New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 445976 = | 79 (0.770) | 9 (0.120) | 4/36 | NT | 13.8% | coding (944/1287 nt) | amtB | ammonium transporter |
? | REL606 | 3083447 = | 53 (0.690) | coding (197/495 nt) | yqhA | hypothetical protein |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GGCGGCGCGTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACGC > REL606/445942‑446010 | tcgtgttgctgtcgctggtggatatgacgctggtt > 1:15744411‑M1/35‑35 (MQ=255) ggcggcGCGTTGATTGTCGGCGTGGCAGCTGGTCt > 1:2320767/1‑35 (MQ=255) gcggcgCGTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGACTg < 1:16497163/35‑1 (MQ=255) cgtgttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTg < 1:580456‑M1/2‑1 (MQ=255) gtgttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTgg < 1:1564620‑M1/3‑1 (MQ=255) gtgttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTgg < 1:10286828‑M1/3‑1 (MQ=255) gtgttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTgg > 1:17563606‑M1/33‑35 (MQ=255) gtgttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTgg < 1:5411364‑M1/3‑1 (MQ=255) gtgttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTgg > 1:5867750‑M1/33‑35 (MQ=255) gtgttgctgtcgctggtggatatgacgctgggTgg < 1:12750830‑M1/3‑1 (MQ=255) cggcgCGTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTgg < 1:279757/35‑1 (MQ=255) cggcgCGTTGATTGTCGGCGTGGCAGGTGGGCTgg > 1:929386/1‑35 (MQ=25) ggcgTGTTGATTGTCGGCGTGGGAGCTGGTCTggg > 1:5770376/1‑34 (MQ=25) ggcgCGTTGATTGTCGGCGTGTTAGCTGGTCTGGc < 1:15106820/35‑1 (MQ=255) ggcgCGTTGATTGTCGGAGTGGTAGCTGGTCTGGc < 1:11566945/35‑1 (MQ=255) gttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGgcn > 1:10692519‑M1/31‑34 (MQ=255) gttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCg > 1:1567142‑M1/31‑35 (MQ=255) gttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCg > 1:13491376‑M1/31‑35 (MQ=255) gttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCg > 1:15300799‑M1/31‑35 (MQ=255) gcgcGTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCg < 1:12730708/35‑1 (MQ=255) ttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCgg > 1:18144691‑M1/30‑35 (MQ=255) ttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCgg < 1:17854978‑M1/6‑1 (MQ=255) ttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCgg < 1:1689436‑M1/6‑1 (MQ=255) ttgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCgg > 1:817903‑M1/30‑35 (MQ=255) cgcgTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCgg < 1:758922/35‑1 (MQ=255) cgcgTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCgg < 1:11277729/35‑1 (MQ=255) tgctgtcgctggtggatatgacgctggtTGGCggg < 1:6673678‑M1/7‑1 (MQ=255) tgctgtcgctggtggatatgacgctgggTGGCggg < 1:10939279‑M1/7‑1 (MQ=255) gcgTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCggg < 1:2567188/35‑1 (MQ=255) cgTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGt < 1:18756796/35‑1 (MQ=255) gtggATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGtt < 1:18867897/32‑1 (MQ=255) gTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGtt < 1:4683289/35‑1 (MQ=255) ctgtcgctggtggatatgacgctggtTGgcggggt < 1:11470647‑M1/9‑3 (MQ=255) ttGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGttt < 1:9374140/35‑1 (MQ=255) ttGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGttt < 1:13014790/35‑1 (MQ=255) tgtcgctggtggatatgacgctggtTggcggggtt < 1:8651321‑M1/10‑4 (MQ=255) tgtcgctggtggatatgacgctggtTggcggggtt < 1:6804034‑M1/10‑4 (MQ=255) tGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTtg < 1:10013793/35‑1 (MQ=255) tGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTtg < 1:18675286/35‑1 (MQ=255) tGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTtg < 1:7920666/35‑1 (MQ=255) tctGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTtgtg < 1:8694736/33‑1 (MQ=255) cgctggtggatatgacgctggtTGGCGGGTTtgtg < 1:14194175‑M1/13‑1 (MQ=255) aTTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTtgtg < 1:4757595/35‑1 (MQ=255) ttGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTgg < 1:121230/35‑1 (MQ=255) gctggtgtatatgacgctggtTGGCGGGTTTGTgg < 1:5969181‑M1/14‑1 (MQ=255) gctggtggatatgacgctggtTGGCGGGGTTGTgg < 1:20115861‑M1/14‑1 (MQ=255) tGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTggg < 1:13569355/35‑1 (MQ=255) tGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTggg < 1:8425451/35‑1 (MQ=255) tGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTggg < 1:2131566/35‑1 (MQ=255) ctggtggatatgacgctggtTGGCGGGTTTTTggg < 1:416030‑M1/15‑1 (MQ=255) ctggtggatatgacgctggtTGGCGGGTTTGTggg < 1:19888549‑M1/15‑1 (MQ=255) ctggtggatatgacgctggtTGGCGGGTTTCTggg < 1:7040580‑M1/15‑1 (MQ=255) tggtggatatgacgctggtTGGCGGGTTTTTgggg < 1:10918007‑M1/16‑1 (MQ=255) tCGGCGTGTTAGCTGGTCTTGCGGGTTTGTGGGGc > 1:15533795/1‑35 (MQ=38) tCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGc < 1:10225520/35‑1 (MQ=255) tCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGc < 1:1339363/35‑1 (MQ=255) tCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGc < 1:3369800/35‑1 (MQ=255) acGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGGTTGTggggg > 1:831955/2‑34 (MQ=38) gCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGtt < 1:7105576/35‑1 (MQ=255) gCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGtt < 1:5315277/35‑1 (MQ=255) gCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGtt < 1:2819700/35‑1 (MQ=255) tGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACt < 1:68824/35‑1 (MQ=255) tGGTAGCTGGTCTGGCGGGGTTTTTGGGCGTTACt > 1:19317363/1‑35 (MQ=25) ggTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTa < 1:13059301/35‑1 (MQ=255) ggTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTa < 1:3672379/35‑1 (MQ=255) ggTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTa < 1:15553428/35‑1 (MQ=255) ggTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTa < 1:12282982/35‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTAt < 1:4663298/35‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTAt < 1:13696307/35‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTAt < 1:7937644/35‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTAt < 1:7075444/35‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTAt < 1:11999276/35‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTAt < 1:5980326/35‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTCTGGCGGGGTTGTGGGGGGGTTCTAt > 1:10395315/1‑35 (MQ=19) tAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATg < 1:14215279/35‑1 (MQ=255) tAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATg < 1:13153117/35‑1 (MQ=255) tAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATg < 1:11908930/35‑1 (MQ=255) aGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGc < 1:14843425/35‑1 (MQ=255) aGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGc < 1:14126863/35‑1 (MQ=255) aGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGc < 1:5883063/35‑1 (MQ=255) gCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCt < 1:6573451/35‑1 (MQ=255) gCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCt < 1:8193498/35‑1 (MQ=255) gCTGGTCTGGCGGGGTTGTGGGGCGTTACTATGcc > 1:17086534/1‑34 (MQ=255) cTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTc < 1:16705149/35‑1 (MQ=255) cTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTc < 1:18844624/35‑1 (MQ=255) cTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTc < 1:14356432/35‑1 (MQ=255) tGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCa < 1:1819912/35‑1 (MQ=255) ggTCTGGCGGGGTTGTGGGGCGTTACTATGCTCaa > 1:4871288/1‑35 (MQ=255) gTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCaaa < 1:2167765/35‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCaaa < 1:4470293/35‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCaaa > 1:13154708/1‑35 (MQ=255) tCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAAc < 1:15460107/35‑1 (MQ=255) tCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAAc < 1:8655384/35‑1 (MQ=255) tCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAAc < 1:19836491/35‑1 (MQ=255) cTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACg < 1:18449459/35‑1 (MQ=255) cTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACg < 1:10644802/35‑1 (MQ=255) cTGGCGAGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACg < 1:15776449/35‑1 (MQ=255) TGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACGc > 1:8684713‑M1/1‑35 (MQ=255) TGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACGc > 1:9209402‑M1/1‑35 (MQ=255) TGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACGc < 1:11079638‑M1/35‑1 (MQ=255) | GGCGGCGCGTTGATTGTCGGCGTGGTAGCTGGTCTGGCGGGTTTGTGGGGCGTTACTATGCTCAAACGC > REL606/445942‑446010 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |