New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 894104 = | 69 (0.670) | 17 (0.200) | 5/40 | NT | 21.9% | coding (646/1767 nt) | ECB_00833 | Terminase, ATPase subunit |
? | REL606 | = 2195255 | 64 (0.750) | coding (108/837 nt) | yeiG | predicted esterase |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TTAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTGC > REL606/894070‑894138 | ttAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccac > 1:14005084/1‑35 (MQ=255) ttAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccac < 1:18398297/35‑1 (MQ=255) ttAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccac < 1:18862619/35‑1 (MQ=255) ctgcccgatgacgttcagtatctttctcccccccc > 1:16792981‑M1/35‑35 (MQ=255) ctgcccgatgacgttcagtatctttctcccccccc > 1:16516819‑M1/35‑35 (MQ=255) ctgcccgatgacgttcagtatctttctcccccccc > 1:17614681‑M1/35‑35 (MQ=255) ctgcccgatgacgttcagtatctttctcccccccc < 1:15920615‑M1/1‑1 (MQ=255) atgcccgatgacgttcagtatctttctcccccccc < 1:4244187‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcccgatgacgttcagtatctttctccccccccc < 1:3014357‑M1/2‑1 (MQ=255) tgcccgatgacgttcagtatctctctccccccccc > 1:3795378‑M1/34‑35 (MQ=255) tAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacc < 1:1934475/35‑1 (MQ=255) tAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacc > 1:19275842/1‑35 (MQ=255) tAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacc > 1:17486398/1‑35 (MQ=255) tAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacc > 1:3560434/1‑35 (MQ=255) gcccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCt > 1:20374731‑M1/33‑35 (MQ=255) gcccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCt < 1:20396285‑M1/3‑1 (MQ=255) gcccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCt > 1:6904483‑M1/33‑35 (MQ=255) gcccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCt > 1:8563757‑M1/33‑35 (MQ=255) aGGAAGCCCTATCGGATCGCCTTTCAGctccacct < 1:11057408/35‑1 (MQ=255) aGGAAGCACTATCGGATCGCCCTTCCGctccacct > 1:3717917/1‑35 (MQ=37) ggAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacctc > 1:534869/1‑35 (MQ=255) ggAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacctc > 1:7466103/1‑35 (MQ=255) cccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCTc > 1:17411387‑M1/32‑35 (MQ=255) cccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCTc < 1:14272057‑M1/4‑1 (MQ=255) cccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCTc > 1:4923512‑M1/32‑35 (MQ=255) cccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCTc > 1:11730036‑M1/32‑35 (MQ=255) cccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCTc < 1:11491507‑M1/4‑1 (MQ=255) cccgatgacgttcagtatctttctcccccccCCTc > 1:9030087‑M1/32‑35 (MQ=255) gAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacctcc > 1:17253154/1‑35 (MQ=255) aaGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacctcca > 1:12177966/1‑35 (MQ=255) aaGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccacctcca > 1:5104112/1‑35 (MQ=255) aaGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccaccccca > 1:2443377/1‑35 (MQ=255) aaGCACTATCGGATCGCCTTTCAGctccaccccca > 1:11922075/1‑35 (MQ=255) aaGCACTATCGGATCGCCTTTAAGctccacctcca < 1:4909083/35‑1 (MQ=255) gCACTATCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCAct > 1:1707314/1‑35 (MQ=255) gCACTATCGGATCCCCTTTCAGCTCCACCTCAAct < 1:10044819/35‑1 (MQ=37) cACTATCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCActt > 1:6110287/1‑35 (MQ=255) aCTATCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCActtc > 1:12898481/1‑35 (MQ=255) aCTATCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCActtc > 1:8817920/1‑35 (MQ=255) cTATCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCActtct > 1:3293164/1‑35 (MQ=255) ctCGGGTCCCCTTTCCCCCCCCCCTCCACTTCttt < 1:1252133/34‑1 (MQ=9) aTCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTACACTTCttt < 1:14658964/35‑1 (MQ=255) cGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCttttg > 1:3252552/1‑33 (MQ=255) cGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTgg > 1:10372115/1‑35 (MQ=255) ggATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGc > 1:14040249/1‑35 (MQ=255) ggATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGc > 1:9310257/1‑35 (MQ=255) gATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCg > 1:13943075/1‑35 (MQ=255) gATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCg > 1:14846289/1‑35 (MQ=255) aTCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGa > 1:18685779/1‑35 (MQ=255) aTCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGa > 1:6523327/1‑35 (MQ=255) tCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGaa > 1:5246748/1‑35 (MQ=255) tCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGaa > 1:5796346/1‑35 (MQ=255) cccccTTCCAGCCCCCCCTCCACTTCTTTGGCGaa < 1:8173861/32‑1 (MQ=19) cccccTTCCACCCCCCCCTCCACTTCTTTGGCGaa < 1:9127980/32‑1 (MQ=12) cGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAg > 1:319532/1‑35 (MQ=255) cGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAg > 1:10431402/1‑35 (MQ=255) cccTTTCCCCCCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGt < 1:2809389/34‑1 (MQ=25) ctttcccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTc > 1:6641186‑M1/14‑35 (MQ=255) ccTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTc > 1:10402852/1‑35 (MQ=255) ccTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTc > 1:4466425/1‑35 (MQ=255) ccTTCCACCCCCCCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTc < 1:2319600/35‑1 (MQ=19) tttcccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCg > 1:6528053‑M1/13‑35 (MQ=255) cTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCg > 1:15860459/1‑35 (MQ=255) cTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGACGAAGTCg > 1:7669609/1‑35 (MQ=255) tttCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCga > 1:2121914/1‑35 (MQ=255) tcccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgat > 1:18808425‑M1/11‑35 (MQ=255) tcccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgat > 1:3865143‑M1/11‑35 (MQ=255) ccccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgat > 1:5279337‑M1/11‑35 (MQ=255) ccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgatga > 1:7139552‑M1/9‑35 (MQ=255) ccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgatga > 1:17329134‑M1/9‑35 (MQ=255) ccccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgatga > 1:20527947‑M1/9‑35 (MQ=255) cAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgatga > 1:14576950/1‑35 (MQ=255) cAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgatga > 1:2753382/1‑35 (MQ=255) aGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCgatgat > 1:3904554/1‑35 (MQ=255) gCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGatgatg > 1:796792/1‑35 (MQ=255) gCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGatgatg > 1:11342946/1‑35 (MQ=255) ccccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGatgatg > 1:16501825‑M1/7‑35 (MQ=255) cccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGt > 1:10747719‑M1/6‑35 (MQ=255) cccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGt > 1:1571554‑M1/6‑35 (MQ=255) cccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGt > 1:4118436‑M1/6‑35 (MQ=255) tccacctccacTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTa > 1:1495919/1‑35 (MQ=255) tccacctccacTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTa > 1:7993842/1‑35 (MQ=255) ccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTa > 1:6951404‑M1/5‑35 (MQ=255) ccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTa > 1:863455‑M1/5‑35 (MQ=255) ccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTa > 1:16102970‑M1/5‑35 (MQ=255) ccccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTa > 1:5533301‑M1/5‑35 (MQ=255) ccacctccacTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTAc > 1:12483545/1‑35 (MQ=255) ccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACt > 1:1833631‑M1/3‑35 (MQ=255) ccCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACt > 1:7357826‑M1/3‑35 (MQ=255) cacctccacTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACt > 1:13133841/1‑35 (MQ=255) cCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTg > 1:4336217‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTg > 1:1961598‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTg > 1:19671105‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTg > 1:4432153‑M1/2‑35 (MQ=255) cCCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTg > 1:3978737‑M1/2‑35 (MQ=255) acctccacTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTg > 1:19784295/1‑35 (MQ=255) acctccacTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGGACTg > 1:4803715/1‑35 (MQ=255) CCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTGc > 1:14195861‑M1/1‑35 (MQ=255) CCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTGc < 1:18186200‑M1/35‑1 (MQ=255) CCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTGc > 1:13105481‑M1/1‑35 (MQ=255) | TTAGGAAGCACTATCGGATCGCCTTTCAGCTCCACCTCCACTTCTTTGGCGAAGTCGATGATGTACTGC > REL606/894070‑894138 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |