New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1133033 = | 122 (1.190) | 8 (0.100) | 3/38 | NT | 9.4% | coding (13/576 nt) | yceI | hypothetical protein |
? | REL606 | = 2612120 | 57 (0.700) | intergenic (‑323/+253) | yfhK/purL | predicted sensory kinase in two‑component system/phosphoribosylformylglycinamidine synthase |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
AACGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCAGCCACT > REL606/2612086‑2612154 | aaCGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTAt > 1:1549546/1‑35 (MQ=255) aaCGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTAt < 1:11098111/35‑1 (MQ=255) aCGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGTATTTATg < 1:20202323‑M2/35‑2 (MQ=255) aCGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATg < 1:15811912‑M2/35‑2 (MQ=255) aCGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATg < 1:20117649‑M2/35‑2 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg > 1:12842782‑M2/1‑33 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg > 1:19586340‑M2/1‑33 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg < 1:15737597‑M2/35‑3 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg < 1:10952557‑M2/35‑3 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg < 1:2407421‑M2/35‑3 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg > 1:9400984‑M2/1‑33 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg > 1:10481415‑M2/1‑33 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATgg > 1:16990093‑M2/1‑33 (MQ=255) cGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTACgg < 1:305587/35‑1 (MQ=255) gTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggc < 1:15397599‑M2/35‑4 (MQ=255) gTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggc > 1:896488‑M2/1‑32 (MQ=255) tACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggct > 1:16309802‑M2/1‑31 (MQ=255) tACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggct > 1:15156338‑M2/1‑31 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt < 1:13494436‑M2/35‑6 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt > 1:16752180‑M2/1‑30 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt < 1:13174201‑M2/35‑6 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt > 1:6948455‑M2/1‑30 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt < 1:19155858‑M2/35‑6 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt < 1:19197076‑M2/35‑6 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt > 1:12408233‑M2/1‑30 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt > 1:5782754‑M2/1‑30 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt < 1:2068319‑M2/35‑6 (MQ=255) aCTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggctt > 1:3216431‑M2/1‑30 (MQ=255) cTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggcttt < 1:6413201‑M2/35‑7 (MQ=255) cTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggcttt < 1:14744496‑M2/35‑7 (MQ=255) cTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggcttt < 1:9495571‑M2/35‑7 (MQ=255) cTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGcttc < 1:17703252/35‑1 (MQ=255) tGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGcttct < 1:3717996/35‑1 (MQ=255) tGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGcttct < 1:4985796/35‑1 (MQ=255) tGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGcttct < 1:16668334/35‑1 (MQ=255) gATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggcttttt < 1:7326927‑M2/35‑9 (MQ=255) gATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGcttctt < 1:11708570/35‑1 (MQ=255) aTTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCttcttc < 1:15954990/35‑1 (MQ=255) aTTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCttcttc < 1:1198431/35‑1 (MQ=255) aTTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCttcttc < 1:10461631/35‑1 (MQ=255) aTTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCttcttc < 1:8120360/35‑1 (MQ=255) aTTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCttcttc < 1:7934507/35‑1 (MQ=255) ttATACGTTGCTTTGAGGGATTTATggcttttttt < 1:13190845‑M2/35‑11 (MQ=255) ttATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCg < 1:14475808/35‑1 (MQ=255) tataCGTTGCTTTGAGGGATTTATggctttttttc < 1:5592737‑M2/35‑12 (MQ=255) tataCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGc < 1:20542023/35‑1 (MQ=255) tataCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTATTCGc < 1:8104703/35‑1 (MQ=255) tataAGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGc < 1:13849902/35‑1 (MQ=255) ataCGTTGCTTTGAGGGATTTATggctttttttct < 1:10856486‑M2/35‑13 (MQ=255) ataCGTTGCTTTGAGGGATTTATggctttttttct < 1:3955828‑M2/35‑13 (MQ=255) ataCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCt < 1:328649/35‑1 (MQ=255) ataCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCt < 1:12699737/35‑1 (MQ=255) ataCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCt < 1:2962623/35‑1 (MQ=255) ataCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCt < 1:9047138/35‑1 (MQ=255) ataCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCt < 1:3586757/35‑1 (MQ=255) taCGTTGCTTTGAGGGATTTATggctttttttctt < 1:12889428‑M2/35‑14 (MQ=255) taCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTa < 1:1735354/35‑1 (MQ=255) taCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTa < 1:6340421/35‑1 (MQ=255) taCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTa < 1:3151095/35‑1 (MQ=255) taCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTa < 1:10984385/35‑1 (MQ=255) aCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTTTTCTCttt > 1:17253527/1‑33 (MQ=25) aCGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTAt < 1:2770429/35‑1 (MQ=255) cGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTTTTTGCTAtt > 1:12965898/1‑35 (MQ=37) gTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTTTTCCCTCttt > 1:18362988/1‑35 (MQ=25) gTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTAttt < 1:12419226/35‑1 (MQ=255) gTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTAttt < 1:1939344/35‑1 (MQ=255) gTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTAttt < 1:19333375/35‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAGGGATTTATggctttttttctttttt < 1:6609305‑M2/35‑18 (MQ=255) ttGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTg < 1:17141884/35‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTg < 1:15206481/35‑1 (MQ=255) tGCTTTGAGGGATTTATGGCTTTTTTTCTAttttt > 1:15801812/1‑33 (MQ=21) tGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGa < 1:19821207/35‑1 (MQ=255) tGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGa < 1:12730131/35‑1 (MQ=255) gCTTTGAGGGATTTATGGCTTTTTTTCTAttttta > 1:18761626/1‑32 (MQ=19) gCTTTGAGGGATTTATGGCTTTTTCTCTAttttta > 1:10303285/1‑32 (MQ=25) gCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGaa < 1:13357417/35‑1 (MQ=255) gCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGaa < 1:7315614/35‑1 (MQ=255) cTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAAt < 1:4508413/35‑1 (MQ=255) cTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAAt < 1:12019178/35‑1 (MQ=255) tttGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATg < 1:1057313/35‑1 (MQ=255) tttGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATg < 1:16905988/35‑1 (MQ=255) ttGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGt < 1:3647834/35‑1 (MQ=255) ttGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGt < 1:5115918/35‑1 (MQ=255) ttGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGt < 1:5956430/35‑1 (MQ=255) tGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTa < 1:17588490/35‑1 (MQ=255) tGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTa < 1:8279659/35‑1 (MQ=255) gAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTaa < 1:7138112/35‑1 (MQ=255) aGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTaaa < 1:4015609/35‑1 (MQ=255) ggATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATc < 1:19759274/35‑1 (MQ=255) ggATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATc < 1:19037820/35‑1 (MQ=255) ggATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATc < 1:7373964/35‑1 (MQ=255) gATTTATTGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCa > 1:18842388/1‑35 (MQ=255) gATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCa < 1:14168692/35‑1 (MQ=255) gATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCa < 1:19997603/35‑1 (MQ=255) gATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCa < 1:2767616/35‑1 (MQ=255) aTTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCAg < 1:8295187/35‑1 (MQ=255) tttATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCAGc < 1:12380707/35‑1 (MQ=255) tttATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCAGc < 1:8983234/35‑1 (MQ=255) tATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCAGCCa < 1:14319945/35‑1 (MQ=255) tGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCAGCCACt > 1:12880016/1‑35 (MQ=255) | AACGTACTGATTATACGTTGCTTTGAGGGATTTATGGCTTCTTCGCTATTTGAATGTAAATCAGCCACT > REL606/2612086‑2612154 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |