New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3331631 = | 78 (0.760) | 5 (0.070) | 4/34 | NT | 9.4% | coding (257/975 nt) | yhdH | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding |
? | REL606 | = 4600665 | 41 (0.560) | coding (36/606 nt) | osmY | periplasmic protein |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CCGCGTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGTGGG > REL606/3331597‑3331665 | ccGCGTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAc < 1:20209357/35‑1 (MQ=255) ccGCGTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAc < 1:19114928/35‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAct < 1:459364/35‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAct < 1:9670853/35‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAct < 1:3901388/35‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAct < 1:18534849/35‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAct < 1:1160443/35‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCAct < 1:17450921/35‑1 (MQ=255) gcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActg < 1:7028633/35‑1 (MQ=255) gcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActg < 1:17213424/35‑1 (MQ=255) gcgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActg < 1:15540364/35‑1 (MQ=255) cgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActgg < 1:5681479/35‑1 (MQ=255) cgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActgg > 1:4284241/1‑35 (MQ=255) cgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActgg < 1:4239680/35‑1 (MQ=255) cgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActgg > 1:3926521/1‑35 (MQ=255) cgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActgg < 1:12419213/35‑1 (MQ=255) cgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActgg < 1:6461556/35‑1 (MQ=255) cgTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActgg < 1:12321527/35‑1 (MQ=255) gTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggc > 1:10928870/1‑35 (MQ=255) gTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggc > 1:765445/1‑35 (MQ=255) gTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggc < 1:19768764/35‑1 (MQ=255) gTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggc > 1:14356757/1‑35 (MQ=255) gTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggc < 1:16328646/35‑1 (MQ=255) gTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggc > 1:15955043/1‑35 (MQ=255) ttttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggct > 1:4481693/1‑35 (MQ=255) ttttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggct < 1:19914913/35‑1 (MQ=255) ttttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggct < 1:1973570/35‑1 (MQ=255) ttttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggct < 1:17216715/35‑1 (MQ=255) ttttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggct > 1:8917888/1‑35 (MQ=255) tttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctg > 1:2443944/1‑35 (MQ=255) tttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctg < 1:19822001/35‑1 (MQ=255) tttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctg < 1:19742915/35‑1 (MQ=255) tttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctg < 1:18173719/35‑1 (MQ=255) ttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctgg > 1:2128767/1‑35 (MQ=255) ttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctgg > 1:20319348/1‑35 (MQ=255) ttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctgg > 1:11680710/1‑35 (MQ=255) ttCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCActggctgg < 1:9261120/35‑1 (MQ=255) tCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTggg < 1:1033393/35‑1 (MQ=255) tCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTggg < 1:7686201/35‑1 (MQ=255) cATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTgggg > 1:377801/1‑35 (MQ=255) aTGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTggggg > 1:18589787/1‑34 (MQ=255) aTGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTggggg > 1:7477549/1‑34 (MQ=255) aTGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTggggg > 1:9050881/1‑34 (MQ=255) aTGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGc < 1:9412053/35‑1 (MQ=255) aTGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGc < 1:1078809/35‑1 (MQ=255) tGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTgggggg > 1:7713313/1‑33 (MQ=255) tGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCg > 1:5710910/1‑35 (MQ=255) tGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCg > 1:7573419/1‑35 (MQ=255) gacGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGt < 1:10168301/33‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGGAGGTGTTACTAACTGGCTGGGGCGt < 1:4689393/35‑1 (MQ=255) actgaagatttcgaaaactctgCTGgctggggtgg < 1:13832297‑M1/13‑4 (MQ=255) ctgaagatttcgaaaactctgCTGGCTGGGGGGtt < 1:2823997‑M1/14‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGtt < 1:9639250/35‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGtt < 1:8735921/35‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGtt < 1:13064480/35‑1 (MQ=255) cGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTg < 1:7222814/35‑1 (MQ=255) cGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTg < 1:9172001/35‑1 (MQ=255) cGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTg < 1:15427554/35‑1 (MQ=255) ggTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGGGGTgg > 1:13845193/1‑35 (MQ=37) ggTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGGGGTgg > 1:1855502/1‑35 (MQ=37) ggTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTgg < 1:7440195/35‑1 (MQ=255) ggTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTgg < 1:10982437/35‑1 (MQ=255) gaagatttcgaaaactctgCTGGCTGGGGTGTtgt < 1:2733801‑M1/16‑2 (MQ=255) gaagatttcgaaaactctgCTGGCTGGGGGGTTgg < 1:7307249‑M1/16‑1 (MQ=255) gTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGt < 1:13473327/35‑1 (MQ=255) gTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGt < 1:11578664/35‑1 (MQ=255) gTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGt < 1:12249090/35‑1 (MQ=255) aagatttcgaaaactctgCTGGCTGGGGCGTCGGt < 1:2358331‑M1/17‑1 (MQ=255) tCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTg < 1:12729075/35‑1 (MQ=255) tCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTg < 1:17740205/35‑1 (MQ=255) cAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGa < 1:6368752/35‑1 (MQ=255) cAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGa < 1:8431002/35‑1 (MQ=255) aggaggTGTTACTCACTGGCTGGGGGGGTGGGGaa > 1:10332257/1‑35 (MQ=25) aggaggTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGaa < 1:9792753/35‑1 (MQ=255) ggaggTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGaaa < 1:19707283/35‑1 (MQ=255) gaggTGTTACTCACTGGCTGGGGGGGTGGGGaaaa > 1:5975657/1‑35 (MQ=25) gaggTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGaaaa < 1:6150820/35‑1 (MQ=255) gaggTGTTAATCACTGGCTGGGGCGTTGGTGaaaa < 1:15785723/35‑1 (MQ=255) aggTGTTACTCACTGGCTGGGGGGGTGGTGAAAAc > 1:17422496/1‑35 (MQ=37) aggTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAAc < 1:3621830/35‑1 (MQ=255) aggTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAAc < 1:1128947/35‑1 (MQ=255) gtTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACt < 1:7615491/35‑1 (MQ=255) gtTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACt < 1:14059648/35‑1 (MQ=255) ttACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTg < 1:20503173/35‑1 (MQ=255) tACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTgg < 1:10772392/35‑1 (MQ=255) tACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTgg < 1:10779308/35‑1 (MQ=255) tACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTgg < 1:9319763/35‑1 (MQ=255) aCTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTggg < 1:13013151/35‑1 (MQ=255) aCTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTggg < 1:14981119/35‑1 (MQ=255) cTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTgggg < 1:5981945/35‑1 (MQ=255) tCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGt < 1:3908210/35‑1 (MQ=255) tCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGt < 1:1531053/35‑1 (MQ=255) tCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGt < 1:1523622/35‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGTgg < 1:4120451/35‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGCgg < 1:5183014/35‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGGCATTGGTGAAAACCACTGGGGTgg < 1:6536690/35‑1 (MQ=255) CTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGTggg < 1:8281061‑M1/35‑1 (MQ=255) CTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGTggg < 1:20151774‑M1/35‑1 (MQ=255) CTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGTggg < 1:3450504‑M1/35‑1 (MQ=255) CTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGTggg > 1:10073672‑M1/1‑35 (MQ=255) | CCGCGTTTTCATGCCGGTCAGGAGGTGTTACTCACTGGCTGGGGCGTTGGTGAAAACCACTGGGGTGGG > REL606/3331597‑3331665 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |