New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 422591 = | 80 (0.780) | 12 (0.150) | 3/38 | NT | 17.9% | intergenic (‑278/+184) | cyoA/ampG | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II/muropeptide transporter |
? | REL606 | = 2605528 | 47 (0.580) | coding (679/1254 nt) | glyA | serine hydroxymethyltransferase |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AGGCCGCCGCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAACCGGG > REL606/2605494‑2605562 | agcccgccgCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAgt < 1:14037867/32‑1 (MQ=255) aGGCCGCCGCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAgt > 1:3203185/1‑35 (MQ=255) ggCCTCCGCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTg < 1:2657364‑M2/35‑2 (MQ=255) ggCCGCAGCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTg > 1:7487442‑M2/1‑34 (MQ=255) gccgccGCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTgg < 1:10259806‑M2/35‑3 (MQ=255) gccgccGCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTgg < 1:697361‑M2/35‑3 (MQ=255) ccgccgCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggt < 1:3373737‑M2/35‑4 (MQ=255) ccgccgCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggt < 1:4876347‑M2/35‑4 (MQ=255) cgccgcGCGGCCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtg > 1:3818203‑M2/1‑31 (MQ=255) cgccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTtgtg < 1:19826000‑M2/35‑5 (MQ=255) cgccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtg < 1:17214636‑M2/35‑5 (MQ=255) cgccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtg > 1:3423178‑M2/1‑31 (MQ=255) cgccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtg > 1:9446786‑M2/1‑31 (MQ=255) gccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgg < 1:5513818‑M2/35‑6 (MQ=255) gccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgg < 1:974071‑M2/35‑6 (MQ=255) gccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgg > 1:3320404‑M2/1‑30 (MQ=255) ccgcGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtggg < 1:8273076‑M2/35‑7 (MQ=255) cgcgcgGGCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgta < 1:6282159/35‑1 (MQ=255) cgcgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggg < 1:19062868‑M2/35‑8 (MQ=255) cgcgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggg < 1:878519‑M2/35‑8 (MQ=255) cgcgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgta < 1:6616567/35‑1 (MQ=255) cgcgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgta < 1:16408425/35‑1 (MQ=255) cgcgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgta < 1:5918186/35‑1 (MQ=255) gcgcgGCCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgtag < 1:6555564/35‑1 (MQ=255) cgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggg < 1:20111477‑M2/35‑10 (MQ=255) cgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggg < 1:17085246‑M2/35‑10 (MQ=255) cgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTTGTGgtagg > 1:13621038/1‑34 (MQ=255) cgcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgtagt < 1:2585408/35‑1 (MQ=255) cgcaGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgtagt < 1:19938176/35‑1 (MQ=255) gcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtggggggg < 1:6322682‑M2/35‑11 (MQ=255) gcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtggggggg < 1:12329414‑M2/35‑11 (MQ=255) gcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtggggggg < 1:8810253‑M2/35‑11 (MQ=255) gcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtggggggg < 1:15860569‑M2/35‑11 (MQ=255) gcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtggggggg < 1:1740012‑M2/35‑11 (MQ=255) gcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTgggggggggg < 1:4175635‑M2/35‑11 (MQ=255) gcgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGgtagta < 1:5749113/35‑1 (MQ=255) cgGCCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaa < 1:8566164/35‑1 (MQ=255) cgGCCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaa < 1:5660866/35‑1 (MQ=255) cgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtggggggag < 1:299456‑M2/35‑12 (MQ=255) cgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaa < 1:9825639/35‑1 (MQ=255) cgGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaa < 1:3156468/35‑1 (MQ=255) ggACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaa < 1:306456‑M2/35‑13 (MQ=255) ggACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaa < 1:15820885‑M2/35‑13 (MQ=255) gACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaga < 1:12340464‑M2/35‑14 (MQ=255) gACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaca < 1:15868046‑M2/35‑14 (MQ=255) gACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaaa < 1:17608014‑M2/35‑14 (MQ=255) gACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaaa < 1:9442499‑M2/35‑14 (MQ=255) gACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaaa < 1:1297414‑M2/35‑14 (MQ=255) ccccGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaacaa < 1:9080768/34‑1 (MQ=255) aCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaaaa < 1:3172636‑M2/35‑15 (MQ=255) aCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaacaa < 1:3200692/35‑1 (MQ=255) aCCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaacaa < 1:876318/35‑1 (MQ=255) cccGCCAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaaaaa < 1:4320400‑M2/35‑16 (MQ=255) cccGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaacaac < 1:7555254/35‑1 (MQ=255) cccGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaacaac < 1:20222680/35‑1 (MQ=255) cccGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaacaac < 1:3027575/35‑1 (MQ=255) cccGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTaacaac < 1:16744900/35‑1 (MQ=255) cGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGt < 1:19814055/35‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTg < 1:14904185/35‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTg < 1:3907144/35‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTg < 1:2165934/35‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTg < 1:20454647/35‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTg < 1:19379476/35‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTg < 1:14225255/35‑1 (MQ=255) ccAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGa < 1:20585111/35‑1 (MQ=255) ccAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGa < 1:10535127/35‑1 (MQ=255) cAGGGTTTTGTGAGTggtgggggggaaaacaaagg < 1:9927148‑M2/35‑21 (MQ=255) cAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAg < 1:7409827/35‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCAt < 1:4398293/35‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCAt < 1:1838544/35‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCAt < 1:10617747/35‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCAt < 1:8520108/35‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCAt < 1:20527793/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATg < 1:17719894/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATg < 1:18589729/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATg < 1:7956727/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATg < 1:11379057/35‑1 (MQ=255) gTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATg < 1:11702909/35‑1 (MQ=255) ttttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGa < 1:2185803/35‑1 (MQ=255) ttttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGa < 1:17920734/35‑1 (MQ=255) ttttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGa < 1:18408750/35‑1 (MQ=255) ttttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGa < 1:4344270/35‑1 (MQ=255) tttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAg < 1:18333628/35‑1 (MQ=255) tttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAg < 1:9147908/35‑1 (MQ=255) tttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAg < 1:8260239/35‑1 (MQ=255) ttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAgg < 1:4497350/35‑1 (MQ=255) ttGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAgg < 1:18750113/35‑1 (MQ=255) tgtgAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGa < 1:14799591/35‑1 (MQ=255) gtgAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGaa < 1:9013117/35‑1 (MQ=255) tgAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAc < 1:10682537/35‑1 (MQ=255) tgAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAc < 1:20428821/35‑1 (MQ=255) tgAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAc < 1:2055307/35‑1 (MQ=255) gAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAcc < 1:13143839/35‑1 (MQ=255) gAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAcc < 1:8252807/35‑1 (MQ=255) gAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAcc < 1:4840765/35‑1 (MQ=255) gAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAcc < 1:10538309/35‑1 (MQ=255) gAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAAcc < 1:11025754/35‑1 (MQ=255) gtggtgGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAACCgg < 1:18728271/35‑1 (MQ=255) gtggtgGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAACCgg < 1:15045761/35‑1 (MQ=255) tggtggTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAACCggg < 1:15995374/35‑1 (MQ=255) | AGGCCGCCGCGCGGACCCGCCAGGGTTTTGTGAGTGGTGGTAGTAACAACGTGAGCATGAGGAACCGGG > REL606/2605494‑2605562 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |