Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (+) +6 bp | 66.5% | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 30 (0.470) | 59 (0.660) | 32/42 | NT | 58.4% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 32 (0.500) | 64 (0.710) | 34/42 | NT | 58.8% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448526‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACC < REL606/2774196‑2774168 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:10145800/35‑1 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:15732189/35‑1 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:8166078/35‑1 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC > 1:17938064/1‑35 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC > 1:5520301/1‑35 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:4283991/35‑1 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATC < 1:19512042/35‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC < 1:15685924/35‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC > 1:1793653/1‑35 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC < 1:18973916/35‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC > 1:2869436/1‑35 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC < 1:4144605/35‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC < 1:8438107/35‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCC > 1:9170554/1‑35 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCC < 1:4972671/35‑1 GATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCC < 1:6314661/35‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA > 1:19316554/1‑35 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA < 1:19267890/35‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA < 1:18444975/35‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA < 1:18303174/35‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA > 1:6573409/1‑35 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA < 1:14295695/35‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCA > 1:13148358/1‑35 TTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAT > 1:14985376/1‑35 TTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAT > 1:640511/1‑35 TTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCAT < 1:8641719/35‑1 TTAACAGGCGTAAAAAAACAGGGGAATTATCCCAT > 1:6222865/1‑35 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATA < 1:1101830/35‑1 AACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAA < 1:8775529/35‑1 AACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAA < 1:13571975/35‑1 AACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAA < 1:9587619/35‑1 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:7351671/1‑35 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:11597622/1‑35 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:9395986/1‑35 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:17902106/1‑35 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:6459669/1‑35 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGC > 1:3428254/1‑35 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGC > 1:7776935/1‑35 AGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG < 1:14618220/35‑1 AGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG > 1:14200326/1‑35 AGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCG < 1:2510540/35‑1 GGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGC > 1:18932778/1‑35 GGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGC > 1:16361401/1‑35 GCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCT > 1:11810127/1‑35 GCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCT < 1:15743302/35‑1 GCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCT > 1:13550861/1‑35 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA > 1:17660642/1‑35 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA < 1:3648455/35‑1 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTA > 1:1325689/1‑35 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA > 1:6366113/1‑35 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:7116173/35‑1 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:3772738/35‑1 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA > 1:2867691/1‑35 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:2587811/35‑1 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:7855353/35‑1 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA < 1:17432747/35‑1 TAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC < 1:1399732/35‑1 TAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC > 1:3258004/1‑35 TAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC < 1:8657160/35‑1 TAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAAC < 1:17790497/35‑1 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACT < 1:234345/35‑1 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACT < 1:204309/35‑1 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACT > 1:7578461/1‑35 AAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTT > 1:20345336/1‑35 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:2847601/35‑1 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA > 1:17223589/1‑35 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTA < 1:15814655/35‑1 AAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA > 1:9217002/1‑35 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:13838483/35‑1 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:12149629/1‑35 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:1623639/1‑35 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:2267930/35‑1 AACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:12909675/35‑1 AACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 1:20152343/1‑35 ACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG > 1:12773698/1‑35 ACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG < 1:11425113/35‑1 ACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG > 1:13782346/1‑35 CCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAGGGGg > 1:27791/1‑34 CCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT > 1:18139901/1‑35 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:7832349/35‑1 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:18362053/1‑35 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:17130580/1‑35 CGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:9383701/1‑35 GGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:19825005/1‑35 GGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:19422040/1‑35 GGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG > 1:13480423/1‑35 GGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGA < 1:541668/35‑1 GGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGA < 1:5329477/35‑1 GGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGA > 1:10711036/1‑35 GGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAA > 1:15301037/1‑35 GGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAA > 1:1579876/1‑35 GGAATGATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAA < 1:9789853/35‑1 GAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGtgg < 1:18505851/35‑4 AATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACC < 1:1350345/35‑1 AATTATCCCATAAGAGCTAACTTAAGGGTTGAACC < 1:1328599/35‑1 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448526‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACC < REL606/2774196‑2774168 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |