New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2908068 = | 60 (0.580) | 9 (0.110) | 4/38 | NT | 14.3% | coding (999/2871 nt) | xdhD | fused predicted xanthine/hypoxanthine oxidase: molybdopterin‑binding subunit/Fe‑S binding subunit |
? | REL606 | 4123539 = | 60 (0.740) | coding (903/1080 nt) | frwC | predicted enzyme IIC component of PTS |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGC > REL606/4123505‑4123572 | gatcatatgctcgccgcgctgggctgcatggctgg > 1:13693438‑M2/35‑35 (MQ=255) cggcgCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgg > 1:12484451/1‑35 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTggg < 1:9574434/35‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTCGATGCGCAGTGCTATGCAGGCTggg > 1:14341337/1‑35 (MQ=255) ggcgATGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTggg < 1:17970251/35‑1 (MQ=255) atcatattctcgccgcgctgggctgcatggctggg > 1:17598773‑M2/34‑35 (MQ=255) tcatatgctcgccgcgctgggctgcatggctgggg > 1:19002858‑M2/33‑35 (MQ=255) tcatatgctcgccgcgctgggctgcatggctgggg > 1:15038378‑M2/33‑35 (MQ=255) gcgcTGGTCGGTGCGCAGTTCTATGCAGGCTgggg > 1:14401965/1‑35 (MQ=255) gcgcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggg < 1:10149667/35‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggg < 1:9182750/35‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggg < 1:5529717/35‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggg > 1:4326814/1‑35 (MQ=255) cgcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTggggg > 1:10725392/1‑34 (MQ=255) cgcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggt < 1:17589252/35‑1 (MQ=255) cgcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggt < 1:17918041/35‑1 (MQ=255) catatgctcgccgcgctgtgctgcatggctggggg > 1:9048373‑M2/32‑34 (MQ=255) catatgctcgccgcgctgggctgcatggctggggg > 1:4947699‑M2/32‑34 (MQ=255) catatgctcgccgcgctgggctgcatggctggggg > 1:302204‑M2/32‑34 (MQ=255) gcTGGTCTGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggggg > 1:8056295/1‑33 (MQ=38) gcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggggg > 1:4450578/1‑33 (MQ=255) gcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggggg > 1:16035943/1‑33 (MQ=255) gcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTgggggg > 1:15312175/1‑33 (MQ=255) gcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTggggcg > 1:6258523/1‑33 (MQ=255) gcTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggtg > 1:3972087/1‑35 (MQ=255) tatgctcgccgcgctgggctgcatggctgGggggg > 1:19978475‑M2/30‑35 (MQ=255) tatgctcgccgcgctgggctgcatggctgGggggg > 1:6422195‑M2/30‑35 (MQ=255) cTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCATGCTGGggtgg > 1:2695010/1‑35 (MQ=255) cTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggggg > 1:19439245/1‑35 (MQ=255) cTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggggg > 1:3856208/1‑35 (MQ=255) tGGTCGGTGCTCAGTGCTATGCAGGCTGGgggggg > 1:9231132/1‑34 (MQ=37) tGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggtggt < 1:18939135/35‑1 (MQ=255) tGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggtggt < 1:2115114/35‑1 (MQ=255) tGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggtggt < 1:5919364/35‑1 (MQ=255) tGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGgggggg > 1:12936977/1‑34 (MQ=255) tGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggcggg > 1:67427/1‑34 (MQ=255) tgctcgccgcgctgggctgcatggctggggtgggt > 1:5216672‑M2/28‑33 (MQ=255) tgctcgccgcgctgggctgcatggctggggtgggc > 1:20451376‑M2/28‑33 (MQ=255) tgctcgccgcgctgggctgcatggctgGGGTGGTc > 1:1812695‑M2/28‑35 (MQ=255) ggTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggggggg > 1:18772852/1‑33 (MQ=38) ggTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGggggggc > 1:15207120/1‑33 (MQ=38) ggTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTc < 1:9151377/35‑1 (MQ=255) gctcgccgcgctgggctgcatggctgGGGTGGTCt > 1:14490603‑M2/27‑35 (MQ=255) gctcgccgcgctgggctgcatggctgGGGTGGTCt > 1:6946370‑M2/27‑35 (MQ=255) gTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGgggggggt > 1:9657507/1‑32 (MQ=37) tCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTg < 1:5904781/35‑1 (MQ=255) tCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTg > 1:1961316/1‑35 (MQ=37) cGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGa < 1:19846572/35‑1 (MQ=255) gTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGAtt < 1:17370709/35‑1 (MQ=255) gTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGAtt < 1:6659823/35‑1 (MQ=255) gTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGGtt > 1:15209180/1‑35 (MQ=25) gTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGAtt > 1:7277126/1‑35 (MQ=38) gTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGAtt > 1:17295233/1‑35 (MQ=38) gTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGAtt > 1:16591435/1‑35 (MQ=38) tGCGCAGTTCTATGCAGGCTGGGGTGGGCTGATtg > 1:15135380/1‑35 (MQ=38) tGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATtg < 1:5910774/35‑1 (MQ=255) gcgcAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGTGTGATtgt > 1:18579598/1‑35 (MQ=38) cgcAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATtgtg < 1:18326526/35‑1 (MQ=255) cgcAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATtgtg < 1:15924289/35‑1 (MQ=255) cgcAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGGCTGATtgtg > 1:1657222/1‑35 (MQ=255) gcAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGGGTGATTTtgc > 1:16876034/1‑35 (MQ=25) gcAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGGCTGATTGtgc > 1:5313934/1‑35 (MQ=255) gcAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGGTTTtgc > 1:526529/1‑35 (MQ=19) gcAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGATtgtgg > 1:3925886/1‑34 (MQ=37) gcAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGATTGtgc > 1:6826661/1‑35 (MQ=37) tcttGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGtgct < 1:18666672/32‑1 (MQ=255) cAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGtgct < 1:6382644/35‑1 (MQ=255) cAGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGGTTTtgct > 1:17100178/1‑35 (MQ=19) aGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGtgctg < 1:12296687/35‑1 (MQ=255) aGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGtgctg < 1:20131628/35‑1 (MQ=255) aGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGtgctg < 1:9792582/35‑1 (MQ=255) aGTGCTATGCAGGCTGGGGGGTTCTGATTGtgctg > 1:11837025/1‑35 (MQ=38) aGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGATTGtgctg > 1:431867/1‑35 (MQ=37) aGTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGATTGtgctg > 1:2117909/1‑35 (MQ=37) aGTGCTATGCAGGCTGGGGGAGTCTGGTTGtgctg > 1:7180605/1‑35 (MQ=25) gTGCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGGTTGtgctgc > 1:10704793/1‑35 (MQ=25) gCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCg < 1:11042485/35‑1 (MQ=255) gCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCg < 1:6132720/35‑1 (MQ=255) gCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCg < 1:12148979/35‑1 (MQ=255) gCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCg < 1:16769306/35‑1 (MQ=255) gCTATGCAGGCTGGGGGGGGCTGATTTTGGTGGCg > 1:3513292/1‑35 (MQ=12) cTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCgg < 1:16491021/35‑1 (MQ=255) tGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCggtgg < 1:14741627/35‑1 (MQ=255) gCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCggtggt < 1:11309368/35‑1 (MQ=255) gCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCggtggt < 1:7689576/35‑1 (MQ=255) cAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCggggggg > 1:11138060/1‑33 (MQ=37) gggctgGGGTGGTCTGATTGTCCTGCCGGTGGTTg < 1:2240971‑M2/29‑1 (MQ=255) aGGCTGGTGTGGTCTGATTGTGCTGCCgggggggg > 1:12923108/1‑32 (MQ=25) aGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCggtggggg > 1:10412874/1‑32 (MQ=255) aGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCgggggggg > 1:7154991/1‑32 (MQ=37) aGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTg < 1:10803993/35‑1 (MQ=255) aGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGGTg > 1:13936326/1‑35 (MQ=255) ggctgGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGa < 1:15945418‑M2/30‑1 (MQ=255) ggctgGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGa < 1:12598617‑M2/30‑1 (MQ=255) gctgGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGaa < 1:17387565‑M2/31‑1 (MQ=255) cTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCTGTGGGTGAAg > 1:98177/1‑35 (MQ=25) tgGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAgg < 1:15681008‑M2/33‑1 (MQ=255) ggGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAgg < 1:5570951‑M2/33‑1 (MQ=255) gGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGc < 1:10688388‑M2/34‑1 (MQ=255) gGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGc < 1:18931786‑M2/34‑1 (MQ=255) | CGGCGCTGGTCGGTGCGCAGTGCTATGCAGGCTGGGGTGGTCTGATTGTGCTGCCGGTGGTTGAAGGC > REL606/4123505‑4123572 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |