New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2713428 = | 47 (0.520) | 102 (1.130) | 38/42 | NT | 68.5% | noncoding (77/93 nt) | serV | tRNA‑Ser |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACT > REL606/2713394‑2713462 | cagatggttcaacccttaagttagcgcttatggga > 1:17762371‑M1/35‑35 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatggga > 1:2396361‑M1/35‑35 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatggga < 1:14125441‑M1/1‑1 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatggga < 1:4296014‑M1/1‑1 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatggga < 1:5181618‑M1/1‑1 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatggga < 1:12890628‑M1/1‑1 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggAt > 1:15370140‑M1/34‑35 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggAt > 1:12636141‑M1/34‑35 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggAt > 1:1229606‑M1/34‑35 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggAt > 1:10064520‑M1/34‑35 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggAt > 1:8641613‑M1/34‑35 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggata < 1:12661127‑M1/3‑2 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggata < 1:10882781‑M1/3‑2 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggact < 1:8413688‑M1/3‑3 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggAtt > 1:2677274‑M1/33‑35 (MQ=255) gatggttcaacccttaagttagcgcttatgggAtt < 1:8741455‑M1/3‑1 (MQ=255) gatggttcaacacttaagttagcgcttatgggata > 1:13499331‑M1/33‑34 (MQ=255) gAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGAtt < 1:16107801/35‑1 (MQ=255) gAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGAtt < 1:4762105/35‑1 (MQ=255) atggttcaacccttaagttagcgcttatgggataa > 1:14612230‑M1/32‑33 (MQ=255) atggttcaacccttaagttagcgcttatgggataa < 1:11885912‑M1/4‑3 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatgggATTCg > 1:7769399‑M1/31‑35 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatgggATTCg > 1:2031193‑M1/31‑35 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatgggATTCg > 1:2137299‑M1/31‑35 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatgggATTCg < 1:2279757‑M1/5‑1 (MQ=255) gCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCg < 1:5508390/35‑1 (MQ=255) tACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGaa < 1:2933168/35‑1 (MQ=255) gttcaacccttaagttagcgcttatgggATTCGaa < 1:18204359‑M1/7‑1 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatgggATTCGAAc < 1:15251429‑M1/8‑1 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatgggATTCGAAc < 1:6764533‑M1/8‑1 (MQ=255) tcaacccttaagttagcgcttatgggATTCGAAcc < 1:6394343‑M1/9‑1 (MQ=255) tcaacccttaagttagcgcttatgggATTCGAAcc < 1:348381‑M1/9‑1 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggATTCGAAccc < 1:14851800‑M1/10‑1 (MQ=255) caacccttaagttagcgcttatgggATTCGAAccc > 1:13688247‑M1/26‑35 (MQ=255) gATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAAcccc < 1:4126828/35‑1 (MQ=255) gATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAAcccc < 1:20056796/35‑1 (MQ=255) gATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAAcccc < 1:17333260/35‑1 (MQ=255) gATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAAcccc < 1:13282999/35‑1 (MQ=255) acccttaagttagcgcttatgggATTCGAACCCCg > 1:7630490‑M1/24‑35 (MQ=255) aTGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCg < 1:6190136/35‑1 (MQ=255) aTGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCg < 1:9561569/35‑1 (MQ=255) tGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCgg < 1:19917580/35‑1 (MQ=255) tGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCgg < 1:18789015/35‑1 (MQ=255) cccttaagttagcgcttatgggATTCGAACCCCgg > 1:19632007‑M1/23‑35 (MQ=255) cccttaagttagcgcttatgggATTCGAACCCCgg < 1:17217299‑M1/13‑1 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGa < 1:1623380‑M1/14‑1 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGAt > 1:11606482‑M1/21‑35 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATg > 1:2872241‑M1/20‑35 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATg < 1:4551184‑M1/16‑1 (MQ=255) aaaTGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATg < 1:12005105/35‑1 (MQ=255) aaTGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGc < 1:5786543/35‑1 (MQ=255) aagttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCa > 1:1015450‑M1/18‑35 (MQ=255) aagttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCa < 1:20218226‑M1/18‑1 (MQ=255) agttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAg > 1:4240103‑M1/17‑35 (MQ=255) agttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAg < 1:10756261‑M1/19‑1 (MQ=255) agttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAg > 1:18920093‑M1/17‑35 (MQ=255) agttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAg < 1:18713762‑M1/19‑1 (MQ=255) gttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGc < 1:19325740‑M1/20‑1 (MQ=255) gttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGc > 1:10376435‑M1/16‑35 (MQ=255) ttagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCt > 1:1357112‑M1/15‑35 (MQ=255) tagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCtt > 1:8828565‑M1/14‑35 (MQ=255) tagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCtt < 1:5813733‑M1/22‑1 (MQ=255) tagcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCtt > 1:5848019‑M1/14‑35 (MQ=255) ggTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCttt < 1:13013657/35‑1 (MQ=255) agcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCttt < 1:3397686‑M1/23‑1 (MQ=255) gcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCtttt > 1:19817350‑M1/12‑35 (MQ=255) gcgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCtttt < 1:2975589‑M1/24‑1 (MQ=255) gTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCtttt < 1:7169819/35‑1 (MQ=255) ngcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTg > 1:16983681‑M1/11‑35 (MQ=255) cgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTg < 1:16369600‑M1/25‑1 (MQ=255) cgcttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTg > 1:44734‑M1/11‑35 (MQ=255) gAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCttttta > 1:14518385/1‑33 (MQ=255) gAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGa < 1:1170969/35‑1 (MQ=255) gAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGa < 1:13194202/35‑1 (MQ=255) gAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGa < 1:10639785/35‑1 (MQ=255) cttatgggATTCTAACCCCGGATGCAGCTTTTGAc < 1:9184‑M1/27‑1 (MQ=255) aGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAc > 1:3870321/1‑35 (MQ=255) aGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAc > 1:6448535/1‑35 (MQ=255) aGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAc > 1:4775412/1‑35 (MQ=255) ttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAcc > 1:20202594‑M1/8‑35 (MQ=255) ttatgggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAcc > 1:16513931‑M1/8‑35 (MQ=255) ggCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGAcc < 1:3564874/35‑1 (MQ=255) gCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCg < 1:16736952/35‑1 (MQ=255) cGGGGATTCGAACCCAGGATGCAGCTTTTGACCGc < 1:18602777/35‑1 (MQ=255) tgggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCa > 1:13102665‑M1/5‑35 (MQ=255) tgggATTCGAACACCGGATGCAGCTTTTGACCGCa > 1:17085977‑M1/5‑35 (MQ=255) ggggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCa > 1:18137845/1‑35 (MQ=255) gggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCAt < 1:15774423‑M1/32‑1 (MQ=255) gggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCAt > 1:8132150‑M1/4‑35 (MQ=255) gggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCAt > 1:10534370‑M1/4‑35 (MQ=255) ggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATa < 1:11198455‑M1/33‑1 (MQ=255) ggATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATa > 1:17596856‑M1/3‑35 (MQ=255) gATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCAtan < 1:18077428‑M1/34‑2 (MQ=255) gATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATAc < 1:20479415‑M1/34‑1 (MQ=255) gATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATAc > 1:6020900‑M1/2‑35 (MQ=255) gATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATAc < 1:19062013‑M1/34‑1 (MQ=255) gATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATAc < 1:18462364‑M1/34‑1 (MQ=255) aTTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACt < 1:6647240/35‑1 (MQ=255) aTTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACt < 1:14787162/35‑1 (MQ=255) aTTCGAACCCCGGATGCAGCTCTTGACCGCATACt > 1:2127420/1‑35 (MQ=255) | CTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACT > REL606/2713394‑2713462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |