New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1686611 | 82 (0.800) | 5 (0.050) | 3/48 | NT | 10.1% | coding (276/1059 nt) | rnfD | electron transport complex protein RnfD |
? | REL606 | 1736972 = | 7 (0.070) | coding (819/1221 nt) | sufS | selenocysteine lyase |
TGATGCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCAC > REL606/1736938‑1737006 | tgatgCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAAc < 1:13397985/35‑1 (MQ=255) gatgCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAAcc < 1:11596467/35‑1 (MQ=255) gatgCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAAcc < 1:16985295/35‑1 (MQ=255) atgCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCg < 1:17270599/35‑1 (MQ=255) atgCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCg < 1:16446625/35‑1 (MQ=255) tgCCCCGGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGc < 1:13190727/35‑1 (MQ=255) cccGGTATTGGGTGTACCGGCTTTTAAACGccccg > 1:1724161/1‑32 (MQ=19) ggTATTGGGTGTACCGGCTTTTAACCCCCCTgggg > 1:7973140/1‑33 (MQ=16) ccGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCTAGGt > 1:16197484/1‑35 (MQ=255) ccGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGt > 1:7068568/1‑35 (MQ=255) ggCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg > 1:12261407/1‑35 (MQ=255) ggCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg > 1:981302/1‑35 (MQ=255) cccccccccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAg < 1:4826362‑M2/26‑1 (MQ=255) gCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGt > 1:4344090/1‑35 (MQ=255) gCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGt > 1:13852003/1‑35 (MQ=255) ccccccccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGt < 1:9045322‑M2/27‑1 (MQ=255) cccccccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTg < 1:6139808‑M2/28‑1 (MQ=255) cccccccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTg < 1:1496522‑M2/28‑1 (MQ=255) cccccccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTg < 1:15547536‑M2/28‑1 (MQ=255) tCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGcc > 1:2430707/1‑35 (MQ=255) tCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGcc > 1:1679773/1‑35 (MQ=255) cccccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGcc < 1:938910‑M2/30‑1 (MQ=255) ccccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCt < 1:2402925‑M2/31‑1 (MQ=255) cAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCt > 1:10571613/1‑35 (MQ=255) cAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCt > 1:17378552/1‑35 (MQ=255) cccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCtt < 1:13650154‑M2/32‑1 (MQ=255) cccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCtt < 1:14538198‑M2/32‑1 (MQ=255) cccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCtn < 1:19595348‑M2/32‑1 (MQ=255) accCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCtt < 1:18640817‑M2/32‑1 (MQ=255) aaaCCGCCATGTTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCtt > 1:16114561/1‑35 (MQ=255) aaaCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGcgcg > 1:20338177/1‑32 (MQ=255) ccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTc < 1:14864892‑M2/33‑1 (MQ=255) ccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTc < 1:4947015‑M2/33‑1 (MQ=255) ccCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTc < 1:17422636‑M2/33‑1 (MQ=255) aaCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTATTGCCTTc > 1:7085245/1‑35 (MQ=255) aaCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTc > 1:17061584/1‑35 (MQ=255) cCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCa < 1:5097249‑M2/34‑1 (MQ=255) cCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCa < 1:3330351‑M2/34‑1 (MQ=255) cCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCa < 1:8097112‑M2/34‑1 (MQ=255) cCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCa < 1:13657590‑M2/34‑1 (MQ=255) cCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCa < 1:1979231‑M2/34‑1 (MQ=255) aCCGCCATGGTGCTTTGTTCCAGGTAGTGCCTTCa > 1:4142003/1‑35 (MQ=255) aCCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCa > 1:13838373/1‑35 (MQ=255) ccGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCAc < 1:1561223/35‑1 (MQ=255) ccGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCAc > 1:15549520/1‑35 (MQ=255) ccGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCAc > 1:3571070/1‑35 (MQ=255) ccGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCAc > 1:5483572/1‑35 (MQ=255) ccGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCAc > 1:5669240/1‑35 (MQ=255) | TGATGCCCCCGGTATTGGGTGTACCGGCTTCAAACCGCCATGGTGCTTTGGTCCAGGTAGTGCCTTCAC > REL606/1736938‑1737006 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |