New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 223959 = | 46 (0.450) | 15 (0.180) | 4/38 | NT | 24.3% | coding (503/654 nt) | metI | DL‑methionine transporter subunit |
? | REL606 | 1306336 = | 57 (0.700) | intergenic (‑97/+274) | cls/kch | cardiolipin synthetase/voltage‑gated potassium channel |
TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/223997‑223959 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcggGGGCGGGGGTAT > REL606/1306336‑1306347 TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGTGTGGTGCAG > 1:19893343/1‑35 TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAG > 1:14056326/1‑35 TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAG < 1:12465270/35‑1 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT > 1:6816037/1‑35 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT > 1:15977354/1‑35 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT > 1:18369384/1‑35 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT < 1:8934784/35‑1 ACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGT < 1:19105680/35‑1 CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTTGTGCAGTC > 1:8795178/1‑35 CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC > 1:15169374/1‑35 CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC < 1:8613168/35‑1 CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC < 1:11698830/35‑1 CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC < 1:2132150/35‑1 CCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTC < 1:10895649/35‑1 CCCTGGTCGGTTATTACGCGATGGGTGGTGCAGTC < 1:10517777/35‑1 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG < 1:19630142/35‑1 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG > 1:7184598/1‑35 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG > 1:7210668/1‑35 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG < 1:20509984/35‑1 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG < 1:2783592/35‑1 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG < 1:14503612/35‑1 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG < 1:10783638/35‑1 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCG > 1:5995340/1‑35 CCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGGGCAGTCG > 1:19307743/1‑35 aTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG < 1:5472358/34‑1 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG > 1:18504909/1‑35 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG < 1:1291744/35‑1 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG < 1:18931252/35‑1 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG < 1:12830186/35‑1 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG < 1:3844474/35‑1 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG < 1:11522473/35‑1 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG > 1:10979026/1‑35 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG > 1:5357839/1‑35 CTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG < 1:13936920/35‑1 TGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGG > 1:16298736/1‑35 GGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGG > 1:3396135/1‑35 GGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGG > 1:3290402/1‑35 GGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGG > 1:2218998/1‑35 GGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGG > 1:16871473/1‑35 GGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGG > 1:9702329/1‑35 CGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCNNGGGNN > 1:11723217/1‑35 CGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGgg > 1:5854485/1‑33 CGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCc > 1:1350007/1‑34 CGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCG > 1:9465737/1‑35 GGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGG > 1:4920713/1‑35 GTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGG > 1:9991549/1‑35 GTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGG > 1:3217012/1‑35 GTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGG > 1:10945539/1‑35 TTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGG > 1:4448451/1‑35 TTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGG > 1:1155530/1‑35 TATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGG > 1:4519618/1‑35 TATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGG > 1:11612446/1‑35 TATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGG > 1:10431294/1‑35 TATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCCGGGG > 1:735588/1‑35 ATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGg > 1:12733665/1‑34 ATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGg > 1:8983872/1‑34 ATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGCCGGGGGg > 1:18827041/1‑34 TTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGgg > 1:15670530/1‑33 TCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGGGGGCGGGGGggg > 1:18992892/1‑32 TACCCTGGTCGGTTATTCCGCGATGGGTGGTGCAGTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/223997‑223959 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcggGGGCGGGGGTAT > REL606/1306336‑1306347 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |