New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 2949571 | 69 (0.670) | 15 (0.150) | 5/46 | NT | 14.6% | coding (834/996 nt) | argK | arginine/ornithine transport system ATPase |
? | REL606 | = 3728925 | 109 (1.110) | coding (59/960 nt) | yibQ | predicted polysaccharide deacetylase |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
CTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGAT > REL606/3728891‑3728959 | cTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTcccc > 1:8938319/1‑35 (MQ=255) cTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTcccc < 1:3180758/35‑1 (MQ=255) cTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTcccc < 1:15502741/35‑1 (MQ=255) cTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTcccc > 1:12882560/1‑35 (MQ=255) ttGCATTTGGCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCc < 1:2852735‑M2/35‑2 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCc > 1:2789503‑M2/1‑34 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCc > 1:8245993‑M2/1‑34 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCc < 1:2456849‑M2/35‑2 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCc < 1:2937964‑M2/35‑2 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCc < 1:8562182‑M2/35‑2 (MQ=255) ttGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCc > 1:12928429‑M2/1‑34 (MQ=255) tGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCg > 1:5437119/1‑35 (MQ=255) tGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCg > 1:8357616/1‑35 (MQ=255) tGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCg < 1:8439528/35‑1 (MQ=255) tGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCg > 1:17361474/1‑35 (MQ=255) gCATTTGCCGCTCTTTTGGCGCTCTCCTCCCCCGt > 1:7355483/1‑35 (MQ=255) gCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGt < 1:15053942/35‑1 (MQ=255) gCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGt > 1:11925024/1‑35 (MQ=255) cATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCccaa > 1:17484638‑M2/1‑31 (MQ=255) cATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTa < 1:15028135/35‑1 (MQ=255) aTTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTAc > 1:6933227/1‑35 (MQ=255) tttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACt < 1:14219144/35‑1 (MQ=255) tttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACt < 1:19646985/35‑1 (MQ=255) ttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACtt > 1:1299420/1‑35 (MQ=255) ttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACtt < 1:15890410/35‑1 (MQ=255) ttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACtt > 1:11601797/1‑35 (MQ=255) ttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACtt < 1:17668323/35‑1 (MQ=255) ttGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCACGTACtt < 1:12975622/35‑1 (MQ=255) tGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTg < 1:7619467/35‑1 (MQ=255) tGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTg < 1:12047162/35‑1 (MQ=255) gCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGc < 1:11809364/35‑1 (MQ=255) gCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGc < 1:6443474/35‑1 (MQ=255) ccGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCt < 1:9801280/35‑1 (MQ=255) ccGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCt < 1:6701370/35‑1 (MQ=255) ccGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCt > 1:19859769/1‑35 (MQ=255) ccGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCACCCGTACTTGCt < 1:7945320/35‑1 (MQ=255) cGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTg > 1:13048090/1‑35 (MQ=255) cGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTg < 1:8027943/35‑1 (MQ=255) gCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTgg < 1:15006165/35‑1 (MQ=255) gCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTgg < 1:7160935/35‑1 (MQ=255) gCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTgg > 1:662659/1‑35 (MQ=255) gCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTgg > 1:10442842/1‑35 (MQ=255) ctctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGc > 1:9459717/1‑35 (MQ=255) ctctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGc < 1:5462658/35‑1 (MQ=255) ctctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGc < 1:13298005/35‑1 (MQ=255) ctctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGc > 1:12405099/1‑35 (MQ=255) ctctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTAATTGCTGGc < 1:9205656/35‑1 (MQ=255) ctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCaa > 1:17025009/1‑35 (MQ=255) ctGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCaa > 1:16085965/1‑35 (MQ=255) tGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCaaa > 1:16217655/1‑35 (MQ=255) gTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAAc < 1:7008900/35‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAAc > 1:19179462/1‑35 (MQ=255) gTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAAc < 1:8779345/35‑1 (MQ=255) ttGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACt > 1:18565420/1‑35 (MQ=255) ttGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACt < 1:10691607/35‑1 (MQ=255) ttGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACt < 1:13453145/35‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTCCTCCACCGTACTTGCTGGCAAACtt < 1:11654687/35‑1 (MQ=255) tGGAGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACtt < 1:12719978/35‑1 (MQ=255) tGGAGCTCTCCTCCCCAGTACTTGCTGGCAAACtt < 1:13663169/35‑1 (MQ=38) ggCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTg > 1:10344021/1‑35 (MQ=255) ggCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTg > 1:5603853/1‑35 (MQ=255) gcgcTCTCCTCCCTCGTACTTGCTGGCAAACTTGc > 1:6162448/1‑35 (MQ=255) gcgcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGc > 1:3835291/1‑35 (MQ=255) gcgcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGc < 1:16696889/35‑1 (MQ=255) gcgcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGc > 1:16956981/1‑35 (MQ=255) cgtTCTCCTCCCCcagccattccaccgattgttgt > 1:11428225‑M2/1‑13 (MQ=255) cgcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGcc > 1:15985688/1‑35 (MQ=255) cgcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGcc > 1:9614309/1‑35 (MQ=255) cgcTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGcc < 1:20485195/35‑1 (MQ=255) tgtctcctCCCCcagccattccaccgattgttgtt > 1:2082029‑M2/3‑12 (MQ=255) ttctccTCCCCcagccattccaccgattgttgttg > 1:17955610‑M2/2‑11 (MQ=255) ctctCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCAt > 1:4584417/1‑35 (MQ=255) tctcCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATc > 1:5862015/1‑35 (MQ=255) ctcctcCCCcagccattccaccgattgttgttgcc > 1:17997799‑M2/1‑9 (MQ=255) ctcctcCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCg < 1:11158106/35‑1 (MQ=255) ctcctcCCCAGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCg < 1:12173098/35‑1 (MQ=255) tcctccCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGt < 1:1999883/35‑1 (MQ=255) tcccccCCcagccattccaccgattgttgttgccg > 1:19506754‑M2/1‑8 (MQ=255) cctccCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTc < 1:5353628/35‑1 (MQ=255) ctccCCcagccattccaccgattgttgttgccgca > 1:18227692‑M2/1‑6 (MQ=255) tccCCcagccattccaccgattgttgttgccgcac > 1:9888343‑M2/1‑5 (MQ=255) cccccagccattccaccgattgttgttgccgcact > 1:10196490‑M2/1‑4 (MQ=255) cccccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCAtt < 1:4117896/35‑1 (MQ=255) ncccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtg > 1:16776074/2‑35 (MQ=255) ccccagccattccgccgattgttgttgccgcactt > 1:12613268‑M2/1‑3 (MQ=255) ccccagccattccaccgattgttgttgccgcactt > 1:9949335‑M2/1‑3 (MQ=255) ccccagccattccaccgattgttgttgccgcactt > 1:6425052‑M2/1‑3 (MQ=255) ccccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtg < 1:3058607/35‑1 (MQ=255) ccccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtg < 1:2821426/35‑1 (MQ=255) cccagccattccaccgattgttgttgccgcacttg > 1:2656228‑M2/1‑2 (MQ=255) cccagccattccaccgattgttgttgccgcacttg > 1:8732283‑M2/1‑2 (MQ=255) cccagccattccaccgattgttgttgccgcacttg > 1:1875680‑M2/1‑2 (MQ=255) cccagccattccaccgattgttgttgccgcacttg > 1:9067321‑M2/1‑2 (MQ=255) cccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtga > 1:16572901/1‑35 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtgat > 1:18923746/1‑35 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtgat > 1:18479757/1‑35 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtgat > 1:3346582/1‑35 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtgat > 1:14018684/1‑35 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtgat > 1:5496520/1‑35 (MQ=255) ccGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATtgat < 1:6311163/35‑1 (MQ=255) | CTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGGCAAACTTGCCATCGTCATTGAT > REL606/3728891‑3728959 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |