New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1947885 = | 81 (0.790) | 20 (0.200) | 9/46 | NT | 16.6% | coding (250/861 nt) | cheR | chemotaxis regulator, protein‑glutamate methyltransferase |
? | REL606 | = 3428485 | 123 (1.250) | coding (671/1338 nt) | yhfM | predicted fructoselysine transporter |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGC > REL606/1947851‑1947919 | gCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGc < 1:14287788/35‑1 (MQ=255) gCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGc < 1:13343731/35‑1 (MQ=255) gCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGc > 1:12761939/1‑35 (MQ=255) gCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAAAGc < 1:19349242/35‑1 (MQ=255) ctatctgttatatgaccggcgaaattaaaaacccc > 1:16928432‑M1/35‑35 (MQ=255) ccGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGcc < 1:819623/35‑1 (MQ=255) ccGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGcc > 1:1540271/1‑35 (MQ=255) cGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCt > 1:1832738/1‑35 (MQ=255) cGTCAGATTAGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCt < 1:8386505/35‑1 (MQ=255) gTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTTATAAACGCCTg > 1:9799048/1‑35 (MQ=255) gTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTg < 1:17031244/35‑1 (MQ=255) gTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTg > 1:15417145/1‑35 (MQ=255) gTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTg > 1:13431393/1‑35 (MQ=255) tCAGATTCGTTGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGc > 1:10102635/1‑35 (MQ=255) cAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACTCCTGcc > 1:14575660/1‑35 (MQ=255) cAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGcc > 1:4282682/1‑35 (MQ=255) cAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGcc < 1:12272459/35‑1 (MQ=255) aGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCa > 1:15268128/1‑35 (MQ=255) gATTCTTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCAc > 1:2007528/1‑35 (MQ=255) gATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCAc > 1:6146457/1‑35 (MQ=255) gATTCGTGGTCAGCGAATTGAAAAACGCCTGCCAc > 1:2994377/1‑35 (MQ=255) aTTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCCCt > 1:19558984/1‑35 (MQ=255) aTTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACt > 1:18404377/1‑35 (MQ=255) ttCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTc > 1:8468461/1‑35 (MQ=255) ttCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTc > 1:7477598/1‑35 (MQ=255) tCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCa > 1:5438646/1‑35 (MQ=255) tCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCa > 1:422733/1‑35 (MQ=255) cGTGGTCAGCTAATTGATAAACGCCTGCCACTCAc > 1:11180747/1‑35 (MQ=255) cGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCAc > 1:18946682/1‑35 (MQ=255) cGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCAc > 1:13850638/1‑35 (MQ=255) cGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCAc > 1:923070/1‑35 (MQ=255) gTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCAcc > 1:7587414/1‑35 (MQ=255) gTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCAcc > 1:16006972/1‑35 (MQ=255) gTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCAcc > 1:16578953/1‑35 (MQ=255) ggTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGc > 1:14209349/1‑35 (MQ=255) ggTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGc > 1:12816257/1‑35 (MQ=255) gTCAGCGAATTGATAAACTCCTGCCACTCACCGCt > 1:18925780/1‑35 (MQ=255) gTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCt > 1:9942009/1‑35 (MQ=255) gTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCt > 1:5152402/1‑35 (MQ=255) gTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCt > 1:764996/1‑35 (MQ=255) gTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCt > 1:18389281/1‑35 (MQ=255) gTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCt > 1:14049889/1‑35 (MQ=255) tCAGCGAATTTATAAACGCCTGCCACTCACCGCtg > 1:10137280/1‑35 (MQ=255) aGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCtgtg > 1:14505565/1‑35 (MQ=255) aGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCtgtg > 1:8833981/1‑35 (MQ=255) gCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGc > 1:11395789/1‑35 (MQ=255) cGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCt > 1:370375/1‑35 (MQ=255) cGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCt > 1:6300819/1‑35 (MQ=255) gAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTg > 1:17571827/1‑35 (MQ=255) gAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTg > 1:11160074/1‑35 (MQ=255) gAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTg > 1:12768260/1‑35 (MQ=255) gAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTg > 1:18598590/1‑35 (MQ=255) gAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTg > 1:7364055/1‑35 (MQ=255) aattaaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGa > 1:519394‑M1/13‑35 (MQ=255) aaTTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGa > 1:15048392/1‑35 (MQ=255) aaTTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGa > 1:6827161/1‑35 (MQ=255) aaTTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGa > 1:13890021/1‑35 (MQ=255) attaaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAt > 1:8924742‑M1/12‑35 (MQ=255) ataaaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAt > 1:946725‑M1/12‑35 (MQ=255) aTTTATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAt > 1:10689193/1‑35 (MQ=255) aTTGATAACCCCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAt < 1:20613786/35‑1 (MQ=25) aTTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAt > 1:7163962/1‑35 (MQ=255) ttaaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAtt > 1:11470814‑M1/11‑35 (MQ=255) ttGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAtt > 1:2475155/1‑35 (MQ=255) ttGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAtt > 1:539110/1‑35 (MQ=255) ttGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGAtt > 1:3761603/1‑35 (MQ=255) tgaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTa > 1:20102563‑M1/10‑35 (MQ=255) taaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTa > 1:1249118‑M1/10‑35 (MQ=255) tGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTa > 1:13632873/1‑35 (MQ=255) tGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTa > 1:11627139/1‑35 (MQ=255) gaaaccccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAg > 1:16778402‑M1/9‑35 (MQ=255) aaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAg > 1:4073277‑M1/9‑35 (MQ=255) aaaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAg > 1:15671262‑M1/9‑35 (MQ=255) aaaccccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGa > 1:10404092‑M1/8‑35 (MQ=255) aaaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGa > 1:17712842‑M1/8‑35 (MQ=255) tAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGAt > 1:1120766/1‑35 (MQ=255) aaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGAt > 1:6734410‑M1/7‑35 (MQ=255) aaacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGAt > 1:2645251‑M1/7‑35 (MQ=255) aacccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGAtt > 1:19479692‑M1/6‑35 (MQ=255) ccccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTc > 1:1560105‑M1/5‑35 (MQ=255) acccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTc > 1:14706172‑M1/5‑35 (MQ=255) aaCGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTc > 1:1978775/1‑35 (MQ=255) aaCGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTc > 1:3896033/1‑35 (MQ=255) cccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTcc > 1:12033896‑M1/4‑35 (MQ=255) aCGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTcc > 1:1723561/1‑35 (MQ=255) ccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCa > 1:7315372‑M1/3‑35 (MQ=255) ccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCa > 1:6788362‑M1/3‑35 (MQ=255) ccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCa > 1:2870560‑M1/3‑35 (MQ=255) ccCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCa > 1:8954067‑M1/3‑35 (MQ=255) cGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCa > 1:7722272/1‑35 (MQ=255) cGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCa > 1:16977631/1‑35 (MQ=255) gCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAg > 1:5516430/1‑35 (MQ=255) cCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAg > 1:7575757‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAg > 1:7904315‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAg > 1:10677923‑M1/2‑35 (MQ=255) CCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGc < 1:8707681‑M1/35‑1 (MQ=255) CCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGc < 1:5617776‑M1/35‑1 (MQ=255) CCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGc > 1:2955896‑M1/1‑35 (MQ=255) CCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGc < 1:12208597‑M1/35‑1 (MQ=255) CCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGc < 1:3522224‑M1/35‑1 (MQ=255) | GCCGTCAGATTCGTGGTCAGCGAATTGATAAACGCCTGCCACTCACCGCTGTGCTGATTAGATTCCAGC > REL606/1947851‑1947919 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |