New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 514780 = | 90 (0.880) | 3 (0.050) | 3/28 | NT | 8.3% | coding (727/1146 nt) | glxK | glycerate kinase II |
? | REL606 | 1871739 = | 14 (0.230) | coding (75/1911 nt) | yoaA | conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain |
TCTATCGCCTGGGTGACGGCTACCGCCATCTGTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCG > REL606/1871707‑1871773 | tCTATCGCCTGGGTGACGGCTACCGCCATCTGTCg > 1:3716286/1‑35 (MQ=255) aTCGCCTGGGTGACGGCTAACGCCATCTGTTGccg > 1:11444830/1‑33 (MQ=25) gCCTGGGTGACGGCTACCGCCATCTGTCGCCGTgg > 1:16780060/1‑35 (MQ=255) ccTGGGTGACGGCTACCGCCATCTGTCGCTGGggg > 1:9120880/1‑34 (MQ=255) ccTGGGTGACGGCTACCGCCATCTGTCGCTGGggg > 1:384614/1‑34 (MQ=255) tGGGTGACGGCTACCGCCATCTGTCGCTGTgggtt > 1:7403825/1‑32 (MQ=255) ggggCGACGTCTCCCGCCATCTGTCGCTGTGGTtc < 1:2523051/34‑1 (MQ=21) gggTGCCGGCTCCCGCCATCTGTCGCTGTGGTtct < 1:20381338/35‑1 (MQ=25) gggTGCCGGCTCCCGCCATCTGTCGCTGTGGTtct < 1:8805171/35‑1 (MQ=25) gggTGACGGCTAACGCCATCTGTCGCTGGGGGtct > 1:4712347/1‑35 (MQ=25) gtggACGGTTCCAGCCATCTGTCGCTGTGGTtctc < 1:16630412/32‑1 (MQ=16) ggTGCCGCCTCCCGCCATCTGTCGCTGTGGTtctc < 1:1852839/35‑1 (MQ=21) gTGCCGCCTCCCGCCATCTGTCGCTGTGGTTCTcg < 1:17879228/35‑1 (MQ=21) gTGCCGCCTACCGCCATCTGTCGCTGTGGTTCTcg < 1:12430589/35‑1 (MQ=25) gccgcctcccgccatctgTCGCTGTGGTTCTcgcg < 1:7131828‑M2/17‑1 (MQ=255) gACGGCTCCAGCCATCTGTCGCTGTGGTTCTcgcg < 1:9581401/35‑1 (MQ=25) gcGGCTACCGCCATCTGTCGCTGTGGTTCTCGCgg < 1:317785/34‑1 (MQ=255) ccgcctcccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCgg < 1:4716095‑M2/18‑1 (MQ=255) cgcctcccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGc < 1:14158055‑M2/19‑1 (MQ=255) gctcccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCtt < 1:11250287‑M2/21‑1 (MQ=255) gctcccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCtt < 1:13858409‑M2/21‑1 (MQ=255) tcccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTaa < 1:7991570‑M2/23‑1 (MQ=255) tcccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTaa < 1:7365380‑M2/23‑1 (MQ=255) cccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTaaa < 1:5110079‑M2/24‑1 (MQ=255) cccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTaaa < 1:17208693‑M2/24‑1 (MQ=255) cccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTaaa < 1:6150779‑M2/24‑1 (MQ=255) cccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTaaa < 1:5605228‑M2/24‑1 (MQ=255) aCCGCCATCTGTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTtaa > 1:13693236/1‑35 (MQ=255) ccgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAg < 1:20193929‑M2/25‑1 (MQ=255) ccGCCATCTGTCGCTGTGGGTCTCGGGGGTTTAAg > 1:2991563/1‑35 (MQ=16) cagccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAg < 1:241780‑M2/25‑1 (MQ=255) cgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGc < 1:783318‑M2/26‑1 (MQ=255) cgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGc < 1:12906909‑M2/26‑1 (MQ=255) cgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGc < 1:10018240‑M2/26‑1 (MQ=255) cgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGc < 1:10612336‑M2/26‑1 (MQ=255) cgccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGc < 1:15071661‑M2/26‑1 (MQ=255) gccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGcc < 1:5901218‑M2/27‑1 (MQ=255) gccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGcc < 1:12566607‑M2/27‑1 (MQ=255) ccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCt < 1:9552715‑M2/28‑1 (MQ=255) ccatctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCt < 1:8212171‑M2/28‑1 (MQ=255) catctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTg < 1:13381616‑M2/29‑1 (MQ=255) catctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTg < 1:1812372‑M2/29‑1 (MQ=255) atctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTgg < 1:7364137‑M2/30‑1 (MQ=255) atctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTgg < 1:2027094‑M2/30‑1 (MQ=255) tctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGt < 1:6332921‑M2/31‑1 (MQ=255) tctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGt < 1:17717180‑M2/31‑1 (MQ=255) ctgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTa < 1:6660471‑M2/32‑1 (MQ=255) tgTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTAt < 1:5993727‑M2/33‑1 (MQ=255) gTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATc < 1:9666799‑M2/34‑1 (MQ=255) gTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATc < 1:1385074‑M2/34‑1 (MQ=255) tCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAATCCTGGTATCg > 1:17460341/1‑35 (MQ=255) tCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCg < 1:12814542/35‑1 (MQ=255) tCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCg < 1:6923603/35‑1 (MQ=255) tCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCg < 1:15789288/35‑1 (MQ=255) tCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCg > 1:5470759/1‑35 (MQ=255) tCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCg > 1:18608266/1‑35 (MQ=255) tCGCTGTGGTGCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCg < 1:14336181/35‑1 (MQ=255) | TCTATCGCCTGGGTGACGGCTACCGCCATCTGTCGCTGTGGTTCTCGCGGCTTAAAGCCTGGTATCG > REL606/1871707‑1871773 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |