New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2703325 = | 45 (0.440) | 9 (0.120) | 3/36 | NT | 16.6% | coding (158/1185 nt) | ygaX | predicted transporter |
? | REL606 | = 4091236 | 57 (0.740) | coding (461/600 nt) | yiiQ | hypothetical protein |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTCTGCTG > REL606/2703291‑2703359 | ccttctgtctcggtgtaataacgtttgtttttccc > 1:80193‑M1/35‑35 (MQ=255) ccttctgtctcggtgtaataacgtttggttttccc < 1:8689685‑M1/1‑1 (MQ=255) cttctgtctcggtgtaataacgtttgtttttcccc < 1:2755148‑M1/2‑1 (MQ=255) cccTTTCCGCTAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAcc < 1:20204886/35‑1 (MQ=255) cccTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAcc < 1:20275056/35‑1 (MQ=255) cccTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAcc < 1:6008845/35‑1 (MQ=255) cccTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAcc < 1:12383773/35‑1 (MQ=255) cccTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAcc < 1:1654692/35‑1 (MQ=255) cccTTCCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAcc < 1:19140153/35‑1 (MQ=255) ttctgtctcggtgtaataacgtttgtttttccccg > 1:15153154‑M1/33‑35 (MQ=255) ttctgtctcggtgtaataacgtttgtttttccccg > 1:18177123‑M1/33‑35 (MQ=255) ttctgtctcggtgtaataacgtttgtttttccccc < 1:13341760‑M1/3‑2 (MQ=255) ccTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTTTTGTTAccg > 1:13749541/1‑35 (MQ=255) ccTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccg < 1:4961846/35‑1 (MQ=255) ccTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccg > 1:18480673/1‑35 (MQ=255) cTTTCCGCTAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccgc < 1:7660253/35‑1 (MQ=255) cTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccgc > 1:2443145/1‑35 (MQ=255) cTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccgc > 1:4820085/1‑35 (MQ=255) cTTCCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccgc < 1:19840804/35‑1 (MQ=255) cTTCCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccgc < 1:3444595/35‑1 (MQ=255) ctgtctcggtgtaataacgtttgtttttccccgcc > 1:2862860‑M1/31‑35 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccgccg > 1:15311654/1‑35 (MQ=255) ttCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTAccgccg > 1:3589831/1‑35 (MQ=255) tgtctcggtgtaataacgtttgtttttccccgccg > 1:8294369‑M1/30‑35 (MQ=255) tCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTTTTACcgccgc > 1:18437239/1‑35 (MQ=255) gCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCa > 1:13822120/1‑35 (MQ=255) ccAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCaa > 1:18198961/1‑35 (MQ=255) cAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAAt > 1:1121964/1‑35 (MQ=255) aGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAAtt > 1:329521/1‑35 (MQ=255) tCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTggg > 1:9840547/1‑35 (MQ=255) cGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGc > 1:7135662/1‑35 (MQ=255) ggCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCCATTGGGCt > 1:12037780/1‑35 (MQ=255) ggCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCt > 1:6951140/1‑35 (MQ=255) ggCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCt > 1:10006401/1‑35 (MQ=255) cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGTGCTAt > 1:18162588/1‑35 (MQ=255) cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTAt > 1:3917416/1‑35 (MQ=255) cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTAt > 1:5449103/1‑35 (MQ=255) cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTAt > 1:11296308/1‑35 (MQ=255) cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTAt > 1:8199671/1‑35 (MQ=255) cAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTAt > 1:8763258/1‑35 (MQ=255) aGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATg > 1:9967502/1‑35 (MQ=255) aGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATg > 1:10501951/1‑35 (MQ=255) aGGCTTTATTGTTAACGCCGCGCAATTGGGCTATg < 1:16715591/35‑1 (MQ=255) ggCTTTATTTTCCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgc < 1:17675196/35‑1 (MQ=21) ggCTTTATTGTTGCCGACGCGCAATTGGGCTATgc < 1:10058120/35‑1 (MQ=37) ggCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATgc > 1:18436218/1‑35 (MQ=255) ggCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATgc > 1:15934658/1‑35 (MQ=255) ggCTTTATTGTCCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgc < 1:18009949/35‑1 (MQ=37) gcttttATGGTGCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgc < 1:11156742/32‑1 (MQ=16) ttttttttttccCCGCCGCGCAATTGGGCTATgca > 1:1472507‑M1/13‑35 (MQ=255) tttttATTTTCCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgca < 1:7786159/33‑1 (MQ=21) gtttttttttccCCGCCGCGCAATTGGGCTATgca > 1:2861662‑M1/13‑35 (MQ=255) gCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATtca > 1:1893701/1‑35 (MQ=255) ttttATTGTTCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgcag < 1:3407527/34‑1 (MQ=255) ttttATTGTCCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgcag < 1:17554467/34‑1 (MQ=37) cTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATgcag > 1:16327350/1‑35 (MQ=255) cTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATgcag > 1:12561455/1‑35 (MQ=255) cTTTATTGTTACCGCAGCGCAATTGGGCTATgcag < 1:1240783/35‑1 (MQ=255) cTTTATTGTCCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgcag < 1:3148934/35‑1 (MQ=37) tttTTTGTCCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgcagc < 1:10144851/35‑1 (MQ=25) tttATTGTTCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgcagc < 1:4659492/35‑1 (MQ=255) tttATTGTCCCCGCCGCGCAATTGGGCTATgcagc < 1:19511208/35‑1 (MQ=37) tttttttccCCGCCGCGCAATTGGGCTATgcagca > 1:4480879‑M1/10‑35 (MQ=255) ttATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATgcagca > 1:18932102/1‑35 (MQ=255) ttATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATgcagca > 1:15635882/1‑35 (MQ=255) ttATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATgcagca > 1:16239103/1‑35 (MQ=255) ttATTGTTACCGCCGCGCAATTGAGCTATgcagca > 1:20454238/1‑35 (MQ=255) ttttgtccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGcagcag > 1:14116283‑M1/9‑35 (MQ=255) tttttccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAgg > 1:8486668‑M1/8‑35 (MQ=255) tttctccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAgg > 1:16149385‑M1/8‑35 (MQ=255) attgtccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAgg > 1:12443344‑M1/8‑35 (MQ=255) ttgtccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGt > 1:6527301‑M1/7‑35 (MQ=255) ttctccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGt > 1:10589290‑M1/7‑35 (MQ=255) ttGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGt > 1:4377549/1‑35 (MQ=255) ttGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGt > 1:19312073/1‑35 (MQ=255) tttccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTc > 1:6892417‑M1/6‑35 (MQ=255) ttcccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTc > 1:18843696‑M1/6‑35 (MQ=255) tGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTc > 1:11912217/1‑35 (MQ=255) ttccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTct > 1:19042449‑M1/5‑35 (MQ=255) ttccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTct > 1:9107740‑M1/5‑35 (MQ=255) gtccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTct > 1:11067706‑M1/5‑35 (MQ=255) gTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTct > 1:15547904/1‑35 (MQ=255) ctgcCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTct > 1:7675640‑M1/5‑35 (MQ=255) ctccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTct > 1:417878‑M1/5‑35 (MQ=255) ttACCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctg > 1:14901110/1‑35 (MQ=255) tccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctg > 1:18907095‑M1/4‑35 (MQ=255) tcaCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctg < 1:15306932/33‑1 (MQ=255) cccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctg > 1:5827710‑M1/4‑35 (MQ=255) ccCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgc > 1:14896042‑M1/3‑35 (MQ=255) cCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgct > 1:7457816‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgct > 1:11415634‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgct > 1:3575016‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgct > 1:15341698‑M1/2‑35 (MQ=255) aCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgct > 1:3866832/1‑35 (MQ=255) aCCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgct > 1:8627985/1‑35 (MQ=255) CCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgctg < 1:16328165‑M1/35‑1 (MQ=255) CCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgctg > 1:8379071‑M1/1‑35 (MQ=255) CCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgctg > 1:12044465‑M1/1‑35 (MQ=255) CCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgctg > 1:19537623‑M1/1‑35 (MQ=255) CCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTctgctg > 1:5422512‑M1/1‑35 (MQ=255) | TCCCTTTCCGCCAGTTCGGCAGGCTTTATTGTTACCGCCGCGCAATTGGGCTATGCAGCAGGTCTGCTG > REL606/2703291‑2703359 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |