New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | = 50078 | 64 (0.620) | 8 (0.100) | 3/38 | NT | 17.8% | coding (77/1332 nt) | yaaU | predicted transporter |
? | REL606 | 558256 = | 23 (0.280) | coding (193/294 nt) | ECB_00516 | conserved hypothetical protein |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
ATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATT > REL606/50044‑50112 | aTTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGG > 1:4575987‑M1/1‑35 (MQ=255) aTTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGGGG > 1:19568410‑M1/1‑35 (MQ=255) aTTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGGGG > 1:18229280‑M1/1‑35 (MQ=255) ttCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGg > 1:4075849‑M1/1‑34 (MQ=255) ttCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGg > 1:12450493‑M1/1‑34 (MQ=255) tCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGgc > 1:2842859‑M1/1‑33 (MQ=255) cccccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTc < 1:15672098/32‑1 (MQ=255) cccccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTc < 1:12590384/32‑1 (MQ=255) ccccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTcc < 1:20172638/33‑1 (MQ=255) ccccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTcc < 1:13866946/33‑1 (MQ=255) ccccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTcc < 1:14387774/33‑1 (MQ=255) cACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggc > 1:20483604‑M1/1‑32 (MQ=255) cACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggc > 1:15266721‑M1/1‑32 (MQ=255) cccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCg < 1:7214208/34‑1 (MQ=255) cccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCg < 1:8040362/34‑1 (MQ=255) aCCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGgccg > 1:8780214‑M1/1‑31 (MQ=255) aCCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGgccg > 1:4781141‑M1/1‑31 (MQ=255) ccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggccg > 1:1797176‑M1/1‑30 (MQ=255) ccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGgccgg > 1:11043474‑M1/1‑30 (MQ=255) ccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGt < 1:2249983/35‑1 (MQ=255) ccgccgCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGt < 1:1137247/35‑1 (MQ=255) cagccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGt < 1:5541637/33‑1 (MQ=255) cgccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGtt < 1:16465258/35‑1 (MQ=255) gccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGgggggtt > 1:6452171‑M1/1‑28 (MQ=255) gccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGttt < 1:13175262/35‑1 (MQ=255) gccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGttt < 1:15736771/35‑1 (MQ=255) gccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGttt < 1:7796995/35‑1 (MQ=255) gccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGttt < 1:11906229/35‑1 (MQ=255) ccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggcgtttt > 1:14093888‑M1/1‑27 (MQ=255) ccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggcggttt > 1:15668275‑M1/1‑27 (MQ=255) ccgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggcggttt > 1:5297900‑M1/1‑27 (MQ=255) cgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCt < 1:8128911/35‑1 (MQ=255) cgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCt < 1:6255745/35‑1 (MQ=255) cgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCt < 1:19335689/35‑1 (MQ=255) cgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGGGCGTTTCt > 1:12842554/1‑35 (MQ=37) cgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGGCCGGTTCt > 1:6938849/1‑35 (MQ=37) gcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggcggttttg > 1:2032565‑M1/1‑25 (MQ=255) gcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTg < 1:15626621/35‑1 (MQ=255) gcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTg < 1:13054960/35‑1 (MQ=255) gcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTg < 1:11446726/35‑1 (MQ=255) gcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTg < 1:20383575/35‑1 (MQ=255) gcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGGCCGTTTCTg > 1:19642031/1‑35 (MQ=255) cATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGggcggttttgg > 1:5376979‑M1/1‑24 (MQ=255) aTTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGa < 1:8632041/35‑1 (MQ=255) aTTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGGGCGGTTCTCGa > 1:9054257/1‑35 (MQ=19) ttttGCTGTGGGGAAGCGGTGGggcggttttgggt > 1:3011662‑M1/1‑22 (MQ=255) ttttGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGAt < 1:16830007/35‑1 (MQ=255) ttttGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGAt < 1:1967040/35‑1 (MQ=255) ttttGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGAt < 1:19979077/35‑1 (MQ=255) tttGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATg < 1:19432506/35‑1 (MQ=255) tttGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATg < 1:11220123/35‑1 (MQ=255) tttGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATg < 1:1316021/35‑1 (MQ=255) tttGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATg < 1:7825984/35‑1 (MQ=255) tGCTTTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGt < 1:2905851/35‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGt < 1:7290546/35‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGt < 1:13636732/35‑1 (MQ=255) gCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGtt < 1:12034236/35‑1 (MQ=255) gCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGAAGGtt < 1:19180094/35‑1 (MQ=255) cTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTa < 1:18717939/35‑1 (MQ=255) cTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTa < 1:13473926/35‑1 (MQ=255) cTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTa < 1:2317638/35‑1 (MQ=255) gtgGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATg < 1:16496698/35‑1 (MQ=255) gtgGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATg < 1:14027508/35‑1 (MQ=255) tgGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGt < 1:19332753/35‑1 (MQ=255) tgGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGt < 1:1396264/35‑1 (MQ=255) ggggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTa < 1:13417309/35‑1 (MQ=255) ggggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTa < 1:4089274/35‑1 (MQ=255) ggggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTa < 1:13508652/35‑1 (MQ=255) gggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTAc < 1:5835392/35‑1 (MQ=255) gggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTAc < 1:8389307/35‑1 (MQ=255) gggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTAc < 1:13644349/35‑1 (MQ=255) gggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTAc < 1:7506373/35‑1 (MQ=255) gggAAGCGGTGGTCAGTTTCTGGATGGTTATGTAc < 1:17209375/35‑1 (MQ=255) ggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACt < 1:1489155/35‑1 (MQ=255) ggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACt < 1:16570181/35‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTg < 1:13086667/35‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTg < 1:10563511/35‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTgg < 1:18967520/35‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGATTATGTACTgg < 1:14985421/35‑1 (MQ=255) aGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGt < 1:18093677/35‑1 (MQ=255) gCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTa < 1:10520969/35‑1 (MQ=255) cGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTaa < 1:590002/35‑1 (MQ=255) ggtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAAt > 1:8432150/1‑35 (MQ=255) ggtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAAt > 1:18301722/1‑35 (MQ=255) ggtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGGAAt > 1:10239411/1‑35 (MQ=255) ggtggtCCGTTTCTGGATGGCTATGTACTGGTAAt > 1:1246055/1‑35 (MQ=255) gtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATg < 1:11990250/35‑1 (MQ=255) gtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATg < 1:12345252/35‑1 (MQ=255) gtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATg < 1:14784056/35‑1 (MQ=255) gtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATg > 1:17261054/1‑35 (MQ=255) gtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATg > 1:15379467/1‑35 (MQ=255) tggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGa < 1:8060936/35‑1 (MQ=255) ggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAt > 1:7534997/1‑35 (MQ=255) ggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAt < 1:18149654/35‑1 (MQ=255) ggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAt < 1:20004688/35‑1 (MQ=255) ggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAt > 1:4995395/1‑35 (MQ=255) gtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAtt < 1:15940559/35‑1 (MQ=255) gtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAtt < 1:13190468/35‑1 (MQ=255) gtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAtt < 1:19113969/35‑1 (MQ=255) gtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGAtt < 1:1932966/35‑1 (MQ=255) | ATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATT > REL606/50044‑50112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |