New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 76423 = | 43 (0.420) | 4 (0.050) | 3/36 | NT | 7.3% | coding (903/1611 nt) | thiP | thiamin ABC transporter membrane protein |
? | REL606 | = 3891004 | 69 (0.900) | coding (451/1497 nt) | yieN | fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein |
CATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/76462‑76423 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctgGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACA < REL606/3891004‑3890971 CATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGC < 1:18914987/35‑1 CATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGC > 1:15951402/1‑35 CATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGC < 1:7590314/35‑1 CATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGC > 1:7671599/1‑35 CATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGC < 1:11009523/35‑1 ATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCT > 1:19465715/1‑35 ATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCT < 1:16789002/35‑1 ATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCT < 1:7323752/35‑1 ATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCT < 1:16625113/35‑1 ATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCT < 1:11839992/35‑1 ATTTGCGACACGGTGCTAATTGTGCTGGCGCTGCT < 1:20256364/35‑1 TTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTG < 1:4827397/35‑1 TTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTG < 1:485164/35‑1 TTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTG > 1:5061456/1‑35 TTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTG > 1:16042235/1‑35 TTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTG < 1:6897726/35‑1 TTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTG < 1:9851931/35‑1 TTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTG > 1:7733075/1‑35 TTGCGGCACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGC < 1:19352989/35‑1 TTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGC < 1:422323/35‑1 TTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGC > 1:7574305/1‑35 TTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGC > 1:9916275/1‑35 TTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGC > 1:19084260/1‑35 TTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGC > 1:16208044/1‑35 TGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCT < 1:7256508/35‑1 TGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCT > 1:8106688/1‑35 TGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCT < 1:9571102/35‑1 GCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTG < 1:19825378/35‑1 CGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGG > 1:18123404/1‑35 CGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCCGG > 1:733036/1‑35 ACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTTGTt > 1:5034668/1‑34 ACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTG > 1:5268836/1‑35 CACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTGc > 1:16563706/1‑34 ACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTtgt > 1:17756461/1‑32 ACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTtgt > 1:5493073/1‑32 ACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTtct > 1:5382211/1‑32 ACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTGct > 1:9234295/1‑33 CGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTGTCG > 1:15622777/1‑35 GTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTGGCGGC > 1:17507027/1‑35 GTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTGGCGGC > 1:8725569/1‑35 TGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTGGTGGCGGCC > 1:5013909/1‑35 CTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCCGAAGa > 1:950249/1‑34 CTGCTGGGGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGC < 1:19045485/35‑1 TGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCA > 1:17392045/1‑35 TGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCA < 1:13071199/35‑1 GCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCcg > 1:7673318/1‑33 GCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAG < 1:15326957/35‑1 GCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAG < 1:14503025/35‑1 GCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAG < 1:14474871/35‑1 GCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAG < 1:8258067/35‑1 GCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAG > 1:9009567/1‑35 GCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGATGCCGGAAGCAG < 1:274902/35‑1 CTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGA > 1:15556762/1‑35 CTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGA > 1:16650960/1‑35 TGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGAC > 1:8736859/1‑35 TGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGAC > 1:13135895/1‑35 GGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACA > 1:13734953/1‑35 GGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACA < 1:16165298/35‑1 CATTTGCGACACGGTGTTAATTGTGCTGGCGCTGCTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/76462‑76423 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctgGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACA < REL606/3891004‑3890971 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |