Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (+) +6 bp | 66.5% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 30 (0.470) | 59 (0.660) | 32/42 | NT | 58.4% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 32 (0.500) | 64 (0.710) | 34/42 | NT | 58.8% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2448465‑2448498 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > REL606/2772854‑2772887 TGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTC < 1:16798709/35‑1 TGTAAGACAATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTC < 1:16446885/35‑1 GTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCC < 1:2888579/35‑1 TAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCC > 1:7348046/1‑35 TAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCC > 1:3650722/1‑35 AAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCA > 1:11534607/1‑35 AGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCAT > 1:10541703/1‑35 AGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCAT > 1:11600311/1‑35 GACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATA > 1:6211445/1‑35 GACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATA > 1:12350927/1‑35 ACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAA < 1:19149020/35‑1 ACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAA < 1:19869602/35‑1 ACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAA < 1:20490648/35‑1 CCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAG > 1:16011946/1‑35 CCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAG > 1:19883648/1‑35 CATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGC < 1:17190071/35‑1 CATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGC < 1:18999955/35‑1 ATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCG < 1:15303238/35‑1 ATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCG < 1:9595250/35‑1 TACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGC < 1:17704988/35‑1 TACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGC < 1:4799173/35‑1 ACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCT < 1:14786978/35‑1 ACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCT > 1:11804998/1‑35 ACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCT < 1:2146779/35‑1 CATAAAAAAGCCGGGGATGATTCCCATAAGCGCTA < 1:19409856/35‑1 CATAAAAAAGCCGGGGATGATTCCCATAAGCGCTA > 1:139947/1‑35 CATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTA < 1:8121690/35‑1 CATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTA < 1:13256105/35‑1 CATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTA < 1:3875163/35‑1 CATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTA > 1:12555111/1‑35 CATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTA > 1:807083/1‑35 CATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTA > 1:18646502/1‑35 ATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAA > 1:20036515/1‑35 ATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAA < 1:15190322/35‑1 AAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACT < 1:6156741/35‑1 AAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTT > 1:15700963/1‑35 AAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTT > 1:9332881/1‑35 AAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTT < 1:6507339/35‑1 AAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTT > 1:2105052/1‑35 AAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTA > 1:13549893/1‑35 AAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAA < 1:20571398/35‑1 AAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAA > 1:14414013/1‑35 AAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:9139407/1‑35 AAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:367403/35‑1 AGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:11797012/35‑1 AGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 1:19879271/1‑35 GCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG < 1:19440744/35‑1 GCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG < 1:11036365/35‑1 CGGTGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:8531378/1‑35 CGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAATGGTT > 1:203950/1‑35 CGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:2061989/1‑35 CGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:20117976/35‑1 CGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:1929512/1‑35 CGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:10202189/1‑35 GGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:4582549/1‑35 GGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:6593301/1‑35 GGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT > 1:743459/1‑35 GGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG > 1:1908678/1‑35 GGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG > 1:7481101/1‑35 GGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG < 1:12675952/35‑1 GATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG < 1:16547122/35‑1 GATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG < 1:7316999/35‑1 GATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG < 1:12344453/35‑1 GATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGATTGTGG > 1:15461687/1‑35 ATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:17315807/35‑1 ATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:2812843/35‑1 ATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:46352/1‑35 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:14308957/35‑1 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:9365536/35‑1 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:2906743/35‑1 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:379599/35‑1 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:7016889/1‑35 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:16973051/1‑35 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:5150979/1‑35 TAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:17776354/1‑35 AATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAT < 1:9811270/35‑1 ATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:2975043/35‑1 TTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA > 1:1375266/1‑35 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:17343877/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:9445790/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:10619169/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:9183660/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:3020293/1‑35 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:8553806/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:3444667/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:17154412/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:17089772/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:3770090/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:14590709/1‑35 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:17008911/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:6688927/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:4116791/1‑35 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:6530258/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:5035711/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:15954740/1‑35 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:5235844/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:5414698/35‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:5341827/1‑35 TCCAATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:3872060/35‑1 TCCAATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:2935583/35‑1 TGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2448465‑2448498 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > REL606/2772854‑2772887 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |