Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 1,162,790 | IS150 (–) +3 bp | 41.7% | coding (601‑603/1071 nt) | plsX → | fatty acid/phospholipid synthesis protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 664688 = | NA (NA) | 45 (0.480) | 28/44 | NT | 38.5% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | 1162790 = | 62 (0.760) | coding (601/1071 nt) | plsX | fatty acid/phospholipid synthesis protein | |||||
* | ? | REL606 | = 666130 | NA (NA) | 46 (0.450) | 24/48 | NT | 38.2% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
? | REL606 | = 1162792 | 65 (0.720) | coding (603/1071 nt) | plsX | fatty acid/phospholipid synthesis protein |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
TAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCG > REL606/1162758‑1162826 | tAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCTGCg > 1:14187174/1‑35 (MQ=255) tAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCg > 1:12987882/1‑35 (MQ=255) tAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCg > 1:7533252/1‑35 (MQ=255) aaaGGGTCTCGACAGTATTCGGTATGCCTCAGCGt < 1:955918‑M2/35‑2 (MQ=255) aaaGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCgg > 1:4348401/1‑35 (MQ=255) aaGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtg < 1:7881293‑M2/35‑3 (MQ=255) aGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgt > 1:5403620‑M2/1‑32 (MQ=255) gggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgta < 1:6218190‑M2/35‑5 (MQ=255) gggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGc > 1:2072388/1‑35 (MQ=255) gggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGc < 1:3516648/35‑1 (MQ=255) gggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGc < 1:9895465/35‑1 (MQ=255) gggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGGGc > 1:5929017/1‑35 (MQ=255) catcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGc < 1:1360710‑M2/7‑1 (MQ=255) ggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtac < 1:13885845‑M2/35‑6 (MQ=255) ggTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtac < 1:13339260‑M2/35‑6 (MQ=255) atcgtccaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCt < 1:12065471‑M2/8‑1 (MQ=255) atcgtcaaacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCt < 1:16591455‑M2/8‑1 (MQ=255) gTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtact > 1:1920385‑M2/1‑29 (MQ=255) gTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtact > 1:10661108‑M2/1‑29 (MQ=255) gTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtact > 1:4562851‑M2/1‑29 (MQ=255) tctcGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtactg > 1:12752988‑M2/1‑28 (MQ=255) tctcGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTa > 1:378655/1‑35 (MQ=255) cGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTaaaa < 1:9258249/35‑1 (MQ=255) cGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTaaaa < 1:17192598/35‑1 (MQ=255) gACAGTATTAGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccc > 1:634360‑M2/1‑24 (MQ=255) caacaaaatgggtgcagtacaGCTGTGCTTAAAAc > 1:3847802‑M2/22‑35 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACa < 1:12486947‑M2/15‑1 (MQ=255) aacaaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACa < 1:15827723‑M2/15‑1 (MQ=255) cAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACaa > 1:19664701/1‑35 (MQ=255) cAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACaa < 1:15001855/35‑1 (MQ=255) caaaatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAAt < 1:10089693‑M2/17‑1 (MQ=255) aGTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaa > 1:15497572‑M2/1‑21 (MQ=255) aGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAAt < 1:1892092/35‑1 (MQ=255) gTATTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaa < 1:5080833‑M2/35‑16 (MQ=255) tATTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaa < 1:4222608‑M2/35‑17 (MQ=255) tATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATcc < 1:2031525/35‑1 (MQ=255) tATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATcc > 1:7691003/1‑35 (MQ=255) tATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATcc > 1:18153796/1‑35 (MQ=255) tATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATcc < 1:12229750/35‑1 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATccc < 1:2281084‑M2/20‑1 (MQ=255) aatgggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATccc < 1:19577791‑M2/20‑1 (MQ=255) aTTCTGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaa < 1:13105103‑M2/35‑18 (MQ=255) aTTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaa < 1:16063033‑M2/35‑18 (MQ=255) aTTCGGGATGCCTCAGCGtgtactgacccaaaaaa > 1:10331495‑M2/1‑18 (MQ=255) tCGGGATGGCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCtt < 1:19972038/35‑1 (MQ=255) gggtgcattacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc > 1:12273099‑M2/13‑35 (MQ=255) gggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc < 1:3315080‑M2/23‑1 (MQ=255) gggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc > 1:16431358‑M2/13‑35 (MQ=255) cGGGATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagtt < 1:17847396‑M2/35‑21 (MQ=255) cGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc < 1:6783209/35‑1 (MQ=255) cGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTc < 1:6062243/35‑1 (MQ=255) ggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCt > 1:1384093‑M2/12‑35 (MQ=255) ggtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCt < 1:2661994‑M2/24‑1 (MQ=255) gggATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttg < 1:3174424‑M2/35‑22 (MQ=255) gggATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCt < 1:11827347/35‑1 (MQ=255) gggATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCATTCt < 1:14125729/35‑1 (MQ=255) gtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTa < 1:7398383‑M2/25‑1 (MQ=255) gtgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTa > 1:2154962‑M2/11‑35 (MQ=255) ggATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttgg > 1:12408084‑M2/1‑13 (MQ=255) ggATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttgg > 1:11114101‑M2/1‑13 (MQ=255) ggATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTa < 1:10778430/35‑1 (MQ=255) ggATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTa < 1:2531846/35‑1 (MQ=255) tgcagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTAt < 1:15206981‑M2/26‑1 (MQ=255) gATGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttgga > 1:15752045‑M2/1‑12 (MQ=255) gATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTAt < 1:18663522/35‑1 (MQ=255) gATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTATAt < 1:7163582/35‑1 (MQ=255) aTGCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggac > 1:3556723‑M2/1‑11 (MQ=255) aTGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATc < 1:6846636/35‑1 (MQ=255) aTGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATc > 1:2726898/1‑35 (MQ=255) tGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCa < 1:18733736/35‑1 (MQ=255) tGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCa < 1:10826549/35‑1 (MQ=255) cagtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCa < 1:17535021‑M2/28‑1 (MQ=255) gCCTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacag < 1:18597624‑M2/35‑27 (MQ=255) gCATCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacag > 1:11068900‑M2/1‑9 (MQ=255) agtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCaa < 1:873773‑M2/29‑1 (MQ=255) gtacaGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAAt > 1:18476720‑M2/6‑35 (MQ=255) ccTCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacagt < 1:284192‑M2/35‑28 (MQ=255) tCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacagtta < 1:7202552‑M2/35‑30 (MQ=255) tCAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacagtta > 1:6923918‑M2/1‑6 (MQ=255) tCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATta > 1:16239942/1‑35 (MQ=255) tCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATta < 1:11429631/35‑1 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtat < 1:14214597‑M2/33‑1 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtat < 1:17260845‑M2/33‑1 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtat > 1:18265377‑M2/3‑35 (MQ=255) caGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtat < 1:5189335‑M2/33‑1 (MQ=255) cAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa < 1:11326424‑M2/35‑31 (MQ=255) cAGCGtgtactgaccccaaaaagttggacagttaa < 1:15271786‑M2/35‑31 (MQ=255) aGCGtgtactgacccaaaaaagttggacagttaaa > 1:80979‑M2/1‑4 (MQ=255) aGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATtata > 1:20246806‑M2/2‑35 (MQ=255) cGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATc > 1:2789328/1‑35 (MQ=255) cGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATc < 1:11623916/35‑1 (MQ=255) cGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATc < 1:17945867/35‑1 (MQ=255) cGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATc < 1:5672706/35‑1 (MQ=255) cGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATc < 1:5301036/35‑1 (MQ=255) cGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATc > 1:8299059/1‑35 (MQ=255) cGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATc > 1:10538626/1‑35 (MQ=255) ggTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCg > 1:20537731/1‑35 (MQ=255) ggTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCg < 1:1464980/35‑1 (MQ=255) ggTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCg > 1:7970718/1‑35 (MQ=255) ggTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCg < 1:15361737/35‑1 (MQ=255) | TAAAGGGTCTCGACAGTATTCGGGATGCCTCAGCGGTGCTTAAAACAATCCCTTCTATCAATTATATCG > REL606/1162758‑1162826 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |