New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1076727 = | 60 (0.580) | 8 (0.090) | 5/40 | NT | 14.4% | coding (1182/2547 nt) | torA | trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit |
? | REL606 | 3786648 = | 45 (0.530) | coding (75/339 nt) | ECB_03525 | conserved hypothetical protein |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
AGTGGGCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGTGGTTTTG > REL606/1076693‑1076761 | gctcaaacatgccgttatcacagttggcggccagg < 1:5147051‑M1/1‑1 (MQ=255) gctcaaacatgccgttatcacagttggcggccagg > 1:18295397‑M1/35‑35 (MQ=255) aGTGGGCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATg < 1:7604315/35‑1 (MQ=255) aGTGGGCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATg < 1:13881153/35‑1 (MQ=255) gTGGGCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGc < 1:15676744/35‑1 (MQ=255) ctcaaacatgccgttatcacagttggcggccagGc > 1:3367634‑M1/34‑35 (MQ=255) ctcaaacatgccgttatcacagttggcggccagGc < 1:15678713‑M1/2‑1 (MQ=255) tcaaacatgccgttatcacagttggcggccagGCt < 1:8507605‑M1/3‑1 (MQ=255) tcaaacatgccgttatcacagttggcggccagGCt < 1:2756243‑M1/3‑1 (MQ=255) tcaaacatgccgttatcacagttggcggccagGCt > 1:19010127‑M1/33‑35 (MQ=255) tcaaacatgccgttatcacagttggcggccagGCt > 1:17369187‑M1/33‑35 (MQ=255) tcaaacatgccgttatcacagttggcggccagGCt < 1:5172150‑M1/3‑1 (MQ=255) tGGGCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCt < 1:1436022/35‑1 (MQ=255) tGGGCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCt < 1:10111387/35‑1 (MQ=255) caaacatgccgttatcacagttggcggccagGCTg > 1:19478588‑M1/32‑35 (MQ=255) caaacatgccgttatcacagttggcggccagGCTg > 1:13362535‑M1/32‑35 (MQ=255) caaacatgccgttatcacagttggcggccagGCTg > 1:378190‑M1/32‑35 (MQ=255) ggCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTgg < 1:4208285/35‑1 (MQ=255) ggCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTgg < 1:586555/35‑1 (MQ=255) ggCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTgg < 1:5923338/35‑1 (MQ=255) aaacatgccgttatcacagttggcggccagGCTgg < 1:13965963‑M1/5‑1 (MQ=255) aaacatgccgttatcacagttggcggccagGCTgg < 1:15097603‑M1/5‑1 (MQ=255) gCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTggg < 1:8054607/35‑1 (MQ=255) aacatgccgttatcacagttggcggccagGCTggg < 1:11612674‑M1/6‑1 (MQ=255) aacatgccgttatcacagttggcggccagGCTggg < 1:894581‑M1/6‑1 (MQ=255) cGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTgggg < 1:10699991/35‑1 (MQ=255) gTGGATTATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGc < 1:2143772/35‑1 (MQ=255) atgccgttatcacagttggcggccaggctgggcaa < 1:15175033‑M1/9‑4 (MQ=255) atgccgttatcacagttggcggccagGCTGGGGCa < 1:2798884‑M1/9‑1 (MQ=255) tgccgttatcacagttggcggccagGCTGGGGcat < 1:1310456‑M1/10‑2 (MQ=255) ggATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCaa < 1:3055702/35‑1 (MQ=255) gccgttatcacagttggcggccagGCTGGGGGaaa < 1:194887‑M1/11‑1 (MQ=255) gatgatTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCaaa < 1:16279828/35‑1 (MQ=255) atgatTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAAt < 1:17266735/35‑1 (MQ=255) tgatTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAAtt < 1:3050299/35‑1 (MQ=255) tgatTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAAtt < 1:5809796/35‑1 (MQ=255) cgttatcacagttggcggccagGCTGGGGCATAtt < 1:10905499‑M1/13‑1 (MQ=255) cgttatcacagttggcggccagGCTGGGGCATAtt < 1:9249030‑M1/13‑1 (MQ=255) gatTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTg < 1:9655097/35‑1 (MQ=255) gatTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTg < 1:14431847/35‑1 (MQ=255) tttGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTgg < 1:13584589/34‑1 (MQ=255) atTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTgg < 1:13445002/35‑1 (MQ=255) atTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTgg < 1:18459791/35‑1 (MQ=255) atTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTgg < 1:11714489/35‑1 (MQ=255) atTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTgg < 1:8014887/35‑1 (MQ=255) ttGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGc < 1:10160116/35‑1 (MQ=255) ttGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGc < 1:13213235/35‑1 (MQ=255) ttGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGc < 1:13821134/35‑1 (MQ=255) tgtgGTTCTGGCTGCGATGCTGGGGCAAATTGGcc > 1:760694/1‑35 (MQ=255) tgtgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGcc < 1:18756695/35‑1 (MQ=255) tgtgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGcc < 1:15105973/35‑1 (MQ=255) gtgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCt < 1:6915676/35‑1 (MQ=255) gtgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCt < 1:12825460/35‑1 (MQ=255) gtgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCt < 1:13178592/35‑1 (MQ=255) tgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTg < 1:12537331/35‑1 (MQ=255) tgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTg < 1:6580485/35‑1 (MQ=255) tgGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTg < 1:19434691/35‑1 (MQ=255) ggTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGc < 1:11550826/35‑1 (MQ=255) gTTCTGGCGGCGGTGCTGGGGCAAATTGGCCTGcc < 1:3819343/35‑1 (MQ=255) gTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGcc < 1:12352169/35‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCa < 1:8506281/35‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCa < 1:9264576/35‑1 (MQ=255) tCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAg < 1:709560/35‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAgg < 1:4600147/35‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAgg < 1:11072375/35‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGACGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAgg < 1:15875147/35‑1 (MQ=255) tGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggt < 1:6079792/35‑1 (MQ=255) tGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggt < 1:6100612/35‑1 (MQ=255) tGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggt < 1:2316643/35‑1 (MQ=255) tGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggt < 1:19987946/35‑1 (MQ=255) ggcggcGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtg < 1:14769321/35‑1 (MQ=255) ggcggcGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtg < 1:16306272/35‑1 (MQ=255) cggcgATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggt < 1:6415802/35‑1 (MQ=255) ggcgATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtg < 1:12623640/35‑1 (MQ=255) ggcgATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtg < 1:14893868/35‑1 (MQ=255) gcgATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtgg > 1:684347/1‑35 (MQ=255) gcgATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtgg > 1:8135213/1‑35 (MQ=255) cgATGCTGGGTCAAATTGGCCTGCCAggtggtggg > 1:2304407/1‑34 (MQ=255) cgATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtggg > 1:16739849/1‑34 (MQ=255) cgATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtggg > 1:14845056/1‑34 (MQ=255) gATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtgggt > 1:11862034/1‑33 (MQ=255) gATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggtgggt > 1:19223555/1‑33 (MQ=255) gATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAggtggggggt > 1:179522/1‑33 (MQ=38) gATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAgggggtgggt > 1:20365715/1‑33 (MQ=38) gATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggtt < 1:20153525/35‑1 (MQ=255) gATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggtt < 1:11430458/35‑1 (MQ=255) aTGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggttt < 1:2729594/35‑1 (MQ=255) aTGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggttt > 1:20420873/1‑35 (MQ=255) aTGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggttt < 1:19944272/35‑1 (MQ=255) tGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggtttt < 1:9470318/35‑1 (MQ=255) tGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggtttt > 1:9338524/1‑35 (MQ=255) tGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggtttt < 1:17002118/35‑1 (MQ=255) tGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggtttt > 1:16472585/1‑35 (MQ=255) tGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggtttt > 1:6328751/1‑35 (MQ=255) tGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtgggttt > 1:16032050/1‑35 (MQ=255) tGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtgggttt > 1:6028025/1‑35 (MQ=255) GCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtggttttg > 1:6678937‑M1/1‑35 (MQ=255) GCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtgggtttg < 1:7384009‑M1/35‑1 (MQ=255) GCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtgggtttg < 1:6972888‑M1/35‑1 (MQ=255) GCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGtgggtttg < 1:10086977‑M1/35‑1 (MQ=255) | AGTGGGCGTGGATGATTGTGGTTCTGGCGGCGATGCTGGGGCAAATTGGCCTGCCAGGTGGTGGTTTTG > REL606/1076693‑1076761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |