG > 1:19002858/1‑35 CATATGCTCGCCGCGCTGTGCTGCATGGCTGGGGg > 1:9048373/1‑34 CATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGg > 1:302204/1‑34 CATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGg > 1:4947699/1‑34 ATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGgg > 1:2542602/1‑33 ATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTt > 1:1289339/1‑34 TATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGGGG > 1:19978475/1‑35 TATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGGGG > 1:6422195/1‑35 ATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTGGg > 1:9935356/1‑34 ATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTGGT > 1:6489377/1‑35 TGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTGGgt > 1:5216672/1‑33 TGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTGGgc > 1:20451376/1‑33 TGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTGGTC > 1:1812695/1‑35 GCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTGGTCT > 1:6946370/1‑35 GCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTGGGGTGGTCT > 1:14490603/1‑35 gGGCTGGGGTGGTCTGATTGTCCTGCCGGTGGTTG < 1:2240971/34‑1 GGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGA < 1:15945418/35‑1 GGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGA < 1:12598617/35‑1 GCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAA < 1:17387565/35‑1 gGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGG < 1:5570951/34‑1 TGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGG < 1:15681008/35‑1 GGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGC < 1:18931786/35‑1 GGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGC < 1:10688388/35‑1 GGGGTGGTCTGATTGTGCTGCAGGTGGTTGAAGGC < 1:6983810/35‑1 TTGATGATCATATGCTCGCCGCGCTGGGCTGCATGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2908106‑2908068 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggctgGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGC > REL606/4123539‑4123572 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |