New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 114196 = | 59 (0.570) | 12 (0.130) | 3/42 | NT | 17.6% | coding (349/390 nt) | mutT | nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP |
? | REL606 | 422596 = | 61 (0.680) | intergenic (‑283/+179) | cyoA/ampG | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II/muropeptide transporter |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACG > REL606/114162‑114230 | gTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgc > 1:16367409/1‑35 (MQ=255) gTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgc < 1:19565478/35‑1 (MQ=255) cGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgcca < 1:3632205/35‑1 (MQ=255) cGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgcca > 1:17743279/1‑35 (MQ=255) cGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgcca < 1:18419600/35‑1 (MQ=255) cGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgcca < 1:17303019/35‑1 (MQ=255) cGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgcca > 1:10986263/1‑35 (MQ=255) cGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgcca > 1:15274348/1‑35 (MQ=255) gCTGGTCTGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgccag > 1:13424896/1‑35 (MQ=255) gCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgccag > 1:20467254/1‑35 (MQ=255) gCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgccag < 1:15000491/35‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgccag > 1:7037332/1‑35 (MQ=255) gCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgccag > 1:18476828/1‑35 (MQ=255) gCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCgccag > 1:18024115/1‑35 (MQ=255) 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tcggtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAAt > 1:18998536/1‑35 (MQ=255) cggtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATg > 1:10464964/1‑35 (MQ=255) ggtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGa > 1:14435063/1‑35 (MQ=255) ggtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGa > 1:13748904/1‑35 (MQ=255) ggtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGa > 1:15642096/1‑35 (MQ=255) gtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGaa > 1:7554512/1‑35 (MQ=255) gtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGaa > 1:15226711/1‑35 (MQ=255) gtcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGaa > 1:18383952/1‑35 (MQ=255) tcTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAAc > 1:19268992/1‑35 (MQ=255) cTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCANTGAAcn > 1:11557217/1‑35 (MQ=255) cTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAAcc > 1:7960574/1‑35 (MQ=255) cTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAAcc > 1:11242143/1‑35 (MQ=255) cTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAAcc > 1:15008276/1‑35 (MQ=255) tAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCgg > 1:11720188/1‑35 (MQ=255) tAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCgg > 1:5422526/1‑35 (MQ=255) tAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCgg > 1:485393/1‑35 (MQ=255) aaTGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGt > 1:10008698/1‑35 (MQ=255) aTGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTa > 1:5484326/1‑35 (MQ=255) aTGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTa > 1:7476779/1‑35 (MQ=255) tGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTaa > 1:18577720/1‑35 (MQ=255) tGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTaa > 1:11963631/1‑35 (MQ=255) ccGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAAtt > 1:3579017/1‑35 (MQ=255) cGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTg > 1:3183003/1‑35 (MQ=255) cGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTg > 1:19062548/1‑35 (MQ=255) gatgatTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGc > 1:17435278/1‑35 (MQ=255) gatgatTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGc > 1:1927640/1‑35 (MQ=255) ttttttcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCg > 1:14204363‑M1/12‑35 (MQ=255) ttttttcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCg > 1:19085543‑M1/12‑35 (MQ=255) ttgtttcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCg > 1:13940800‑M1/12‑35 (MQ=255) atgttTTCCCCCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCg < 1:7036834/35‑1 (MQ=25) atgatTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCg > 1:13519913/1‑35 (MQ=255) ttttccccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGa > 1:789941‑M1/11‑35 (MQ=255) tgatTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGa > 1:638735/1‑35 (MQ=255) tgatTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGa > 1:12713502/1‑35 (MQ=255) tgatTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGa > 1:4361043/1‑35 (MQ=255) ttttcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGaa > 1:15502604‑M1/10‑35 (MQ=255) ggttttCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGaa > 1:14928444/3‑35 (MQ=255) gatTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGaa > 1:19627507/1‑35 (MQ=255) gatTTCCCCCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGaa < 1:10711813/35‑1 (MQ=37) tttcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAg > 1:7647681‑M1/9‑35 (MQ=255) atTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAg > 1:2682569/1‑35 (MQ=255) atTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAg > 1:20586971/1‑35 (MQ=255) ttttCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGc > 1:4515678/1‑35 (MQ=255) ttttCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGc > 1:13583319/1‑35 (MQ=255) tccccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGc > 1:474097‑M1/8‑35 (MQ=255) tcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCt > 1:4318077‑M1/7‑35 (MQ=255) tcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCt > 1:14761675‑M1/7‑35 (MQ=255) tcccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCt > 1:17475719‑M1/7‑35 (MQ=255) ccccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCt > 1:17874671‑M1/7‑35 (MQ=255) ttCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCtt > 1:19325303/1‑35 (MQ=255) ttCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCtt > 1:8392980/1‑35 (MQ=255) cccccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCtt > 1:1462721‑M1/6‑35 (MQ=255) tCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTa > 1:18711037/1‑35 (MQ=255) cccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTaa > 1:10255445‑M1/4‑35 (MQ=255) cccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTaa > 1:14507673‑M1/4‑35 (MQ=255) cccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTaa > 1:2000004‑M1/4‑35 (MQ=255) cccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTaa > 1:18020683‑M1/4‑35 (MQ=255) ccCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTaaa > 1:15353846‑M1/3‑35 (MQ=255) cGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTaaa > 1:6394564/1‑35 (MQ=255) cCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAAc > 1:10067695‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAAc > 1:17251706‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCAGCCAATGAACAGGTAATTGCGAAGCTTAAAc > 1:6066771‑M1/2‑35 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGACGCTTAAACg < 1:1468958‑M1/35‑1 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACg < 1:4537648‑M1/35‑1 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACg > 1:317525‑M1/1‑35 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACg > 1:11708884‑M1/1‑35 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACg > 1:2796240‑M1/1‑35 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACg > 1:15977350‑M1/1‑35 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACg > 1:17349502‑M1/1‑35 (MQ=255) CCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACg < 1:9337660‑M1/35‑1 (MQ=255) | GTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACG > REL606/114162‑114230 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |