New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1979076 | 88 (0.860) | 10 (0.110) | 4/44 | NT | 14.7% | coding (595/636 nt) | yedZ | hypothetical protein |
? | REL606 | = 2901067 | 35 (0.370) | coding (153/579 nt) | ygfJ | hypothetical protein |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
AGCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTATC > REL606/1979042‑1979110 | aGCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTA > 1:6783693‑M1/1‑35 (MQ=255) aGCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTA < 1:15906106‑M1/35‑1 (MQ=255) aGCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTA > 1:5621301‑M1/1‑35 (MQ=255) aGCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTA > 1:19211157‑M1/1‑35 (MQ=255) aGCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTA < 1:12702497‑M1/35‑1 (MQ=255) gCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTaa < 1:11954411/35‑1 (MQ=255) ccTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAAc > 1:14408925/1‑35 (MQ=255) ccTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAAc > 1:1082376/1‑35 (MQ=255) cTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAAcn < 1:2115646/35‑1 (MQ=255) cTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAAcc > 1:546853/1‑35 (MQ=255) cTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAAcc > 1:10061656/1‑35 (MQ=255) ttACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCg < 1:3670515/35‑1 (MQ=255) ttACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCg < 1:4275804/35‑1 (MQ=255) ttACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCg < 1:15319790/35‑1 (MQ=255) ttACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCg > 1:15006355/1‑35 (MQ=255) ttACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCg < 1:14665528/35‑1 (MQ=255) tACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCgg > 1:5276119/1‑35 (MQ=255) tACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCgg < 1:1488091/35‑1 (MQ=255) aCGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGt < 1:17848827/35‑1 (MQ=255) aCGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGt < 1:6778060/35‑1 (MQ=255) cGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGtt < 1:20370622/35‑1 (MQ=255) cGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGtt < 1:19725905/35‑1 (MQ=255) cGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGtt < 1:12936171/35‑1 (MQ=255) ggTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTa > 1:18511216/1‑35 (MQ=255) ggTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTa < 1:15046152/35‑1 (MQ=255) gTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTAc < 1:17480984/35‑1 (MQ=255) gTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTAc > 1:16598136/1‑35 (MQ=255) gTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTAc > 1:4265827/1‑35 (MQ=255) gTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTAc < 1:15336239/35‑1 (MQ=255) gTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTAc < 1:9382583/35‑1 (MQ=255) tataAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACg > 1:13508486/1‑35 (MQ=255) tataAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACg > 1:19896347/1‑35 (MQ=255) tataAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACg > 1:14730615/1‑35 (MQ=255) ataAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGc < 1:17259487/35‑1 (MQ=255) ataAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTAAGc > 1:8610893/1‑35 (MQ=255) taAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCa < 1:15249584/35‑1 (MQ=255) taAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCa > 1:8420180/1‑35 (MQ=255) taAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCa > 1:16464704/1‑35 (MQ=255) aagaagTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCaa > 1:18696696/1‑35 (MQ=255) aagaagTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCaa > 1:3217999/1‑35 (MQ=255) aagaagTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCaa > 1:7776270/1‑35 (MQ=255) agaagTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAg < 1:16891409/35‑1 (MQ=255) agaagTTGCGTTCCCTTTTTAACAGGTTACGCAAg < 1:14909275/35‑1 (MQ=255) gaagTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGc < 1:11324243/35‑1 (MQ=255) agTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAg < 1:11714189/35‑1 (MQ=255) agTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAg > 1:9620507/1‑35 (MQ=255) gTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAgg < 1:17609051/35‑1 (MQ=255) gTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAgg < 1:14433642/35‑1 (MQ=255) gTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAgg < 1:20227164/35‑1 (MQ=255) gTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAgg < 1:4460154/35‑1 (MQ=255) gTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAgg < 1:2923682/35‑1 (MQ=255) ttGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGt < 1:13703013/35‑1 (MQ=255) tGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGtt < 1:880322/35‑1 (MQ=255) tGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGtt < 1:13642314/35‑1 (MQ=255) tGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGtt > 1:10721396/1‑35 (MQ=255) tGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGtt > 1:4716640/1‑35 (MQ=255) tGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGAAggat > 1:257635/1‑33 (MQ=38) gCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTc < 1:14104513/35‑1 (MQ=255) gCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTc > 1:16355389/1‑35 (MQ=255) cGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTca > 1:8797358/1‑35 (MQ=255) cGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTca < 1:8480915/35‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTca < 1:4243119/35‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTca < 1:18237628/35‑1 (MQ=255) tttcCCTTTTTAgccggtgactaaaataattcggc < 1:8341456‑M1/34‑24 (MQ=255) gTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTcac < 1:7672758/35‑1 (MQ=255) gTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTcac < 1:13267828/35‑1 (MQ=255) gTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTcac < 1:10094751/35‑1 (MQ=255) gTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTcac > 1:4800114/1‑35 (MQ=255) attcCCTTTTTAgccggtgactaaaataattcggc < 1:248279‑M1/34‑24 (MQ=255) ttCTCTTTTTAgccggtgactaaaataattcggct < 1:4204236‑M1/35‑25 (MQ=255) ttCCCTTTTTAgccggtgactaaaataattcggct < 1:3980888‑M1/35‑25 (MQ=255) ttCCCTTTTTAgccggtgactaaaataattcggct < 1:6396260‑M1/35‑25 (MQ=255) ttCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTcaca < 1:12089195/35‑1 (MQ=255) tCCCTTTTTAgccggtgactaaaataattcggcta < 1:6615575‑M1/35‑26 (MQ=255) tCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCacaa > 1:6235290/1‑35 (MQ=255) tCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCacaa < 1:11476925/35‑1 (MQ=255) cccTTTTTAgccggtgactaaaataattcggctac < 1:2459916‑M1/35‑27 (MQ=255) cccTTTTTAgccggtgactaaaataattcggctac < 1:8996305‑M1/35‑27 (MQ=255) cccTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCacaac < 1:781791/35‑1 (MQ=255) ccTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCacaaca < 1:11120582/35‑1 (MQ=255) ccttttagccggtgactaaaataattcggctacaa < 1:12824940‑M1/33‑29 (MQ=255) cTTTTTAgccggtgactaaaataattcggctacaa < 1:4818637‑M1/35‑29 (MQ=255) cTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCAcaacaa > 1:412270/1‑35 (MQ=255) cTTTTTAACCGGTTACGAAAGCAGGTTCAcaacaa < 1:20022482/35‑1 (MQ=255) tttttAgccggtgactaaaataattcggctacaaa < 1:1665787‑M1/35‑30 (MQ=255) tttttAgccggtgactaaaataattcggctacaaa < 1:1111063‑M1/35‑30 (MQ=255) tttttAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACaaa < 1:20224953/35‑1 (MQ=255) tttttAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACaaa > 1:818887/1‑35 (MQ=255) ttttAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAAt < 1:7075344/35‑1 (MQ=255) ttttAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCAACACAAAt > 1:5844635/1‑35 (MQ=255) ctttagccggtgactaaaataattcggctacaaaa < 1:11713726‑M1/34‑31 (MQ=255) ttAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTa > 1:19286800/1‑35 (MQ=255) tAgccggtgactaaaataattcggctacaaaactg < 1:15248742‑M1/35‑34 (MQ=255) tAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTAt < 1:8110494/35‑1 (MQ=255) tAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTAt < 1:15922605/35‑1 (MQ=255) agccggtgactaaaataattcggctacaaaactgc > 1:13941183‑M1/1‑1 (MQ=255) agccggtgactaaaataattcggctacaaaactgc > 1:8967712‑M1/1‑1 (MQ=255) aaCCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTATc > 1:12719047/1‑35 (MQ=255) aaCCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTATc < 1:6144649/35‑1 (MQ=255) aaCCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTATc > 1:9407672/1‑35 (MQ=255) | AGCCTTACGGTATAAGAAGTTGCGTTCCCTTTTTAACCGGTTACGCAAGCAGGTTCACAACAAATTATC > REL606/1979042‑1979110 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |