New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1691508 = | 100 (0.970) | 7 (0.100) | 3/34 | NT | 8.7% | intergenic (+43/‑63) | ydgR/gst | putative tripeptide transporter permease/glutathionine S‑transferase |
? | REL606 | = 1806767 | 76 (1.040) | coding (233/1479 nt) | astD | succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase |
TTTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/1691548‑1691508 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagccgAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA < REL606/1806767‑1806734 TTTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAA > 1:9806654/1‑35 TTTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAA < 1:11727083/35‑1 TTTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAA < 1:1953079/35‑1 TTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAA < 1:8880190/35‑1 TTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAA > 1:8177832/1‑35 TTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAA > 1:7375054/1‑35 TAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAA < 1:356317/35‑1 TAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAA < 1:20593829/35‑1 TAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAA > 1:13428211/1‑35 TAAAGTATGGTAGGGCGTTGCTGAACAAAAAAAAA > 1:20119092/1‑35 AAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAG > 1:13679638/1‑35 AAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAG < 1:14231964/35‑1 AAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAG < 1:12084257/35‑1 AAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAG < 1:6620940/35‑1 AAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAG < 1:20337149/35‑1 AAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGC > 1:16320989/1‑35 AGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGtc < 1:18733484/35‑3 AGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGCC > 1:18188522/1‑35 AGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGCC < 1:14628923/35‑1 AGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGCC < 1:17002942/35‑1 GTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGTCG > 1:18682827/1‑35 GTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGCCc > 1:5085591/1‑34 TATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGCagc < 1:5399452/35‑4 CTGAAAAAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTAT < 1:19487564/35‑1 gGAAAAAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATT < 1:16092123/34‑1 TGAAAAAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATT < 1:17298197/35‑1 TGAAAAAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATT < 1:8309273/35‑1 GAAAAAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTG < 1:16108775/35‑1 GAAAAAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTG < 1:400980/35‑1 aaAAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCC < 1:8636261/33‑1 gAAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAG < 1:2201791/34‑1 agAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAG < 1:464778/33‑1 AAAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGA < 1:14616768/35‑1 AAAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAG < 1:2182189/35‑1 AAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGA < 1:5205646/35‑1 AAAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGA < 1:10465239/35‑1 AAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAA < 1:6579571/35‑1 AAAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAA < 1:20147565/35‑1 AAAAAGCCGAATTAACAGCGATTATTGCCAGAGAA < 1:4040357/35‑1 AAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAA < 1:7826416/35‑1 AAAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAA < 1:4052707/35‑1 AAAGCCGAATTACCCGCGATTATTGCCAGAGAAAC < 1:15061296/35‑1 AAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAAC < 1:9691574/35‑1 AAAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAAC < 1:6155334/35‑1 AAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACG < 1:6838462/35‑1 AAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACG > 1:15238557/1‑35 AAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACG < 1:2924524/35‑1 AAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACG > 1:13019330/1‑35 AAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACG < 1:19339706/35‑1 AAGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACG < 1:10048728/35‑1 AAGCCAAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACG < 1:13597224/35‑1 AGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGG > 1:855929/1‑35 AGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGG > 1:15141085/1‑35 AGCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGG > 1:16204962/1‑35 GCCGAATTACCCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGG < 1:10167719/35‑1 GCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGG > 1:3806001/1‑35 GCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGG < 1:937810/35‑1 GCCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGG > 1:15101682/1‑35 CCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGT < 1:14368586/35‑1 CCGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGT < 1:9540083/35‑1 CGAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTA > 1:15231149/1‑35 CGAATTAACAGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTA < 1:13171683/35‑1 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA > 1:617327/1‑35 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA > 1:4508582/1‑35 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA > 1:4355284/1‑35 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA > 1:3615639/1‑35 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA > 1:12812304/1‑35 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA < 1:2464727/35‑1 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA < 1:15320219/35‑1 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA > 1:15967554/1‑35 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA < 1:16917910/35‑1 GAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGAAA > 1:20014041/1‑35 TTTAAAGTATGGTAGTGCGTTGCTGAACAAAAAAAAAGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/1691548‑1691508 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaagccgAATTAACCGCGATTATTGCCAGAGAAACGGGTAA < REL606/1806767‑1806734 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |