New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 1006225 | 100 (0.970) | 9 (0.110) | 3/38 | NT | 13.2% | intergenic (‑149/+20) | asnS/pncB | asparaginyl‑tRNA synthetase/nicotinate phosphoribosyltransferase |
? | REL606 | = 4210740 | 39 (0.480) | intergenic (‑178/+75) | yjbD/lysC | hypothetical protein/aspartate kinase III |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAA > REL606/4210706‑4210774 | tattCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACa > 1:16056768/1‑35 (MQ=255) tattCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACa > 1:16649549/1‑35 (MQ=255) tattCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACa < 1:17272798/35‑1 (MQ=255) tattCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACa > 1:15003244/1‑35 (MQ=255) tattCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACa < 1:8928479/35‑1 (MQ=255) tattCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACa > 1:7653033/1‑35 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg < 1:1988898‑M2/35‑2 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg > 1:297255‑M2/1‑34 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg < 1:4870847‑M2/35‑2 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg > 1:12677261‑M2/1‑34 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg < 1:6600453‑M2/35‑2 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg < 1:6807745‑M2/35‑2 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg < 1:11310259‑M2/35‑2 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg < 1:9037953‑M2/35‑2 (MQ=255) aTTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAg < 1:9535666‑M2/35‑2 (MQ=255) ttCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAgg < 1:10273163‑M2/35‑3 (MQ=255) tctcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggc > 1:12960637‑M2/1‑32 (MQ=255) tctcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGNNCNgnn > 1:8538171/1‑33 (MQ=37) ctcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggct > 1:4288182‑M2/1‑31 (MQ=255) ctcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggct < 1:14378670‑M2/35‑5 (MQ=255) ctcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggct < 1:19617444‑M2/35‑5 (MQ=255) ctcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggct < 1:19346280‑M2/35‑5 (MQ=255) tcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctc > 1:6121388‑M2/1‑30 (MQ=255) tcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctc < 1:20105244‑M2/35‑6 (MQ=255) tcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctc < 1:20027064‑M2/35‑6 (MQ=255) tcCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctc > 1:1339657‑M2/1‑30 (MQ=255) ccGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCg < 1:7162564/35‑1 (MQ=255) ccGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCg < 1:5666213/35‑1 (MQ=255) cGATAAAGGCGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGt < 1:4346053/35‑1 (MQ=255) cGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccc < 1:16451582‑M2/35‑8 (MQ=255) cGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGt < 1:20058553/35‑1 (MQ=255) cGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGt < 1:6711993/35‑1 (MQ=255) cGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGt < 1:18501291/35‑1 (MQ=255) gATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccgt < 1:16570588‑M2/35‑9 (MQ=255) gATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccct < 1:17729032‑M2/35‑9 (MQ=255) gATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccct < 1:3835310‑M2/35‑9 (MQ=255) gATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGtt < 1:6362312/35‑1 (MQ=255) gATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGtt < 1:2108056/35‑1 (MQ=255) ctAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGttt < 1:11837329/34‑1 (MQ=255) aTAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccctt < 1:2476837‑M2/35‑10 (MQ=255) aTAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccctt < 1:5909420‑M2/35‑10 (MQ=255) aTAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGttt < 1:5386985/35‑1 (MQ=255) aTAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGttt < 1:15420569/35‑1 (MQ=255) tAAAGACGCTTGTTAACAGAGTACAggctcccttt < 1:4691922‑M2/35‑11 (MQ=255) tAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccgttt < 1:8215575‑M2/35‑11 (MQ=255) tAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTa < 1:18889616/35‑1 (MQ=255) tAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTa < 1:17915226/35‑1 (MQ=255) aaaGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTAt < 1:3117234/35‑1 (MQ=255) aaaGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTAt < 1:20359733/35‑1 (MQ=255) aaGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTAtt < 1:15779591/35‑1 (MQ=255) aaGACGCTGGTTAACAGAGTACAGACTCGTTTAtt < 1:3453066/35‑1 (MQ=255) aggcGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtg < 1:13455354/32‑1 (MQ=255) aGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtg < 1:5170304/35‑1 (MQ=255) gACGCTTGTTAACAGAGTACAggctcccttttttt < 1:18343254‑M2/35‑15 (MQ=255) gACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccgttttttt < 1:20259961‑M2/35‑15 (MQ=255) gACGCTGGTTAACAGAGTACAggctcccttttttt < 1:8682196‑M2/35‑15 (MQ=255) gACGCTGGTTAACAGAGTACAggctccctttttta < 1:3441115‑M2/35‑15 (MQ=255) gACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtga < 1:9336891/35‑1 (MQ=255) gACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGGTTTtttt > 1:12586546/1‑33 (MQ=25) aCGCTGGTTAACAGAGTACAggctcccttattttt < 1:6616218‑M2/35‑16 (MQ=255) cGCTGGTTAACAGAGTACAggctcccttttttatt < 1:9298909‑M2/35‑17 (MQ=255) cGCTGGTTAACAGAGTACAggctcccttttttatg < 1:19766722‑M2/35‑17 (MQ=255) cGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTTTttatg > 1:16087443/1‑35 (MQ=38) cGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATtgatg < 1:5088336/35‑1 (MQ=255) cTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAg < 1:20547922/35‑1 (MQ=255) cTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGCTTTTTTTTGAg > 1:7958516/1‑35 (MQ=16) cTGGTTAACAGAGTACAGGCTCCCTTTTTTATGAg > 1:16795212/1‑35 (MQ=19) cTGGTTAACAGAGTACAGGCTCCCTTATTTATGAg > 1:16567417/1‑35 (MQ=25) tGGTTAACAGAGTACATGCTCGTTTATTGATGAGc < 1:11351508/35‑1 (MQ=255) tGGTTAACAGAGTACAGGCTCGCTTATTGTTGAGc > 1:8872542/1‑35 (MQ=38) ggTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCa < 1:10524451/35‑1 (MQ=255) ggTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCa < 1:13654089/35‑1 (MQ=255) gTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCAt < 1:1140340/35‑1 (MQ=255) gTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCAt < 1:912825/35‑1 (MQ=255) gTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCAt < 1:20281215/35‑1 (MQ=255) gTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCAt < 1:7844966/35‑1 (MQ=255) aaCAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGt < 1:19830572/35‑1 (MQ=255) aaCAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGt < 1:184514/35‑1 (MQ=255) aaCAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGt < 1:18247463/35‑1 (MQ=255) aCAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTg < 1:1501650/35‑1 (MQ=255) cAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGa < 1:8774123/35‑1 (MQ=255) cAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGa < 1:14931556/35‑1 (MQ=255) agagTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGAc < 1:1574907/35‑1 (MQ=255) agagTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGAc < 1:18284585/35‑1 (MQ=255) gagTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACa < 1:10035820/35‑1 (MQ=255) agTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACaa < 1:13498803/35‑1 (MQ=255) agTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACaa < 1:2893130/35‑1 (MQ=255) gTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAg < 1:11475450/35‑1 (MQ=255) gTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAg < 1:385781/35‑1 (MQ=255) gTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAg < 1:14999823/35‑1 (MQ=255) tACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGa < 1:20560949/35‑1 (MQ=255) cAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa > 1:5847558/1‑35 (MQ=255) cAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa > 1:18982698/1‑35 (MQ=255) cAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa > 1:8366231/1‑35 (MQ=255) cAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa > 1:15404683/1‑35 (MQ=255) cAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa > 1:327219/1‑35 (MQ=255) cAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa > 1:2298884/1‑35 (MQ=255) cAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa < 1:22023/35‑1 (MQ=255) cAGGCTAGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaa < 1:18049392/35‑1 (MQ=255) aGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGaaaa > 1:12488537/1‑35 (MQ=255) | TATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAA > REL606/4210706‑4210774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |