New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 256933 | 70 (0.680) | 10 (0.130) | 4/36 | NT | 13.6% | coding (70/399 nt) | yafO | predicted toxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
? | REL606 | 3944634 = | 75 (0.970) | intergenic (+23/‑124) | proM/aslB | tRNA‑Pro/predicted regulator of arylsulfatase activity |
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
ACTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGCC > REL606/256899‑256967 | aCTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGG < 1:10972522‑M1/35‑1 (MQ=255) aCTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGG > 1:3528144‑M1/1‑35 (MQ=255) cTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGg > 1:11014334‑M1/1‑34 (MQ=255) cTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGg > 1:1733367‑M1/1‑34 (MQ=255) ttACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGgg > 1:17323727‑M1/1‑33 (MQ=255) tACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGgtg > 1:14175929‑M1/1‑32 (MQ=255) tACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggt > 1:14243311‑M1/1‑32 (MQ=255) tACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggt > 1:11247274‑M1/1‑32 (MQ=255) tACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggg > 1:16868533‑M1/1‑32 (MQ=255) tACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGAtt < 1:17481994/35‑1 (MQ=255) tACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGAtt < 1:12303293/35‑1 (MQ=255) tACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGAtt < 1:7103546/35‑1 (MQ=255) aCAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGgttt > 1:2432520‑M1/1‑31 (MQ=255) aCAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtt > 1:3253677‑M1/1‑31 (MQ=255) aCAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtt > 1:18485466‑M1/1‑31 (MQ=255) aCAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtt > 1:6670627‑M1/1‑31 (MQ=255) aCAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGgggt > 1:18990954‑M1/1‑31 (MQ=255) cagcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggttt > 1:15257634‑M1/1‑30 (MQ=255) cagcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGAtttt < 1:3000264/35‑1 (MQ=255) cagcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGAtttt < 1:16600386/35‑1 (MQ=255) cagcagAGGAAATTGATGCGTTAACGGCGGAtttt < 1:17421802/35‑1 (MQ=255) agcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtttt > 1:11951493‑M1/1‑29 (MQ=255) agcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggttta > 1:3573601‑M1/1‑29 (MQ=255) agcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGgggtta > 1:2241996‑M1/1‑29 (MQ=255) agcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTa < 1:18142355/35‑1 (MQ=255) agcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTa < 1:8331639/35‑1 (MQ=255) gcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTAt < 1:14186210/35‑1 (MQ=255) gcagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTAt < 1:8824893/35‑1 (MQ=255) catagGAACTTGATGCGTTAACGGCAGGTTTTAtt > 1:11547398/4‑35 (MQ=25) cagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtttttt > 1:8028186‑M1/1‑27 (MQ=255) cagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTAtt < 1:18757694/35‑1 (MQ=255) cagAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTAtt < 1:13847253/35‑1 (MQ=255) agagGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggttttttt > 1:3887386‑M1/1‑26 (MQ=255) gagGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtttttttt > 1:14740925‑M1/1‑25 (MQ=255) gagGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtttttttt > 1:12517515‑M1/1‑25 (MQ=255) gagGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTc < 1:8843028/35‑1 (MQ=255) gagGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTc < 1:5360070/35‑1 (MQ=255) agGAACTTGATGCGTTAACGGCGGggttttttttc > 1:19437575‑M1/1‑24 (MQ=255) agGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTcc < 1:17653312/35‑1 (MQ=255) ggAACTTGATGCGTTAACGGCGGggtttttttttt > 1:12126449‑M1/1‑23 (MQ=255) ggAACTTGATGCGTTAACGGCGGGGTTTTTTTTCt > 1:20518957/1‑35 (MQ=16) ggAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCt < 1:2022416/35‑1 (MQ=255) ggAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCt < 1:11242834/35‑1 (MQ=255) ggAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCt < 1:13076786/35‑1 (MQ=255) gAACTTGATGCGTTAACGGCGGGGTTTTTTTTCtt > 1:8403964/1‑34 (MQ=16) gAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCta < 1:4640855/35‑1 (MQ=255) gAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCta < 1:8533124/35‑1 (MQ=255) gAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCta < 1:9701008/35‑1 (MQ=255) gAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCta < 1:18032066/35‑1 (MQ=255) gAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCta < 1:16102650/35‑1 (MQ=255) aaCTTGATGCGTTAACGGCGGGGTTTTTTTTCttt > 1:13782772/1‑33 (MQ=12) aaCTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCtat < 1:9489044/35‑1 (MQ=255) aaCTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCtat < 1:8340834/35‑1 (MQ=255) aCTTGATGCGTTAACGGCGGGGTTTTTTTTTtata > 1:19914640/1‑35 (MQ=12) aCTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCtata < 1:10110059/35‑1 (MQ=255) aCTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCtata < 1:16691036/35‑1 (MQ=255) cTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATaa < 1:18358076/35‑1 (MQ=255) cTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATaa < 1:20464441/35‑1 (MQ=255) ttGATGCGTTAACGGCGGGGTTTTTTTTTTATAAg > 1:1889686/1‑35 (MQ=12) ttGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAg < 1:6201712/35‑1 (MQ=255) ttGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAg < 1:7647724/35‑1 (MQ=255) tGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGc < 1:9299364/35‑1 (MQ=255) tGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGc < 1:5915953/35‑1 (MQ=255) gATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCg < 1:9076226/35‑1 (MQ=255) gATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCg < 1:13202320/35‑1 (MQ=255) aTGCGTTAACGGCGGGGTTTTTTTTCTTTAAACgg > 1:71506/1‑34 (MQ=2) aTGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGt < 1:4152795/35‑1 (MQ=255) tGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTg < 1:15813178/35‑1 (MQ=255) tGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTg < 1:15498371/35‑1 (MQ=255) gCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGa < 1:4185977/35‑1 (MQ=255) cGTTAACTGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGAc > 1:8054945/1‑35 (MQ=255) gTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACg < 1:19083602/35‑1 (MQ=255) gTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACg < 1:18423508/35‑1 (MQ=255) gTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACg < 1:6823957/35‑1 (MQ=255) ttAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACgg < 1:14894631/35‑1 (MQ=255) ttAACGGAGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACgg < 1:8578561/35‑1 (MQ=255) tAACGGAGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGgt < 1:3041882/35‑1 (MQ=255) aCGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGgtgt < 1:19488700/35‑1 (MQ=255) cggcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGtt < 1:20516326/35‑1 (MQ=255) cggcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGtt < 1:17150973/35‑1 (MQ=255) ggcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGttt < 1:9733137/35‑1 (MQ=255) ggcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGttt > 1:19098507/1‑35 (MQ=255) ggcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGttt > 1:19232484/1‑35 (MQ=255) ggcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGGGttt > 1:3412165/1‑35 (MQ=255) gcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGtttt < 1:14428643/35‑1 (MQ=255) gcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGtttt > 1:5280544/1‑35 (MQ=255) gcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGtttt < 1:20033635/35‑1 (MQ=255) gcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGtttt < 1:2954553/35‑1 (MQ=255) gcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGGGtttt > 1:8908234/1‑35 (MQ=255) gcggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGGGgttt > 1:6872749/1‑35 (MQ=38) cggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTg > 1:12561716/1‑35 (MQ=255) cggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTg < 1:11442814/35‑1 (MQ=255) cggATTTTATTTCATATAAGCGTGACGGTGTTTTg < 1:10030166/35‑1 (MQ=255) ggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGc < 1:7711316/35‑1 (MQ=255) ggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGc > 1:17063281/1‑35 (MQ=255) ggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGc > 1:14243728/1‑35 (MQ=255) ggATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGc > 1:10276087/1‑35 (MQ=255) gATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGcc < 1:3853938/35‑1 (MQ=255) gATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGcc < 1:5152983/35‑1 (MQ=255) gATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGGGTTTTGcc > 1:5575149/1‑35 (MQ=255) | ACTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGCGTGACGGTGTTTTGCC > REL606/256899‑256967 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |