New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3190470 = | 58 (0.560) | 12 (0.120) | 5/46 | NT | 19.7% | coding (511/1269 nt) | yhaO | predicted transporter |
? | REL606 | 4585732 = | 42 (0.430) | coding (509/1023 nt) | yjjN | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CACATTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGAA > REL606/3190436‑3190504 | gacaTTCCCCCCATCGACACGCCCAGCGCCGCGac < 1:8492216/34‑1 (MQ=255) acaTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacc > 1:13864183/1‑35 (MQ=255) acaTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacc > 1:3856469/1‑35 (MQ=255) acaTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacc > 1:16414484/1‑35 (MQ=255) acaTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacc > 1:5392770/1‑35 (MQ=255) acaTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacc > 1:17315742/1‑35 (MQ=255) acaTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacc > 1:6729045/1‑35 (MQ=255) caTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacca > 1:4148682/1‑35 (MQ=255) caTACCCGCCATCGACACGCCCAGCGCCGCGacca < 1:842732/35‑1 (MQ=25) atccccCCCATCGACACGCCCAGCGCCGCGaccac < 1:611668/32‑1 (MQ=25) aTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGaccac < 1:1945289/35‑1 (MQ=255) aTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGaccac > 1:14222288/1‑35 (MQ=255) aTTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGaccac > 1:3172046/1‑35 (MQ=255) tCCCACCATCGACACGCCCAGCTCCGCGAccacca > 1:2789658/1‑35 (MQ=255) ccaccaTCTACACGCCCAGCGCCGCGACCACcagc > 1:12654576/1‑35 (MQ=255) caccaTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACcagca > 1:3709025/1‑35 (MQ=255) accaTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACcagcag > 1:591677/1‑35 (MQ=255) accaTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACcagcag > 1:4264457/1‑35 (MQ=255) ccaTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCagcagc > 1:20202636/1‑35 (MQ=255) ccaTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCagcagc > 1:10433541/1‑35 (MQ=255) caTCGACACGCCCAGCGCCGCTACCACCAGCAGCt > 1:13381974/1‑35 (MQ=255) caTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCt > 1:12032178/1‑35 (MQ=255) caTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCt > 1:18475374/1‑35 (MQ=255) aTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCtt > 1:10140740/1‑35 (MQ=255) aTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCtt > 1:10901965/1‑35 (MQ=255) aTCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCtt > 1:15562030/1‑35 (MQ=255) tCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTg > 1:9211735/1‑35 (MQ=255) tCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTg > 1:16648748/1‑35 (MQ=255) cGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTgg > 1:11967903/1‑35 (MQ=255) cGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTgg > 1:5810022/1‑35 (MQ=255) cGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTgg > 1:15912946/1‑35 (MQ=255) cGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTgg > 1:1412359/1‑35 (MQ=255) gACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGt > 1:3557822/1‑35 (MQ=255) gACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGt > 1:9454235/1‑35 (MQ=255) cacGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCa > 1:6815342/1‑35 (MQ=255) cacGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCa > 1:17637158/1‑35 (MQ=255) acGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAg > 1:7148771/1‑35 (MQ=255) acGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAg > 1:13242553/1‑35 (MQ=255) acGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAg > 1:3234958/1‑35 (MQ=255) cGCCCAGCGCCGCGACCACCGGCAGGCTGGTCCGc > 1:18533246/1‑35 (MQ=12) cGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGc > 1:4110413/1‑35 (MQ=255) gCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCa > 1:13575252/1‑35 (MQ=255) gCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCa > 1:13041665/1‑35 (MQ=255) gCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCa > 1:7927565/1‑35 (MQ=255) cccAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCAc > 1:14159581/1‑35 (MQ=255) cccAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCAc > 1:16496996/1‑35 (MQ=255) cccAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCAc > 1:6953548/1‑35 (MQ=255) cgcgcgcCGCGCCCACCAGCAGCTTGGTCAGCAcc < 1:869518/32‑1 (MQ=25) ccAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCAcc > 1:4329571/1‑35 (MQ=255) ccAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCAcc > 1:4684728/1‑35 (MQ=255) ccAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCAcc > 1:6135598/1‑35 (MQ=255) ccAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCAcc > 1:14634824/1‑35 (MQ=255) cggccccccccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCa > 1:13853646‑M1/12‑35 (MQ=255) cgcccccgcccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCa > 1:675483‑M1/12‑35 (MQ=255) cAGCGCCGCGCCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCa < 1:19045501/35‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCa > 1:12524641/1‑35 (MQ=255) ggccccgcgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCAt > 1:20287833‑M1/11‑35 (MQ=255) agccccgcgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCAt > 1:11840951‑M1/11‑35 (MQ=255) aGCGCCGCGCCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCAt < 1:11984297/35‑1 (MQ=255) aGCGCCGCGCCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCAt < 1:7854963/35‑1 (MQ=255) aGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCAt > 1:4561413/1‑35 (MQ=255) aGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCAt > 1:11142325/1‑35 (MQ=255) gcgcCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATg > 1:14440760/1‑35 (MQ=255) gccccgcgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATg > 1:2914075‑M1/10‑35 (MQ=255) gccccgcccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATg > 1:5544946‑M1/10‑35 (MQ=255) cgccgcGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGc > 1:9734091/1‑35 (MQ=255) cgccgcGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGc > 1:4459139/1‑35 (MQ=255) cgccgcGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGc > 1:5701492/1‑35 (MQ=255) cgccgcGACCACAAGCAGCTTGGTCAGCACCATGc < 1:4702289/35‑1 (MQ=255) ccccgcccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGc > 1:1986747‑M1/9‑35 (MQ=255) ccccgcccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCAACATGc > 1:13242958‑M1/9‑35 (MQ=255) ccccccccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGc > 1:15049191‑M1/9‑35 (MQ=255) gccgcGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGcc > 1:18425627/1‑35 (MQ=255) cccgcgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGcc > 1:14252824‑M1/8‑35 (MQ=255) ncggccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCg > 1:20615978‑M1/7‑35 (MQ=255) ccgcGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCg > 1:20215846/1‑35 (MQ=255) cgcgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCgg > 1:19206156‑M1/6‑35 (MQ=255) cgcgACCACCAGCATCTTGGTCAGCACCATGCCgg > 1:2005171/1‑35 (MQ=255) cgcccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCgg > 1:19376094‑M1/6‑35 (MQ=255) cccccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCgg > 1:8646032‑M1/6‑35 (MQ=255) gcgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGt > 1:10718703‑M1/5‑35 (MQ=255) gcgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGt > 1:15586999‑M1/5‑35 (MQ=255) gcgACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGt > 1:4214024/1‑35 (MQ=255) gcgACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGt > 1:2446270/1‑35 (MQ=255) cgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTc > 1:11371999‑M1/4‑35 (MQ=255) cgcCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTc > 1:5661890‑M1/4‑35 (MQ=255) cgACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTc > 1:14549226/1‑35 (MQ=255) cccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTc > 1:6974053‑M1/4‑35 (MQ=255) cccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTc > 1:19283847‑M1/4‑35 (MQ=255) cccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTc > 1:18551789‑M1/4‑35 (MQ=255) gACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCg > 1:18209240/1‑35 (MQ=255) ccCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCg > 1:4776801‑M1/3‑35 (MQ=255) cCCCCCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGa > 1:19151639‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGa > 1:19973809‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGa > 1:14047314‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGa > 1:6214916‑M1/2‑35 (MQ=255) accaccAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGa > 1:14622170/1‑35 (MQ=255) accaccAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGa > 1:14132848/1‑35 (MQ=255) accaccAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGa > 1:931049/1‑35 (MQ=255) CCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGaa > 1:14195444‑M1/1‑35 (MQ=255) | CACATTCCCACCATCGACACGCCCAGCGCCGCGACCACCAGCAGCTTGGTCAGCACCATGCCGGTCGAA > REL606/3190436‑3190504 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |