New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 13453 = | 80 (0.780) | 8 (0.080) | 4/44 | NT | 10.6% | coding (1293/1917 nt) | dnaK | molecular chaperone DnaK |
? | REL606 | 348289 = | 62 (0.660) | coding (475/1212 nt) | mhpT | predicted 3‑hydroxyphenylpropionic transporter |
CCCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/13488‑13453 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > REL606/348289‑348322 CCCTGCAGCACATGGATTGTTACCGCAGACTGGTT > 1:6459159/1‑35 CCCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTT > 1:5810416/1‑35 CCCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTT < 1:1228401/35‑1 CCCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTT < 1:13939226/35‑1 CCCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTT < 1:14700473/35‑1 CCCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTT < 1:18368125/35‑1 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG < 1:7080247/35‑1 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG < 1:7113949/35‑1 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG > 1:13092342/1‑35 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG < 1:3880936/35‑1 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG < 1:13423/35‑1 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG > 1:2568191/1‑35 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG > 1:8791773/1‑35 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGGTG > 1:19950375/1‑35 CCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGGTG > 1:13754400/1‑35 CTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGG > 1:9127114/1‑35 CTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGG > 1:18672471/1‑35 CTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGG > 1:2153666/1‑35 CTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGG > 1:9451464/1‑35 TGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGCCTGGTTGGt > 1:19391807/1‑34 TGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGc > 1:3830305/1‑34 TGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGG > 1:6538892/1‑35 TGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGG > 1:13557449/1‑35 TGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGG > 1:6335363/1‑35 TGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGG > 1:5738138/1‑35 TGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGGTGGG > 1:4528615/1‑35 GCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGT > 1:13332162/1‑35 CAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGgt > 1:8523359/1‑33 CAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGct > 1:1486835/1‑33 CAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTT > 1:19286405/1‑35 CAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTT > 1:17167701/1‑35 AGCACATGTATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTT > 1:2293986/1‑35 AGCACATGGATGGTTACTGCAGACTGGTTGGGTTc > 1:14710110/1‑34 AGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGgtc > 1:8879837/1‑32 AGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTc > 1:13714106/1‑34 GCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGGTTt > 1:9503648/1‑34 CACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTtt > 1:1459888/1‑33 ACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTacc > 1:20574339/1‑32 ACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTCGC > 1:11981340/1‑35 ACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTCGC > 1:15325084/1‑35 ACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTCCGC > 1:11921722/1‑35 TGGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTCGCGGG > 1:5906861/1‑35 GGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTCGCGGGG > 1:8985988/1‑35 GGATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTCGAGGGG > 1:9137975/1‑35 GATGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTCGCGGGGG > 1:9066462/1‑35 TGGTTACCGCAGACTGGTTGGGTTTCGCGGGGGag > 1:1791925/1‑33 TGGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACG > 1:1965432/1‑35 TGGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACG < 1:16852242/35‑1 TGGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACG < 1:11966106/35‑1 GGGTTTCGCGTGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > 1:13735543/1‑35 GGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > 1:6560769/1‑35 GGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > 1:6176963/1‑35 GGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > 1:1927346/1‑35 GGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > 1:18772612/1‑35 GGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > 1:17141439/1‑35 GGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG < 1:10415504/35‑1 CCCTGCAGCACATGGATGGTTACCGCAGACTGGTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/13488‑13453 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGGTTTCGCGGGGGCAAACTTAGCATGGCAAACGG > REL606/348289‑348322 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |