Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 3,517,306 | IS186 (+) +8 bp :: Δ2 | 56.2% | coding (187‑194/1743 nt) | ggt ← | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 590715 = | NA (NA) | 34 (0.380) | 22/42 | NT | 41.2% | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | = 3517313 | 30 (0.540) | coding (187/1743 nt) | ggt | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor | |||||
* | ? | REL606 | = 2774194 | NA (NA) | 52 (0.530) | 28/46 | NT | 47.8% | noncoding (1341/1343 nt) | IS186 | repeat region |
? | REL606 | 3517306 = | 37 (0.580) | coding (194/1743 nt) | ggt | gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/590748‑590715 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG < REL606/3517313‑3517280 gcAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:18369907/3‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:8700527/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:1805733/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:18274391/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:7573233/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:18454627/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:11894568/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:16083454/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:20411102/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:6283330/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:15721208/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG < 1:3072927/35‑1 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:12636948/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG < 1:14463875/35‑1 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG > 1:1307534/1‑35 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGATTATGGGG < 1:4533329/35‑1 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCCCTTATGGGG > 1:3793453/1‑35 GTAATACCACAAACCTTAAGTTAGCGCTTATGGGG < 1:17773658/35‑1 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:82570/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:17412133/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT < 1:18115747/35‑1 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:16691976/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT < 1:6797719/35‑1 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:12033125/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:12128879/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:12330806/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:12539629/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:3177414/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:14664863/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT < 1:344730/35‑1 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT > 1:6204484/1‑35 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT < 1:1432429/35‑1 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT < 1:5351044/35‑1 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGT < 1:13900480/35‑1 AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTG < 1:7667328/35‑1 ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGG < 1:2817891/35‑1 ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGG < 1:997184/35‑1 TACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGA > 1:6953146/1‑35 TACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGA < 1:5067338/35‑1 ACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGAT > 1:1929876/1‑35 ACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGAT < 1:10642343/35‑1 CCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATA > 1:18920703/1‑35 ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATC > 1:13479754/1‑35 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCC < 1:2973370/35‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT > 1:20601331/1‑35 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT < 1:7113858/35‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT > 1:16201984/1‑35 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCT < 1:15805813/35‑1 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGTGTGGATATCCTC > 1:4357556/1‑35 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTaa < 1:18729316/35‑3 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCA < 1:3060388/35‑1 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCA < 1:17019764/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAA < 1:14508016/35‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAA > 1:3933592/1‑35 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAG < 1:19629749/35‑1 CTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAG < 1:6280463/35‑1 TTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGG > 1:15575749/1‑35 TTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGG > 1:501666/1‑35 TTAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGG > 1:12164065/1‑35 TAAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGA < 1:1019598/35‑1 AAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAG > 1:4709469/1‑35 AAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAG > 1:13961865/1‑35 AAGTTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAG > 1:10404178/1‑35 TTAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGC > 1:9663542/1‑35 TAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCG > 1:17569871/1‑35 TAGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCG > 1:17045165/1‑35 AGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGG < 1:18074974/35‑1 AGCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGG < 1:12713030/35‑1 GCGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGG < 1:11711293/35‑1 CGCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGA < 1:3514298/35‑1 GCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAA > 1:6922249/1‑35 GCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAA > 1:12637207/1‑35 GCTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAA < 1:19654505/35‑1 CTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAAT < 1:11341830/35‑1 CTTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAAT < 1:9568272/35‑1 TTATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATG < 1:1994146/35‑1 TATGGGTTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC > 1:13961622/1‑35 TATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC < 1:4673412/35‑1 TATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC < 1:5854005/35‑1 TATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGC > 1:2863110/1‑35 ATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCC > 1:830201/1‑35 ATGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCC > 1:6919031/1‑35 TGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCa < 1:7353114/35‑2 TGGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCG > 1:16231546/1‑35 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT > 1:1642104/1‑35 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT < 1:18107108/35‑1 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT > 1:9112408/1‑35 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT > 1:18853787/1‑35 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT < 1:5255628/35‑1 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT > 1:5252657/1‑35 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT > 1:5201790/1‑35 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT < 1:1575225/35‑1 GGGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGT < 1:2935386/35‑1 GGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTT < 1:104475/35‑1 GGGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTT > 1:2106486/1‑35 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG < 1:7022537/35‑1 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG < 1:10623334/35‑1 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG > 1:20502643/1‑35 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG < 1:4463450/35‑1 GGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG < 1:14856814/35‑1 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/590748‑590715 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggGTGGATATCCTCAAGGAGGGCGGGAATGCCGTTG < REL606/3517313‑3517280 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |