New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 225795 = | 119 (1.160) | 11 (0.130) | 3/40 | NT | 13.7% | coding (123/573 nt) | gmhB | hypothetical protein |
? | REL606 | 2126049 = | 40 (0.470) | coding (187/1041 nt) | gatD | galactitol‑1‑phosphate dehydrogenase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding |
TCATCAACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGATAATAA > REL606/2126015‑2126083 | tcatcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGcc > 1:19829686/1‑35 (MQ=255) tcatcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGcc > 1:14574338/1‑35 (MQ=255) catcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCg > 1:4174212/1‑35 (MQ=255) catcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCg > 1:7151373/1‑35 (MQ=255) catcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCg > 1:7911390/1‑35 (MQ=255) ctaccaccagcgcaaaccccattttttttagcccg > 1:13195316‑M2/33‑33 (MQ=255) atcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGc > 1:15882252/1‑35 (MQ=255) atcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGc > 1:5622929/1‑35 (MQ=255) atcaACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGc > 1:4838856/1‑35 (MQ=255) aaCACCGGATCCCACCGCATCAATATAGNNGCTnn > 1:20258524/1‑35 (MQ=255) aaCACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTaa > 1:5105783/1‑35 (MQ=255) aaCACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTaa > 1:3958496/1‑35 (MQ=255) aaCACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTaa > 1:7667275/1‑35 (MQ=255) aaCACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTaa > 1:14706650/1‑35 (MQ=255) acacCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTaaa > 1:1585281/1‑35 (MQ=255) cacCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAAt > 1:2623721/1‑35 (MQ=255) cacCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAAt > 1:2107839/1‑35 (MQ=255) acCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAAtt > 1:9470851/1‑35 (MQ=255) acCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAAtt > 1:1546586/1‑35 (MQ=255) acCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAAtt > 1:7795367/1‑35 (MQ=255) ccGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTACATTc > 1:2604687/1‑35 (MQ=255) cGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCa > 1:5235150/1‑35 (MQ=255) cGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCa > 1:1697171/1‑35 (MQ=255) ggATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCAt > 1:4983089/1‑35 (MQ=255) ggATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCAt > 1:2939825/1‑35 (MQ=255) aTCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATgg > 1:11348757/1‑35 (MQ=255) aTCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATgg > 1:5045712/1‑35 (MQ=255) aTCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATgg > 1:11742666/1‑35 (MQ=255) aTCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATgg > 1:5540568/1‑35 (MQ=255) aTCCCACCGCATCAATAGAGCCGCTAAATTCATgg > 1:4350719/1‑35 (MQ=255) tCCCACCGCATCAATATAGCCGCTTAATTCATGGc > 1:5749102/1‑35 (MQ=255) cccACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGcc > 1:12180969/1‑35 (MQ=255) cccACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGcc > 1:17457721/1‑35 (MQ=255) ccACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCt > 1:2900309/1‑35 (MQ=255) ccACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCt > 1:12054041/1‑35 (MQ=255) cACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTa > 1:9699471/1‑35 (MQ=255) cACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTa > 1:9626818/1‑35 (MQ=255) cACCACATTATTTTAGCCGCTAAATTCATGGCCTa < 1:8775273/35‑1 (MQ=19) aCCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTaa > 1:7236790/1‑35 (MQ=255) aCCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTaa > 1:509325/1‑35 (MQ=255) aCCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTaa > 1:16708418/1‑35 (MQ=255) aCCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTaa > 1:18485776/1‑35 (MQ=255) cttattttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAAc < 1:2766737‑M2/20‑1 (MQ=255) cccattttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAAc < 1:2129625‑M2/20‑1 (MQ=255) ccGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAAc > 1:101659/1‑35 (MQ=255) ccGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAAc > 1:19065940/1‑35 (MQ=255) tctttttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACg < 1:18420847‑M2/21‑1 (MQ=255) ctattttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACg < 1:11136093‑M2/21‑1 (MQ=255) catttttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACg < 1:10886374‑M2/21‑1 (MQ=255) gattttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGt < 1:2460108‑M2/22‑1 (MQ=255) gCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGt > 1:2740731/1‑35 (MQ=255) gCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGt > 1:14189916/1‑35 (MQ=255) acatttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGt < 1:4233539‑M2/22‑1 (MQ=255) tttttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGtt < 1:9325104‑M2/23‑1 (MQ=255) cATCAATATAGCCGCTAAATTCATGTCCTAACTtt > 1:14069554/1‑35 (MQ=37) ttttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTa < 1:6330035‑M2/24‑1 (MQ=255) ttttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTa < 1:4949527‑M2/24‑1 (MQ=255) atatttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTa < 1:15862848‑M2/24‑1 (MQ=255) tttttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTAt < 1:9611712‑M2/25‑1 (MQ=255) tCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTAt > 1:4854225/1‑35 (MQ=255) tCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTAt > 1:5090940/1‑35 (MQ=255) cAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTAtt > 1:15585286/1‑35 (MQ=255) tttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg < 1:471850‑M2/27‑1 (MQ=255) tttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg < 1:4017316‑M2/27‑1 (MQ=255) tttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg < 1:10008518‑M2/27‑1 (MQ=255) tttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg < 1:2783275‑M2/27‑1 (MQ=255) tttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg < 1:15903737‑M2/27‑1 (MQ=255) attttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg < 1:12308943‑M2/27‑1 (MQ=255) aaTATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg > 1:12505389/1‑35 (MQ=255) aaTATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTg > 1:3492971/1‑35 (MQ=255) ttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTgg < 1:17056460‑M2/28‑1 (MQ=255) ttttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTgg < 1:3849649‑M2/28‑1 (MQ=255) atatAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTgg > 1:1359019/1‑35 (MQ=255) atatAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTgg > 1:7345406/1‑35 (MQ=255) tttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGa < 1:9061578‑M2/29‑1 (MQ=255) tttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGa < 1:1335933‑M2/29‑1 (MQ=255) tataGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGa > 1:19826245/1‑35 (MQ=255) ttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGat < 1:18142902‑M2/30‑1 (MQ=255) ttagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGat < 1:10118338‑M2/30‑1 (MQ=255) ttaccCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGat < 1:8364050‑M2/30‑1 (MQ=255) ataGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTTGat > 1:1583656/1‑35 (MQ=255) tagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGata > 1:11297583‑M2/5‑35 (MQ=255) tagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGata > 1:7792099‑M2/5‑35 (MQ=255) tagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGata > 1:7681657‑M2/5‑35 (MQ=255) tagcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGata < 1:13497523‑M2/31‑1 (MQ=255) agcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataa < 1:1641078‑M2/32‑1 (MQ=255) agcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataa > 1:3729528‑M2/4‑35 (MQ=255) agcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataa > 1:9802947‑M2/4‑35 (MQ=255) gcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataat > 1:7874243‑M2/3‑35 (MQ=255) gcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataat < 1:9481012‑M2/33‑1 (MQ=255) gcCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataat < 1:17589487‑M2/33‑1 (MQ=255) cCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataata < 1:13137163‑M2/34‑1 (MQ=255) cCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataata < 1:7972838‑M2/34‑1 (MQ=255) cCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGataata > 1:19760698‑M2/2‑35 (MQ=255) cGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGAtaataa < 1:13023455/35‑1 (MQ=255) cGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGAtaataa < 1:15018200/35‑1 (MQ=255) cGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGAtaataa < 1:9644375/35‑1 (MQ=255) | TCATCAACACCGGATCCCACCGCATCAATATAGCCGCTAAATTCATGGCCTAACGTTATTGGATAATAA > REL606/2126015‑2126083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |