New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3258154 = | 65 (0.630) | 8 (0.110) | 5/34 | NT | 13.0% | coding (1151/1338 nt) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
? | REL606 | 3281934 = | 61 (0.840) | coding (122/492 nt) | ptsN | sugar‑specific enzyme IIA component of PTS |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAG > REL606/3258120‑3258188 | tcaaaacccacctgaggcggcaggctaagttgttt > 1:4134817‑M1/35‑35 (MQ=255) tcaaaaaccacctgaggcggcaggctaagttgttt > 1:7627906‑M1/35‑35 (MQ=255) ggTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGAt < 1:16507381/35‑1 (MQ=255) ggTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGAt > 1:10678067/1‑35 (MQ=255) caaaaaaccacctgaggcggcaggctaagttgttt > 1:1692975‑M1/35‑35 (MQ=255) gTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATc < 1:20353798/35‑1 (MQ=255) gTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATc < 1:11212222/35‑1 (MQ=255) gTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATc < 1:16906198/35‑1 (MQ=255) gTCACGGCTTTAACTGACTAATGCTCAAGTGGATc < 1:2646183/35‑1 (MQ=255) caaaaaccacctgaggcggcaggctaagttgttTc > 1:1877758‑M1/34‑35 (MQ=255) caaaaaccacctgaggcggcaggctaagttgttTc > 1:1863262‑M1/34‑35 (MQ=255) caaaaacaacctgaggcggcaggctaagttgttTc > 1:15200463‑M1/34‑35 (MQ=255) tCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcg < 1:18123125/35‑1 (MQ=255) tCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcg < 1:15086523/35‑1 (MQ=255) tCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTAGATcg < 1:17275130/35‑1 (MQ=255) aaaacccacctgaggcggcaggctaagttgttTcg > 1:1365283‑M1/33‑35 (MQ=255) aaaacccacctgaggcggcaggctaagttgttTcg > 1:15472409‑M1/33‑35 (MQ=255) aaaacccacctgaggcggcaggctaagttgttTcg > 1:11696057‑M1/33‑35 (MQ=255) aaaaaccacctgaggcggcaggctaagttgttTcg > 1:12531262‑M1/33‑35 (MQ=255) aaaaaccacctgaggcggcaggctaagttgttTcg > 1:19809534‑M1/33‑35 (MQ=255) cACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgc < 1:16227017/35‑1 (MQ=255) cACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgc > 1:785760/1‑35 (MQ=255) aaaaccacctgaggcggcaggctaagttgttttgc < 1:1771979‑M1/4‑4 (MQ=255) aacccacctgaggcggcaggctaagttgttTcgcc > 1:4151264‑M1/31‑35 (MQ=255) aCGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgcc > 1:3243800/1‑35 (MQ=255) aCGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgcc < 1:309140/35‑1 (MQ=255) aCGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgcc > 1:2894805/1‑35 (MQ=255) aCGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgcc < 1:2860077/35‑1 (MQ=255) aCGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgcc < 1:10665359/35‑1 (MQ=255) aCGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgcc < 1:13142876/35‑1 (MQ=255) cGGCTTTACCTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccg < 1:3739246/35‑1 (MQ=255) cGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccg < 1:17658005/35‑1 (MQ=255) cGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATccccg > 1:11165111/1‑35 (MQ=255) acccacctgaggcggcaggctaagttgttTcgccg > 1:5451146‑M1/30‑35 (MQ=255) acccacctgaggcggcaggctaagttgttTcgccg > 1:15864828‑M1/30‑35 (MQ=255) acccacctgaggcggcaggctaagttgttTcgccg > 1:18392172‑M1/30‑35 (MQ=255) acccacctgaggcggcaggctaagttgttTcgccg > 1:3426204‑M1/30‑35 (MQ=255) aaccacctgaggcggcaggctaagttgttTcgccg > 1:20592735‑M1/30‑35 (MQ=255) aaccacctgaggcggcaggctaagttgttTcgccg > 1:15974956‑M1/30‑35 (MQ=255) ggCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccgc > 1:8789673/1‑35 (MQ=255) ggCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccgc > 1:3538447/1‑35 (MQ=255) ggCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccgc > 1:13362917/1‑35 (MQ=255) ggCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccgc > 1:8730190/1‑35 (MQ=255) ggCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccgc > 1:19784634/1‑35 (MQ=255) ggCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgcagc < 1:11891398/35‑1 (MQ=255) gCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCt > 1:18920931/1‑35 (MQ=255) gCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCt > 1:12380988/1‑35 (MQ=255) gCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCt > 1:4915403/1‑35 (MQ=255) cTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTa > 1:854320/1‑35 (MQ=255) cTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTa > 1:13472389/1‑35 (MQ=255) tttAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTAc > 1:12491473/1‑35 (MQ=255) tttAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTAc > 1:19575393/1‑35 (MQ=255) tttAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTAc > 1:16515763/1‑35 (MQ=255) tAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCt > 1:7431994/1‑35 (MQ=255) tAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCt > 1:3766163/1‑35 (MQ=255) aCTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGc > 1:5642304/1‑35 (MQ=255) aCTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGc > 1:15644081/1‑35 (MQ=255) aCTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGc > 1:19427801/1‑35 (MQ=255) aCTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGc > 1:12074004/1‑35 (MQ=255) cTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCg > 1:2668870/1‑35 (MQ=255) cTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCg > 1:9807870/1‑35 (MQ=255) cTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCg > 1:17726368/1‑35 (MQ=255) tGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCgg > 1:291797/1‑35 (MQ=255) tGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCgg > 1:7222469/1‑35 (MQ=255) gACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTTCGgt > 1:4319927/1‑35 (MQ=255) gACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCggg > 1:719289/1‑34 (MQ=255) gACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCggg > 1:7878387/1‑34 (MQ=255) aCTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCgggg > 1:2277992/1‑33 (MQ=255) cTCATGCTCAAGTGGATCGCCACTACCTGCggggg > 1:6776224/1‑32 (MQ=38) tCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGgggtg > 1:19263872/1‑34 (MQ=255) catgctaagttgttTCGCCGCTACCTGCGGTGTaa > 1:4871720‑M1/15‑35 (MQ=255) cATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGgggtga > 1:11240868/1‑33 (MQ=37) aTGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGgggtgaa > 1:9695080/1‑32 (MQ=37) aTGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGGGTAac > 1:8682449/1‑35 (MQ=255) tGCTCAGTTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacg < 1:3688709/35‑1 (MQ=18) tGCTCAGTTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacg < 1:2240091/35‑1 (MQ=18) tGCTCAAGTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacg < 1:404626/35‑1 (MQ=255) tcTCAAGTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgt < 1:4905530/34‑1 (MQ=255) gctaagtggttTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgt > 1:14330826‑M1/12‑35 (MQ=255) gCTCAGGTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgt < 1:2696057/35‑1 (MQ=25) tgcAAGTGATTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgta < 1:18351733/33‑1 (MQ=25) cTCAGGTGTTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgta < 1:6631224/35‑1 (MQ=25) taaaGTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtac < 1:1662892/33‑1 (MQ=25) taaaGGGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtac < 1:9644912/33‑1 (MQ=21) tCAAGGGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtac < 1:10055795/35‑1 (MQ=25) gcAAGTGTGTCCCCGCTACCTGCGGTGTAacgtac < 1:18108743/34‑1 (MQ=25) caagttgttTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtac > 1:19759372‑M1/10‑35 (MQ=255) acAAGTGTTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtac < 1:10547561/34‑1 (MQ=25) tagtggttTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtacg > 1:695931‑M1/9‑35 (MQ=255) atgTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtacgt < 1:12737247/33‑1 (MQ=25) aggtgttTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtacgt > 1:18147064‑M1/8‑35 (MQ=255) aggTGGTTCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgtacgt < 1:5779128/33‑1 (MQ=25) aaGTTGATCGCCGCTACCTGCGGGGTAaagtacgg > 1:19023318/1‑34 (MQ=25) aaGTGGATCGCCGCTACCTGCGGGGTAacgtacgg > 1:13455383/1‑34 (MQ=255) aaGTGGATCGCCGCTACCTGCGGGGTAaaggacgg > 1:7081991/1‑34 (MQ=21) gggttTCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTa > 1:1432541‑M1/6‑35 (MQ=255) ttTCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAAcc > 1:2900768‑M1/3‑35 (MQ=255) gtTCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAAcc > 1:3488903‑M1/3‑35 (MQ=255) TCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTtaacgag > 1:7692711‑M1/1‑32 (MQ=255) TCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAg > 1:1476353‑M1/1‑35 (MQ=255) | GGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAG > REL606/3258120‑3258188 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |