New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 365501 = | 115 (1.120) | 5 (0.060) | 3/40 | NT | 6.1% | coding (1217/1221 nt) | sbmA | predicted transporter |
? | REL606 | = 3726074 | 57 (0.670) | coding (49/1545 nt) | yibO | phosphoglyceromutase |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
AAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTT > REL606/3726040‑3726108 | aaaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGatggctatg < 1:10767905/35‑1 (MQ=255) aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg < 1:15183140‑M2/35‑2 (MQ=255) aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg > 1:6058868‑M2/1‑34 (MQ=255) aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg > 1:14188222‑M2/1‑34 (MQ=255) aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg > 1:18226268‑M2/1‑34 (MQ=255) aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg < 1:18108296‑M2/35‑2 (MQ=255) aaaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGg > 1:10367937‑M2/1‑34 (MQ=255) aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc > 1:13070369‑M2/1‑33 (MQ=255) aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc < 1:17190513‑M2/35‑3 (MQ=255) aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc < 1:12087621‑M2/35‑3 (MQ=255) aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc > 1:8672027‑M2/1‑33 (MQ=255) aaCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgc < 1:10806026‑M2/35‑3 (MQ=255) aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGggt < 1:2515620‑M2/35‑4 (MQ=255) aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct < 1:11883301‑M2/35‑4 (MQ=255) aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct > 1:12555162‑M2/1‑32 (MQ=255) aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct < 1:18911531‑M2/35‑4 (MQ=255) aCCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct > 1:18537103‑M2/1‑32 (MQ=255) aCATATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgct > 1:1893226‑M2/1‑32 (MQ=255) ccTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgcta > 1:8422214‑M2/1‑31 (MQ=255) ccTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgcta < 1:7437240‑M2/35‑5 (MQ=255) catatGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgcta > 1:8285652‑M2/3‑31 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat < 1:15887577/35‑1 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat < 1:17583559/35‑1 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat < 1:5138574/35‑1 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat < 1:9535986/35‑1 (MQ=255) cTATGGTACTGGTGATTCTGGATggctatggctat < 1:14789589/35‑1 (MQ=255) tATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaa < 1:13672568‑M2/35‑7 (MQ=255) tATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATc < 1:12312073/35‑1 (MQ=255) aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaa < 1:14808048‑M2/35‑8 (MQ=255) aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaa < 1:6843407‑M2/35‑8 (MQ=255) aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCg < 1:19376600/35‑1 (MQ=255) aTGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCg < 1:16481383/35‑1 (MQ=255) tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt < 1:20556737/35‑1 (MQ=255) tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt < 1:7277524/35‑1 (MQ=255) tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt < 1:20340669/35‑1 (MQ=255) tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGt < 1:7389348/35‑1 (MQ=255) ggTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTg < 1:15919425/35‑1 (MQ=255) ggTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATAGTg < 1:5758563/35‑1 (MQ=255) gTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTga < 1:19275017/35‑1 (MQ=255) gTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTga < 1:5400518/35‑1 (MQ=255) gTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTga < 1:8811193/35‑1 (MQ=255) tACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaa < 1:9252627‑M2/35‑12 (MQ=255) tACTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaa < 1:18378934‑M2/35‑12 (MQ=255) tACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaa < 1:17163093/35‑1 (MQ=255) aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaaggag < 1:8732291‑M2/35‑13 (MQ=255) aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaaggaa < 1:10012098‑M2/35‑13 (MQ=255) aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaaa < 1:15154209‑M2/35‑13 (MQ=255) aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaagaaa < 1:17076010‑M2/35‑13 (MQ=255) aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaag < 1:9647749/35‑1 (MQ=255) aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaag < 1:16369061/35‑1 (MQ=255) cTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaaga < 1:9576356/35‑1 (MQ=255) cTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaaga < 1:11803508/35‑1 (MQ=255) cTGGTGATCCTGGATGGCTATGgctaaaaaggaga < 1:5898566‑M2/35‑14 (MQ=255) tGGTGATTCTGGATGGCTATGgctaaaaaggagaa < 1:2803368‑M2/35‑15 (MQ=255) tGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaagaa < 1:17070920/35‑1 (MQ=255) tGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaagaa < 1:7578771/35‑1 (MQ=255) tGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTgaagaa < 1:11835636/35‑1 (MQ=255) ggTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAc < 1:5447620/35‑1 (MQ=255) ggTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAc < 1:13175817/35‑1 (MQ=255) ggTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAc < 1:10187821/35‑1 (MQ=255) gTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAca < 1:8322811/35‑1 (MQ=255) gTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAca < 1:3112164/35‑1 (MQ=255) gTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAca < 1:18124437/35‑1 (MQ=255) tGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcag < 1:7326826/35‑1 (MQ=255) tGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcag < 1:9431231/35‑1 (MQ=255) tGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcag < 1:9677419/35‑1 (MQ=255) tGATTCTGGATGGCTATGGCTAAAATgaagaaaaa > 1:9302022/1‑32 (MQ=19) tGATTCTGGATGGCTATGGCTAAAATgaagaaaaa > 1:14743214/1‑32 (MQ=19) gATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagc < 1:1435081/35‑1 (MQ=255) gATTCGGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagc < 1:1773040/35‑1 (MQ=255) aTTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagca < 1:19743597/35‑1 (MQ=255) aTTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagca < 1:3772673/35‑1 (MQ=255) aTTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagca < 1:4011474/35‑1 (MQ=255) aTTCTGGATGGCTATAGCTATCGTGAAGAAcagca < 1:13122688/35‑1 (MQ=255) ttCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagcag < 1:9209641/35‑1 (MQ=255) ttCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAAcagcag < 1:3086908/35‑1 (MQ=255) tGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGAt < 1:5108261/35‑1 (MQ=255) tGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGAt < 1:8333197/35‑1 (MQ=255) tGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGAt < 1:1359343/35‑1 (MQ=255) ggATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATa < 1:15273435/35‑1 (MQ=255) ggATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATa < 1:6405067/35‑1 (MQ=255) gATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATaa < 1:19403159/35‑1 (MQ=255) gATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATaa < 1:15697483/35‑1 (MQ=255) gATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATaa < 1:15418865/35‑1 (MQ=255) atggctatggctATCGTGAAGAACAGCAGGATAAc < 1:16036665/35‑1 (MQ=255) atggctatggctATCGTGAAGAACAGCAGGATAAc < 1:4752756/35‑1 (MQ=255) atggctatggctATCGTGAAGAACAGCAGGATAAc < 1:4647820/35‑1 (MQ=255) tggctatggctaTCGTGAAGAACAGCAGGATAACg < 1:2183423/35‑1 (MQ=255) ggctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGc < 1:18294294/35‑1 (MQ=255) ggctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGc < 1:1638738/35‑1 (MQ=255) ggctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGc < 1:8126130/35‑1 (MQ=255) gctatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGcc < 1:6824108/35‑1 (MQ=255) tatggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAt < 1:13566693/35‑1 (MQ=255) atggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtt < 1:6998817/35‑1 (MQ=255) tggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAttt < 1:8387007/35‑1 (MQ=255) tggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAttt < 1:14143384/35‑1 (MQ=255) ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtttt < 1:11373723/35‑1 (MQ=255) ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtttt < 1:15388365/35‑1 (MQ=255) ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCAtttt > 1:4417291/1‑35 (MQ=255) ggctatCGTGAAGAACAGCAGGATAAAGCCAtttt > 1:8745932/1‑35 (MQ=255) | AAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGTGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTT > REL606/3726040‑3726108 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |