Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 4,524,522 | IS186 (+) +6 bp | 94.5% | coding (494‑499/549 nt) | fimA → | major type 1 subunit fimbrin (pilin) |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | 84 (0.930) | 36/42 | NT | 95.2% | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | = 4524527 | 3 (0.050) | coding (499/549 nt) | fimA | major type 1 subunit fimbrin (pilin) | |||||
* | ? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | 70 (0.780) | 36/42 | NT | 89.3% | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | 4524522 = | 6 (0.090) | coding (494/549 nt) | fimA | major type 1 subunit fimbrin (pilin) |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2774166‑2774196 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAC > REL606/4524522‑4524555 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCtg < 1:19968180/35‑3 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCtg < 1:14889164/35‑3 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGC > 1:2958779/1‑35 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGC > 1:15379489/1‑35 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGC < 1:9117519/35‑1 TGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCA > 1:16876757/1‑35 TGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCA > 1:14303334/1‑35 TGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCA > 1:8982225/1‑35 GGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAA < 1:20264119/35‑1 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAAC > 1:11263265/1‑35 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACC < 1:5576279/35‑1 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACC > 1:903019/1‑35 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACC > 1:10219691/1‑35 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCC < 1:413353/35‑1 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCC > 1:8417397/1‑35 aAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCC < 1:6838401/34‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCC < 1:3660903/35‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCC < 1:10726411/35‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCC > 1:13952178/1‑35 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCG < 1:1861113/35‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCG > 1:11026029/1‑35 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCG < 1:6017706/35‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCG < 1:20407930/35‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCG > 1:13832879/1‑35 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGt > 1:18934290/1‑34 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGG > 1:8220169/1‑35 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGG < 1:20413768/35‑1 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGG < 1:12861665/35‑1 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGG > 1:11422561/1‑35 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGG < 1:11613408/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGT < 1:19796481/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGT > 1:19343898/1‑35 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTG > 1:5734878/1‑35 TTAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGC > 1:794817/1‑35 TAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCT > 1:15353500/1‑35 TAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCT < 1:9673606/35‑1 TAAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCT < 1:1167804/35‑1 AAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTG > 1:13189235/1‑35 AAGTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTG < 1:4259731/35‑1 GTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCT > 1:10718326/1‑35 GTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCT < 1:3121262/35‑1 GTTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCT < 1:18517915/35‑1 TTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTA > 1:14568839/1‑35 TTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTA < 1:14701717/35‑1 TTAGCGCTTATGGGCCGCAACCCAGGGTGCTGCTA < 1:9728505/35‑1 TAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAA > 1:4810689/1‑35 TAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAA > 1:4553057/1‑35 TAGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAA < 1:10800298/35‑1 tagGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAAT > 1:19578000/4‑35 AGCGCTTATGGTCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAAT > 1:42901/1‑35 AGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAAT > 1:5662827/1‑35 AGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAAT < 1:7744343/35‑1 AGCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAAT > 1:14672408/1‑35 GCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATG < 1:19026043/35‑1 GCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATG < 1:15219062/35‑1 GCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATG < 1:11106542/35‑1 GCGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATG < 1:966332/35‑1 CGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGC < 1:4948027/35‑1 CGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGC < 1:7008209/35‑1 CGCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGC < 1:8597290/35‑1 GCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCG > 1:2006699/1‑35 GCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCG > 1:16908991/1‑35 GCTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCG > 1:12669512/1‑35 cgTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG < 1:13379819/33‑1 CTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG > 1:11843183/1‑35 CTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG < 1:12654423/35‑1 CTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG < 1:3374114/35‑1 CTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG < 1:3240140/35‑1 CTTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG < 1:8973895/35‑1 CTTAGGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG < 1:14436882/35‑1 CTTAGGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGG < 1:19553050/35‑1 TTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGA < 1:11267232/35‑1 TTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGA < 1:20545945/35‑1 TTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGA < 1:4314822/35‑1 TTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGA > 1:20205847/1‑35 TTATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGA > 1:17925348/1‑35 TATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGTAT > 1:16927780/1‑35 TATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGAT < 1:5756569/35‑1 ATGGGCCGCAGCCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATG < 1:19297457/35‑1 ATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATG < 1:11202529/35‑1 ATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATG > 1:4882585/1‑35 ATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATG < 1:6404447/35‑1 ATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATG < 1:1348320/35‑1 ATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATG > 1:8573506/1‑35 ATGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATG > 1:15413663/1‑35 TGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGC > 1:10067546/1‑35 TGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGC < 1:12014218/35‑1 TGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGC < 1:14094825/35‑1 TGGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGC < 1:18956328/35‑1 GGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCG < 1:16010471/35‑1 GGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCG < 1:18131050/35‑1 GGGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCG < 1:8870418/35‑1 GGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGA < 1:1771652/35‑1 GGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGA > 1:13316743/1‑35 GGCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGA > 1:1097300/1‑35 GCCGCAGCCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAC < 1:525316/35‑1 GCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAC < 1:12385942/35‑1 GCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAC < 1:19796910/35‑1 GCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAC < 1:11302659/35‑1 GCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAC < 1:4894706/35‑1 ATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2774166‑2774196 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggCCGCAACCCCGGGTGCTGCTAATGCGGATGCGAC > REL606/4524522‑4524555 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |