Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
JC JC REL606 3,517,306 IS186 (+) +8 bp :: Δ2 56.2% coding (187‑194/1743 nt) ggt ← gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? REL606 590715 =NA (NA)34 (0.380) 22/42 NT 41.2% noncoding (1/1343 nt) IS186 repeat region
?REL606 = 3517313 30 (0.540)coding (187/1743 nt) ggt gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor
* ? REL606 = 2774194NA (NA)52 (0.530) 28/46 NT 47.8% noncoding (1341/1343 nt) IS186 repeat region
?REL606 3517306 = 37 (0.580)coding (194/1743 nt) ggt gamma‑glutamyltranspeptidase periplasmic precursor

Only 100 of 224 total aligned reads displayed.

GGCGGCATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCCAC  >  REL606/3517272‑3517340
                                  |                                  
ggcggcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGa                                    >  1:19030814/1‑35 (MQ=255)
ggcggcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGa                                    >  1:7976850/1‑35 (MQ=255)
ggcggcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGa                                    >  1:11018692/1‑35 (MQ=255)
 gcggcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGat                                   <  1:18098403/35‑1 (MQ=255)
   ggcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGatat                                 >  1:12316794/1‑35 (MQ=255)
   ggcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGatat                                 >  1:4343927/1‑35 (MQ=255)
   agatggttcaacccttaagttagcgcttatgatat                                 <  1:14762480‑M2/4‑1 (MQ=255)
    gtaTCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATc                                <  1:3885650/33‑1 (MQ=255)
    gcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATc                                <  1:4740725/35‑1 (MQ=255)
    gcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATc                                >  1:3778033/1‑35 (MQ=255)
    gcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATc                                >  1:1699578/1‑35 (MQ=255)
    gcATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATc                                <  1:11879539/35‑1 (MQ=255)
    gatggttcaacccttaagttagcgcttatgATATc                                <  1:2474991‑M2/5‑1 (MQ=255)
    gatggttcaacccttaagttagcgcttatgATATc                                <  1:9367588‑M2/5‑1 (MQ=255)
     cATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATcc                               <  1:3072239/35‑1 (MQ=255)
     atggttcaacccttaagttagcgcttatgATATcc                               >  1:15395951‑M2/30‑35 (MQ=255)
     atggttcaacccttaagttagcgcttatgATATcc                               <  1:10854387‑M2/6‑1 (MQ=255)
      tggttcaacccttaagttagcgcttatgATATCCa                              >  1:6746172‑M2/29‑35 (MQ=255)
      aTCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCa                              <  1:13160615/35‑1 (MQ=255)
      aTCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCa                              >  1:17652773/1‑35 (MQ=255)
      aTCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCa                              >  1:8136786/1‑35 (MQ=255)
      aTCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCa                              <  1:7152327/35‑1 (MQ=255)
      aTCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCa                              <  1:15020954/35‑1 (MQ=255)
      aTCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATACa                              >  1:16493634/1‑35 (MQ=255)
       tCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCag                             >  1:8389208/1‑34 (MQ=255)
       tCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCAc                             <  1:10559467/35‑1 (MQ=255)
       tCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCAc                             <  1:7666085/35‑1 (MQ=255)
       tCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCAc                             <  1:1258034/35‑1 (MQ=255)
       tCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCAc                             >  1:20529180/1‑35 (MQ=255)
        gttcaacccttaagttagcgcttatgATATCCAcc                            <  1:158722‑M2/9‑1 (MQ=255)
        cAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACc                            <  1:14856814‑M2/35‑2 (MQ=255)
        cAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACc                            <  1:7022537‑M2/35‑2 (MQ=255)
          aCGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACccc                          >  1:18853787‑M2/1‑32 (MQ=255)
          aCGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACccc                          >  1:1642104‑M2/1‑32 (MQ=255)
          aCGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACccc                          <  1:1575225‑M2/35‑4 (MQ=255)
          aCGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACccc                          <  1:2935386‑M2/35‑4 (MQ=255)
           caacccttaagttagcgcttatgATATCCAccccc                         <  1:8598031‑M2/12‑1 (MQ=255)
           cGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACccca                         >  1:16231546‑M2/1‑31 (MQ=255)
            ggCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccat                        >  1:6919031‑M2/1‑30 (MQ=255)
            ggCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCa                        <  1:20603216/35‑1 (MQ=255)
            ggCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCa                        <  1:8907556/35‑1 (MQ=255)
            ggCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCa                        <  1:5596979/35‑1 (MQ=255)
            aacccttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCa                        <  1:1598886‑M2/13‑1 (MQ=255)
             gCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCAAcccata                       >  1:13961622‑M2/1‑29 (MQ=255)
             acccttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCAc                       >  1:18066939‑M2/22‑35 (MQ=255)
              cATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccataa                      >  1:6436929‑M2/1‑28 (MQ=255)
              cATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCAcc                      <  1:14072894/35‑1 (MQ=255)
              cATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCAACCCCCAcc                      <  1:7473494/35‑1 (MQ=255)
               ccttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCt                     >  1:3840624‑M2/20‑35 (MQ=255)
               ccttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCt                     <  1:5330067‑M2/16‑1 (MQ=255)
               ccttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCt                     >  1:4255355‑M2/20‑35 (MQ=255)
               aTTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccataag                     <  1:11341830‑M2/35‑9 (MQ=255)
               aTTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccataag                     <  1:9568272‑M2/35‑9 (MQ=255)
               aTTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCt                     <  1:18363625/35‑1 (MQ=255)
               aTTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCt                     <  1:4205726/35‑1 (MQ=255)
                ttCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccataagc                    <  1:19654505‑M2/35‑10 (MQ=255)
                cttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTg                    >  1:19577918‑M2/19‑35 (MQ=255)
                cttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTg                    <  1:2684643‑M2/17‑1 (MQ=255)
                 ttaagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGa                   <  1:17034885‑M2/18‑1 (MQ=255)
                 tCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccataagcg                   <  1:3514298‑M2/35‑11 (MQ=255)
                  cccGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccataagcgc                  <  1:11711293‑M2/35‑12 (MQ=255)
                  cccGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCTGag                  >  1:12448828/1‑35 (MQ=255)
                   ccGCCCTCCTTGAGGATATCCACcccataagcgct                 <  1:12713030‑M2/35‑13 (MQ=255)
                   ccGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCTGagt                 >  1:9652288/1‑35 (MQ=255)
                   aagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGagt                 >  1:5885461‑M2/16‑35 (MQ=255)
                   aagttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGagt                 >  1:6025790‑M2/16‑35 (MQ=255)
                    cGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCTGagtg                <  1:20466816/35‑1 (MQ=255)
                     gttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGagtgg               <  1:2305173‑M2/22‑1 (MQ=255)
                     gttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGagtgg               <  1:7218555‑M2/22‑1 (MQ=255)
                     gCCCTCCTTGAGCATATCCACCCCCACCTGagtgg               >  1:784272/1‑35 (MQ=255)
                     gCCCTCCNTGAGGATATCCACCCCCNCCTGagtgg               >  1:5204290/1‑35 (MQ=255)
                     ctcctcctTGAGGATATCCACCCCCACCTGagtgg               <  1:10018741/33‑1 (MQ=255)
                      ttagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGagtggc              <  1:17122041‑M2/23‑1 (MQ=255)
                      cccTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCTGagtggc              <  1:11864198/35‑1 (MQ=255)
                       tagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGagtggca             <  1:18521238‑M2/24‑1 (MQ=255)
                       tagcgcttatgATATCCACCCCCACCTGagtggca             >  1:4700682‑M2/12‑35 (MQ=255)
                       cctcctTGAGGATATCCACCCCCACCTGagtggca             >  1:10761003/1‑35 (MQ=255)
                       cctcctTGAGGATATCCACCCCCACCTGagtggca             <  1:7573586/35‑1 (MQ=255)
                        ctcctTGAGGATATCCACcccataagcgctaactt            >  1:10404178‑M2/1‑18 (MQ=255)
                        ctcatTGAGGATATCCACCCCCACCTGagtggcag            <  1:10733499/35‑1 (MQ=255)
                        agcgcttatgATATCAACCCCCACCTGagtggcag            <  1:1710257‑M2/25‑1 (MQ=255)
                         tcctTGAGGATATCCACCCCCACCTGagtggcagt           <  1:11540476/35‑1 (MQ=255)
                         gcgcttatgATATCCACCCCCACCTgagtggcagg           >  1:576251‑M2/10‑34 (MQ=255)
                          cctTGAGGATATCCACcccataagcgctaacttaa          >  1:501666‑M2/1‑16 (MQ=255)
                          cctTGAGGATATCCACcccataagcgctaacttaa          >  1:15575749‑M2/1‑16 (MQ=255)
                           gcttatgATATCCACCCCCACCTGagtggcagtgg         <  1:2754140‑M2/28‑1 (MQ=255)
                            ttGAGGATATCCACcccataagcgctaacttaagg        <  1:14508016‑M2/35‑22 (MQ=255)
                            ttGAGGATATCCACCCCCACCTGagtggcagtggc        <  1:19376479/35‑1 (MQ=255)
                            cttatgATATCCACCCACACCTGagtggcagtggc        <  1:10935883‑M2/29‑1 (MQ=255)
                             ttaggATATCCACcccataagcgctaacttaaggg       <  1:18729316‑M2/33‑23 (MQ=255)
                             tGAGGATATCCACcccataagcgctaacttaaggg       <  1:3060388‑M2/35‑23 (MQ=255)
                              gAGGATATCCACaccataagcgctaacttaagggt      >  1:4357556‑M2/1‑12 (MQ=255)
                              gAGGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGt      <  1:9292287/35‑1 (MQ=255)
                              gAGGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGt      <  1:3987416/35‑1 (MQ=255)
                               atgATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTc     <  1:8741824‑M2/32‑1 (MQ=255)
                               aGGATATCCACcccataagcgctaacttaagggtt     >  1:20601331‑M2/1‑11 (MQ=255)
                                tgATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTcc    <  1:16846064‑M2/33‑1 (MQ=255)
                                tgATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTcc    <  1:17908144‑M2/33‑1 (MQ=255)
                                tgATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTcc    <  1:20073057‑M2/33‑1 (MQ=255)
                                 gATATCCACcccataagcgctaacttaagggttgt   >  1:13479754‑M2/1‑9 (MQ=255)
                                  |                                  
GGCGGCATCAACGGCATTCCCGCCCTCCTTGAGGATATCCACCCCCACCTGAGTGGCAGTGGCGTCCAC  >  REL606/3517272‑3517340

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.