Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ REL606 4017655–4017755 4017997–4017764 10–343 52 [41] [46] 52 rrlA 23S ribosomal RNA

TTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGTGTGG  >  REL606/4017989‑4018032
         |                                  
ttGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTa           <  1:1572665/35‑1 (MQ=32)
ttGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTa           <  1:12987564/35‑1 (MQ=32)
ttGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTa           >  1:12367682/1‑35 (MQ=32)
ttGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTa           <  1:18185975/35‑1 (MQ=32)
ttGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTa           <  1:16863022/35‑1 (MQ=32)
 tGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAg          >  1:13840999/1‑35 (MQ=35)
 tGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAg          >  1:8287557/1‑35 (MQ=35)
 tGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAg          <  1:16727946/35‑1 (MQ=35)
 tGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAg          >  1:19124137/1‑35 (MQ=35)
 tGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAg          <  1:3664105/35‑1 (MQ=35)
 tGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAg          <  1:2821938/35‑1 (MQ=35)
  gAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGa         <  1:11677257/35‑1 (MQ=38)
  gAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGa         <  1:3392600/35‑1 (MQ=38)
  gAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGa         <  1:680260/35‑1 (MQ=38)
   aGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGaa        <  1:15821806/35‑1 (MQ=38)
   aGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGaa        <  1:20537666/35‑1 (MQ=38)
   aGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGaa        <  1:15718983/35‑1 (MQ=38)
   aGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGaa        >  1:1090747/1‑35 (MQ=38)
   aGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGaa        >  1:10854876/1‑35 (MQ=38)
   aGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGaa        >  1:982477/1‑35 (MQ=38)
    gCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGGTTAGAAg       >  1:11041295/1‑35 (MQ=255)
    gCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAg       <  1:7948363/35‑1 (MQ=38)
    gCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAg       <  1:11398829/35‑1 (MQ=38)
    gCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAg       <  1:5290225/35‑1 (MQ=38)
    gCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAg       >  1:4625283/1‑35 (MQ=38)
    gCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAg       >  1:4294302/1‑35 (MQ=38)
     ccTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgt      >  1:6996431/1‑35 (MQ=38)
     ccTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgt      <  1:1320106/35‑1 (MQ=38)
     ccTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgt      <  1:11741650/35‑1 (MQ=38)
     ccTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgt      <  1:8555881/35‑1 (MQ=38)
     ccTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgt      <  1:18125339/35‑1 (MQ=38)
     ccTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgt      <  1:9353124/35‑1 (MQ=38)
     ccTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgg      >  1:1360941/1‑34 (MQ=38)
      cTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtg     >  1:19805652/1‑35 (MQ=38)
      cTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtg     >  1:18959892/1‑35 (MQ=38)
      cTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtg     >  1:18407516/1‑35 (MQ=38)
      cTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtg     >  1:14009397/1‑35 (MQ=38)
       ttGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtgt    <  1:2284736/35‑1 (MQ=38)
       ttGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtgt    >  1:2256985/1‑35 (MQ=38)
       ttGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtgt    >  1:9756687/1‑35 (MQ=38)
       ttGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtgt    >  1:5958625/1‑35 (MQ=38)
       ttGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtgt    >  1:5988015/1‑35 (MQ=38)
       ttGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtgt    <  1:10947590/35‑1 (MQ=38)
       ttGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAgtgt    <  1:13712302/35‑1 (MQ=38)
        tGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGtgtg   >  1:10161081/1‑35 (MQ=38)
        tGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGtgtg   <  1:6485398/35‑1 (MQ=38)
         gATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGTGTgg  <  1:7336475/35‑1 (MQ=38)
         gATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGTGTgg  <  1:13965706/35‑1 (MQ=38)
         gATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGTGTgg  >  1:13299560/1‑35 (MQ=38)
         gATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGTGTgg  >  1:11690461/1‑35 (MQ=38)
         gATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGTGTgg  >  1:2722954/1‑35 (MQ=38)
         gATGTGTAGGATACGTGGGAGGCTTAGAAGTGTgg  >  1:18356908/1‑35 (MQ=255)
         |                                  
TTGAGCCTTGATGTGTAGGATAGGTGGGAGGCTTAGAAGTGTGG  >  REL606/4017989‑4018032

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.