New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1686611 | 82 (0.800) | 5 (0.050) | 3/48 | NT | 10.1% | coding (276/1059 nt) | rnfD | electron transport complex protein RnfD |
? | REL606 | 1736972 = | 7 (0.070) | coding (819/1221 nt) | sufS | selenocysteine lyase |
CCCCCCCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1686603‑1686611 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA > REL606/1736972‑1737005 CCCCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAG < 1:4826362/35‑1 CCCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGT < 1:9045322/35‑1 CCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTG < 1:6139808/35‑1 CCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTG < 1:1496522/35‑1 CCCCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTG < 1:15547536/35‑1 CCCCCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCC < 1:938910/35‑1 cccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCT < 1:2402925/32‑1 ccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTT < 1:14538198/33‑1 ccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTT < 1:13650154/33‑1 ccCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTN < 1:19595348/33‑1 acCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTT < 1:18640817/33‑1 cCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTC < 1:17422636/34‑1 cCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTC < 1:14864892/34‑1 cCCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTC < 1:4947015/34‑1 CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA < 1:1979231/35‑1 CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA < 1:3330351/35‑1 CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA < 1:5097249/35‑1 CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA < 1:8097112/35‑1 CCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA < 1:13657590/35‑1 CCCCCCCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1686603‑1686611 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCA > REL606/1736972‑1737005 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |