New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 3676501 | 106 (1.030) | 13 (0.130) | 7/46 | NT | 12.1% | coding (1242/1278 nt) | yiaN | predicted transporter |
? | REL606 | = 3822225 | 91 (0.890) | coding (203/1323 nt) | glvG | predicted 6‑phospho‑beta‑glucosidase |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
ATCAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCTTTTTCTTT > REL606/3822191‑3822259 | aTCAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCggtgg > 1:17807117/1‑35 (MQ=255) aTCAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCggtgg < 1:5521639/35‑1 (MQ=255) tCAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCggtggt < 1:17862706/35‑1 (MQ=255) tCAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCggtggt < 1:12818589/35‑1 (MQ=255) tCAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGg < 1:8113231‑M2/35‑2 (MQ=255) tCAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGg < 1:5862645‑M2/35‑2 (MQ=255) cAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGgtggtg < 1:5758440/35‑1 (MQ=255) cAACGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGgg < 1:14979524‑M2/35‑3 (MQ=255) aaCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGgtgt < 1:8772072/35‑1 (MQ=255) aaCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGgtgt < 1:12310758/35‑1 (MQ=255) aaCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggg < 1:2135200‑M2/35‑4 (MQ=255) aaCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggg < 1:6362945‑M2/35‑4 (MQ=255) aaCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggg < 1:13042206‑M2/35‑4 (MQ=255) aCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGgggg < 1:1986901‑M2/35‑5 (MQ=255) aCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGgggg < 1:13357283‑M2/35‑5 (MQ=255) aCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGgggg < 1:9421718‑M2/35‑5 (MQ=255) aCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTa < 1:5646565/35‑1 (MQ=255) aCGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTa < 1:10044257/35‑1 (MQ=255) cGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggggg < 1:4474945‑M2/35‑6 (MQ=255) cGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggggg < 1:8193897‑M2/35‑6 (MQ=255) cGTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTaa < 1:4597704/35‑1 (MQ=255) gTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGTTGGTGTAAc > 1:14412119/1‑35 (MQ=255) gTCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAAc < 1:17207869/35‑1 (MQ=255) tCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggggagt < 1:19719489‑M2/35‑8 (MQ=255) tCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggggaat < 1:2129155‑M2/35‑8 (MQ=255) tCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACt < 1:17880920/35‑1 (MQ=255) tCGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACt < 1:860636/35‑1 (MQ=255) cGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTa < 1:18537949/35‑1 (MQ=255) cGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTa < 1:6750333/35‑1 (MQ=255) cGCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTa < 1:17453770/35‑1 (MQ=255) cGCCGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTa < 1:100576/35‑1 (MQ=255) gCTGAACGCTACTTCAGGATCTGTGGTGTAACTaa > 1:236462/1‑35 (MQ=255) gCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTaa < 1:8076368/35‑1 (MQ=255) gCTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTaa < 1:8057868/35‑1 (MQ=255) cTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggggaataaa < 1:1075665‑M2/35‑11 (MQ=255) cTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggggaataaa < 1:1998616‑M2/35‑11 (MQ=255) cTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTaaa < 1:3001659/35‑1 (MQ=255) cTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTaaa < 1:13482175/35‑1 (MQ=255) cTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTaaa < 1:11998518/35‑1 (MQ=255) cTGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTaaa < 1:9603034/35‑1 (MQ=255) tGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGggggaataaaa < 1:7835771‑M2/35‑12 (MQ=255) tGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAAc < 1:14706741/35‑1 (MQ=255) tGAACGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAAc < 1:11452854/35‑1 (MQ=255) aCGCTACTTCAGGATCGGTGGggggactaaaaaca < 1:19036717‑M2/35‑15 (MQ=255) aCGCTACTTCAGGATCGGTGGggggaataaaaaca < 1:4635597‑M2/35‑15 (MQ=255) aCGCTACTTCAGGATCGGTGGggggaataaaaaca < 1:3339658‑M2/35‑15 (MQ=255) aCGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCa < 1:19289153/35‑1 (MQ=255) aCGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCa < 1:2827755/35‑1 (MQ=255) aCGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCa < 1:18728687/35‑1 (MQ=255) aCGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCa < 1:8149163/35‑1 (MQ=255) cGCTACTTCAGGATCGGTGGggggaataaaaacaa < 1:20530198‑M2/35‑16 (MQ=255) cGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCaa < 1:2931542/35‑1 (MQ=255) cGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCaa < 1:6967866/35‑1 (MQ=255) cGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCaa < 1:3398780/35‑1 (MQ=255) cGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCaa < 1:2479176/35‑1 (MQ=255) cGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCaa < 1:4046842/35‑1 (MQ=255) cGCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCaa < 1:10479870/35‑1 (MQ=255) gCTACTTCAGGATCGGTGGggggaataaaaacaaa < 1:6595206‑M2/35‑17 (MQ=255) gCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAAt < 1:125276/35‑1 (MQ=255) gCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAAt < 1:6764748/35‑1 (MQ=255) gCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAAt < 1:6227521/35‑1 (MQ=255) gCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAAt < 1:9849494/35‑1 (MQ=255) gCTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAAt < 1:18333652/35‑1 (MQ=255) cTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATg < 1:6484620/35‑1 (MQ=255) cTACTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATg < 1:4558843/35‑1 (MQ=255) aCTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTc < 1:7602384/35‑1 (MQ=255) aCTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTc < 1:19277733/35‑1 (MQ=255) cTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTcc < 1:16448553/35‑1 (MQ=255) cTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTcc < 1:16775072/35‑1 (MQ=255) cTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTcc < 1:5118369/35‑1 (MQ=255) cTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTcc < 1:3095232/35‑1 (MQ=255) cTTCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTcc < 1:3175797/35‑1 (MQ=255) ttCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCg < 1:10308180/35‑1 (MQ=255) ttCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCg < 1:16616309/35‑1 (MQ=255) ttCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCg < 1:6030152/35‑1 (MQ=255) tCAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCgg < 1:17927903/35‑1 (MQ=255) cAGTATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGgc < 1:1192582/35‑1 (MQ=255) cAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGgc < 1:16754424/35‑1 (MQ=255) cAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGgc < 1:12037421/35‑1 (MQ=255) cAGGATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGgc < 1:6557935/35‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCt < 1:16085217/35‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCtt < 1:6645837/35‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCtt < 1:1704964/35‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCtt < 1:1530307/35‑1 (MQ=255) tCGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCttt < 1:535068/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCtttt < 1:9332842/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCtttt < 1:8671458/35‑1 (MQ=255) ggtggtGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCttttt > 1:16395597/1‑35 (MQ=255) ggtggtGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCttttt > 1:13779689/1‑35 (MQ=255) ggtggtGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCttttt < 1:3995649/35‑1 (MQ=255) ggtggtGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCttttt < 1:11097315/35‑1 (MQ=255) ggtggtGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCttttt > 1:10873565/1‑35 (MQ=255) ggtgggGTAACTAAACGCAATGTCCGGCGCttttt > 1:15003872/1‑35 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |