New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 2979870 | 135 (1.310) | 6 (0.060) | 3/44 | NT | 6.2% | coding (962/981 nt) | yggR | predicted transporter |
? | REL606 | 4245169 = | 59 (0.630) | coding (456/1080 nt) | alr | alanine racemase |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCAT > REL606/2979836‑2979904 | tCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCA > 1:1554551‑M1/1‑35 (MQ=255) cGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCAc > 1:3762927/1‑35 (MQ=255) cGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCAc < 1:6769729/35‑1 (MQ=255) gggCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCAcc > 1:13818524/1‑35 (MQ=255) gggCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCAcc < 1:17303938/35‑1 (MQ=255) gggCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCAcc > 1:4233457/1‑35 (MQ=255) ggCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCAAccc < 1:14882005/35‑1 (MQ=255) gCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCg > 1:3417251/1‑35 (MQ=255) cATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCgg < 1:7452056/35‑1 (MQ=255) cATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCgg > 1:2720561/1‑35 (MQ=255) cATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCgg > 1:8855686/1‑35 (MQ=255) cATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCgg > 1:15273432/1‑35 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGt > 1:11176351/1‑35 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGt > 1:6587026/1‑35 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGt > 1:11110456/1‑35 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGt < 1:3840708/35‑1 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGt > 1:18190675/1‑35 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGt > 1:12538509/1‑35 (MQ=255) tGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTg > 1:7473580/1‑35 (MQ=255) tGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTg > 1:7792882/1‑35 (MQ=255) tGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTg > 1:15021906/1‑35 (MQ=255) gCAATGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCt > 1:982156/1‑35 (MQ=255) gCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCt > 1:18028582/1‑35 (MQ=255) gCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCt < 1:12331880/35‑1 (MQ=255) cAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTg > 1:9419270/1‑35 (MQ=255) cAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTg > 1:2870244/1‑35 (MQ=255) aaCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGa < 1:8393046/35‑1 (MQ=255) aaCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGa > 1:14222722/1‑35 (MQ=255) aaCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGa < 1:12998738/35‑1 (MQ=255) aaCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGa > 1:3582598/1‑35 (MQ=255) aaCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGa > 1:4529296/1‑35 (MQ=255) aaCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGa > 1:5686170/1‑35 (MQ=255) aCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGAt < 1:17721588/35‑1 (MQ=255) aCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGAt > 1:15109385/1‑35 (MQ=255) aCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGAt > 1:1315191/1‑35 (MQ=255) aCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGAt < 1:8217299/35‑1 (MQ=255) aCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCAGGTGCTGAn < 1:10865997/35‑1 (MQ=255) cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATa > 1:5479596/1‑35 (MQ=255) cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATa < 1:6123270/35‑1 (MQ=255) cGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATa < 1:864773/35‑1 (MQ=255) cGTCACAAACGCCATTCCCCCACCCGGTGCTGATa < 1:13697063/35‑1 (MQ=255) gTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATaa > 1:15974186/1‑35 (MQ=255) gTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATaa < 1:16045154/35‑1 (MQ=255) tCACAAACGCCCTTCCCCCACCCTGTGCTGATAAc > 1:7264199/1‑35 (MQ=255) tCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAAc < 1:4080485/35‑1 (MQ=255) tCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAAc < 1:16729406/35‑1 (MQ=255) tCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAAc > 1:19262013/1‑35 (MQ=255) tCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAAc < 1:18770927/35‑1 (MQ=255) tCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTACTGATAAc > 1:12391266/1‑35 (MQ=255) cacaAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAAct < 1:11230525/35‑1 (MQ=255) cacaAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAAct < 1:10646025/35‑1 (MQ=255) acaAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAActc < 1:17563178/35‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAActct > 1:6882845/1‑35 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAActct > 1:1986094/1‑35 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAActct < 1:19118975/35‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAActct < 1:9287299/35‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAActct < 1:16553123/35‑1 (MQ=255) caAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAActct < 1:7887388/35‑1 (MQ=255) aaaCGCCCTTCCCCCACCCGTTGCTGATAACTctg > 1:8280175/1‑35 (MQ=255) aaaCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctg > 1:11982785/1‑35 (MQ=255) aaaCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctg < 1:3065133/35‑1 (MQ=255) aaaCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctg < 1:8997559/35‑1 (MQ=255) aaaCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctg < 1:15796172/35‑1 (MQ=255) aaCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctgc < 1:9126070/35‑1 (MQ=255) aCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctgct < 1:2939406/35‑1 (MQ=255) aCGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctgct < 1:14193670/35‑1 (MQ=255) cGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTctgctg < 1:1281158/35‑1 (MQ=255) gCCCTTCCCCAACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGa < 1:14015172/35‑1 (MQ=255) cccTTCCCCCAgccggtgaatatcgtcagccattt < 1:5592449‑M1/35‑25 (MQ=255) cccTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGaa > 1:11403490/1‑35 (MQ=255) cccGTCCCCCAgccggtgaatatcgtcagccattt < 1:6353918‑M1/35‑25 (MQ=255) ccTTCCCCCAgccggtgaatatcgtcagcaatttt < 1:234016‑M1/35‑26 (MQ=255) ccTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGaaa < 1:12155389/35‑1 (MQ=255) ccTTCCCCCACCAGGTGCTGATAACTCTGCTGaaa < 1:16930745/35‑1 (MQ=255) cTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAAc < 1:7138839/35‑1 (MQ=255) cTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAAc < 1:16479422/35‑1 (MQ=255) ttCCCCCAgccggtgaatatagtcagccattttgc < 1:11771260‑M1/35‑28 (MQ=255) ttCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACg > 1:11316192/1‑35 (MQ=255) ttCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACg < 1:19007275/35‑1 (MQ=255) ttCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACg > 1:13485004/1‑35 (MQ=255) tccccccagccggtgaatatcgtcagccattttgc < 1:12286861‑M1/33‑28 (MQ=255) tCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGt < 1:5251154/35‑1 (MQ=255) cccccAgccggtgaatatcgtcagccattttgcgc < 1:5913218‑M1/35‑30 (MQ=255) cccccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGtt < 1:16182597/35‑1 (MQ=255) cccccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGtt < 1:17137855/35‑1 (MQ=255) cccccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGtt > 1:10517811/1‑35 (MQ=255) ccccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTa < 1:15743580/35‑1 (MQ=255) ccccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTa > 1:17632004/1‑35 (MQ=255) cccAgccggtgaatatcgtcagccattttgcgcgc < 1:15680501‑M1/35‑32 (MQ=255) cccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTat > 1:1740755/1‑35 (MQ=255) ccACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTatc < 1:17896496/35‑1 (MQ=255) cAgccggtgaatatcgtcagccatttttcgcgcgc > 1:877193‑M1/1‑2 (MQ=255) cAgccggtgaatatcgtcagccatttttcgcgcgc > 1:2128167‑M1/1‑2 (MQ=255) cAgccggtgaatatcgccagccattttgcgcgcgc > 1:11367485‑M1/1‑2 (MQ=255) cACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTatca > 1:8024995/1‑35 (MQ=255) cACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTatca < 1:4458405/35‑1 (MQ=255) agccggtgaatatcgtcagccatttttcgcgcgcg > 1:19913371‑M1/1‑1 (MQ=255) aCCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTatcat < 1:18394445/35‑1 (MQ=255) aCCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTatcat > 1:17067978/1‑35 (MQ=255) aCCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTatcat < 1:10003235/35‑1 (MQ=255) | TCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCAT > REL606/2979836‑2979904 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |