New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1072149 | 74 (0.720) | 4 (0.040) | 3/42 | NT | 4.8% | coding (320/2745 nt) | torS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with TorR |
? | REL606 | 3712714 = | 106 (1.030) | coding (451/684 nt) | ECB_03459 | conserved hypothetical protein |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACGGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTGCAG > REL606/1072115‑1072183 | acgGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCgg > 1:9365259/1‑35 (MQ=255) acgGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCgg < 1:19410740/35‑1 (MQ=255) acgGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCgg < 1:12950627/35‑1 (MQ=255) acgGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCgg > 1:8374499/1‑35 (MQ=255) acgGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCgg < 1:11596919/35‑1 (MQ=255) cgGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggt < 1:17732762/35‑1 (MQ=255) cGGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGg > 1:9933658‑M1/1‑34 (MQ=255) gggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtg < 1:8047345/35‑1 (MQ=255) gggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtg < 1:18038939/35‑1 (MQ=255) gggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtg < 1:11032928/35‑1 (MQ=255) gggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGgg > 1:9198640‑M1/1‑33 (MQ=255) gggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGgg > 1:17598033‑M1/1‑33 (MQ=255) gggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGgg > 1:2197527‑M1/1‑33 (MQ=255) ggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtgg < 1:4962540/35‑1 (MQ=255) ggAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGggg > 1:8162066‑M1/1‑32 (MQ=255) gagaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtggt < 1:61792/35‑1 (MQ=255) gagaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtggt < 1:4624150/35‑1 (MQ=255) gagaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtggg > 1:15296553/1‑34 (MQ=255) gagaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtggg > 1:9090272/1‑34 (MQ=255) gagaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCTGgggt > 1:4028011‑M1/1‑31 (MQ=255) gagaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGgggg > 1:15178854‑M1/1‑31 (MQ=255) agaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCggtgggg > 1:15555617/1‑33 (MQ=255) agaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGggggg > 1:17059404‑M1/1‑30 (MQ=255) agaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGggggg > 1:16736409‑M1/1‑30 (MQ=255) agaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGggggg > 1:18625880‑M1/1‑30 (MQ=255) agaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTa < 1:1997583/35‑1 (MQ=255) gaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGgggggt > 1:3747025‑M1/1‑29 (MQ=255) gaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTAt < 1:5258125/35‑1 (MQ=255) gaTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTAt < 1:7908641/35‑1 (MQ=255) aTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGgggggtt > 1:17586656‑M1/1‑28 (MQ=255) aTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGggggggt > 1:10350192‑M1/1‑28 (MQ=255) aTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTATc < 1:19071567/35‑1 (MQ=255) aTCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTATc < 1:4386469/35‑1 (MQ=255) tctcCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTATCa < 1:12001104/35‑1 (MQ=255) tctcCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTATCa < 1:19697325/35‑1 (MQ=255) tctcCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTATCa < 1:4627274/35‑1 (MQ=255) ctcctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCaa < 1:3897357/35‑1 (MQ=255) tcctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCaaa < 1:4738815/35‑1 (MQ=255) tcctgctactgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCaaa < 1:14181855/35‑1 (MQ=255) cctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCaaan < 1:15062579/35‑1 (MQ=255) cctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCaaaa < 1:12074474/35‑1 (MQ=255) cctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCaaaa < 1:19648151/35‑1 (MQ=255) cctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCaaaa < 1:9446700/35‑1 (MQ=255) ctgctcctgTTGTTCAATAGCGGgggggttaaaaa > 1:20180195‑M1/1‑23 (MQ=255) ctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAAc < 1:12920136/35‑1 (MQ=255) ctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAAc < 1:7411610/35‑1 (MQ=255) ctgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAAc < 1:11805948/35‑1 (MQ=255) tgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAAcc < 1:18901125/35‑1 (MQ=255) tgctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAAcc < 1:16320756/35‑1 (MQ=255) gctcctgTTGTTCAATAGCGGgggggtgaaaaacc > 1:899909‑M1/1‑21 (MQ=255) gctcctgTTGTTCAATAGCGGgggggggaaaaacc > 1:16091670‑M1/1‑21 (MQ=255) gctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAACCt < 1:16115285/35‑1 (MQ=255) gctcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAACCt < 1:10832795/35‑1 (MQ=255) ctcctgTTGTTCAATAGCGGgggggtgaaaaacct > 1:6755369‑M1/1‑20 (MQ=255) ctcctgTTGTTCAATAGCGGGGGGGTCAAAAACtt > 1:10390681/1‑35 (MQ=19) tcctgTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTg < 1:19841605/35‑1 (MQ=255) ttgttCAATAGCTGTGGTATCAAAACCTTGTTccc > 1:12526341/1‑35 (MQ=255) ttgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTccc < 1:7467073/35‑1 (MQ=255) ttgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTccc < 1:16067663/35‑1 (MQ=255) ttgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTccc < 1:6520779/35‑1 (MQ=255) ttgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTccc < 1:19772733/35‑1 (MQ=255) tgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCg < 1:922140/35‑1 (MQ=255) tgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCg < 1:9289397/35‑1 (MQ=255) tgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCg < 1:16633030/35‑1 (MQ=255) tgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCg < 1:2458375/35‑1 (MQ=255) tgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCg < 1:2402762/35‑1 (MQ=255) tgttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCg < 1:17169485/35‑1 (MQ=255) tgttCAATAGCGCTGGTATCAAAACCTTGTTCCCg > 1:6910506/1‑35 (MQ=255) gttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGt < 1:14313667/35‑1 (MQ=255) gttCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGt < 1:19188427/35‑1 (MQ=255) tCAATAGCGTTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTaa > 1:6898473/1‑35 (MQ=255) tCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTaa < 1:13672263/35‑1 (MQ=255) tCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTaa < 1:12360227/35‑1 (MQ=255) cAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTagc < 1:7644455/35‑3 (MQ=255) cAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAAc < 1:8050267/35‑1 (MQ=255) cAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAAc < 1:11832960/35‑1 (MQ=255) cAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAAc < 1:16358307/35‑1 (MQ=255) cAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAAc < 1:14084139/35‑1 (MQ=255) cAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAAc < 1:2917824/35‑1 (MQ=255) aaTAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACg < 1:723881/35‑1 (MQ=255) aaTAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACg < 1:14787343/35‑1 (MQ=255) aTAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGc < 1:17962561/35‑1 (MQ=255) aTAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGc < 1:3816907/35‑1 (MQ=255) aTAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGc < 1:8978816/35‑1 (MQ=255) aGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCtt < 1:7170380/35‑1 (MQ=255) aGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCtt < 1:9676781/35‑1 (MQ=255) aGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCtt < 1:16555969/35‑1 (MQ=255) aGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCtt < 1:3576441/35‑1 (MQ=255) gCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTg < 1:4187640/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgc < 1:347999/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGCAACGATTgc > 1:7961046/1‑35 (MQ=37) cGGTGGGATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgc > 1:5897610/1‑35 (MQ=255) ggtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgca < 1:20119352/35‑1 (MQ=255) ggtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgca < 1:3015954/35‑1 (MQ=255) ggtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgca < 1:3208756/35‑1 (MQ=255) ggtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgca > 1:11214693/1‑35 (MQ=255) ggtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgca > 1:12219265/1‑35 (MQ=255) gtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgcag < 1:13371634/35‑1 (MQ=255) gtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgcag > 1:18149657/1‑35 (MQ=255) gtggtATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTgcag < 1:12668522/35‑1 (MQ=255) | ACGGGAGATCTCCTGCTCCTGTTGTTCAATAGCGGTGGTATCAAAACCTTGTTCCCGTAACGCTTGCAG > REL606/1072115‑1072183 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |