New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1430232 = | 98 (0.950) | 7 (0.100) | 3/34 | NT | 10.1% | coding (2159/3525 nt) | ydbK | fused predicted pyruvate‑flavodoxin oxidoreductase: conserved protein/conserved protein/FeS binding protein |
? | REL606 | 3284457 = | 55 (0.760) | coding (588/729 nt) | mtgA | monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TGAAACGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTCGCGG > REL606/3284423‑3284491 | tGAAACGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGt > 1:7711503/1‑35 (MQ=255) gAAACGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTa > 1:5737979/1‑35 (MQ=255) aaaCGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTaa > 1:16987969/1‑35 (MQ=255) aaaCGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTaa > 1:6734890/1‑35 (MQ=255) aaCGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAAt > 1:9182192/1‑35 (MQ=255) aaCGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAAt > 1:2286701/1‑35 (MQ=255) aaCGAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAAt > 1:6261062/1‑35 (MQ=255) gAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCa > 1:6516153/1‑35 (MQ=255) gAAGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCa > 1:12565336/1‑35 (MQ=255) gAAGTGGATTAGGTAATACAGCTACCAGTAATGCa > 1:19501393/1‑35 (MQ=255) aaGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAg > 1:16292180/1‑35 (MQ=255) aaGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAg > 1:16465898/1‑35 (MQ=255) aaGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAg > 1:11559229/1‑35 (MQ=255) aGTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGc > 1:1061869/1‑35 (MQ=255) gTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCt > 1:79346/1‑35 (MQ=255) gTGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCt > 1:17720944/1‑35 (MQ=255) tGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCtt > 1:11964175/1‑35 (MQ=255) tGGATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCtt > 1:591166/1‑35 (MQ=255) ggATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTc > 1:8873771/1‑35 (MQ=255) gATTATGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTcc > 1:782894/1‑35 (MQ=255) gATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTcc > 1:17800638/1‑35 (MQ=255) gATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTcc > 1:19674973/1‑35 (MQ=255) gATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTcc > 1:10856700/1‑35 (MQ=255) gATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTcc > 1:5977959/1‑35 (MQ=255) gATTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTcc > 1:8275457/1‑35 (MQ=255) aTTAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCg > 1:8730159/1‑35 (MQ=255) tAGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGAc > 1:17426988/1‑35 (MQ=255) aGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGAcc > 1:14672314/1‑35 (MQ=255) aGGTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGAcc > 1:12322867/1‑35 (MQ=255) ggTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCg > 1:18160098/1‑35 (MQ=255) gaaaacccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCg < 1:8639598‑M2/18‑1 (MQ=255) gaaaacacccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCg < 1:9623199‑M2/18‑1 (MQ=255) gcaaTACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCgg > 1:19235983/3‑35 (MQ=255) gTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCgg > 1:15877493/1‑35 (MQ=255) gTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCgg > 1:14278480/1‑35 (MQ=255) gTAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCgg > 1:729002/1‑35 (MQ=255) taacccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCggg < 1:1046908‑M2/20‑1 (MQ=255) tAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCggg > 1:2378224/1‑35 (MQ=255) tAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCggg > 1:3150089/1‑35 (MQ=255) tAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCggg > 1:1059907/1‑35 (MQ=255) tAATACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCggg > 1:18637420/1‑35 (MQ=255) tAATACAGATGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCggg < 1:10293702/35‑1 (MQ=255) aacccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGt < 1:13946148‑M2/21‑1 (MQ=255) ccccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTn < 1:11205032‑M2/22‑1 (MQ=255) ccccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTa < 1:9616769‑M2/22‑1 (MQ=255) aTACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTa > 1:7976720/1‑35 (MQ=255) aTACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTa > 1:746222/1‑35 (MQ=255) tACAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTaa > 1:19667249/1‑35 (MQ=255) cccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTaa < 1:460832‑M2/23‑1 (MQ=255) cccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTaa < 1:406484‑M2/23‑1 (MQ=255) ccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAg < 1:11747087‑M2/24‑1 (MQ=255) ccccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAg < 1:18350050‑M2/24‑1 (MQ=255) aCAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGAGCGGGCAAg > 1:326379/1‑35 (MQ=37) aCAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTacg > 1:19978219/1‑33 (MQ=255) aCAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAg > 1:11601775/1‑35 (MQ=255) aCAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAg > 1:13291640/1‑35 (MQ=255) aCAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAg > 1:20244866/1‑35 (MQ=255) cccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGt < 1:12565281‑M2/25‑1 (MQ=255) cccctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGt < 1:6996888‑M2/25‑1 (MQ=255) cAGCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGt > 1:6899930/1‑35 (MQ=255) gCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGttt > 1:6496616/1‑35 (MQ=255) gCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGttt > 1:19798732/1‑35 (MQ=255) gCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGttt > 1:4565284/1‑35 (MQ=255) gCTGCCAGTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGttt > 1:384713/1‑35 (MQ=255) cctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGttt < 1:16878466‑M2/27‑1 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg < 1:4536649‑M2/28‑1 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg > 1:17430637‑M2/8‑35 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg > 1:459299‑M2/8‑35 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg > 1:13048670‑M2/8‑35 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg < 1:15209386‑M2/28‑1 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg < 1:5755216‑M2/28‑1 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg < 1:2684527‑M2/28‑1 (MQ=255) ctgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTg < 1:6014257‑M2/28‑1 (MQ=255) tgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGc < 1:8360080‑M2/29‑1 (MQ=255) tgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGc > 1:5285808‑M2/7‑35 (MQ=255) tgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGc < 1:16337035‑M2/29‑1 (MQ=255) tgccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGc > 1:16246211‑M2/7‑35 (MQ=255) tgccagTAATGCAGCTTCCGACCGCGTAAGTTTGc > 1:2861085‑M2/7‑35 (MQ=255) gccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCt > 1:19910512‑M2/6‑35 (MQ=255) gccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCt > 1:2958199‑M2/6‑35 (MQ=255) ctcagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCt < 1:15035378‑M2/30‑1 (MQ=255) ccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTc > 1:4037507‑M2/5‑35 (MQ=255) ccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTc > 1:11168957‑M2/5‑35 (MQ=255) ccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTc < 1:14126373‑M2/31‑1 (MQ=255) ccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTc < 1:3111844‑M2/31‑1 (MQ=255) ccagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTc > 1:13663019‑M2/5‑35 (MQ=255) cagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTcg < 1:18826190‑M2/32‑1 (MQ=255) cagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTcg > 1:10911669‑M2/4‑35 (MQ=255) cagTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTcg < 1:15239788‑M2/32‑1 (MQ=255) agTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTcgc < 1:10306745‑M2/33‑1 (MQ=255) agTAATGCAGCTTCCGACCGGGTAAGTTTGCTcgc > 1:15842880‑M2/3‑35 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |