New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1072149 | 74 (0.720) | 4 (0.040) | 3/42 | NT | 4.8% | coding (320/2745 nt) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
? | REL606 | 3712714 = | 106 (1.030) | coding (451/684 nt) | ECB_03459 | conserved hypothetical protein |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
AATCTCAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGCCCG > REL606/3712680‑3712748 | gagatctcctgctcctgttgttcaatagcgggggg > 1:15178854‑M2/35‑35 (MQ=255) aaTCTCAAACATTGGCTTTAATGCGACATGTggtg > 1:16582075/1‑35 (MQ=255) aaTCTCAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGggtg < 1:5096709/35‑1 (MQ=255) aaTCTCAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGggtg > 1:3042866/1‑35 (MQ=255) agatctcctgctcctgttgttcaatagcggggggg > 1:17059404‑M2/34‑35 (MQ=255) aTCTCAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGggtgg < 1:7638127/35‑1 (MQ=255) aTCTCAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGggtgg > 1:17088075/1‑35 (MQ=255) ctcAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGggtgggg > 1:19882139/1‑33 (MQ=255) ctcAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGGgtggtg > 1:20575838/1‑35 (MQ=255) ctcAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGGgtggtg < 1:12050090/35‑1 (MQ=255) atctcctgctcctgttgttcaatagcggggggggt > 1:10350192‑M2/32‑33 (MQ=255) atctcctgctcctgttgttcaatagcgggggGgtt > 1:17586656‑M2/32‑34 (MQ=255) tcAAACATTTGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGa > 1:4809771/1‑35 (MQ=255) tcAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGa < 1:18889053/35‑1 (MQ=255) cAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaa > 1:4308174/1‑35 (MQ=255) cAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaa < 1:924231/35‑1 (MQ=255) aaaCATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaaa > 1:12454273/1‑35 (MQ=255) aaaCATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaaa > 1:5835580/1‑35 (MQ=255) aaaCATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaaa < 1:10888548/35‑1 (MQ=255) aaaCATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaaa > 1:9491993/1‑35 (MQ=255) aaCATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaaaa < 1:1292552/35‑1 (MQ=255) ctgctcctgttgttcaatagcgggggGGTTaaaaa > 1:20180195‑M2/27‑35 (MQ=255) aCATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGaaaaa < 1:14875461/35‑1 (MQ=255) aCATTGGCTTTAATGCGACATGGGGGGGGGaaaaa > 1:13409540/1‑35 (MQ=37) cATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAAc < 1:17698937/35‑1 (MQ=255) gctcctgttgttcaatagcgggggGGGGAAAAAcc > 1:16091670‑M2/25‑35 (MQ=255) aTTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGATAAAcc < 1:16900748/35‑1 (MQ=255) aTTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAAcc < 1:16845522/35‑1 (MQ=255) ttGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCt > 1:2970579/1‑35 (MQ=255) ctcctgttgttcaatagcgggggGGTGAAAAACCt > 1:6755369‑M2/24‑35 (MQ=255) tGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTg > 1:13087443/1‑35 (MQ=255) tGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTg < 1:8383200/35‑1 (MQ=255) ggCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGt < 1:18858140/35‑1 (MQ=255) ggCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGt > 1:15851885/1‑35 (MQ=255) ggCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGt > 1:11513966/1‑35 (MQ=255) gCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTc < 1:8659047/35‑1 (MQ=255) gCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTc < 1:6498413/35‑1 (MQ=255) gCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTc > 1:3066899/1‑35 (MQ=255) gCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTc > 1:14259714/1‑35 (MQ=255) cTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTct > 1:18031824/1‑34 (MQ=255) cTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCg < 1:17582766/35‑1 (MQ=255) tttAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGa < 1:8028691/35‑1 (MQ=255) tttAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGa < 1:12057443/35‑1 (MQ=255) tttAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGa > 1:19322917/1‑35 (MQ=255) tttAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGa > 1:15295537/1‑35 (MQ=255) ttAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGAt < 1:2553716/35‑1 (MQ=255) ttAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGAt > 1:19749342/1‑35 (MQ=255) ttAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGAt < 1:15560761/35‑1 (MQ=255) tAATTCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATg > 1:2948028/1‑35 (MQ=255) tAATGCGACATGGTGTGGTGAAAAACCTGTCGATg > 1:10274524/1‑35 (MQ=255) tAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATg < 1:7873052/35‑1 (MQ=255) tAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATg > 1:18153098/1‑35 (MQ=255) tAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATg < 1:6125708/35‑1 (MQ=255) aaTTCGACATGGGGTGGTTAAAAACCTGTCGATGc > 1:6470368/1‑35 (MQ=37) aaTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGc > 1:8464159/1‑35 (MQ=255) aaTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGc < 1:18390035/35‑1 (MQ=255) aaTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGc > 1:14359455/1‑35 (MQ=255) aaTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGc < 1:20390663/35‑1 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc > 1:15858207/1‑35 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc > 1:16127709/1‑35 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc < 1:9206432/35‑1 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc < 1:3585382/35‑1 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc > 1:9284811/1‑35 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc < 1:13739562/35‑1 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc < 1:18090418/35‑1 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc > 1:1863919/1‑35 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc < 1:1270901/35‑1 (MQ=255) aTGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGcc < 1:2239868/35‑1 (MQ=255) tgagACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCa < 1:11426234/32‑1 (MQ=255) tGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCa < 1:2625644/35‑1 (MQ=255) tGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCa > 1:13424517/1‑35 (MQ=255) gctaCATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCaa > 1:10903599/4‑35 (MQ=255) gCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCaa > 1:19164397/1‑35 (MQ=255) gCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCaa > 1:7391103/1‑35 (MQ=255) gCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCaa > 1:5551612/1‑35 (MQ=255) cGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCaaa < 1:13185105/35‑1 (MQ=255) gACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAag > 1:11148375/1‑35 (MQ=255) gACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAag > 1:14507463/1‑35 (MQ=255) aCATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAaga > 1:8211362/1‑35 (MQ=255) aCATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAaga < 1:7384309/35‑1 (MQ=255) aCATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAaga < 1:14593256/35‑1 (MQ=255) aCATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAaga < 1:20598035/35‑1 (MQ=255) aCATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAaga < 1:20421499/35‑1 (MQ=255) aCATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAaga > 1:12606833/1‑35 (MQ=255) cATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAagag < 1:6345576/35‑1 (MQ=255) cATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAagag < 1:11942585/35‑1 (MQ=255) cATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAagag > 1:11148233/1‑35 (MQ=255) cATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAagag < 1:5467334/35‑1 (MQ=255) cATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAagag > 1:6590674/1‑35 (MQ=255) aTGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGt > 1:5048573/1‑35 (MQ=255) aTGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGt < 1:11725889/35‑1 (MQ=255) aTGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGt < 1:3994931/35‑1 (MQ=255) ggggTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGttt > 1:8519223/1‑35 (MQ=255) gggTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTg > 1:4973111/1‑35 (MQ=255) gtggtgAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGcc > 1:12522726/1‑35 (MQ=255) tggtgAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGccc < 1:12268947/35‑1 (MQ=255) tggtgAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGccc > 1:9288360/1‑35 (MQ=255) tggtgAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGccc < 1:6615164/35‑1 (MQ=255) ggtgAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGCCCg < 1:11494622/35‑1 (MQ=255) ggtgAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGCCCg > 1:14010404/1‑35 (MQ=255) | AATCTCAAACATTGGCTTTAATGCGACATGGGGTGGTGAAAAACCTGTCGATGCCAAAGAGTTTGCCCG > REL606/3712680‑3712748 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |