Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA REL606 4,431,394 Δ2 bp 100% coding (3526‑3527/3780 nt) ytfN → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*REL6064,431,3940G→.100.0% 383.7 99coding (3526/3780 nt)ytfNhypothetical protein
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*REL6064,431,3950G→.100.0% 383.7 99coding (3527/3780 nt)ytfNhypothetical protein
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CTGATTGGTCTGGGGGTTGCGCAAAGTGGCCAGATTGTGGGTAAAATCGGCGAGA  >  REL606/4431367‑4431421
                           ||                          
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                  gcgcAAAGT‑‑CCAGATTGTGGGTAAAATCGGCgaga  >  1:1590066/1‑35 (MQ=25)
                           ||                          
CTGATTGGTCTGGGGGTTGCGCAAAGTGGCCAGATTGTGGGTAAAATCGGCGAGA  >  REL606/4431367‑4431421

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.